DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SLC12A3 and slc12a3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000330.3 Gene:SLC12A3 / 6559 HGNCID:10912 Length:1030 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_002937217.2 Gene:slc12a3 / 100494755 XenbaseID:XB-GENE-866805 Length:1030 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1038 Identity:768/1038 - (73%)
Similarity:888/1038 - (85%) Gaps:16/1038 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAELPTTETPGDATLCSGRFTISTLLSSDEP------SPPAAYDSSHPSHLTHSSTFCMRTFGYN 59
            ||| ...:.|.:....:|||||.:|:|:::.      ...:|||:.:|::||.:||..|||||||
 Frog     1 MAE-NRNDNPVENAPSNGRFTIRSLISTEDSIKAQYGQQESAYDTFNPNNLTQTSTLYMRTFGYN 64

Human    60 TIDVVPTYEHYANSTQPGEPRKVRPTLADLHSFLKQEGRHLHALAFDSRPSHEMTDGLVEGEAGT 124
            |:|.:|.|:||||:...|:.:||||||.||||.|||:..| |.    ..|.::.|....:|||..
 Frog    65 TVDAIPNYDHYANTEISGQIKKVRPTLEDLHSILKQDSSH-HL----DPPDYDNTVEPPDGEAEN 124

Human   125 SSEKNPEEPVRFGWVKGVMIRCMLNIWGVILYLRLPWITAQAGIVLTWIIILLSVTVTSITGLSI 189
            :.:|...|||||||:|||||||||||||||||||||||||||||.|||:||.:||||||||||||
 Frog   125 TEQKPAGEPVRFGWIKGVMIRCMLNIWGVILYLRLPWITAQAGIALTWLIIFMSVTVTSITGLSI 189

Human   190 SAISTNGKVKSGGTYFLISRSLGPELGGSIGLIFAFANAVGVAMHTVGFAETVRDLLQEYGAPIV 254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||::|.:.||
 Frog   190 SAISTNGKVKSGGTYFLISRSLGPELGGSIGLIFAFANAVAVAMHTVGFAETVRDLLRDYDSTIV 254

Human   255 DPINDIRIIAVVSVTVLLAISLAGMEWESKAQVLFFLVIMVSFANYLVGTLIPPSEDKASKGFFS 319
            |||||||||.:::|.|||.|||||||||:|||:|||:|||:|||||||||:||.:|:|.:|||||
 Frog   255 DPINDIRIIGIITVIVLLGISLAGMEWEAKAQILFFIVIMISFANYLVGTVIPATEEKQAKGFFS 319

Human   320 YRADIFVQNLVPDWRGPDGTFFGMFSIFFPSATGILAGANISGDLKDPAIAIPKGTLMAIFWTTI 384
            ||||||.:|.||.|||.||:||||||||||||||||||||||||||||.:||||||||:|||||:
 Frog   320 YRADIFAENFVPKWRGQDGSFFGMFSIFFPSATGILAGANISGDLKDPTVAIPKGTLMSIFWTTV 384

Human   385 SYLAISATIGSCVVRDASGVLNDTVTPGWGACEGLACSYGWNFTECTQQHSCHYGLINYYQTMSM 449
            |||.|||||||||||||||.||||:|.|...|.||||.||||||:|..:.:|.|||||.||:|||
 Frog   385 SYLVISATIGSCVVRDASGSLNDTITDGGLNCVGLACGYGWNFTDCATKQNCKYGLINQYQSMSM 449

Human   450 VSGFAPLITAGIFGATLSSALACLVSAAKVFQCLCEDQLYPLIGFFGKGYGKNKEPVRGYLLAYA 514
            |||||||:|||||||||||||||||||.|||||||:|.|||||||||||||||.||:|||||.:.
 Frog   450 VSGFAPLVTAGIFGATLSSALACLVSAPKVFQCLCKDNLYPLIGFFGKGYGKNNEPIRGYLLTFL 514

Human   515 IAVAFIIIAELNTIAPIISNFFLCSYALINFSCFHASITNSPGWRPSFQYYNKWAALFGAIISVV 579
            ||.|||:|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:|||:||||:.|||
 Frog   515 IASAFILIGELNTIAPIISNFFLCSYALINFSCFHASITNSPGWRPSFKYYSKWASLFGAVASVV 579

Human   580 IMFLLTWWAALIAIGVVLFLLLYVIYKKPEVNWGSSVQAGSYNLALSYSVGLNEVEDHIKNYRPQ 644
            |||||.|.:||||||:|:|||.||:|||||.||||||||||||:||||.||||:||:||||:|||
 Frog   580 IMFLLAWESALIAIGIVIFLLGYVLYKKPEANWGSSVQAGSYNMALSYCVGLNQVEEHIKNFRPQ 644

Human   645 CLVLTGPPNFRPALVDFVGTFTRNLSLMICGHVLIGPHKQRMPELQLIANGHTKWLNKRKIKAFY 709
            ||||||||||||||||||||||:..||||||:|:|||.||::.|:.  ..||.||||||||||||
 Frog   645 CLVLTGPPNFRPALVDFVGTFTKKQSLMICGNVIIGPRKQKLQEIS--PEGHIKWLNKRKIKAFY 707

Human   710 SDVIAEDLRRGVQILMQAAGLGRMKPNILVVGFKKNWQSAHPATVEDYIGILHDAFDFNYGVCVM 774
            :.:||:|||.|.|:|:||||||.|:||:||:||||||.::||.:.|:|:||||||.||..|:|::
 Frog   708 TGLIADDLRSGTQMLIQAAGLGHMRPNVLVMGFKKNWSTSHPRSTENYVGILHDALDFKCGLCLL 772

Human   775 RMREGLNVSKMMQAHINPVFDPAEDG--KEASARGARPSVSGALDPKALVKEEQATTIFQSEQGK 837
            ||:||:|:|::||||||||::..|:.  |:....||..|....|||:|:..|:||:||||.:|.|
 Frog   773 RMKEGINISRVMQAHINPVYEQTEEPKLKDGGENGASCSAQSTLDPEAVTVEQQASTIFQIKQDK 837

Human   838 KTIDIYWLFDDGGLTLLIPYLLGRKRRWSKCKIRVFVGGQINRMDQERKAIISLLSKFRLGFHEV 902
            ||||||||||||||||||||||.||:||.|.||||||||||||||:|.||:||||||||:|||||
 Frog   838 KTIDIYWLFDDGGLTLLIPYLLSRKKRWQKAKIRVFVGGQINRMDEECKAMISLLSKFRIGFHEV 902

Human   903 HILPDINQNPRAEHTKRFEDMIAPFRLNDGFKDEATVNEMRRDCPWKISDEEITKNRVKSLRQVR 967
            |:||||||.||.||.|||||:|||:.||||||||.||||||||||||||||||.|||.|||||:|
 Frog   903 HVLPDINQKPRPEHIKRFEDLIAPYMLNDGFKDELTVNEMRRDCPWKISDEEIKKNRAKSLRQIR 967

Human   968 LNEIVLDYSRDAALIVITLPIGRKGKCPSSLYMAWLETLSQDLRPPVILIRGNQENVLTFYCQ 1030
            |||::|||||||.|||||:||.|||||||:|||||||||||||||||:|.||||:||||.|||
 Frog   968 LNEVLLDYSRDAGLIVITMPIARKGKCPSTLYMAWLETLSQDLRPPVLLTRGNQQNVLTMYCQ 1030

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SLC12A3NP_000330.3 2a30 59..1029 CDD:273347 740/971 (76%)
Scissor helix. /evidence=ECO:0000269|PubMed:36792826, ECO:0007744|PDB:8FHO, ECO:0007744|PDB:8FHP, ECO:0007744|PDB:8FHQ, ECO:0007744|PDB:8FHR, ECO:0007744|PDB:8FHT 615..630 12/14 (86%)
slc12a3XP_002937217.2 2a30 64..1029 CDD:273347 740/971 (76%)

Return to query results.
Submit another query.