Protein Alignment SMARCA4 and Smarca4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001122321.1
• Gene: SMARCA4 / 6597
• HGNCID: 11100
• Length: 1679
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: XP_063120900.1
• Gene: Smarca4 / 171379
• RGDID: 621728
• Length: 1650
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1679
• Identity: 1636/1679 - (97%)
• Similarity: 1645/1679 - (97%)
• Gaps: 29/1679 - (1%)

Human     1 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGPSPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPIPTQGPGGYP 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
  Rat     1 MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGPSPGSAHSMMGPSPGPPSAGHPMPTQGPGGYP 65

Human    66 QDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRSGGHAGMGPPPSPMDQHSQGYPSPLGGSEHA 130
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 QDNMHQMHKPMESMHEKGMPDDPRYNQMKGMGMRSGAHTGMGPPPSPMDQHSQGYPSPLGGSEHA 130

Human   131 SSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQNQLHQLRAQIMAYKMLARGQP 195
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 SSPVPASGPSSGPQMSSGPGGAPLDGSDPQALGQQNRGPTPFNQNQLHQLRAQIMAYKMLARGQP 195

Human   196 LPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGPGPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNM 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 LPDHLQMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGPGPGPGPGPGPAPPNYSRPHGMGGPNM 260

Human   261 PPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAAPTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAVPPAASPV 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 PPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAAPTSTPQKLIPPQPTGRPSPAPPAVPPAASPV 325

Human   326 MPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQSRITPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPG 390
            ||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 MPPQTQSPGQPAQPAPLVPLHQKQSRITPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPG 390

Human   391 SLAGDLRTKATIELKALRLLNFQRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEK 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 SLAGDLRTKATIELKALRLLNFQRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREARITEK 455

Human   456 LEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKLTKAVATYHANTEREQKKENE 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||:|||||||||||||||||||||||
  Rat   456 LEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSILQHAKDFREYHRSVTGKLQKLTKAVATYHANTEREQKKENE 520

Human   521 RIEKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKK 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 RIEKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQKKDKRLAYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKK 585

Human   586 KKKAENAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYE 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 KKKAENAEGQTPAIGPDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYE 650

Human   651 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENAKQDVD 715
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQPAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENAKQDVD 715

Human   716 DEYGVSQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADE 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 DEYGVSQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADE 780

Human   781 MGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAARRAFV 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 MGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAARRAFV 845

Human   846 PQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRLLLT 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 PQLRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRLLLT 910

Human   911 GTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPF 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 GTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPF 975

Human   976 LLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIM 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 LLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIM 1040

Human  1041 QLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIVQGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQM 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1041 QLRKICNHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIVQGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQM 1105

Human  1106 TSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADT 1170
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1106 TSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLKTFNEPGSEYFIFLLSTRAGGLGLNLQSADT 1170

Human  1171 VIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFD 1235
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1171 VIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVRVLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFD 1235

Human  1236 QKSSSHERRAFLQAILEHEEQDESRHCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDE 1300
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1236 QKSSSHERRAFLQAILEHEEQDESRHCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDE 1300

Human  1301 TVNQMIARHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEK 1365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1301 TVNQMIARHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKDDAEVERLTCEEEEEK 1365

Human  1366 MFGRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKKITGKDIHDTASSVARGLQFQRGLQFCTRASKAIEEGTLE 1430
            |||||||||||||||||||||||||.:                             |||||||||
  Rat  1366 MFGRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKTL-----------------------------KAIEEGTLE 1401

Human  1431 EIEEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMK 1495
            |||||||||||||||||||:||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1402 EIEEEVRQKKSSRKRKRDSEAGSSTPTTSTRSRDKDEESKKQKKRGRPPAEKLSPNPPNLTKKMK 1466

Human  1496 KIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKD 1560
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1467 KIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYELIRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKD 1531

Human  1561 VMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSV 1625
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1532 VMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDSIVLQSVFTSVRQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSV 1596

Human  1626 KVKIKLGRKEKAQDRLKGGRRRPSRGSRAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED 1679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat  1597 KVKIKLGRKEKAQDRLKGGRRRPSRGSRAKPVVSDDDSDEEQEEDRSGSGSEED 1650

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SMARCA4	NP_001122321.1	DEGH box	881..884		2/2 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1254..1299		44/44 (100%)
		SnAC	1322..1389	CDD:464219	66/66 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1432..1492		57/59 (97%)
		Bromo_SNF2L2	1490..1596	CDD:99947	105/105 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1596..1679		81/82 (99%)
		KIKL. /evidence=ECO:0000269|PubMed:29567837	1628..1631		2/2 (100%)
		Necessary for interaction with SS18L1/CREST. /evidence=ECO:0000250	1..282		275/280 (98%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1..177		170/175 (97%)
		Med15	42..>222	CDD:312941	174/179 (97%)
		QLQ	171..205	CDD:462622	33/33 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	198..352		152/153 (99%)
		Smc	<364..>570	CDD:440809	203/205 (99%)
		HSA	460..532	CDD:214727	69/71 (97%)
		RNA-binding region which is sufficient for binding to lncRNA Evf2. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q3TKT4	462..728		262/265 (99%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	577..610		32/32 (100%)
		BRK	612..656	CDD:197800	43/43 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	647..699		50/51 (98%)
		DEXHc_SMARCA4	731..981	CDD:350820	249/249 (100%)
		PLN03142	750..>1232	CDD:215601	481/481 (100%)
		Sufficient for interaction with DLX1. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q3TKT4	837..916		78/78 (100%)
Smarca4	XP_063120900.1	None