Protein Alignment SMARCC2 and Smarcc2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001317217.1
• Gene: SMARCC2 / 6601
• HGNCID: 11105
• Length: 1245
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_001414181.1
• Gene: Smarcc2 / 685179
• RGDID: 1597704
• Length: 1247
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1250
• Identity: 1189/1250 - (95%)
• Similarity: 1209/1250 - (96%)
• Gaps: 8/1250 - (0%)

Human     1 MAVRKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLGKNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFG 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAVRKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLGKNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFG 65

Human    66 KHVSNAPLTKLPIKCFLDFKAGGSLCHILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKS 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 KHVSNAPLTKLPIKCFLDFKAGGSLCHILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKS 130

Human   131 LVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKLLGKLKDIIKRHQGTVTEDKNNASHVVYPVPGNLEEEEWVRPVM 195
            |||||||||||||||||||||||||||||:||||||::|||:||||||||.||||||||||||||
  Rat   131 LVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKLLGKLKDIVKRHQGTISEDKSNASHVVYPAPGNLEEEEWVRPVM 195

Human   196 KRDKQVLLHWGYYPDSYDTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVN 260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
  Rat   196 KRDKQVLLHWGYYPDSYDTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVS 260

Human   261 DDKNPVSRRKKISAKTLTDEVNSPDSDRRDKKGGNYKKRKRSPSPSPTPEAKKKNAKKGPSTPYT 325
            |||:|||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 DDKSPVSRRKKISAKTLTDEVNSPDADRRDKKGGNYKKRKRSPSPSPTPEAKKKNAKKGPSTPYT 325

Human   326 KSKRGHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQEDESMET 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||
  Rat   326 KSKRGHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQDDESMET 390

Human   391 TGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEFFNGKNK 455
            ||||||||||||||||||:.|||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 TGKDEDENSTGNKGEQTKSADLHEDNVTEQTHHIIVPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEFFNGKNK 455

Human   456 SKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGLINYQVDAESRP 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 SKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGLINYQVDAESRP 520

Human   521 TPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKTPQGRQVDADTKAGRKGKELDDLVPETAKGKPELQTSA 585
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
  Rat   521 TPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKPPQGRQVDADTKAGRKGKELDDLVPEAAKGKPELQGSA 585

Human   586 SQQMLNFPDKGKEKPTDMQNFGLRTDMYTKKNVPSKSKAAASATREWTEQETLLLLEALEMYKDD 650
            |||||||||||||||.||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 SQQMLNFPDKGKEKPADMQNFGLRTDMYTKKNIPSKSKAAASATREWTEQETLLLLEALEMYKDD 650

Human   651 WNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGPLAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVV 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 WNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGPLAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVV 715

Human   716 DPRVASAAAKSALEEFSKMKEEVPTALVEAHVRKVEEAAKVTGKADPAFGLESSGIAGTTSDEPE 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
  Rat   716 DPRVASAAAKSALEEFSKMKEEVPTALVEAHVRKVEEAAKVTGKADPAFGLESSGIAGTASDEPE 780

Human   781 RIEESGNDEARVEGQATDEKKEPKEPREGGGAIEEEAKEKTSEAPKKDEEKGKEGDSEKESEKSD 845
            ||||||.:|||.|.||.|||||||||||||||:||||||:.|||||||||||||.||||||||||
  Rat   781 RIEESGTEEARAESQAADEKKEPKEPREGGGAVEEEAKEEISEAPKKDEEKGKEADSEKESEKSD 845

Human   846 GDPIVDPEKEKEPKEGQEEVLKEVVESEGERKTKVERDIGEGNLSTAAAAALAAAAVKAKHLAAV 910
            |||||||||:|||.|||||.||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 GDPIVDPEKDKEPTEGQEEGLKEVAEPEGERKAKVERDIGEGNLSTAAAAALAAAAVKAKHLAAV 910

Human   911 EERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREREALEYQRQQLLADRQAFHMEQLKYAEM 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 EERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREREALEYQRQQLLADRQAFHMEQLKYAEM 975

Human   976 RARQQHFQQMHQQ-----QQQPPPALPPGSQPIPPTGAAGPPAVHGLAVAPASVVPAPAGSGAPP 1035
            ||||||||||.||     ...||||||||||||||||||.|..|||||||||||..||.|.||||
  Rat   976 RARQQHFQQMQQQPPPPPPPPPPPALPPGSQPIPPTGAAAPATVHGLAVAPASVASAPPGGGAPP 1040

Human  1036 GSLGPSEQIGQAGSTAGPQQQQPAGAPQPGAVPPGVPPPGPHGPSPFPNQQTPPSMMPGAVPGSG 1100
            |:|||||||||||:||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1041 GTLGPSEQIGQAGTTAGPQQPQQAGAPQPGAVPPGVPPPGPHGPSPFPNQQTPPSMMPGAVPGSG 1105

Human  1101 HPGVAGNAPLGLPFGMPPPPPPPAPSIIPFGSLADSISINLPAPPNLHGHHHHLPFAPGTLPPPN 1165
            |||||||||||||||: |.|||.||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||:||||
  Rat  1106 HPGVAGNAPLGLPFGL-PLPPPAAPSIIPFGSLADSISINLP-PPNLHG-HHHLPFAPGTIPPPN 1167

Human  1166 LPVSMANPLHPNLPATTTMPSSLPLGPGLGSAAAQSPAIVAAVQGNLLPSASPLPDPGTPLPPDP 1230
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Rat  1168 LPVSMANPLHPNLPATTTMPSSLPLGPGLGSAAAQSPAIVAAVQGSLLPSASPLPDPGTPLPPDP 1232

Human  1231 TAPSPGTVTPVPPPQ 1245
            |||||||||||||||
  Rat  1233 TAPSPGTVTPVPPPQ 1247

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SMARCC2	NP_001317217.1	SWIRM-assoc_2	4..420	CDD:465143	404/415 (97%)
		RSC8	379..>739	CDD:227584	350/359 (97%)
		SWIRM-assoc_3	715..781	CDD:465145	64/65 (98%)
		PTZ00121	<721..978	CDD:173412	240/256 (94%)
		SWIRM-assoc_1	<911..977	CDD:465142	65/65 (100%)
		PHA03247	<999..1234	CDD:223021	215/234 (92%)
Smarcc2	NP_001414181.1	SWIRM-assoc_2	4..420	CDD:465143	404/415 (97%)
		RSC8	379..>739	CDD:227584	350/359 (97%)
		SWIRM-assoc_3	715..781	CDD:465145	64/65 (98%)
		PTZ00121	<721..>957	CDD:173412	219/235 (93%)
		SWIRM-assoc_1	<911..977	CDD:465142	65/65 (100%)