DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SLC12A3 and Slc12a3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000330.3 Gene:SLC12A3 / 6559 HGNCID:10912 Length:1030 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_063134335.1 Gene:Slc12a3 / 54300 RGDID:3686 Length:1028 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1030 Identity:931/1030 - (90%)
Similarity:970/1030 - (94%) Gaps:2/1030 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAELPTTETPGDATLCSGRFTISTLLSSDEPSPPAAYDSSHPSHLTHSSTFCMRTFGYNTIDVVP 65
            |||||.||.|||| ||||||||||||..||| ||||.|:|.||||||.||..:||||||||||||
  Rat     1 MAELPVTEMPGDA-LCSGRFTISTLLGGDEP-PPAACDNSQPSHLTHGSTLYLRTFGYNTIDVVP 63

Human    66 TYEHYANSTQPGEPRKVRPTLADLHSFLKQEGRHLHALAFDSRPSHEMTDGLVEGEAGTSSEKNP 130
            .|||||||..||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||:||||||.|.|.:|||:|
  Rat    64 AYEHYANSALPGEPRKVRPTLADLHSFLKQEGSHLHALAFDGRPGHELTDGLVEDETGANSEKSP 128

Human   131 EEPVRFGWVKGVMIRCMLNIWGVILYLRLPWITAQAGIVLTWIIILLSVTVTSITGLSISAISTN 195
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||.|||||||||||||||
  Rat   129 GEPVRFGWVKGVMIRCMLNIWGVILYLRLPWITAQAGIVLTWLIILLSVMVTSITGLSISAISTN 193

Human   196 GKVKSGGTYFLISRSLGPELGGSIGLIFAFANAVGVAMHTVGFAETVRDLLQEYGAPIVDPINDI 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||
  Rat   194 GKVKSGGTYFLISRSLGPELGGSIGLIFAFANAVGVAMHTVGFAETVRDLLQENGTPIVDPINDI 258

Human   261 RIIAVVSVTVLLAISLAGMEWESKAQVLFFLVIMVSFANYLVGTLIPPSEDKASKGFFSYRADIF 325
            |||.||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:|||||||:||..|||
  Rat   259 RIIGVVTVTVLLAISLAGMEWESKAQVLFFLVIMVSFANYLVGTLIPASKDKASKGFYSYHGDIF 323

Human   326 VQNLVPDWRGPDGTFFGMFSIFFPSATGILAGANISGDLKDPAIAIPKGTLMAIFWTTISYLAIS 390
            ||||||||||.||:|||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
  Rat   324 VQNLVPDWRGIDGSFFGMFSIFFPSATGILAGANISGDLKDPAVAIPKGTLMAIFWTTISYLAIS 388

Human   391 ATIGSCVVRDASGVLNDTVTPGWGACEGLACSYGWNFTECTQQHSCHYGLINYYQTMSMVSGFAP 455
            |||||||||||||.:|||||||.|.||||||.||||||||:|||||.||||||||||||||.|||
  Rat   389 ATIGSCVVRDASGDVNDTVTPGPGLCEGLACGYGWNFTECSQQHSCRYGLINYYQTMSMVSAFAP 453

Human   456 LITAGIFGATLSSALACLVSAAKVFQCLCEDQLYPLIGFFGKGYGKNKEPVRGYLLAYAIAVAFI 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   454 LITAGIFGATLSSALACLVSAAKVFQCLCEDQLYPLIGFFGKGYGKNKEPVRGYLLAYAIAVAFI 518

Human   521 IIAELNTIAPIISNFFLCSYALINFSCFHASITNSPGWRPSFQYYNKWAALFGAIISVVIMFLLT 585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:||||||||:||||||||||
  Rat   519 IIAELNTIAPIISNFFLCSYALINFSCFHASITNSPGWRPSFRYYSKWAALFGAVISVVIMFLLT 583

Human   586 WWAALIAIGVVLFLLLYVIYKKPEVNWGSSVQAGSYNLALSYSVGLNEVEDHIKNYRPQCLVLTG 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   584 WWAALIAIGVVLFLLLYVIYKKPEVNWGSSVQAGSYNLALSYSVGLNEVEDHIKNYRPQCLVLTG 648

Human   651 PPNFRPALVDFVGTFTRNLSLMICGHVLIGPHKQRMPELQLIANGHTKWLNKRKIKAFYSDVIAE 715
            ||||||||||||.|||:||||||||||||.|.|||:|||:|||:|||||||||||||||||||||
  Rat   649 PPNFRPALVDFVSTFTQNLSLMICGHVLIAPGKQRVPELRLIASGHTKWLNKRKIKAFYSDVIAE 713

Human   716 DLRRGVQILMQAAGLGRMKPNILVVGFKKNWQSAHPATVEDYIGILHDAFDFNYGVCVMRMREGL 780
            |||.||||||||:|||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||:|||||||
  Rat   714 DLRSGVQILMQASGLGRMKPNILVVGFKKNWQSAHPATLEDYIGILHDAFDFNYGVCIMRMREGL 778

Human   781 NVSKMMQAHINPVFDPAEDGKEASARGARPSVSGALDPKALVKEEQATTIFQSEQGKKTIDIYWL 845
            |||:.:|.||||:|||.|..:.||.|.|.|||||...|:|||:|||.:|||||||||||||||||
  Rat   779 NVSEALQTHINPMFDPREGDRRASGRKAGPSVSGMAAPEALVQEEQTSTIFQSEQGKKTIDIYWL 843

Human   846 FDDGGLTLLIPYLLGRKRRWSKCKIRVFVGGQINRMDQERKAIISLLSKFRLGFHEVHILPDINQ 910
            ||||||||||||||.||:||.||||||||||||||||:||||||||||||||||||||:||||||
  Rat   844 FDDGGLTLLIPYLLHRKKRWGKCKIRVFVGGQINRMDEERKAIISLLSKFRLGFHEVHVLPDINQ 908

Human   911 NPRAEHTKRFEDMIAPFRLNDGFKDEATVNEMRRDCPWKISDEEITKNRVKSLRQVRLNEIVLDY 975
            .|:.|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|||:|||||||||||:|||
  Rat   909 KPQVEHTKRFEDMIAPFRLNDGFKDEATVAEMRRDYPWKISDEEINKNRIKSLRQVRLNEILLDY 973

Human   976 SRDAALIVITLPIGRKGKCPSSLYMAWLETLSQDLRPPVILIRGNQENVLTFYCQ 1030
            |||||||::||||||||||||||||||||||||||.|||:|||||||||||||||
  Rat   974 SRDAALIILTLPIGRKGKCPSSLYMAWLETLSQDLSPPVLLIRGNQENVLTFYCQ 1028

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SLC12A3NP_000330.3 2a30 59..1029 CDD:273347 883/969 (91%)
Scissor helix. /evidence=ECO:0000269|PubMed:36792826, ECO:0007744|PDB:8FHO, ECO:0007744|PDB:8FHP, ECO:0007744|PDB:8FHQ, ECO:0007744|PDB:8FHR, ECO:0007744|PDB:8FHT 615..630 14/14 (100%)
Slc12a3XP_063134335.1 None

Return to query results.
Submit another query.