DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ITSN1 and itsn1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_003015.2 Gene:ITSN1 / 6453 HGNCID:6183 Length:1721 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_005171028.1 Gene:itsn1 / 368504 ZFINID:ZDB-GENE-030616-226 Length:1751 Species:Danio rerio


Alignment Length:1787 Identity:1364/1787 - (76%)
Similarity:1498/1787 - (83%) Gaps:102/1787 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAQFPTPFGGSLDIWAITVEERAKHDQQFHSLKPI-SGFITGDQARNFFFQSGLPQPVLAQIWAL 64
            ||||||||||..|.|.|:|:||||||||||||.|. :||||||||||||.|||||.|:|||||||
Zfish     1 MAQFPTPFGGGSDTWVISVDERAKHDQQFHSLTPTPAGFITGDQARNFFLQSGLPAPILAQIWAL 65

Human    65 ADMNNDGRMDQVEFSIAMKLIKLKLQGYQLPSALPPVMKQQPVAISSAPAFGMGGIASMPPLTAV 129
            |||||||:||..|||||||||||||||:.||.:|||.|||||::|.....||:..:.:||.|.||
Zfish    66 ADMNNDGKMDMHEFSIAMKLIKLKLQGHPLPPSLPPSMKQQPISIPPPTPFGIPSMGAMPGLPAV 130

Human   130 APVPM----GSIPVVGMSPTLVSSVPTAAVPPLANGAPPVIQPLPAFAHPAATLPKSSSFSRSGP 190
            .|:|:    ..:|.:|:||.|.:|| |..||.||||||.:||||..|:||.|.|.|:.||:||  
Zfish   131 PPMPLPPLPPGVPGMGVSPPLGASV-TPPVPSLANGAPAMIQPLSGFSHPGAVLNKTPSFNRS-- 192

Human   191 GSQLNTKLQKAQSFDVAS---VPPVAEWAVPQSSRLKYRQLFNSHDKTMSGHLTGPQARTILMQS 252
                :.||||.||.:..|   .||.|:|||.||||||||||||||||.|||:|||||||||||||
Zfish   193 ----SIKLQKGQSVEAPSAPAAPPPADWAVSQSSRLKYRQLFNSHDKMMSGYLTGPQARTILMQS 253

Human   253 SLPQAQLASIWNLSDIDQDGKLTAEEFILAMHLIDVAMSGQPLPPVLPPEYIPPSFRRVRSGSGI 317
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||:||||.||||:|||:.|||:|||:|||||:
Zfish   254 SLPQAQLATIWNLSDIDQDGKLTAEEFILAMHLIDMAMSGLPLPPLLPPDLIPPTFRRMRSGSGV 318

Human   318 SVISSTSVDQRLPEEPVLEDEQQQLEKKLPVTFEDKKRENFERGNLELEKRRQALLEQQRKEQER 382
            ||.|..|.|.|..|||  |:|:::.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   319 SVTSMHSTDLRSQEEP--EEEEKEAEKKLPVTFEDKKRENFERGNLELEKRRQALLEQQRKEQER 381

Human   383 LAQLERAEQERKERERQEQERKRQLELEKQLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKRELERQRQL 447
            ||.||:.|||||||||.||||:||.||:||||:||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   382 LAALEKEEQERKERERLEQERRRQQELDKQLERQRELERQREEERRKEIERREAAKRELERQRQL 446

Human   448 EWERNRRQELLNQRNKEQEDIVVLKAKKKTLEFELEALNDKKHQLEGKLQDIRCRLTTQRQEIES 512
            ||||.||||||.|||:|||:||:|||:|||||||||||||||.||||||||||.||:.||.|||:
Zfish   447 EWERTRRQELLTQRNREQENIVLLKARKKTLEFELEALNDKKSQLEGKLQDIRSRLSIQRHEIET 511

Human   513 TNKSRELRIAEITHLQQQLQESQQMLGRLIPEKQILNDQLKQVQQNSLHRDSLVTLKRALEAKEL 577
            |||:|||||||||.||||||||||.|.||||:||.||||||||||||||||||.:|:||:|.||.
Zfish   512 TNKTRELRIAEITSLQQQLQESQQWLSRLIPDKQCLNDQLKQVQQNSLHRDSLNSLQRAIEMKES 576

Human   578 ARQHLRDQLDEVEKETRSKLQEIDIFNNQLKELREIHNKQQLQKQKSMEAERLKQKEQERKIIEL 642
            .:|.|::|||.|||||||||.|||.||.|||||||||||||.||||.:||: :.|...:||.|:.
Zfish   577 TKQQLKEQLDAVEKETRSKLLEIDAFNTQLKELREIHNKQQRQKQKELEAD-ITQPSHDRKSIDS 640

Human   643 EKQK----EEAQRRAQERD-----------KQWLEHVQQEDEHQRPRKLHEEEKLKREESVKKKD 692
            :..:    ::....|...|           :.|:..|.:|:.|.|                    
Zfish   641 QDSRLSGTDDGVSPAWRDDGLGKAPTPPVSQAWMSRVSEEENHSR-------------------- 685

Human   693 GEEKGKQEAQDKLGRLFHQHQEPAKPAVQAPWSTAEKGPLTISAQENVKVVYYRALYPFESRSHD 757
                  .|.||.|.:||.||.:..|...|:|||.|:|.|::...||.||||||||:||||:||||
Zfish   686 ------AEIQDNLSKLFTQHPQAGKIQAQSPWSMADKIPVSGFNQEKVKVVYYRAMYPFEARSHD 744

Human   758 EITIQPGDIVMVKGEWVDESQTGEPGWLGGELKGKTGWFPANYAEKIPENEVPAPVKPVTDSTSA 822
            ||||.||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||:|||..::....|:||
Zfish   745 EITIHPGDIVMVKGEWVDESQTGEPGWLGGEIKGKTGWFPANYAEKIPESEVPLSLRASAASSSA 809

Human   823 P---------------APKLALRETPAPLAVTSSEP---------STTPNNWADFSSTWPT-STN 862
            |               .|.|.:...||.:|..||.|         |:..:||||||:|||: |..
Zfish   810 PKLGSHMSSASSSTTATPILPVSTEPASIAPPSSAPPPTGPASSSSSASSNWADFSTTWPSNSAV 874

Human   863 EKPETDNWDAW---AAQPSLTVPSAGQLRQRSAFTPATATGSSPSPVLGQGEKVEGLQAQALYPW 924
            ||.::|.||||   ..||||:|||.||:||||||||||.:|||||||||||||||||||||||||
Zfish   875 EKQDSDGWDAWPTQPTQPSLSVPSGGQIRQRSAFTPATLSGSSPSPVLGQGEKVEGLQAQALYPW 939

Human   925 RAKKDNHLNFNKNDVITVLEQQDMWWFGEVQGQKGWFPKSYVKLISGPIRKSTSMDSGSSESPAS 989
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||:|||.|::||||:||.|
Zfish   940 RAKKDNHLNFNKNDVITVLEQQDMWWFGEVQGQRGWFPKSYVKLISGPVRKSMSIESGSSDSPPS 1004

Human   990 LKRVASPAAKPVVSGE-------------EFIAMYTYESSEQGDLTFQQGDVILVTKKDGDWWTG 1041
            :||.:....||...||             |::|||||||:|||||||||||||.||||:||||||
Zfish  1005 VKRPSPSLNKPTELGEGQNSNSNSMYPSKEYVAMYTYESNEQGDLTFQQGDVITVTKKEGDWWTG 1069

Human  1042 TVGDKAGVFPSNYVRLKDSEGSGTAGKTGSLGKKPEIAQVIASYTATGPEQLTLAPGQLILIRKK 1106
            ||..|.||||||||:.|:|||.|:||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Zfish  1070 TVSGKIGVFPSNYVKPKESEGLGSAGKTGSLGKKPEIAQVIAPYTATGAEQLTLAPGQLILIRKK 1134

Human  1107 NPGGWWEGELQARGKKRQIGWFPANYVKLLSPGTSKITPTE--PPKSTALAAVCQVIGMYDYTAQ 1169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||:  |||.....||||||||||||||
Zfish  1135 NPGGWWEGELQARGKKRQIGWFPANYVKLLSPSTSKTTPTDPNPPKLPTPNAVCQVIGMYDYTAQ 1199

Human  1170 NDDELAFNKGQIINVLNKEDPDWWKGEVNGQVGLFPSNYVKLTTDMDPSQQWCSDLHLLDMLTPT 1234
            |||||.|.||||||||::|||||||||:||.||||||||||||||.|||||||:||||||||||.
Zfish  1200 NDDELPFGKGQIINVLSREDPDWWKGELNGSVGLFPSNYVKLTTDTDPSQQWCADLHLLDMLTPV 1264

Human  1235 ERKRQGYIHELIVTEENYVNDLQLVTEIFQKPLMESELLTEKEVAMIFVNWKELIMCNIKLLKAL 1299
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||:||:|||||||||||||||||.||||||||||
Zfish  1265 ERKRQGYIHELIVTEENYVNDLQLVTETFQKPLLESDLLTEKEVAMIFVNWKELTMCNIKLLKAL 1329

Human  1300 RVRKKMSGEKMPVKMIGDILSAQLPHMQPYIRFCSRQLNGAALIQQKTDEAPDFKEFVKRLAMDP 1364
            |||||||||:||||||||||:||||||||||||||.|||||.||||||||.|:||:|||||||||
Zfish  1330 RVRKKMSGERMPVKMIGDILTAQLPHMQPYIRFCSCQLNGATLIQQKTDEVPEFKDFVKRLAMDP 1394

Human  1365 RCKGMPLSSFILKPMQRVTRYPLIIKNILENTPENHPDHSHLKHALEKAEELCSQVNEGVREKEN 1429
            ||||||||||:|||||||||||||||||||||||:|||||||:.|||||||||||||||||||||
Zfish  1395 RCKGMPLSSFLLKPMQRVTRYPLIIKNILENTPESHPDHSHLRLALEKAEELCSQVNEGVREKEN 1459

Human  1430 SDRLEWIQAHVQCEGLSEQLVFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYKAKSNKELYGFLFNDFLLLTQITK 1494
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Zfish  1460 SDRLEWIQAHVQCEGLSEQLVFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYKAKSNKELYGFLFNDFLLLTQIIK 1524

Human  1495 PLGSSGTDKVFSPKSNLQYKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSGDEPIFHISHIDRVYTLRAESINER 1559
            ||||||||||||.||:|||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||
Zfish  1525 PLGSSGTDKVFSAKSHLQYRMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSGDEPIFHISHIDRVYTIRAESINER 1589

Human  1560 TAWVQKIKAASELYIETEKKKREKAYLVRSQRATGIGRLMVNVVEGIELKPCRSHGKSNPYCEVT 1624
            |||||||||||||:|||||:||||||||||||||||||||||:|||||||||||:||||||||||
Zfish  1590 TAWVQKIKAASELFIETEKRKREKAYLVRSQRATGIGRLMVNIVEGIELKPCRSNGKSNPYCEVT 1654

Human  1625 MGSQCHITKTIQDTLNPKWNSNCQFFIRDLEQEVLCITVFERDQFSPDDFLGRTEIRVADIKKDQ 1689
            ||||||:|||:||||||||||||||||:||||:|||:||||||||||||||||||||:|||||||
Zfish  1655 MGSQCHVTKTLQDTLNPKWNSNCQFFIKDLEQDVLCVTVFERDQFSPDDFLGRTEIRLADIKKDQ 1719

Human  1690 GSKGPVTKCLLLHEVPTGEIVVRLDLQLFDEP 1721
            |||||:||.|||||||||||||||||||||||
Zfish  1720 GSKGPITKRLLLHEVPTGEIVVRLDLQLFDEP 1751

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ITSN1NP_003015.2 EH 14..108 CDD:197477 75/94 (80%)
EH 214..309 CDD:197477 83/94 (88%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 322..348 12/25 (48%)
KLERQ 326..702 260/390 (67%)
Smc <363..>684 CDD:440809 232/335 (69%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 650..701 7/61 (11%)
SH3_Intersectin1_1 744..803 CDD:212920 54/58 (93%)
INTAP 803..917 CDD:435467 72/141 (51%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 836..868 17/41 (41%)
SH3_Intersectin1_2 917..968 CDD:212922 49/50 (98%)
SH3_Intersectin1_3 1006..1057 CDD:212924 42/50 (84%)
SH3_Intersectin1_4 1074..1138 CDD:212926 61/63 (97%)
Required for interaction with FCHSD2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:29887380 1074..1138 61/63 (97%)
Bipartite nuclear localization signal, in isoform 2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:29599122 1104..1127 22/22 (100%)
SH3_Intersectin1_5 1158..1211 CDD:212928 46/52 (88%)
RhoGEF 1238..1421 CDD:238091 167/182 (92%)
PH_13 1440..1582 CDD:465218 134/141 (95%)
C2_Intersectin 1582..1716 CDD:176021 123/133 (92%)
itsn1XP_005171028.1 EH 15..112 CDD:197477 76/96 (79%)
EH 215..293 CDD:197477 71/77 (92%)
SMC_prok_B 438..>646 CDD:274008 157/208 (75%)
SH3_Intersectin1_1 731..790 CDD:212920 54/58 (93%)
INTAP 790..932 CDD:435467 72/141 (51%)
SH3_Intersectin1_2 932..983 CDD:212922 49/50 (98%)
SH3 1034..1085 CDD:473055 42/50 (84%)
SH3_Intersectin1_4 1102..1166 CDD:212926 61/63 (97%)
SH3_Intersectin1_5 1188..1241 CDD:212928 46/52 (88%)
RhoGEF 1268..1451 CDD:238091 167/182 (92%)
PH_13 1470..1612 CDD:465218 134/141 (95%)
C2_Intersectin 1612..1746 CDD:176021 123/133 (92%)

Return to query results.
Submit another query.