Protein Alignment SMARCC2 and Smarcc2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001317217.1
• Gene: SMARCC2 / 6601
• HGNCID: 11105
• Length: 1245
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_001359324.1
• Gene: Smarcc2 / 68094
• MGIID: 1915344
• Length: 1244
• Species: Mus musculus
• Alignment Length: 1245
• Identity: 1204/1245 - (96%)
• Similarity: 1221/1245 - (98%)
• Gaps: 1/1245 - (0%)

Human     1 MAVRKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLGKNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFG 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MAVRKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLGKNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFG 65

Human    66 KHVSNAPLTKLPIKCFLDFKAGGSLCHILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKS 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 KHVSNAPLTKLPIKCFLDFKAGGSLCHILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKS 130

Human   131 LVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKLLGKLKDIIKRHQGTVTEDKNNASHVVYPVPGNLEEEEWVRPVM 195
            |||||||||||||||||||||||||||||:||||||::|||:|||||||||||||||||||||||
Mouse   131 LVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKLLGKLKDIVKRHQGTISEDKSNASHVVYPVPGNLEEEEWVRPVM 195

Human   196 KRDKQVLLHWGYYPDSYDTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVN 260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
Mouse   196 KRDKQVLLHWGYYPDSYDTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVS 260

Human   261 DDKNPVSRRKKISAKTLTDEVNSPDSDRRDKKGGNYKKRKRSPSPSPTPEAKKKNAKKGPSTPYT 325
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 DDKSPVSRRKKISAKTLTDEVNSPDSDRRDKKGGNYKKRKRSPSPSPTPEAKKKNAKKGPSTPYT 325

Human   326 KSKRGHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQEDESMET 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||
Mouse   326 KSKRGHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQDDESMET 390

Human   391 TGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEFFNGKNK 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   391 TGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEFFNGKNK 455

Human   456 SKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGLINYQVDAESRP 520
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Mouse   456 SKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGLINYQVDAESRP 520

Human   521 TPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKTPQGRQVDADTKAGRKGKELDDLVPETAKGKPELQTSA 585
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
Mouse   521 TPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKPPQGRQVDADTKAGRKGKELDDLVPETAKGKPELQSSA 585

Human   586 SQQMLNFPDKGKEKPTDMQNFGLRTDMYTKKNVPSKSKAAASATREWTEQETLLLLEALEMYKDD 650
            ||||||||:||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   586 SQQMLNFPEKGKEKPADMQNFGLRTDMYTKKNVPSKSKAAASATREWTEQETLLLLEALEMYKDD 650

Human   651 WNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGPLAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVV 715
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Mouse   651 WNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGPLAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVV 715

Human   716 DPRVASAAAKSALEEFSKMKEEVPTALVEAHVRKVEEAAKVTGKADPAFGLESSGIAGTTSDEPE 780
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Mouse   716 DPRVASAAAKSALEEFSKMKEEVPTALVEAHVRKVEEAAKVTGKADPAFGLESSGIAGTASDEPE 780

Human   781 RIEESGNDEARVEGQATDEKKEPKEPREGGGAIEEEAKEKTSEAPKKDEEKGKEGDSEKESEKSD 845
            ||||||.:|||.||||.|||||||||||||||:||||||:.||.|||||||||||||||||||||
Mouse   781 RIEESGTEEARPEGQAADEKKEPKEPREGGGAVEEEAKEEISEVPKKDEEKGKEGDSEKESEKSD 845

Human   846 GDPIVDPEKEKEPKEGQEEVLKEVVESEGERKTKVERDIGEGNLSTAAAAALAAAAVKAKHLAAV 910
            |||||||||:|||.||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   846 GDPIVDPEKDKEPTEGQEEVLKEVAEPEGERKTKVERDIGEGNLSTAAAAALAAAAVKAKHLAAV 910

Human   911 EERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREREALEYQRQQLLADRQAFHMEQLKYAEM 975
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Mouse   911 EERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREREALEYQRQQLLADRQAFHMEQLKYAEM 975

Human   976 RARQQHFQQMHQQQQQPPPALPPGSQPIPPTGAAGPPAVHGLAVAPASVVPAPAGSGAPPGSLGP 1040
            ||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||.||:|..||.|||||||||||
Mouse   976 RARQQHFQQMHQQQQQQPPTLPPGSQPIPPTGAAGPPTVHGLAVPPAAVASAPPGSGAPPGSLGP 1040

Human  1041 SEQIGQAGSTAGPQQQQPAGAPQPGAVPPGVPPPGPHGPSPFPNQQTPPSMMPGAVPGSGHPGVA 1105
            ||||||||:||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Mouse  1041 SEQIGQAGTTAGPQQPQQAGAPQPGAVPPGVPPPGPHGPSPFPNQPTPPSMMPGAVPGSGHPGVA 1105

Human  1106 GNAPLGLPFGMPPPPPPPAPSIIPFGSLADSISINLPAPPNLHGHHHHLPFAPGTLPPPNLPVSM 1170
            ||||||||||| |||||.|||:|||||||||||||||.|||||||||||||||||:|||||||||
Mouse  1106 GNAPLGLPFGM-PPPPPAAPSVIPFGSLADSISINLPPPPNLHGHHHHLPFAPGTIPPPNLPVSM 1169

Human  1171 ANPLHPNLPATTTMPSSLPLGPGLGSAAAQSPAIVAAVQGNLLPSASPLPDPGTPLPPDPTAPSP 1235
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1170 ANPLHPNLPATTTMPSSLPLGPGLGSAAAQSPAIVAAVQGNLLPSASPLPDPGTPLPPDPTAPSP 1234

Human  1236 GTVTPVPPPQ 1245
            ||||||||||
Mouse  1235 GTVTPVPPPQ 1244

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SMARCC2	NP_001317217.1	SWIRM-assoc_2	4..420	CDD:465143	408/415 (98%)
		RSC8	379..>739	CDD:227584	354/359 (99%)
		SWIRM-assoc_3	715..781	CDD:465145	64/65 (98%)
		PTZ00121	<721..978	CDD:173412	243/256 (95%)
		SWIRM-assoc_1	<911..977	CDD:465142	65/65 (100%)
		PHA03247	<999..1234	CDD:223021	219/234 (94%)
Smarcc2	NP_001359324.1	SWIRM-assoc_2	4..420	CDD:465143	408/415 (98%)
		RSC8	379..>739	CDD:227584	354/359 (99%)
		SWIRM-assoc_3	715..781	CDD:465145	64/65 (98%)
		PTZ00121	<721..>957	CDD:173412	222/235 (94%)
		SWIRM-assoc_1	<911..977	CDD:465142	65/65 (100%)
		PHA03247	<994..1233	CDD:223021	223/239 (93%)