DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ITSN1 and itsn1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_003015.2 Gene:ITSN1 / 6453 HGNCID:6183 Length:1721 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_002939390.1 Gene:itsn1 / 733480 XenbaseID:XB-GENE-5904194 Length:1709 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1727 Identity:1497/1727 - (86%)
Similarity:1586/1727 - (91%) Gaps:24/1727 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAQFPTPFGGSLDIWAITVEERAKHDQQFHSLKPISGFITGDQARNFFFQSGLPQPVLAQIWALA 65
            ||||.|||||:|||||||||||||||||||.|:|.:|:||||||||||.||||||||||||||||
 Frog     1 MAQFGTPFGGNLDIWAITVEERAKHDQQFHGLQPTAGYITGDQARNFFLQSGLPQPVLAQIWALA 65

Human    66 DMNNDGRMDQVEFSIAMKLIKLKLQGYQLPSALPPVMKQQPVAISSAPA------FGMGGIASMP 124
            ||||||||||:||||||||||||||||.||||||..|.:||||:|:|.|      |||.||:.:|
 Frog    66 DMNNDGRMDQLEFSIAMKLIKLKLQGYPLPSALPSNMLKQPVAMSAAAAAAAAAGFGMSGISGIP 130

Human   125 PLTAVAPVPMGSIPVVGMSPTLVSSVPTAAVPPLANGAPPVIQPLPAFAHPAATLPKSSSFSRSG 189
            ||.|||||||.|||||||||.|||||||  |||||||||.|||||||||| :|||||||||.|||
 Frog   131 PLAAVAPVPMPSIPVVGMSPPLVSSVPT--VPPLANGAPAVIQPLPAFAH-SATLPKSSSFGRSG 192

Human   190 PGSQLNTKLQKAQSFDVASVPPVAEWAVPQSSRLKYRQLFNSHDKTMSGHLTGPQARTILMQSSL 254
            .|||:||||||||||||.:.||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   193 AGSQMNTKLQKAQSFDVPTPPPLAEWAVPQSSRLKYRQLFNSHDKTMSGHLTGPQARTILMQSSL 257

Human   255 PQAQLASIWNLSDIDQDGKLTAEEFILAMHLIDVAMSGQPLPPVLPPEYIPPSFRRVRSGSGISV 319
            ||:|||:||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:
 Frog   258 PQSQLATIWNLSDIDLDGKLTAEEFILAMHLIDVAMSGQPLPPVLPPEYIPPSFRRVRSGSGLSI 322

Human   320 ISSTSVDQRLPEEPVLEDEQQQLEKKLPVTFEDKKRENFERGNLELEKRRQALLEQQRKEQERLA 384
            :||.||||||||||. |:|.|..:|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   323 MSSVSVDQRLPEEPA-EEEPQNTDKRLPVTFEDKKRENFERGNLELEKRRQALLEQQRKEQERLA 386

Human   385 QLERAEQERKERERQEQERKRQLELEKQLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKRELERQRQLEW 449
            |||||||||||||||:||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   387 QLERAEQERKERERQDQERKRQQELEKQLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKRELERQRQLEW 451

Human   450 ERNRRQELLNQRNKEQEDIVVLKAKKKTLEFELEALNDKKHQLEGKLQDIRCRLTTQRQEIESTN 514
            |||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
 Frog   452 ERNRRQELLNQRNREQEDIVVLKAKKKTLEFELEALNDKKHQLEGKLQDIRCRLTTQRHEIESTN 516

Human   515 KSRELRIAEITHLQQQLQESQQMLGRLIPEKQILNDQLKQVQQNSLHRDSLVTLKRALEAKELAR 579
            ||||||||||||||||||||||:||:||||||.||||||||||||||||||:||||||||||:.|
 Frog   517 KSRELRIAEITHLQQQLQESQQLLGKLIPEKQSLNDQLKQVQQNSLHRDSLLTLKRALEAKEMGR 581

Human   580 QHLRDQLDEVEKETRSKLQEIDIFNNQLKELREIHNKQQLQKQKSMEAERLKQKEQERKIIELEK 644
            |.|||||||||||||:||||||:||||||||||::|:|||||||..|||::||||.|||..||:|
 Frog   582 QQLRDQLDEVEKETRAKLQEIDVFNNQLKELRELYNRQQLQKQKDFEAEKIKQKELERKTSELDK 646

Human   645 QKEEAQRRAQERDKQWLEHVQQEDEHQRPRKLHEEEKLKREESVKKKDGEEKGKQEAQDKLGRLF 709
            .|||.:||..|:||.|.:.|:||:|..   |..:|||.|||||.::  .||:.|.|.|:|..:||
 Frog   647 MKEEDKRRMLEQDKLWQDRVKQEEERY---KFQDEEKQKREESAQQ--CEEEKKPEIQEKPNKLF 706

Human   710 HQHQEPAKPAVQAPWSTAEKGPLTISAQENVKVVYYRALYPFESRSHDEITIQPGDIVMVKGEWV 774
            |...||.|.....||...||.|||.: |.:||||||||||||::|||||||||||||:|     |
 Frog   707 HLPPEPGKLGGHVPWMNTEKAPLTFN-QGDVKVVYYRALYPFDARSHDEITIQPGDIIM-----V 765

Human   775 DESQTGEPGWLGGELKGKTGWFPANYAEKIPENEVPAPVKPVTDSTSAPAPKLALRETPAPLAVT 839
            ||||||||||||||||||||||||||||::||.|.|:..|...|:|:.|...|| ..||.|.|.|
 Frog   766 DESQTGEPGWLGGELKGKTGWFPANYAERMPEGEFPSTTKQAADTTAKPTVHLA-PSTPTPAAFT 829

Human   840 SSEPSTTPNNWADFSSTWPTSTNEKPETDNWDAWAAQPSLTVPSAGQLRQRSAFTPATATGSSPS 904
            .:  |...||||||||||||:..:|.||||||.|.||||||||||||.||||||||||.||||||
 Frog   830 DN--SANSNNWADFSSTWPTNNTDKAETDNWDTWGAQPSLTVPSAGQHRQRSAFTPATVTGSSPS 892

Human   905 PVLGQGEKVEGLQAQALYPWRAKKDNHLNFNKNDVITVLEQQDMWWFGEVQGQKGWFPKSYVKLI 969
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   893 PVLGQGEKVEGLQAQALYPWRAKKDNHLNFNKNDIITVLEQQDMWWFGEVQGQKGWFPKSYVKLI 957

Human   970 SGPIRKSTSMDSGSSESPASLKRVASPAAKPVVSGEEFIAMYTYESSEQGDLTFQQGDVILVTKK 1034
            |||:|||||:||.|||||||||||:|||.||.:.|||:||||||||:|||||||||||:|:|.||
 Frog   958 SGPLRKSTSIDSTSSESPASLKRVSSPAFKPAMQGEEYIAMYTYESNEQGDLTFQQGDLIVVIKK 1022

Human  1035 DGDWWTGTVGDKAGVFPSNYVRLKDSEGSGTAGKTGSLGKKPEIAQVIASYTATGPEQLTLAPGQ 1099
            ||||||||||:|.|||||||||.||||.:|:||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1023 DGDWWTGTVGEKTGVFPSNYVRPKDSEAAGSAGKTGSLGKKPEIAQVIASYTATGPEQLTLAPGQ 1087

Human  1100 LILIRKKNPGGWWEGELQARGKKRQIGWFPANYVKLLSPGTSKITPTEPPKSTALAAVCQVIGMY 1164
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.|||||||:|:|...|||||||
 Frog  1088 LILIRKKNPGGWWEGELQARGKKRQIGWFPANYVKLLSPGTNKSTPTEPPKATSLPPTCQVIGMY 1152

Human  1165 DYTAQNDDELAFNKGQIINVLNKEDPDWWKGEVNGQVGLFPSNYVKLTTDMDPSQQWCSDLHLLD 1229
            ||.|||||||||.|||:|||||||||||||||:||.||||||||||||||||||||||:||||||
 Frog  1153 DYIAQNDDELAFGKGQVINVLNKEDPDWWKGELNGHVGLFPSNYVKLTTDMDPSQQWCADLHLLD 1217

Human  1230 MLTPTERKRQGYIHELIVTEENYVNDLQLVTEIFQKPLMESELLTEKEVAMIFVNWKELIMCNIK 1294
            ||:|||||||||||||||||||||||||||||.|||||:||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1218 MLSPTERKRQGYIHELIVTEENYVNDLQLVTETFQKPLLESELLTEKEVAMIFVNWKELIMCNIK 1282

Human  1295 LLKALRVRKKMSGEKMPVKMIGDILSAQLPHMQPYIRFCSRQLNGAALIQQKTDEAPDFKEFVKR 1359
            |||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||.||||||||||||||.|:|||||||
 Frog  1283 LLKALRVRKKMSGEKMPVKMIGDILTAQLPHMQPYIRFCSCQLNGAALIQQKTDEVPEFKEFVKR 1347

Human  1360 LAMDPRCKGMPLSSFILKPMQRVTRYPLIIKNILENTPENHPDHSHLKHALEKAEELCSQVNEGV 1424
            |||||||||||||||:|||||||||||||||||:||||||||||||||.||||||||||||||||
 Frog  1348 LAMDPRCKGMPLSSFLLKPMQRVTRYPLIIKNIIENTPENHPDHSHLKQALEKAEELCSQVNEGV 1412

Human  1425 REKENSDRLEWIQAHVQCEGLSEQLVFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYKAKSNKELYGFLFNDFLLL 1489
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1413 REKENSDRLEWIQAHVQCEGLSEQLVFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYKAKSNKELYGFLFNDFLLL 1477

Human  1490 TQITKPLGSSGTDKVFSPKSNLQYKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSGDEPIFHISHIDRVYTLRAE 1554
            |||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1478 TQIIKPLGSSGNDKVFSPKSNLQYKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSGDEPIFHISHIDRVYTLRAE 1542

Human  1555 SINERTAWVQKIKAASELYIETEKKKREKAYLVRSQRATGIGRLMVNVVEGIELKPCRSHGKSNP 1619
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||:||||||
 Frog  1543 SINERTAWVQKIKAASELYIETEKKKREKAYLVRSQRATGIGRLMVNIVEGIELKPCRTHGKSNP 1607

Human  1620 YCEVTMGSQCHITKTIQDTLNPKWNSNCQFFIRDLEQEVLCITVFERDQFSPDDFLGRTEIRVAD 1684
            |||:||||||||||||||||||||||||||||:||||:|||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1608 YCEITMGSQCHITKTIQDTLNPKWNSNCQFFIKDLEQDVLCITVFERDQFSPDDFLGRTEIRVAD 1672

Human  1685 IKKDQGSKGPVTKCLLLHEVPTGEIVVRLDLQLFDEP 1721
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1673 IKKDQGSKGPVTKCLLLHEVPTGEIVVRLDLQLFDEP 1709

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ITSN1NP_003015.2 EH 14..108 CDD:197477 81/93 (87%)
EH 214..309 CDD:197477 91/94 (97%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 322..348 16/25 (64%)
KLERQ 326..702 313/375 (83%)
Smc <363..>684 CDD:440809 275/320 (86%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 650..701 22/50 (44%)
SH3_Intersectin1_1 744..803 CDD:212920 50/58 (86%)
INTAP 803..917 CDD:435467 75/113 (66%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 836..868 17/31 (55%)
SH3_Intersectin1_2 917..968 CDD:212922 49/50 (98%)
SH3_Intersectin1_3 1006..1057 CDD:212924 43/50 (86%)
SH3_Intersectin1_4 1074..1138 CDD:212926 63/63 (100%)
Required for interaction with FCHSD2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:29887380 1074..1138 63/63 (100%)
Bipartite nuclear localization signal, in isoform 2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:29599122 1104..1127 22/22 (100%)
SH3_Intersectin1_5 1158..1211 CDD:212928 47/52 (90%)
RhoGEF 1238..1421 CDD:238091 173/182 (95%)
PH_13 1440..1582 CDD:465218 139/141 (99%)
C2_Intersectin 1582..1716 CDD:176021 128/133 (96%)
itsn1XP_002939390.1 EH 14..108 CDD:197477 81/93 (87%)
EH 217..312 CDD:197477 91/94 (97%)
PTZ00121 <354..701 CDD:173412 296/351 (84%)
SH3_Intersectin1_1 740..794 CDD:212920 50/58 (86%)
INTAP 794..905 CDD:435467 75/113 (66%)
SH3_Intersectin1_2 905..956 CDD:212922 49/50 (98%)
SH3_Intersectin1_3 994..1045 CDD:212924 43/50 (86%)
SH3_Intersectin1_4 1062..1126 CDD:212926 63/63 (100%)
SH3_Intersectin1_5 1146..1199 CDD:212928 47/52 (90%)
RhoGEF 1226..1409 CDD:238091 173/182 (95%)
PH_13 1428..1570 CDD:465218 139/141 (99%)
C2_Intersectin 1570..1704 CDD:176021 128/133 (96%)

Return to query results.
Submit another query.