DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SLC12A3 and slc12a3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000330.3 Gene:SLC12A3 / 6559 HGNCID:10912 Length:1030 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001038545.1 Gene:slc12a3 / 565439 ZFINID:ZDB-GENE-030131-9505 Length:1012 Species:Danio rerio


Alignment Length:1021 Identity:652/1021 - (63%)
Similarity:813/1021 - (79%) Gaps:28/1021 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    20 FTISTLLSSDEP----SPPAAYDSSHPSHLTHSSTFCMRTFGYNTIDVVPTYEHYANSTQPGEPR 80
            |::|:|.:.|:.    ...::||:...:..: |..|.    ||:|:|..|:|:.|.|:...|..:
Zfish    10 FSVSSLSNGDDRKFSLGGCSSYDTDSVASRS-SGVFS----GYDTLDAPPSYDFYTNTEVFGRAK 69

Human    81 KVRPTLADLHSFLKQEGRHLHALAFDSRPSHEMTDGLVEGEAGTSSE---KNPEEPVRFGWVKGV 142
            |.||:|.:|||..:.          |..|.....:..|:.::....:   :.|.||.||||.:||
Zfish    70 KSRPSLFELHSNPQD----------DPSPPPLYEESSVDKQSPEDEDEPTEPPPEPARFGWAQGV 124

Human   143 MIRCMLNIWGVILYLRLPWITAQAGIVLTWIIILLSVTVTSITGLSISAISTNGKVKSGGTYFLI 207
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||:|.::|.|||||.|||:||||||.|||||||
Zfish   125 MIRCMLNIWGVILYLRLPWITAQAGIGLTWIIILVSSSITGITGLSTSAIATNGKVKGGGTYFLI 189

Human   208 SRSLGPELGGSIGLIFAFANAVGVAMHTVGFAETVRDLLQEYGAPIVDPINDIRIIAVVSVTVLL 272
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||:.|:||....:||.:||||||.|::||.||
Zfish   190 SRSLGPELGGSIGLIFAFANAVAVAMHTVGFAETVQVLMQETEVSMVDKLNDIRIIGVITVTCLL 254

Human   273 AISLAGMEWESKAQVLFFLVIMVSFANYLVGTLIPPSEDKASKGFFSYRADIFVQNLVPDWRGPD 337
            |||:||||||||||||||.|||:|||:|::||:||.:..|.::||||||||||..|.||.||||:
Zfish   255 AISMAGMEWESKAQVLFFFVIMISFASYIIGTIIPATPQKQARGFFSYRADIFATNFVPGWRGPE 319

Human   338 GTFFGMFSIFFPSATGILAGANISGDLKDPAIAIPKGTLMAIFWTTISYLAISATIGSCVVRDAS 402
            |:||||||||||||||||||||||||||||.:|||:||::||||||:|||.||||||||||||||
Zfish   320 GSFFGMFSIFFPSATGILAGANISGDLKDPNVAIPRGTMLAIFWTTVSYLIISATIGSCVVRDAS 384

Human   403 GVLNDTVTPGWGACEGLACSYGWNFTECTQQHSCHYGLINYYQTMSMVSGFAPLITAGIFGATLS 467
            |.:|||::...|.|.|:.|:||||||:|...::|.|||.||||:|||||..||||||||||||||
Zfish   385 GDVNDTISSLTGECLGVGCNYGWNFTDCMTNNTCTYGLSNYYQSMSMVSAVAPLITAGIFGATLS 449

Human   468 SALACLVSAAKVFQCLCEDQLYPLIGFFGKGYGKNKEPVRGYLLAYAIAVAFIIIAELNTIAPII 532
            |||||||||.|||||||:|:|||.|||||||||||.||:|.|||||.||:.||:|||||||||||
Zfish   450 SALACLVSAPKVFQCLCKDKLYPGIGFFGKGYGKNNEPLRSYLLAYIIAICFILIAELNTIAPII 514

Human   533 SNFFLCSYALINFSCFHASITNSPGWRPSFQYYNKWAALFGAIISVVIMFLLTWWAALIAIGVVL 597
            ||||||||||||||||||||||||||||:|::|:||.:|.||::||:|||||||||||||||:|:
Zfish   515 SNFFLCSYALINFSCFHASITNSPGWRPTFRFYSKWLSLLGAVVSVIIMFLLTWWAALIAIGIVI 579

Human   598 FLLLYVIYKKPEVNWGSSVQAGSYNLALSYSVGLNEVEDHIKNYRPQCLVLTGPPNFRPALVDFV 662
            |||.||:|||||||||||:||.|||:|||..||||:|||||||||||||||:|||..||:||||:
Zfish   580 FLLGYVLYKKPEVNWGSSMQASSYNMALSQCVGLNQVEDHIKNYRPQCLVLSGPPCARPSLVDFI 644

Human   663 GTFTRNLSLMICGHVLI-GPHKQRMPELQLIANGHTKWLNKRKIKAFYSDVIAEDLRRGVQILMQ 726
            |.||:|.|||||.:||. ||.......:   ::.|.||||.||||:||..|:|:|||.|||:|:|
Zfish   645 GAFTKNQSLMICANVLASGPSPGTADSM---SSTHLKWLNNRKIKSFYHTVVADDLRTGVQMLLQ 706

Human   727 AAGLGRMKPNILVVGFKKNWQSAHPATVEDYIGILHDAFDFNYGVCVMRMREGLNVSKMMQAHIN 791
            :.||||||||:||:|:||||:...|..:|:|:||||||||..|||||:||:|||::::.:||.:|
Zfish   707 STGLGRMKPNVLVMGYKKNWRKVQPGIIENYVGILHDAFDLQYGVCVLRMKEGLDITRTIQAQVN 771

Human   792 PVFDPA-EDGKEA-SARGARPSVSGALDPKALVKEEQATTIFQSEQGKKTIDIYWLFDDGGLTLL 854
            ..|:.: |.|.:. |.....|::..:|||:.|:...|.:|:||:.|||||||:|||.||||||||
Zfish   772 LGFETSTEQGLDTNSTAPTSPTIEASLDPETLMALTQPSTLFQTRQGKKTIDVYWLSDDGGLTLL 836

Human   855 IPYLLGRKRRWSKCKIRVFVGGQINRMDQERKAIISLLSKFRLGFHEVHILPDINQNPRAEHTKR 919
            |||||.||:||.:||:||||||:..::::::|.:..|:|:|||||.::.:|||||..|::||.::
Zfish   837 IPYLLTRKKRWGRCKVRVFVGGEAQQIEEQKKELKGLISRFRLGFKDIQVLPDINGAPQSEHIRK 901

Human   920 FEDMIAPFRLNDGFKDEATVNEMRRDCPWKISDEEITKNRVKSLRQVRLNEIVLDYSRDAALIVI 984
            |||.|||:|::...||....:|..::..|.:||||:...:.|||||:||||::.||||||||||:
Zfish   902 FEDFIAPYRVSSVQKDGQEADEATKEFSWMVSDEEMETFKAKSLRQIRLNEVIQDYSRDAALIVV 966

Human   985 TLPIGRKGKCPSSLYMAWLETLSQDLRPPVILIRGNQENVLTFYCQ 1030
            |:|:||:|.|||.|||||||.:|:||||||:|:|||||||||.|||
Zfish   967 TMPVGRRGSCPSPLYMAWLEIVSRDLRPPVLLVRGNQENVLTQYCQ 1012

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SLC12A3NP_000330.3 2a30 59..1029 CDD:273347 639/975 (66%)
Scissor helix. /evidence=ECO:0000269|PubMed:36792826, ECO:0007744|PDB:8FHO, ECO:0007744|PDB:8FHP, ECO:0007744|PDB:8FHQ, ECO:0007744|PDB:8FHR, ECO:0007744|PDB:8FHT 615..630 9/14 (64%)
slc12a3NP_001038545.1 2a30 48..1011 CDD:273347 639/975 (66%)

Return to query results.
Submit another query.