DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SLC12A1 and slc12a1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000329.2 Gene:SLC12A1 / 6557 HGNCID:10910 Length:1099 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_002936613.2 Gene:slc12a1 / 100490198 XenbaseID:XB-GENE-479925 Length:1086 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1097 Identity:846/1097 - (77%)
Similarity:963/1097 - (87%) Gaps:11/1097 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     3 LNNSSNVFLDSVPSNTNRFQVSVINENHESSAAADDNTDPPHYEETSFGDEAQKRLRISFRPGNQ 67
            :|||.|.|||:.|.:.:||||:|:.|.:::.|..|  .|||.||||||.|:.    |:|:||||:
 Frog     1 MNNSPNTFLDTAPISPSRFQVNVVGEGYDNPACED--KDPPDYEETSFADDN----RMSYRPGNR 59

Human    68 ECYDNFLQSGETAKTDASFHAYDSHTNTYYLQTFGHNTMDAVPKIEYYRNTGSISGPKVNRPSLL 132
            |.::|.|.:|:|.||:.|||.||:|.:.||::||||||:||||||:||||||||||.|:.||||.
 Frog    60 EIFNNVLHNGDTIKTEGSFHPYDTHGHAYYMKTFGHNTVDAVPKIDYYRNTGSISGVKICRPSLA 124

Human   133 EIHEQLAKNVAVTPSSADRVANGDGIPGDEQAENKEDDQAGVVKFGWVKGVLVRCMLNIWGVMLF 197
            :|||||:|||...|.|   |.||:||||||:|..:|.::.|.|||||:|||||||||||||||||
 Frog   125 DIHEQLSKNVVEVPGS---VTNGEGIPGDEEANKEEGEKGGFVKFGWIKGVLVRCMLNIWGVMLF 186

Human   198 IRLSWIVGEAGIGLGVLIILLSTMVTSITGLSTSAIATNGFVRGGGAYYLISRSLGPEFGGSIGL 262
            ||||||||:|||||||:||.||.:|||:||:|.|||.|||.||||||||||||||||||||||||
 Frog   187 IRLSWIVGQAGIGLGVVIICLSVVVTSLTGVSMSAICTNGVVRGGGAYYLISRSLGPEFGGSIGL 251

Human   263 IFAFANAVAVAMYVVGFAETVVDLLKESDSMMVDPTNDIRIIGSITVVILLGISVAGMEWEAKAQ 327
            |||||||||||||||||:||||::||:::::|||..|||||||:|||::||||||||||||||||
 Frog   252 IFAFANAVAVAMYVVGFSETVVEILKDTNTIMVDEVNDIRIIGTITVILLLGISVAGMEWEAKAQ 316

Human   328 VILLVILLIAIANFFIGTVIPSNNEKKSRGFFNYQASIFAENFGPRFTKGEGFFSVFAIFFPAAT 392
            |:|||||||||.|||||||||:..||:::|||||||:||||||||.|..||||||||||||||||
 Frog   317 VVLLVILLIAIVNFFIGTVIPTTKEKRAQGFFNYQATIFAENFGPDFRNGEGFFSVFAIFFPAAT 381

Human   393 GILAGANISGDLEDPQDAIPRGTMLAIFITTVAYLGVAICVGACVVRDATGNMNDTIISGMNCNG 457
            ||||||||||||:|||.|||:|||.||.|||:||||||||..|.||||||||:||||.|...|||
 Frog   382 GILAGANISGDLKDPQGAIPKGTMWAILITTIAYLGVAICAAASVVRDATGNLNDTITSAFKCNG 446

Human   458 SAACGLGYDFSRCRHEPCQYGLMNNFQVMSMVSGFGPLITAGIFSATLSSALASLVSAPKVFQAL 522
            |||||||||||.|..:.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
 Frog   447 SAACGLGYDFSICETQTCNYGLMNNFQVMSMVSGFGPLIIAGIFSATLSSALASLVSAPKVFQAL 511

Human   523 CKDNIYKALQFFAKGYGKNNEPLRGYILTFLIAMAFILIAELNTIAPIISNFFLASYALINFSCF 587
            |||||||.|.|||||:||||||:|||:|||:||:|||||||||.|||||||||||||||||||||
 Frog   512 CKDNIYKGLHFFAKGHGKNNEPIRGYVLTFVIALAFILIAELNVIAPIISNFFLASYALINFSCF 576

Human   588 HASYAKSPGWRPAYGIYNMWVSLFGAVLCCAVMFVINWWAAVITYVIEFFLYVYVTCKKPDVNWG 652
            |||||||||||||:..||||||||||:|||.||||||||||:|||.||.|||:|||.||||||||
 Frog   577 HASYAKSPGWRPAFKYYNMWVSLFGAMLCCGVMFVINWWAALITYAIELFLYIYVTYKKPDVNWG 641

Human   653 SSTQALSYVSALDNALELTTVEDHVKNFRPQCIVLTGGPMTRPALLDITHAFTKNSGLCICCEVF 717
            ||||||.:.:|||:||.|..:||||||||||||||||.||||||||||||:||||||||||||||
 Frog   642 SSTQALQFKNALDSALGLNCIEDHVKNFRPQCIVLTGVPMTRPALLDITHSFTKNSGLCICCEVF 706

Human   718 VGPRKLCVKEMNSGMAKKQAWLIKNKIKAFYAAVAADCFRDGVRSLLQASGLGRMKPNTLVIGYK 782
            .||||..||||||||.|||.||..||.||||||||||.||||||:|||||||||:||||||:|:|
 Frog   707 SGPRKQAVKEMNSGMIKKQTWLTNNKRKAFYAAVAADNFRDGVRTLLQASGLGRLKPNTLVMGFK 771

Human   783 KNWRKAPLTEIENYVGIIHDAFDFEIGVVIVRISQGFDISQVLQVQEELERLEQERLALEATIKD 847
            |:||:|...::.|||||:|||||||.|||||||||||||||||||:||.:||||||||||.|||:
 Frog   772 KDWRQASPVDLANYVGILHDAFDFEHGVVIVRISQGFDISQVLQVKEEFDRLEQERLALEQTIKE 836

Human   848 NECEEESGGIRGLFKKAGKLNITKTTPKKDGSINTSQSMHVGEFNQKLVEASTQFKKKQEKGTID 912
            ||.:|.:.|:|..|.|..||||.:.:..||  ::|...|||||:||:|||||.||||.|.||.||
 Frog   837 NEFKEGNHGLRSFFNKTAKLNINRHSSTKD--VSTPPPMHVGEYNQRLVEASEQFKKNQGKGMID 899

Human   913 VWWLFDDGGLTLLIPYILTLRKKWKDCKLRIYVGGKINRIEEEKIVMASLLSKFRIKFADIHIIG 977
            |||||||||||||||:|||||||||||||||::|||:||:|:||::|||||||||||||||:|:|
 Frog   900 VWWLFDDGGLTLLIPHILTLRKKWKDCKLRIFIGGKVNRLEDEKLMMASLLSKFRIKFADIYIVG 964

Human   978 DINIRPNKESWKVFEEMIEPYRLHESCKDLTTAEKLKRETPWKITDAELEAVKEKSYRQVRLNEL 1042
            |||.:|:|||||.||||||||.|||:..|::||||::||.||||||:|||..|||||||||||||
 Frog   965 DINTKPSKESWKFFEEMIEPYCLHENSTDVSTAEKIRRENPWKITDSELEMFKEKSYRQVRLNEL 1029

Human  1043 LQEHSRAANLIVLSLPVARKGSISDLLYMAWLEILTKNLPPVLLVRGNHKNVLTFYS 1099
            ||||||:|||||||||||||||:||.|||||:|||:|||||||||||||||||||||
 Frog  1030 LQEHSRSANLIVLSLPVARKGSVSDHLYMAWVEILSKNLPPVLLVRGNHKNVLTFYS 1086

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SLC12A1NP_000329.2 RFXV motif. /evidence=ECO:0000269|PubMed:21321328 20..23 2/2 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 31..53 11/21 (52%)
2a30 104..1099 CDD:273347 793/994 (80%)
slc12a1XP_002936613.2 2a30 96..1086 CDD:273347 793/994 (80%)

Return to query results.
Submit another query.