DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment STIM1 and Stim1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001264890.1 Gene:STIM1 / 6786 HGNCID:11386 Length:791 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_063123299.1 Gene:Stim1 / 361618 RGDID:1306831 Length:793 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:793 Identity:754/793 - (95%)
Similarity:770/793 - (97%) Gaps:2/793 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MDVCVRLALWLLWGLLLHQGQSLSHSHSEKATGTSSGANSEESTAAEFCRIDKPLCHSEDEKLSF 65
            ||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||||.||||||||||||||||||||
  Rat     1 MDVCARLALWLLWGLLLHQGQSLSHSHSEKNTGASSGATSEESTEAEFCRIDKPLCHSEDEKLSF 65

Human    66 EAVRNIHKLMDDDANGDVDVEESDEFLREDLNYHDPTVKHSTFHGEDKLISVEDLWKAWKSSEVY 130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||
  Rat    66 EAVRNIHKLMDDDANGDVDVEESDEFLREDLNYHDPTVKHSTFHGEDKLISVEDLWKAWKASEVY 130

Human   131 NWTVDEVVQWLITYVELPQYEETFRKLQLSGHAMPRLAVTNTTMTGTVLKMTDRSHRQKLQLKAL 195
            |||||||:|||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 NWTVDEVIQWLITYVELPQYEETFRKLQLTGHAMPRLAVTNTTMTGTVLKMTDRSHRQKLQLKAL 195

Human   196 DTVLFGPPLLTRHNHLKDFMLVVSIVIGVGGCWFAYIQNRYSKEHMKKMMKDLEGLHRAEQSLHD 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 DTVLFGPPLLTRHNHLKDFMLVVSIVIGVGGCWFAYIQNRYSKEHMKKMMKDLEGLHRAEQSLHD 260

Human   261 LQERLHKAQEEHRTVEVEKVHLEKKLRDEINLAKQEAQRLKELREGTENERSRQKYAEEELEQVR 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 LQERLHKAQEEHRTVEVEKVHLEKKLRDEINLAKQEAQRLKELREGTENERSRQKYAEEELEQVR 325

Human   326 EALRKAEKELESHSSWYAPEALQKWLQLTHEVEVQYYNIKKQNAEKQLLVAKEGAEKIKKKRNTL 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Rat   326 EALRKAEKELESHSSWYAPEALQKWLQLTHEVEVQYYNIKKQNAERQLLVAKEGAEKIKKKRNTL 390

Human   391 FGTFHVAHSSSLDDVDHKILTAKQALSEVTAALRERLHRWQQIEILCGFQIVNNPGIHSLVAALN 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 FGTFHVAHSSSLDDVDHKILTAKQALSEVTAALRERLHRWQQIEILCGFQIVNNPGIHSLVAALN 455

Human   456 IDPSWMGSTRPNPAHFIMTDDVDDMDEEIVSPLSMQSPSLQSSVRQRLTEPQHGLGSQRLVEGEA 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 IDPSWMGSTRPNPAHFIMTDDVDDMDEEIVSPLSMQSPSLQSSVRQRLTEPQHGLGSQRLVEGEA 520

Human   521 GHFLTSRVSLRRMRSLSSGQSFSSEGYGTSSPSASAAASCSSSITTI--TTTTTTTTTFTTVHVH 583
            ||||||||||||||||||||||:|||:|||.|||||::|||||.|:|  |:|||||||..|||||
  Rat   521 GHFLTSRVSLRRMRSLSSGQSFTSEGHGTSPPSASASSSCSSSTTSIATTSTTTTTTTINTVHVH 585

Human   584 PVYYHHSTSYFLQMEPYPDTPPSDSTAVMPGHSESLGDLTHSDSESSLHMSDRQRVAPKPPQMSR 648
            ||||||||||||||:||||..|||:.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||.|
  Rat   586 PVYYHHSTSYFLQMDPYPDPTPSDNIAVMSGHSESLGDLTHSDSESSLHTSDRQRVAPKPPQMGR 650

Human   649 AADEALNAMTSNGSHRLIEGVHPGSLVEKLPDSPALAKKALLALNHGLDKAHSLMELSPSAPPGG 713
            ||||||||.:|||||||||||||||||||||||||||||.:||||||||||||||||:||.||||
  Rat   651 AADEALNATSSNGSHRLIEGVHPGSLVEKLPDSPALAKKTILALNHGLDKAHSLMELNPSVPPGG 715

Human   714 SPHLDSSRSHSPSSPDPDTPSPVGDSRALQASRNTRIPHLAGKKAVAEEDNGSIGEETDSSPGRK 778
            ||.||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Rat   716 SPLLDSSHSHSPSSPDPDTPSPVGDSRALQGSRNTRIPHLAGKKAMAEEDNGSIGEETDSSPGRK 780

Human   779 KFPLKIFKKPLKK 791
            |||||||||||||
  Rat   781 KFPLKIFKKPLKK 793

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
STIM1NP_001264890.1 SAM_STIM1 128..201 CDD:188972 70/72 (97%)
DR0291 244..>427 CDD:441187 181/182 (99%)
SOAR 342..441 CDD:465164 97/98 (99%)
SOAR/CAD. /evidence=ECO:0000269|PubMed:19182790 344..442 96/97 (99%)
Contributes to fast Ca(2+)-dependent inactivation of CRAC channels. /evidence=ECO:0000269|PubMed:19706554 475..483 7/7 (100%)
Stim1XP_063123299.1 None

Return to query results.
Submit another query.