DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment BRCA2 and Brca2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000050.3 Gene:BRCA2 / 675 HGNCID:1101 Length:3418 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038945468.1 Gene:Brca2 / 360254 RGDID:2219 Length:3373 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3491 Identity:1950/3491 - (55%)
Similarity:2426/3491 - (69%) Gaps:200/3491 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MPIGSKERPTFFEIFKTRCNKADLGPISLNWFEELSSEAPPYNSEPAEESEHKNNNYEPNLFKTP 65
            |.:..|.||||:||||.||:.||||||||||||||||||||||:||.||||:|...:||.|||||
  Rat     1 MTVEYKRRPTFWEIFKARCSTADLGPISLNWFEELSSEAPPYNTEPPEESEYKPQGHEPQLFKTP 65

Human    66 QRKPSYNQLASTPIIFKEQGLTLPLYQSPVKELDKFKLDLGRNVPNSRHKSLRTVKTKMDQADDV 130
            ||.|||:|.|||||:||||..||||.|||.||       ||..|.||:.|.....|.:.|...||
  Rat    66 QRNPSYHQFASTPIMFKEQSQTLPLDQSPFKE-------LGNVVANSKRKHHSKKKARKDPVVDV 123

Human   131 SCPLLNSCLSESPVVLQCTHVTPQRDKSVVCGSLFHTPKFVKGRQTPKHISESLGAEVDPDMSWS 195
            :...|.:|.||||...:||.|.|||.|.||.||||:|||.   .:||||||||||.||||||||:
  Rat   124 ASLPLKACPSESPCTPRCTQVAPQRRKPVVSGSLFYTPKL---EETPKHISESLGVEVDPDMSWT 185

Human   196 SSLATPPTLSSTVLIVRNEEASETVFPHDTTANVKSYFSNHDESLKKNDRFIASVTDSENTNQRE 260
            |||||||||||||||.|:|||....||.|:.|::|||||||:||||||||||.||:||||.:|:|
  Rat   186 SSLATPPTLSSTVLIARDEEAHRNAFPADSPASLKSYFSNHNESLKKNDRFIPSVSDSENKSQQE 250

Human   261 AASHGFGKTSG-NSFKVNSCKDHIGKSMPNVLEDEVYETVVDTSEEDSFSLCFSKCRTKNLQKVR 324
            |.|.|..|..| :|.|:|..:|.:.|.:||||||.  ||.||||.||||||||.|.||:||||.|
  Rat   251 AFSQGLEKMLGDSSSKINRFRDCLRKPIPNVLEDG--ETAVDTSGEDSFSLCFPKRRTRNLQKTR 313

Human   325 TSKTRKKIFHEANADE-CEKSKNQVKEKYSFVSEVEPNDTDPLDSNVANQKPFESGSDKISKEVV 388
            ..|.:||||.|...|. .|:::.|..:|.||..|:||.|::|||.:|.||||..|.|..||.|..
  Rat   314 MGKMKKKIFSETRTDGLSEEARGQADDKNSFALEIEPRDSEPLDPSVTNQKPLYSQSGDISSEAG 378

Human   389 PSLACEWSQLTLSGLNGAQMEKIPLLHISSCDQNISEKDLLDTENKRKKDFLTSENSLPRISSLP 453
            ......|||...|||||.|..|||||||||..|:|.| |.:|.:.:.     |...:.|.|||||
  Rat   379 QCSDSIWSQPDPSGLNGTQTRKIPLLHISSHKQSILE-DFIDMKKEG-----TGSITFPHISSLP 437

Human   454 KSEKPLNEETVVNKRDEEQHLESHTDCILAVKQAISGTSPVASSFQGIKKSIFRIRESPKETFNA 518
            :.||..:|||:|:|..|.|||||..|.| :.||.:||||..|.....|:|||.::||..:||.:.
  Rat   438 EPEKMFSEETLVDKEHEGQHLESLEDSI-SGKQMVSGTSQTACLSPSIRKSIVKMREPLEETLDT 501

Human   519 SFSGHMTDPNFKKETEASESGLEIHTVCSQKEDSLCPNLIDNGSWPATTTQNSVALKNAGLISTL 583
            .||..||...|.:|.:||..||||||.|||:||||||:.:|.||||.|.|..|..:||||||:||
  Rat   502 VFSDSMTSSAFTEELDASAGGLEIHTACSQREDSLCPSSVDTGSWPTTLTDTSATVKNAGLITTL 566

Human   584 KKKTNKFIYAIHDETSYKGKKIPKDQKSELINCSAQFEANAFEAPLTFANADSGLLHSSVKRSCS 648
            |.|..||||::.|:.|::|||:...::|||.|.||.|||:|||.|..|.|.|||:..||:|||..
  Rat   567 KNKRRKFIYSVSDDASHQGKKLQTQRQSELTNLSAPFEASAFEVPFPFTNVDSGIPDSSIKRSNL 631

Human   649 QNDSEEPTLSLTSSFGTILRKCSRNETCSNNTVISQDLDYKEAKCNKEKLQLFITPEADSLSCLQ 713
            .||.|||:||||:||.|...|    |....:.:|||||:.|||..::||.|.:...|||.||||.
  Rat   632 PNDPEEPSLSLTNSFVTAASK----EISYIHALISQDLNDKEAILSEEKPQPYTALEADFLSCLP 692

Human   714 EGQCENDPKSKKVSDIKEEVLAAACHPVQH--SKVEYSDTDFQSQKSLLYDHENASTLILTPTSK 776
            |..||||.||.||||.||:||.:||.|...  :.|:.|...|.||::.|..|...|||.|||:.|
  Rat   693 ERSCENDQKSPKVSDRKEKVLVSACRPSGRLAAAVQLSSISFDSQENPLGSHNVTSTLKLTPSPK 757

Human   777 DVLSNLVMISRGKESYKMSDKLKGNNYESDVELTKNIPMEKNQDVCALNENYKNVELLPPEKYMR 841
            ..||..|::|||| ..||.:||:..:.:.::||:||||:..| ::|.|:||.:..|||||.:|:.
  Rat   758 TPLSKPVVVSRGK-MCKMPEKLQCKSCKDNIELSKNIPLGVN-EMCVLSENSETPELLPPLEYIT 820

Human   842 VASPSRKVQFNQNTNLRVIQKNQEETTSISKITVNPDSEELFSDNENNFVFQVANERNNLALGNT 906
            ..|.|.|.||||||.:.|:||:|:::|.||::||:.:|||||.:.||||.|||.||.|...:|:|
  Rat   821 EVSSSVKSQFNQNTKIAVVQKDQKDSTFISEVTVHMNSEELFPEKENNFAFQVTNESNKPNIGST 885

Human   907 KELHETDLTCVNEPIFKNSTMVLYGDTGDKQATQVSIKKD-----LVYVLAEENKNSVKQHIKMT 966
            .|..|.||:.......|||.|.:..|..|:||.||.|.:|     :|:...::::|:::||.|.|
  Rat   886 VEFQEEDLSHTKGHSLKNSPMTVDRDLDDEQAGQVLITEDSDSLAVVHDCTKKSRNTIEQHQKGT 950

Human   967 LGQDLKSDISLNIDKIPEKNNDYMNKWAGLLGPISNHSFGGSFRTASNKEIKLSEHNIKKSKMFF 1031
            ..:|.||:.||.:..  :.||||::||:..|.|:.||.|||||||||||||||||.|:|||||||
  Rat   951 ADKDFKSNSSLYLKS--DGNNDYLDKWSEFLDPLMNHKFGGSFRTASNKEIKLSEDNVKKSKMFF 1013

Human  1032 KDIEEQYPTSLACVEIVNTLALDNQKKLSKPQSIN-----TVS--AHLQSSVVVSDCKNSHITPQ 1089
            |||||||||||.|::.|:||.|.|:|:||:|.:.:     |||  .|.||||...|   :|..||
  Rat  1014 KDIEEQYPTSLDCIDTVSTLQLANKKRLSEPHTFDLKSGTTVSTQCHSQSSVSHED---THTAPQ 1075

Human  1090 MLFSKQDFNSNHNLTPSQKAEITELSTILEESGSQFEFTQFRKPSYILQKSTFEVPENQMTILKT 1154
            ||.|||||:|:||||||||||||||||||||||||||||||:.||:|.|.:|..|..|||.:::|
  Rat  1076 MLSSKQDFHSSHNLTPSQKAEITELSTILEESGSQFEFTQFKNPSHIAQNNTSAVLGNQMAVVRT 1140

Human  1155 TSEECRDADLHVIMNAPSIGQVDSSKQFEGTVEIKRKFAGLLKNDCNKSASGYLTDENEVGFRGF 1219
            .|||.:|.|||:.:|..|:||:|.:|:||..|.:|:..:.||::.||::.|.:|..: |:.|.||
  Rat  1141 ASEEWKDVDLHLPLNPSSVGQIDHNKKFECLVGVKQSSSHLLEDTCNQNTSCFLPIK-EMEFGGF 1204

Human  1220 YSAHGTKLNVSTEALQKAVKLFSDIENISEETSAEVHPISLSSSKCHDSVVSMFKIENHN-DKTV 1283
            .||.||||:||.|||:||:||||||||||||.|.:|.|...||...||||.|:|||:..| ||:.
  Rat  1205 CSALGTKLSVSNEALRKAMKLFSDIENISEEPSTKVGPRGFSSCAHHDSVASVFKIKKQNTDKSF 1269

Human  1284 SEKNNKCQLILQNNIEMTTGTFVEEITENYKRNTENEDNKYTAASRNSHNLE-FDGSDSSKNDTV 1347
            .||::|||:.:|||.||||...|:|..|||.:|.: :||.||.:.||::.|| .|.|.||.:.||
  Rat  1270 DEKSSKCQVTVQNNKEMTTCILVDENPENYVKNIK-QDNNYTGSQRNAYKLENSDVSKSSTSGTV 1333

Human  1348 CIHKDETDLLF-TDQHNICLKLSGQFMKEGNTQIKEDLSDLTFLEVAKAQEACHGNTSNKEQLTA 1411
            .|:|.::||.| .::.|...:...|:::|.|.||||.:||||.|||.||:|.||..:|:||||.:
  Rat  1334 YINKGDSDLPFAAEKGNKYPESCTQYVREENAQIKESVSDLTCLEVMKAEETCHMKSSDKEQLPS 1398

Human  1412 TKTEQNIKDFETSDTFFQTASGKNISVAKESFNKIVNFFDQKPEEL--HNFSLNSELHSDIRKNK 1474
            .|.|||:|:|..|   |||||||||.|:|||.||.||..||:.|:|  .:.||||::...|.|:|
  Rat  1399 DKMEQNMKEFNIS---FQTASGKNIRVSKESLNKSVNILDQETEDLTVTSDSLNSKILCGINKDK 1460

Human  1475 MDILSYEETDIVKHKILKESVPVGTGNQLVTFQGQPERD-EKIKEPTLLGFHTASGKKVKIAKES 1538
            |.|..::::..:| |:.:|..|:||.:||...|..||.: |.|||||||.|||||||||||.:||
  Rat  1461 MHISCHKKSINIK-KVFEEHFPIGTVSQLPALQQYPEYEIESIKEPTLLSFHTASGKKVKIMQES 1524

Human  1539 LDKVKNLFDEKEQGTSEITSFSHQWAKTLKYREACKD-LELACETIEITAAPKCKEMQNSLNNDK 1602
            |||||||||| .|...:.|:|.||.:|.||.||..|: |.||.|.||:||: ||:|||       
  Rat  1525 LDKVKNLFDE-TQYVRKTTNFGHQESKPLKDREDYKERLTLAYEKIEVTAS-KCEEMQ------- 1580

Human  1603 NLVSIETVVPPKLLSDNLCRQTENLKTSKSIFLKVKVHENVEKETAKSPATCYTNQSPYSVIENS 1667
            |.||.:|.:.|: .:|::.||||||.::.|   ..|||.|:|.:..|:|..|...||.|.|.|:|
  Rat  1581 NFVSKQTEMLPQ-QNDHMYRQTENLTSNGS---SPKVHGNIENKIEKNPRICCICQSSYFVTEDS 1641

Human  1668 ALAFYTSCSRKTSVSQTSLLEAKKWLRE--------GIFDGQPERINTADYVGNYLYENNSNSTI 1724
            |||.||..||||.|.::||.:.||||||        ...:.|..:.:|.|:.||.|||::.....
  Rat  1642 ALACYTGDSRKTCVGESSLSKGKKWLREQSDKLGTRNTIEIQCVKEHTEDFAGNALYEHSLVIIR 1706

Human  1725 AENDKNHLSEKQ-DTYLSNSSMSNSYSYHS-----DEVYNDSGYLSKNKLDSGIEPVLKNVEDQK 1783
            .|.|.:|:||.| .|..|:.::.:||..||     |:::|||||..|:|:||.::|.:||.|.  
  Rat  1707 TEIDTSHVSENQASTLFSDPNVCHSYLSHSSFCHHDDMHNDSGYFLKDKIDSDVQPDMKNTEG-- 1769

Human  1784 NTSFSKVISNVKDANAYPQTVNEDICVEELVTSSSPCKNKNAAIKLSISNSNNFEVGPPAFRIAS 1848
            |..|.| ||..|:...:||||||: ||::|.|::||..|||.||..::.:..|.:||.|.|    
  Rat  1770 NAIFPK-ISATKEIKLHPQTVNEE-CVQKLETNASPYANKNIAIDSAMLDLRNCKVGSPVF---- 1828

Human  1849 GKIVCVSHETIKKVKDIFTDSFSKVIKENNENKSKICQTKIMAGCYEALDDSEDILHNSLDNDEC 1913
              |...|.||: ::|:||||:.||::::|.|:|...|||    .|::|||:|||.:..|...|.|
  Rat  1829 --ITTHSQETV-RMKEIFTDNCSKIVEQNRESKPDTCQT----SCHKALDNSEDFICPSSSGDVC 1886

Human  1914 STHSHKVFADIQSEEILQHNQNMSGLEKVSKISPCDVSLETSDICKCSIGKLHKSVSSANTCGIF 1978
            ......:|.. |||:||||||::|||:|.:  :| .|||||.|.|| ||....:.|..:.|.|||
  Rat  1887 INSPMAIFYP-QSEQILQHNQSVSGLKKAA--TP-PVSLETWDTCK-SIRGSPQEVHPSRTYGIF 1946

Human  1979 STASGKSVQVSDASLQNARQVFSEIEDSTKQVFSKVLFKSNEHSDQLTREENTAIRTPEHLISQK 2043
            ||||||:||||||||:.||||||||:...||:.|.|..:.||.|....:.|::.:.....::|.:
  Rat  1947 STASGKAVQVSDASLEKARQVFSEIDGDAKQLASMVSLEGNEKSHHSVKRESSVVHNTHGVLSLR 2011

Human  2044 GFSYNVVNSSAFSGFSTASGKQVSILESSLHKVKGVLEEFDLIRTEHSLHYSPTSRQNVSKILPR 2108
            ......|:||.|||||||.||.|::.||:||||||:|||||||||||:|.:|||. ::||||.|:
  Rat  2012 KTLPGNVSSSVFSGFSTAGGKLVTVSESALHKVKGMLEEFDLIRTEHTLQHSPTP-EDVSKIPPQ 2075

Human  2109 --VDKRNPEHCVNSEMEKTCSKEFKLSNNLNVEGGSSENNHSIKVSPYLSQFQQDKQ-QLVLGTK 2170
              ::.|.||:.|:|:::||.:.:.:..:|.. |.|||.|..|::|||.|||.::.:: |.|||||
  Rat  2076 PCLESRTPEYSVSSKLQKTYNDKSRSPSNYK-ESGSSGNTQSLEVSPQLSQMERKQETQSVLGTK 2139

Human  2171 VSLVENIHVLGKEQASPKNVKMEIGKTETFSDVPVKTNIEVCSTYSKDSENYFETEAVEIAKAFM 2235
            || ....::|.|:|..|:|:|:|..|.||||||.:|||  |...|||:.||||||||||||||||
  Rat  2140 VS-QRKTNILEKKQNLPQNIKIESNKMETFSDVSMKTN--VGEYYSKEPENYFETEAVEIAKAFM 2201

Human  2236 EDDELTDSKLPSHATHSLFTCPENEEMVLSNSRIGKRRGEPLILVGEPSIKRNLLNEFDRIIENQ 2300
            ||||||||: .:||..|||.||:||  .|.|||..||.|...:.||:|.|||:||||||||||::
  Rat  2202 EDDELTDSE-QTHAKCSLFACPQNE--ALLNSRTRKRGGMAGVAVGQPPIKRSLLNEFDRIIESK 2263

Human  2301 EKSLKASKSTPDGTIKDRRLFMHHVSLEPITCVPFRTTKERQEIQNPNFTAPGQEFLSKSHLYEH 2365
            .|||..|||||||||||||||.||:||||:||.||.::|||||.|:|:.|:|.|...||.|...|
  Rat  2264 GKSLTPSKSTPDGTIKDRRLFTHHMSLEPVTCGPFCSSKERQETQSPHVTSPAQGLQSKGHPSRH 2328

Human  2366 LTLEKSSSNLAVSGHPFYQVSATRNEKMRHLITTGRPTKVFVPPFKTKSHFHRVEQC-VRNINLE 2429
            ..:.|||||..        |||.|:|:.||.: :.:.|||||||||.||.|||.|.. .:|:|||
  Rat  2329 SAVGKSSSNPT--------VSALRSERTRHSV-SDKSTKVFVPPFKVKSRFHRDEHFDSKNVNLE 2384

Human  2430 ENRQKQNIDGHGSDDSKNKINDNEIHQFNKNNSNQAVAVTFTKCEEEPLDLITSLQNARDIQDMR 2494
            ...|| :.||...|.     ||::..||||                   ||::|||||||:||:|
  Rat  2385 GKNQK-SADGVSEDG-----NDSDFPQFNK-------------------DLMSSLQNARDLQDIR 2424

Human  2495 IKKKQRQRVFPQPGSLYLAKTSTLPRISLKAAVGGQVPSACSHKQLYTYGVSKHCIKINSKNAES 2559
            ||.|:|..:.||||||||.|:||||||||:||||..||||||.||||.|||||.||.:||||||.
  Rat  2425 IKNKERHHLCPQPGSLYLTKSSTLPRISLQAAVGDSVPSACSPKQLYMYGVSKACISVNSKNAEY 2489

Human  2560 FQFHTEDYFGKESLWTGKGIQLADGGWLIPSNDGKAGKEEFYRALCDTPGVDPKLISRIWVYNHY 2624
            |||..||:||||:|..|||.:||||||||||:|||||||||||||||||||||||||.:||.|||
  Rat  2490 FQFAIEDHFGKEALCAGKGFRLADGGWLIPSDDGKAGKEEFYRALCDTPGVDPKLISSVWVSNHY 2554

Human  2625 RWIIWKLAAMECAFPKEFANRCLSPERVLLQLKYRYDTEIDRSRRSAIKKIMERDDTAAKTLVLC 2689
            |||:|||||||.|||||||||||:|||||||||||||.|||.|.|||:|||:|||||||||||||
  Rat  2555 RWIVWKLAAMEFAFPKEFANRCLNPERVLLQLKYRYDVEIDNSSRSALKKILERDDTAAKTLVLC 2619

Human  2690 VSDIISLSANISETSSNKTSSADTQKVAIIELTDGWYAVKAQLDPPLLAVLKNGRLTVGQKIILH 2754
            ||||||||.|:||||.:|.||.|:.||..||||||||||||||||||||::|:||||||||||..
  Rat  2620 VSDIISLSTNVSETSGSKASSEDSNKVDTIELTDGWYAVKAQLDPPLLALVKSGRLTVGQKIITQ 2684

Human  2755 GAELVGSPDACTPLEAPESLMLKISANSTRPARWYTKLGFFPDPRPFPLPLSSLFSDGGNVGCVD 2819
            |||||||||||.|||||:||.|||||||||||||::|||||.|||||||||||||||||||||||
  Rat  2685 GAELVGSPDACAPLEAPDSLRLKISANSTRPARWHSKLGFFHDPRPFPLPLSSLFSDGGNVGCVD 2749

Human  2820 VIIQRAYPIQWMEKTSSGLYIFRNEREEEKEAAKYVEAQQKRLEALFTKIQEEFEEHEENTTKPY 2884
            ||:||.||:||:|||.||.|||||||||||||.::.|||||:|||||||:..|.:||||:..:..
  Rat  2750 VIVQRVYPLQWVEKTVSGSYIFRNEREEEKEALRFAEAQQKKLEALFTKVHTELKEHEEDIAQRR 2814

Human  2885 LPSRALTRQQVRALQDGAELYEAVKNAADPAYLEGY----------------------------- 2920
            :.|||||||||.|||||||||.||::|:||.:||.|                             
  Rat  2815 VLSRALTRQQVHALQDGAELYAAVQDASDPEHLEVYSALTGGRPARVGRTAAASAVSQCVKCPQT 2879

Human  2921 -FSEEQLRALNNHRQMLNDKKQAQIQLEIRKAMESAEQKEQGLSRDVTTVWKLRIVSYSKKEKDS 2984
             |||||||||||:||||:|||||:||.|.|||:|:|| ||:||||||:||||||:.||.|:|| |
  Rat  2880 CFSEEQLRALNNYRQMLSDKKQARIQSEFRKALEAAE-KEEGLSRDVSTVWKLRVTSYKKREK-S 2942

Human  2985 VILSIWRPSSDLYSLLTEGKRYRIYHLATSKSKSKSERANIQLAATKKTQYQQLPVSDEILFQIY 3049
            .:||||||||||.||||||:|||||||:.||||:|.|..:|||.|||:|||||||||.|.|.|:|
  Rat  2943 ALLSIWRPSSDLPSLLTEGQRYRIYHLSVSKSKNKFEWPSIQLTATKRTQYQQLPVSSETLLQLY 3007

Human  3050 QPREPLHFSKFLDPDFQPSCSEVDLIGFVVSVVKKTGLAPFVYLSDECYNLLAIKFWIDLNEDII 3114
            ||||.|.|||..||.|||.|||||::|.||||||..||||.|||||||.:||.:||.|||||| |
  Rat  3008 QPRELLPFSKLSDPAFQPPCSEVDVVGVVVSVVKPIGLAPLVYLSDECLHLLVVKFGIDLNED-I 3071

Human  3115 KPHMLIAASNLQWRPESKSGLLTLFAGDFSVFSASPKEGHFQETFNKMKNTVENIDILCNEAENK 3179
            ||.:|||||||||||||.|.:.|||||:||||||||||.||||....||:.:||||....|||.|
  Rat  3072 KPRVLIAASNLQWRPESTSRVPTLFAGNFSVFSASPKEAHFQERVTNMKHAIENIDTFYKEAEKK 3136

Human  3180 LMHILHANDPKWSTPTKDCTSGPYTAQIIP----GTGNKLLMSSPNCEIYYQSPLSLCMAKRKSV 3240
            |:.:|..:.||||||.||.|..||.|....    .:|.:|..|||..:..|:||||.|....||.
  Rat  3137 LIQVLKGDSPKWSTPNKDPTREPYPASTCSASDLASGGQLPRSSPTDQQSYRSPLSCCTPTGKST 3201

Human  3241 STPVSAQMTSKSCKGEKEIDDQKNCKKRRALDFLSRLPLPPPVSPICTFVSPAAQKAFQPPRSCG 3305
            ....||.|.:|||.||.||:|.|.|:|:||||.|||||||||:||:|||||||||||||||||||
  Rat  3202 PLAHSAWMAAKSCSGENEIEDPKTCRKKRALDLLSRLPLPPPLSPVCTFVSPAAQKAFQPPRSCG 3266

Human  3306 TKYETPIKKKELNSP-QMTPFKKFNEISLLESNSIADEELALINTQALLSGSTGEKQFISVSEST 3369
            |||.||:||:..:|| ...||:|.:.:|||:.:|:|||||||::||||:..|.|..:.:..|:||
  Rat  3267 TKYPTPLKKEGPSSPWSRAPFQKASGVSLLDCDSVADEELALLSTQALVPHSVGGSEQVFPSDST 3331

Human  3370 RTAPTSSEDYLRLKRRCTTSLIKEQESSQASTEECEKNKQDTITTK 3415
            ||...|:....|...|          |.:.|..:|..:....:..:
  Rat  3332 RTEGPSASTEARPANR----------SKRESLRDCRDDSDGKLAAE 3367

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
BRCA2NP_000050.3 Interaction with PALB2 1..40 29/38 (76%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 37..68 22/30 (73%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 358..381 12/22 (55%)
Interaction with NPM1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:21084279 639..1000 166/367 (45%)
BRCA2 1 1002..1036 30/33 (91%)
Interaction with RAD51. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P97929 1003..2082 557/1106 (50%)
BRCA2 1005..1033 CDD:459881 25/27 (93%)
BRCA2 1216..1243 CDD:459881 19/26 (73%)
Interaction with POLH. /evidence=ECO:0000269|PubMed:24485656 1338..1781 216/461 (47%)
Required for stimulation of POLH DNA polymerization activity 1410..1595 101/188 (54%)
BRCA2 1424..1452 CDD:459881 18/27 (67%)
BRCA2 1522..1548 CDD:459881 22/25 (88%)
BRCA2 1667..1695 CDD:459881 17/27 (63%)
BRCA2 1974..2002 CDD:459881 23/27 (85%)
BRCA2 8 2051..2085 24/33 (73%)
BRCA2 2055..2082 CDD:459881 19/26 (73%)
Interaction with HSF2BP. /evidence=ECO:0000269|PubMed:31242413 2270..2337 47/66 (71%)
Interaction with FANCD2 2350..2545 97/195 (50%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2430..2450 5/19 (26%)
Interaction with SEM1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:10373512, ECO:0000269|PubMed:16205630 2481..2832 285/350 (81%)
BRCA-2_helical 2481..2667 CDD:462700 148/185 (80%)
BRCA-2_OB1 2670..2796 CDD:462678 103/125 (82%)
Nuclear export signal, masked by interaction with SEM1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:24013206 2682..2698 15/15 (100%)
BRCA2DBD_OB2 2804..3054 CDD:239940 185/279 (66%)
BRCA-2_OB3 3052..3186 CDD:462679 92/133 (69%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 3393..3418 3/23 (13%)
Brca2XP_038945468.1 BRCA2 987..1015 CDD:459881 25/27 (93%)
BRCA2 1200..1228 CDD:459881 19/27 (70%)
BRCA2 1408..1436 CDD:459881 19/30 (63%)
BRCA2 1508..1534 CDD:459881 22/25 (88%)
BRCA2 1641..1669 CDD:459881 17/27 (63%)
BRCA2 1942..1970 CDD:459881 23/27 (85%)
BRCA-2_helical 2411..2597 CDD:462700 148/185 (80%)
BRCA-2_OB1 2600..2726 CDD:462678 103/125 (82%)
BRCA2DBD_OB2 2734..3012 CDD:239940 185/279 (66%)
BRCA-2_OB3 3010..3142 CDD:462679 91/132 (69%)

Return to query results.
Submit another query.