DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CDKL5 and Cdkl5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_003150.1 Gene:CDKL5 / 6792 HGNCID:11411 Length:1030 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017457779.1 Gene:Cdkl5 / 100362725 RGDID:2324133 Length:1001 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:945 Identity:868/945 - (91%)
Similarity:892/945 - (94%) Gaps:41/945 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRELKMLR 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRELKMLR 65

Human    66 TLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLIKAIHWCHKND 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 TLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLIKAIHWCHKND 130

Human   131 IVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSPELLLGAPYGKSVDMW 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 IVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSPELLLGAPYGKSVDMW 195

Human   196 SVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFYSNPRFHGLRFPAVNHPQSLER 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 SVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFYSNPRFHGLRFPAVNHPQSLER 260

Human   261 RYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQTQRLLDRSPSRSAKRKPYHVESSTLSN 325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
  Rat   261 RYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQTQRLLDRSPSRSTKRKPYHVESSTLSN 325

Human   326 RNQAGKSTALQSHHRSNSKDIQNLSVGLPRADEGLPANESFLNGNLAGASLSPLHTKTYQASSQP 390
            |:|:.|..|||:|||||||||||||||||||:|||||||||||||||||:|||:||||||||:||
  Rat   326 RSQSTKGGALQTHHRSNSKDIQNLSVGLPRAEEGLPANESFLNGNLAGATLSPMHTKTYQASTQP 390

Human   391 GSTSKDLTNNNIPHLLSPKEAKSKTEFDFNIDPKPSEGPGTKYLKSNSRSQQNRHSFMESSQSKA 455
            ||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||::|||||||||||||||||
  Rat   391 GSSSKDLTNNNIPHLLSPKEAKSKTEFDFNIDPKPSEGPGTKYLKSSTRSQQNRHSFMESSQSKA 455

Human   456 GTLQPNEKQSRHSYIDTIPQSSRSPSYRTKAKSHGALSDSKSVSNLSEARAQIAEPSTSRYFPSS 520
            |||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.:||||||||
  Rat   456 GTLQPSEKQSRHSYIDTIPQSSRSPSYRTKAKSHGALSDSKSVSNLSEARAQITETNTSRYFPSS 520

Human   521 CLDLNSPTSPTPTRHSDTRTLLSPSGRNNRNEGTLDSRRTTTRHSKTMEELKLPEHMDSSHSHSL 585
            |||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 CLDLNSPTSPTPTRHTDTRTLLSPSGRNNRNEGTLDSRRTTTRHSKTMEELKLPEHMDSSHSHSL 585

Human   586 SAPHESFSYGLGYTSPFSSQQRPHRHSMYVTRDKVRAKGLDGSLSIGQGMAARANSLQLLSPQPG 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 SAPHESFSYGLGYTSPFSSQQRPHRHSMYVTRDKVRAKGIDGSLSIGQGMAARANSLQLLSPQPG 650

Human   651 EQLPPEMTVARSSVKETSREGTSSFHTRQKSEGGVYHDPHSDDGTAPKENRHLYNDPVPRRVGSF 715
            |||||||||||.||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 EQLPPEMTVARPSVKESSREGTSSFHTRQKSEGGVYHDPHSDDGTAPKENRHLYNDPVPRRVGSF 715

Human   716 YRVPSPRPDNSFHENNVSTRVSSLPSESSSGTNHSKRQPAFDPWKSPENISHSEQLKEKEKQGFF 780
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||.|||||||||||||:|||||||||||
  Rat   716 YRVPSPRPDNSFHENNVSTRVSSLPSDSSSGTNHSKRQPGFDPWKSPENISHSDQLKEKEKQGFF 780

Human   781 RSMKKKKKKSQT-----------------------------------------VPNSDSPDLLTL 804
            |||||||||:||                                         |||:|.||||||
  Rat   781 RSMKKKKKKTQTTDSTNGENPSIKKSLFPLFNSKNHLKHSSSLKKLPVVTPPMVPNTDGPDLLTL 845

Human   805 QKSIHSASTPSSRPKEWRPEKISDLQTQSQPLKSLRKLLHLSSASNHPASSDPRFQPLTAQQTKN 869
            ||:|||:||.|||||||||||:|||||||||||||||||||||::|||||||||||||||||.||
  Rat   846 QKAIHSSSTASSRPKEWRPEKLSDLQTQSQPLKSLRKLLHLSSSTNHPASSDPRFQPLTAQQAKN 910

Human   870 SFSEIRIHPLSQASGGSSNIRQEPAPKGRPALQLP 904
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||
  Rat   911 SFSEIRIHPLSQASGGSSNIRQEPTPKGRPALQLP 945

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CDKL5NP_003150.1 STKc_CDKL5 11..297 CDD:270838 285/285 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 300..349 41/48 (85%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 382..566 174/183 (95%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 646..834 175/228 (77%)
Cdkl5XP_017457779.1 STKc_CDKL5 11..297 CDD:270838 285/285 (100%)

Return to query results.
Submit another query.