Protein Alignment SLC6A1 and CG13794

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_003033.3
• Gene: SLC6A1 / 6529
• HGNCID: 11042
• Length: 599
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_609137.2
• Gene: CG13794 / 34048
• FlyBaseID: FBgn0031936
• Length: 595
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 628
• Identity: 154/628 - (24%)
• Similarity: 264/628 - (42%)
• Gaps: 135/628 - (21%)

Human    42 PD--RDTWKGRFDFLMSCVGYAIGL----GNVWRFPYLCGKNGGGAF-LIPYFLTLIFAGVPLFL 99
            ||  |..|....|::.:|.|.|:.|    .:.|.|..:      |.| ::||.:.::...||:.:
  Fly    16 PDLKRGKWDKPTDYIFACFGLALKLDIFVASYWFFFDM------GIFGMLPYLVYMVIYLVPIMV 74

Human   100 LECSLGQYTSIGGLGVWKLAPMFKGVGLAAAVLSFWLNIYYIVIISWAIYYLYNSFTTTLPWKQC 164
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  Fly    75 IHSFMGQFSSSGFISAFRLSPFFKGMGYVSVFLTISMLIYYSIFAAVPLLFMINSFRPTLPW-SC 138

Human   165 D--NPWNTDRCFSNYSMVNTTNMT----------------------SAVVEF-------WERNMH 198
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  Fly   139 EGFKSWYNE----SDGKMTTCNMTISEDLTDNSDNNTDFHRPHFHVPSVLYFLKHFESVQEENYS 199

Human   199 QMTDGLDKPGQIRWPLAITLAIAWILVYFCIWK--GVGWTGKVVYFSATYPYIMLIILFFRGVTL 261
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  Fly   200 DLRQDYD----LSWRFVSLFVLVWAMVAFIFYKFSETAMFGKFIRYMVIGTLILLLVCFGRFLFL 260

Human   262 PGAKEGILFYITPNFRKLSDSEVWLDAAT---QIFFSYGLGLGSLIALGSYNSFHNNVYRDSIIV 323
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  Fly   261 PGALLGLRKYVTP-----SPDEIAMGIGSTFVMVLHAFGAGWGSVIALSSFNGFKTDIMSYSWII 320

Human   324 CCINSCTSMFAGFVIFSIVGFMA-HVTKRSI------------ADVAASGPGLAFLAYPEAVTQL 375
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  Fly   321 ----SFGQIFI-FTMFGLVSYMLDHYYNEGIEGSFDKQVLTHWALYLSSATALSSLGWPN----- 375

Human   376 PISPLWAILFFSMLLM---LGIDSQFCTVEGFITALVDEYPRLLRNRREL---FIAAVCIISYLI 434
                ||..::::||||   :.|.:|..||   :.:|.||:..|...::|:   .|..:.:.|:..
  Fly   376 ----LWTFIYYTMLLMAALIVITTQIFTV---LQSLFDEFEVLRVRKQEVTFGLIGGIAVCSFYF 433

Human   435 GLSNITQGGIYVFKLFDYYSASGMSLLFLVFFECVSISWFYGVNRFYDNIQEMVGSRPCIWWKL- 498
                .|..||..|......:....|||.|:..  :.:.|.||..||..:|:.|:| :|...||:
  Fly   434 ----CTNHGITFFSALALDAIFSHSLLHLLLL--LVVLWIYGRERFQRDIEFMLG-QPFASWKVY 491

Human   499 CWSFFTPII-----VAGVFI-------FSAVQMTPLTMGNYVFPKWGQGVGWLMALSSMVLIPGY 551
            ...|..|||     |.|:.:       .||:.:               |:..::.:..::.||||
  Fly   492 ILRFIAPIILIICLVVGILVCYMEHIYSSAIVL---------------GMSIILVILPILAIPGY 541

Human   552 MAYMFLTLKGSLKQRIQVMVQPSEDI-VRPENGPEQPQAGSST 593
            ..|......||..:|.:...:|::.. |..|:..:..:|.|:|
  Fly   542 GIYYIYRSTGSFCERFKRTCRPTDWYPVEMEHRQQYEEAVSNT 584

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SLC6A1	NP_003033.3	SLC6sbd_GAT1	2..599	CDD:212075	154/628 (25%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	577..599		5/18 (28%)
		PDZ-binding	597..599
CG13794	NP_609137.2	SLC5-6-like_sbd	27..509	CDD:271356	132/525 (25%)