DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SLC12A3 and Slc12a3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000330.3 Gene:SLC12A3 / 6559 HGNCID:10912 Length:1030 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017168114.1 Gene:Slc12a3 / 20497 MGIID:108114 Length:1009 Species:Mus musculus


Alignment Length:1037 Identity:917/1037 - (88%)
Similarity:956/1037 - (92%) Gaps:35/1037 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAELPTTETPGDATLCSGRFTISTLLSSDEPSPPAAYDSSHPSHLTHSSTFCMRTFGYNTIDVVP 65
            |||||.||.|||| |||||||||||:..||| ||||.|||.||||||.||..|||||||||||||
Mouse     1 MAELPVTELPGDA-LCSGRFTISTLMGGDEP-PPAACDSSQPSHLTHGSTLYMRTFGYNTIDVVP 63

Human    66 TYEHYANSTQPGEPRKVRPTLADLHSFLKQEGRHLHALAFDSRPSHEMTDGLVEGEAGTSSEKNP 130
            .|||||||..||||||||||||||||||||||.||||||||.|...|:||||||.|.||:|||:|
Mouse    64 AYEHYANSALPGEPRKVRPTLADLHSFLKQEGSHLHALAFDGRQGRELTDGLVEDETGTNSEKSP 128

Human   131 EEPVRFGWVKGVMIRCMLNIWGVILYLRLPWITAQAGIVLTWIIILLSVTVTSITGLSISAISTN 195
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||.|||||||||||||||
Mouse   129 GEPVRFGWVKGVMIRCMLNIWGVILYLRLPWITAQAGIVLTWLIILLSVMVTSITGLSISAISTN 193

Human   196 GKVKSGGTYFLISRSLGPELGGSIGLIFAFANAVGVAMHTVGFAETVRDLL-------QEYGAPI 253
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||.||
Mouse   194 GKVKSGGTYFLISRSLGPELGGSIGLIFAFANAVGVAMHTVGFAETVRDLLQLACSPTQEYGTPI 258

Human   254 VDPINDIRIIAVVSVTVLLAISLAGMEWESKAQVLFFLVIMVSFANYLVGTLIPPSEDKASKGFF 318
            ||||||||||.||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||:
Mouse   259 VDPINDIRIIGVVTVTVLLAISLAGMEWESKAQVLFFLVIMVSFANYLVGTLIPASEDKASKGFY 323

Human   319 SYRADIFVQNLVPDWRGPDGTFFGMFSIFFPSATGILAGANISGDLKDPAIAIPKGTLMAIFWTT 383
            ||..|||||||||||||.||:|||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
Mouse   324 SYHGDIFVQNLVPDWRGIDGSFFGMFSIFFPSATGILAGANISGDLKDPAVAIPKGTLMAIFWTT 388

Human   384 ISYLAISATIGSCVVRDASGVLNDTVTPGWGACEGLACSYGWNFTECTQQHSCHYGLINYYQTMS 448
            ||||||||||||||||||||.:|||:|||.|.||||||.||||||||:||.||.|||||||||||
Mouse   389 ISYLAISATIGSCVVRDASGDVNDTMTPGPGPCEGLACGYGWNFTECSQQRSCRYGLINYYQTMS 453

Human   449 MVSGFAPLITAGIFGATLSSALACLVSAAKVFQCLCEDQLYPLIGFFGKGYGKNKEPVRGYLLAY 513
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||
Mouse   454 MVSAFAPLITAGIFGATLSSALACLVSAAKVFQCLCEDQLYPLIGFFGKGYGKNREPVRGYLLAY 518

Human   514 AIAVAFIIIAELNTIAPIISNFFLCSYALINFSCFHASITNSPGWRPSFQYYNKWAALFGAIISV 578
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:||||||||:|||
Mouse   519 AIAVAFIIIAELNTIAPIISNFFLCSYALINFSCFHASITNSPGWRPSFRYYSKWAALFGAVISV 583

Human   579 VIMFLLTWWAALIAIGVVLFLLLYVIYKKPEVNWGSSVQAGSYNLALSYSVGLNEVEDHIKNYRP 643
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   584 VIMFLLTWWAALIAIGVVLFLLLYVIYKKPEVNWGSSVQAGSYNLALSYSVGLNEVEDHIKNYRP 648

Human   644 QCLVLTGPPNFRPALVDFVGTFTRNLSLMICGHVLIGPHKQRMPELQLIANGHTKWLNKRKIKAF 708
            |||||||||||||||||||.|||:||||||||||||||.|||:|||:|||:||||||||||||||
Mouse   649 QCLVLTGPPNFRPALVDFVSTFTQNLSLMICGHVLIGPGKQRVPELRLIASGHTKWLNKRKIKAF 713

Human   709 YSDVIAEDLRRGVQILMQAAGLGRMKPNILVVGFKKNWQSAHPATVEDYIGILHDAFDFNYGVCV 773
            ||||||||||.||||||||:|||||||||||||||:|||||||||||||||:|||||||||||||
Mouse   714 YSDVIAEDLRSGVQILMQASGLGRMKPNILVVGFKRNWQSAHPATVEDYIGVLHDAFDFNYGVCV 778

Human   774 MRMREGLNVSKMMQAHINPVFDPAEDGKEASARGARPSVSGALDPKALVKEEQATTIFQSEQGKK 838
            ||||||||||:.:|.|..                          |:||::||||:||||||||||
Mouse   779 MRMREGLNVSEALQTHTT--------------------------PEALIQEEQASTIFQSEQGKK 817

Human   839 TIDIYWLFDDGGLTLLIPYLLGRKRRWSKCKIRVFVGGQINRMDQERKAIISLLSKFRLGFHEVH 903
            |||||||||||||||||||||.||:||.||||||||||||||||:||||||||||||||||||||
Mouse   818 TIDIYWLFDDGGLTLLIPYLLHRKKRWGKCKIRVFVGGQINRMDEERKAIISLLSKFRLGFHEVH 882

Human   904 ILPDINQNPRAEHTKRFEDMIAPFRLNDGFKDEATVNEMRRDCPWKISDEEITKNRVKSLRQVRL 968
            :||||||.|:||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||:||||||||
Mouse   883 VLPDINQKPQAEHTKRFEDMIAPFRLNDGFKDEATVTEMRRDCPWKISDEEINKNRIKSLRQVRL 947

Human   969 NEIVLDYSRDAALIVITLPIGRKGKCPSSLYMAWLETLSQDLRPPVILIRGNQENVLTFYCQ 1030
            :||:||||||||||::||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
Mouse   948 SEILLDYSRDAALIILTLPIGRKGKCPSSLYMAWLETLSQDLRPPVLLIRGNQENVLTFYCQ 1009

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SLC12A3NP_000330.3 2a30 59..1029 CDD:273347 868/976 (89%)
Scissor helix. /evidence=ECO:0000269|PubMed:36792826, ECO:0007744|PDB:8FHO, ECO:0007744|PDB:8FHP, ECO:0007744|PDB:8FHQ, ECO:0007744|PDB:8FHR, ECO:0007744|PDB:8FHT 615..630 14/14 (100%)
Slc12a3XP_017168114.1 2a30 57..1008 CDD:273347 868/976 (89%)

Return to query results.
Submit another query.