Protein Alignment SMARCC1 and Smarcc1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_003065.3
• Gene: SMARCC1 / 6599
• HGNCID: 11104
• Length: 1105
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_001400502.1
• Gene: Smarcc1 / 301020
• RGDID: 1304850
• Length: 1102
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1103
• Identity: 1052/1103 - (95%)
• Similarity: 1072/1103 - (97%)
• Gaps: 2/1103 - (0%)

Human     3 AAAGGGGPGTAVGATGSGIAAAAAGLAVYRRKDGGPATKFWESPETVSQLDSVRVWLGKHYKKYV 67
            |...|||||.|.||.|:|.||||:|||||||||||||:||||||:||||||||||||||||||||
  Rat     2 ATTAGGGPGAAAGAVGAGGAAAASGLAVYRRKDGGPASKFWESPDTVSQLDSVRVWLGKHYKKYV 66

Human    68 HADAPTNKTLAGLVVQLLQFQEDAFGKHVTNPAFTKLPAKCFMDFKAGGALCHILGAAYKYKNEQ 132
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
  Rat    67 HADAPTNKTLAGLVVQLLQFQEDAFGKHVTNPAFTKLPAKCFMDFKAGGTLCHILGAAYKYKNEQ 131

Human   133 GWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKLANKLKDIIKRHQGTFTD 197
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   132 GWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKLANKLKDIIKRHQGTFTD 196

Human   198 EKSKASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSYDTWVHSNDVDAEIEDPPIPEKP 262
            ||||||||||||.|||:||||||||||::|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
  Rat   197 EKSKASHHIYPYPSSQEDEEWLRPVMRRDKQVLVHWGFYPDSYDTWVHSNDVDAEIEDAPIPEKP 261

Human   263 WKVHVKWILDTDIFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRISTKNEEPVRSPERRDRKASANARKRKH 327
            ||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
  Rat   262 WKVHVKWILDTDVFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRISTKNEEPVRSPERRERKASANARKRKH 326

Human   328 SPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRSQKEEDEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNLK 392
            ||||||||.||||||||||||||||||||:||:|||||||||||||||||||||||:||||||.|
  Rat   327 SPSPPPPTATESRKKSGKKGQASLYGKRRNQKDEDEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVLLPKNVNPK 391

Human   393 KDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVTAGGKEDEDPAKGDQSRSVDLGEDNVTEQTNHIIIPSYASW 457
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||:|||.|||.|.||||||||||||||||||||
  Rat   392 KDSENTPVKGGTVADLDEQDEEAVTTGGKEDEDPSKGDPSRSADAGEDNVTEQTNHIIIPSYASW 456

Human   458 FDYNCIHVIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAV 522
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   457 FDYNCIHVIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAV 521

Human   523 MRVHAFLEQWGLVNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQVPAAQQMLNFPE 587
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   522 MRVHAFLEQWGLVNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQVPAAQQMLNFPE 586

Human   588 KNKEKPVDLQNFGLRTDIYSKKTLAKSKGASAGREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSR 652
            ||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   587 KNKEKPIDLQNFGLRTDIYSKKTLAKSKGASAGREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSR 651

Human   653 TQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLGPLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKA 717
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   652 TQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLGPLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKA 716

Human   718 ALEEFSRVREEVPLELVEAHVKKVQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPEKLEGAEEEKME 782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||
  Rat   717 ALEEFSRVREEVPLELVEAHVKKVQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPEKLEGSEEEKME 781

Human   783 ADPDGQQPEKAENKVENETDEGDKAQDGENEKNSEKEQDSEVSEDTKSEEKETEENKELTDTCKE 847
            .|||||||||||||.|||:|||||.||||||||||||:||:.|||.|.||||.||||||||||||
  Rat   782 TDPDGQQPEKAENKGENESDEGDKIQDGENEKNSEKERDSDTSEDVKPEEKENEENKELTDTCKE 846

Human   848 RESDTGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLR 912
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   847 RESDTGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLR 911

Human   913 HFEELETIMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQQQHGQNPQQAHQHSGGP 977
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||
  Rat   912 HFEELETIMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQQQHGQPPQQAHQHPGGP 976

Human   978 GLAPLGAAGHPGMMPHQQPPPYPLMHHQMPPPHPPQPGQIPGPGSMMPGQHMPGRMIPTVAANIH 1042
            |||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
  Rat   977 GLAPLGAAGHPGMMPHQQPPPYPMMHHQMPPPHPPQPGQIPGPGSMMPGQPMPGRMIPTVAANIH 1041

Human  1043 PSGSGPTPPGMPPMPGNILGPRVPLTAPNGMYPPPPQQQPPPPPPADGVPPPPAPGPPASAAP 1105
            |:||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||.|||||||.|
  Rat  1042 PTGSGPTPPGMPPMPGNILGPRVPLTAPNGMYPPPPQQ--PPPPPADGVPPPPVPGPPASATP 1102

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SMARCC1	NP_003065.3	MarR-like, BRCT and chromo domains module. /evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU01376	28..302		264/273 (97%)
		SWIRM-assoc_2	32..445	CDD:465143	391/412 (95%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	296..439		130/142 (92%)
		RSC8	444..>710	CDD:227584	264/265 (100%)
		SWIRM-assoc_3	706..772	CDD:465145	65/65 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	745..860		103/114 (90%)
		SWIRM-assoc_1	883..954	CDD:465142	70/70 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	956..1028		68/71 (96%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1041..1105		59/63 (94%)
Smarcc1	NP_001400502.1	SWIRM-assoc_2	31..444	CDD:465143	391/412 (95%)
		RSC8	443..>709	CDD:227584	264/265 (100%)
		SWIRM-assoc_3	705..771	CDD:465145	65/65 (100%)
		Caldesmon	738..>954	CDD:460421	204/215 (95%)
		SWIRM-assoc_1	882..953	CDD:465142	70/70 (100%)