DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SREBF2 and Srebf2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_004590.2 Gene:SREBF2 / 6721 HGNCID:11290 Length:1141 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_150087.1 Gene:Srebf2 / 20788 MGIID:107585 Length:1130 Species:Mus musculus


Alignment Length:1141 Identity:1047/1141 - (91%)
Similarity:1092/1141 - (95%) Gaps:11/1141 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MDDSGELGGLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPGSGGSGSSSG 65
            ||:|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       .|
Mouse     1 MDESSELGVLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPG-------GG 58

Human    66 SSGSSSSSSNGRGSSSGAVDPSVQRSFTQVTLPSFSPSAASPQAPTLQVKVSPTSVPTTPRATPI 130
            |:|.|.::|:|||::.||.||:|||||:||.|.:|||||||||||.||||||    ||.|||||:
Mouse    59 SNGGSGNNSSGRGNNGGATDPAVQRSFSQVPLSTFSPSAASPQAPALQVKVS----PTPPRATPV 119

Human   131 LQPRPQPQPQPQTQLQQQTVMITPTFSTTPQTRIIQQPLIYQNAATSFQVLQPQVQSLVTSSQVQ 195
            |||||||||||..|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Mouse   120 LQPRPQPQPQPPAQLQQQTVMITPTFSTAPQTRIIQQPLIYQNAATSFQVLQPQVQSLVTSPQVQ 184

Human   196 PVTIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQTLAPATVQTVAAPQVQQVPVLVQPQIIKTDSLVLTTLKT 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   185 PVTIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQTLAPATVQTVAAPQVQQVPVLVQPQIIKTDSLVLTTLKT 249

Human   261 DGSPVMAAVQNPALTALTTPIQTAALQVPTLVGSSGTILTTMPVMMGQEKVPIKQVPGGVKQLEP 325
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||:|
Mouse   250 DGSPVMAAVQNPALTALTAPIQTAALQVPTLVGSNGTILTTMPVMMGQEKVPIKQVPGGVKQLDP 314

Human   326 PKEGERRTTHNIIEKRYRSSINDKIIELKDLVMGTDAKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQE 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   315 PKEGERRTTHNIIEKRYRSSINDKIIELKDLVMGTDAKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQE 379

Human   391 NMVLKLANQKNKLLKGIDLGSLVDNEVDLKIEDFNQNVLLMSPPASDSGSQAGFSPYSIDSEPGS 455
            ||||||||||||||||||||||||::|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   380 NMVLKLANQKNKLLKGIDLGSLVDSDVDLKIDDFNQNVLLMSPPASDSGSQAGFSPYSIDSEPGS 444

Human   456 PLLDDAKVKDEPDSPPVALGMVDRSRILLCVLTFLCLSFNPLTSLLQWGGAHDSDQHPHSGSGRS 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||::||||:||||||
Mouse   445 PLLDDAKVKDEPDSPPVALGMVDRSRILLCVLTFLGLSFNPLTSLLQWGGAHNTDQHPYSGSGRS 509

Human   521 VLSFESGSGGWFDWMMPTLLLWLVNGVIVLSVFVKLLVHGEPVIRPHSRSSVTFWRHRKQADLDL 585
            |||.|||:|||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Mouse   510 VLSLESGAGGWFDWMVPTLLLWLVNGVIVLSVFVKLLVHGEPVIRPHSRPSVTFWRHRKQADLDL 574

Human   586 ARGDFAAAAGNLQTCLAVLGRALPTSRLDLACSLSWNVIRYSLQKLRLVRWLLKKVFQCRRATPA 650
            |:|||||||.||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||
Mouse   575 AKGDFAAAAANLQTCLSVLGRALPTSRLDLACSLSWNVIRYSLQKLRLVRWLLKKVFQRWRATPA 639

Human   651 TEAGFEDEAKTSARDAALAYHRLHQLHITGKLPAGSACSDVHMALCAVNLAECAEEKIPPSTLVE 715
            |.||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||:|
Mouse   640 TAAGFEDEAKSSARDAALAYHRLHQLHITGKLPAGSACSDVHMALCAVNLAECAEEKILPSTLIE 704

Human   716 IHLTAAMGLKTRCGGKLGFLASYFLSRAQSLCGPEHSAVPDSLRWLCHPLGQKFFMERSWSVKSA 780
            |||||||||||||||||||||||||:|||||||||||.|||||||||||||||||||||||:|||
Mouse   705 IHLTAAMGLKTRCGGKLGFLASYFLNRAQSLCGPEHSTVPDSLRWLCHPLGQKFFMERSWSIKSA 769

Human   781 AKESLYCAQRNPADPIAQVHQAFCKNLLERAIESLVKPQAKKKAGDQEEESCEFSSALEYLKLLH 845
            ||||||||||:||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   770 AKESLYCAQRSPADPIAQVHQAFCKNLLERAVESLVKPQAKKKAGDQEEESCEFSSALEYLKLLH 834

Human   846 SFVDSVGVMSPPLSRSSVLKSALGPDIICRWWTSAITVAISWLQGDDAAVRSHFTKVERIPKALE 910
            |||||||.::.|.|.||||:||||||:||||||||:|:||||||||||||||.||:|||:|||||
Mouse   835 SFVDSVGFVTSPFSSSSVLRSALGPDVICRWWTSAVTMAISWLQGDDAAVRSRFTEVERVPKALE 899

Human   911 VTESPLVKAIFHACRAMHASLPGKADGQQSSFCHCERASGHLWSSLNVSGATSDPALNHVVQLLT 975
            |||||||||:|:.||||||||.|||||||:||||||||||||||||||||.||||:||||:||.|
Mouse   900 VTESPLVKAVFYTCRAMHASLSGKADGQQNSFCHCERASGHLWSSLNVSGTTSDPSLNHVIQLFT 964

Human   976 CDLLLSLRTALWQKQASASQAVGETYHASGAELAGFQRDLGSLRRLAHSFRPAYRKVFLHEATVR 1040
            ||||||||||||||||||||.:||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   965 CDLLLSLRTALWQKQASASQLLGETYHASGTELAGFQRDLGSLRRLAHSFRPAYRKVFLHEATVR 1029

Human  1041 LMAGASPTRTHQLLEHSLRRRTTQSTKHGEVDAWPGQRERATAILLACRHLPLSFLSSPGQRAVL 1105
            |||||||||||||||||||||.||:|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1030 LMAGASPTRTHQLLEHSLRRRPTQNTKHGEVDTWPGQRERATAILLACRHLPLSFLSSPGQRAVL 1094

Human  1106 LAEAARTLEKVGDRRSCNDCQQMIVKLGGGTAIAAS 1141
            |||||||||||||||||:||||||||||||||||||
Mouse  1095 LAEAARTLEKVGDRRSCSDCQQMIVKLGGGTAIAAS 1130

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SREBF2NP_004590.2 Transcriptional activation (acidic). /evidence=ECO:0000269|PubMed:35120642 1..50 45/48 (94%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 48..144 64/95 (67%)
Interaction with LMNA. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q3U1N2 237..491 247/253 (98%)
bHLHzip_SREBP2 326..402 CDD:381492 75/75 (100%)
Leucine-zipper 380..401 20/20 (100%)
Srebf2NP_150087.1 Transcriptional activation (acidic). /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P36956, ECO:0000250|UniProtKB:Q12772 1..50 45/48 (94%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 53..133 59/90 (66%)
Interaction with LMNA. /evidence=ECO:0000269|PubMed:11929849 226..480 247/253 (98%)
bHLHzip_SREBP2 315..391 CDD:381492 75/75 (100%)
Leucine-zipper 369..390 20/20 (100%)

Return to query results.
Submit another query.