DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ITSN1 and Itsn1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_003015.2 Gene:ITSN1 / 6453 HGNCID:6183 Length:1721 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038944174.1 Gene:Itsn1 / 29491 RGDID:2935 Length:1718 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1721 Identity:1628/1721 - (94%)
Similarity:1667/1721 - (96%) Gaps:3/1721 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAQFPTPFGGSLDIWAITVEERAKHDQQFHSLKPISGFITGDQARNFFFQSGLPQPVLAQIWALA 65
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAQFPTPFGGSLDIWAITVEERAKHDQQFQSLKPISGFITGDQARNFFFQSGLPQPVLAQIWALA 65

Human    66 DMNNDGRMDQVEFSIAMKLIKLKLQGYQLPSALPPVMKQQPVAISSAPAFGMGGIASMPPLTAVA 130
            |||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||:||:|.||||||||
  Rat    66 DMNKDGRMDQVEFSIAMKLIKLKLQGYQLPPALPPVMKQQPAAISSAPAFGIGGMAGMPPLTAVA 130

Human   131 PVPMGSIPVVGMSPTLVSSVPTAAVPPLANGAPPVIQPLPAFAHPAATLPKSSSFSRSGPGSQLN 195
            ||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 PVPMGSIPVVGMSPPLVSSVPQAAVPPLANGAPPVIQPLPAFAHPAATLPKSSSFSRSGPGSQLN 195

Human   196 TKLQKAQSFDVASVPPVAEWAVPQSSRLKYRQLFNSHDKTMSGHLTGPQARTILMQSSLPQAQLA 260
            |||||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 TKLQKAQSFDVASAPAAAEWAVPQSSRLKYRQLFNSHDKTMSGHLTGPQARTILMQSSLPQAQLA 260

Human   261 SIWNLSDIDQDGKLTAEEFILAMHLIDVAMSGQPLPPVLPPEYIPPSFRRVRSGSGISVISSTSV 325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:|.
  Rat   261 SIWNLSDIDQDGKLTAEEFILAMHLIDVAMSGQPLPPVLPPEYIPPSFRRVRSGSGMSVISSSSA 325

Human   326 DQRLPEEPVLEDEQQQLEKKLPVTFEDKKRENFERGNLELEKRRQALLEQQRKEQERLAQLERAE 390
            ||||||||..||| ||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 DQRLPEEPSSEDE-QQVEKKLPVTFEDKKRENFERGNLELEKRRQALLEQQRKEQERLAQLERAE 389

Human   391 QERKERERQEQERKRQLELEKQLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKRELERQRQLEWERNRRQ 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   390 QERKERERQEQERKRQLELEKQLEKQRELERQREEERRKEIERREAAKRELERQRQLEWERNRRQ 454

Human   456 ELLNQRNKEQEDIVVLKAKKKTLEFELEALNDKKHQLEGKLQDIRCRLTTQRQEIESTNKSRELR 520
            |||.||||:||.||||||::||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
  Rat   455 ELLTQRNKDQEGIVVLKARRKTLEFELEALNDKKHQLEGKLQDIRCRLATQRQEIESTNKSRELR 519

Human   521 IAEITHLQQQLQESQQMLGRLIPEKQILNDQLKQVQQNSLHRDSLVTLKRALEAKELARQHLRDQ 585
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||:||||||||||||||.||:|
  Rat   520 IAEITHLQQQLQESQQMLGRLIPEKQILSDQLKQVQQNSLHRDSLLTLKRALEAKELARQQLREQ 584

Human   586 LDEVEKETRSKLQEIDIFNNQLKELREIHNKQQLQKQKSMEAERLKQKEQERKIIELEKQKEEAQ 650
            ||||||||||||||||:||||||||||||:|||||||:|:|||||||||||||.:||||||||.|
  Rat   585 LDEVEKETRSKLQEIDVFNNQLKELREIHSKQQLQKQRSIEAERLKQKEQERKSLELEKQKEEGQ 649

Human   651 RRAQERDKQWLEHVQQEDEHQRPRKLHEEEKLKREESVKKKDGEEKGKQEAQDKLGRLFHQHQEP 715
            ||.|||||||.|||||| |.|||||.|||:|||||:|||||:.||:.|.|.|||..||||.||||
  Rat   650 RRVQERDKQWQEHVQQE-EQQRPRKPHEEDKLKREDSVKKKEAEERAKPEVQDKQSRLFHPHQEP 713

Human   716 AKPAVQAPWSTAEKGPLTISAQENVKVVYYRALYPFESRSHDEITIQPGDIVMVKGEWVDESQTG 780
            |||| ||||.|.|||||||||||:.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   714 AKPA-QAPWPTTEKGPLTISAQESAKVVYYRALYPFESRSHDEITIQPGDIVMVKGEWVDESQTG 777

Human   781 EPGWLGGELKGKTGWFPANYAEKIPENEVPAPVKPVTDSTSAPAPKLALRETPAPLAVTSSEPST 845
            ||||||||||||||||||||||||||||:|.|.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
  Rat   778 EPGWLGGELKGKTGWFPANYAEKIPENEIPTPAKPVTDLTSAPAPKLALRETPAPLPVTSSEPST 842

Human   846 TPNNWADFSSTWPTSTNEKPETDNWDAWAAQPSLTVPSAGQLRQRSAFTPATATGSSPSPVLGQG 910
            |||||||||||||:||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   843 TPNNWADFSSTWPSSTNEKPETDNWDTWAAQPSLTVPSAGQLRQRSAFTPATATGSSPSPVLGQG 907

Human   911 EKVEGLQAQALYPWRAKKDNHLNFNKNDVITVLEQQDMWWFGEVQGQKGWFPKSYVKLISGPIRK 975
            ||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
  Rat   908 EKVEGLQAQALYPWRAKKDNHLNFNKSDVITVLEQQDMWWFGEVQGQKGWFPKSYVKLISGPVRK 972

Human   976 STSMDSGSSESPASLKRVASPAAKPVVSGEEFIAMYTYESSEQGDLTFQQGDVILVTKKDGDWWT 1040
            |||:|:|.:|:|:||||||||||||.:.||||:|||||||||.|||||||||||:||||||||||
  Rat   973 STSIDTGPTEAPSSLKRVASPAAKPAIPGEEFVAMYTYESSEHGDLTFQQGDVIVVTKKDGDWWT 1037

Human  1041 GTVGDKAGVFPSNYVRLKDSEGSGTAGKTGSLGKKPEIAQVIASYTATGPEQLTLAPGQLILIRK 1105
            ||||:.:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1038 GTVGETSGVFPSNYVRLKDSEGSGTAGKTGSLGKKPEIAQVIASYTATGPEQLTLAPGQLILIRK 1102

Human  1106 KNPGGWWEGELQARGKKRQIGWFPANYVKLLSPGTSKITPTEPPKSTALAAVCQVIGMYDYTAQN 1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||:....|||||||||||||||
  Rat  1103 KNPGGWWEGELQARGKKRQIGWFPANYVKLLSPGTSKITPTELPKTAVQPAVCQVIGMYDYTAQN 1167

Human  1171 DDELAFNKGQIINVLNKEDPDWWKGEVNGQVGLFPSNYVKLTTDMDPSQQWCSDLHLLDMLTPTE 1235
            ||||||:||||||||:|||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1168 DDELAFSKGQIINVLSKEDPDWWKGEVSGQVGLFPSNYVKLTTDMDPSQQWCSDLHLLDMLTPTE 1232

Human  1236 RKRQGYIHELIVTEENYVNDLQLVTEIFQKPLMESELLTEKEVAMIFVNWKELIMCNIKLLKALR 1300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1233 RKRQGYIHELIVTEENYVNDLQLVTEIFQKPLTESELLTEKEVAMIFVNWKELIMCNIKLLKALR 1297

Human  1301 VRKKMSGEKMPVKMIGDILSAQLPHMQPYIRFCSRQLNGAALIQQKTDEAPDFKEFVKRLAMDPR 1365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1298 VRKKMSGEKMPVKMIGDILSAQLPHMQPYIRFCSCQLNGAALIQQKTDEAPDFKEFVKRLAMDPR 1362

Human  1366 CKGMPLSSFILKPMQRVTRYPLIIKNILENTPENHPDHSHLKHALEKAEELCSQVNEGVREKENS 1430
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1363 CKGMPLSSFILKPMQRVTRYPLIIKNILENTPENHPDHSHLKHALEKAEELCSQVNEGVREKENS 1427

Human  1431 DRLEWIQAHVQCEGLSEQLVFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYKAKSNKELYGFLFNDFLLLTQITKP 1495
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1428 DRLEWIQAHVQCEGLSEQLVFNSVTNCLGPRKFLHSGKLYKAKSNKELYGFLFNDFLLLTQITKP 1492

Human  1496 LGSSGTDKVFSPKSNLQYKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSGDEPIFHISHIDRVYTLRAESINERT 1560
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1493 LGSSSTDKVFSPKSNLQYKMYKTPIFLNEVLVKLPTDPSGDEPIFHISHIDRVYTLRAESINERT 1557

Human  1561 AWVQKIKAASELYIETEKKKREKAYLVRSQRATGIGRLMVNVVEGIELKPCRSHGKSNPYCEVTM 1625
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1558 AWVQKIKAASELYIETEKKKREKAYLVRSQRATGIGRLMVNVVEGIELKPCRSHGKSNPYCEVTM 1622

Human  1626 GSQCHITKTIQDTLNPKWNSNCQFFIRDLEQEVLCITVFERDQFSPDDFLGRTEIRVADIKKDQG 1690
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1623 GSQCHITKTIQDTLNPKWNSNCQFFIRDLEQEVLCITVFERDQFSPDDFLGRTEIRVADIKKDQG 1687

Human  1691 SKGPVTKCLLLHEVPTGEIVVRLDLQLFDEP 1721
            |||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1688 SKGPVTKCLLLHEVPTGEIVVRLDLQLFDEP 1718

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ITSN1NP_003015.2 EH 14..108 CDD:197477 90/93 (97%)
EH 214..309 CDD:197477 94/94 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 322..348 19/25 (76%)
KLERQ 326..702 342/375 (91%)
Smc <363..>684 CDD:440809 297/320 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 650..701 38/50 (76%)
SH3_Intersectin1_1 744..803 CDD:212920 58/58 (100%)
INTAP 803..917 CDD:435467 106/113 (94%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 836..868 29/31 (94%)
SH3_Intersectin1_2 917..968 CDD:212922 49/50 (98%)
SH3_Intersectin1_3 1006..1057 CDD:212924 44/50 (88%)
SH3_Intersectin1_4 1074..1138 CDD:212926 63/63 (100%)
Required for interaction with FCHSD2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:29887380 1074..1138 63/63 (100%)
Bipartite nuclear localization signal, in isoform 2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:29599122 1104..1127 22/22 (100%)
SH3_Intersectin1_5 1158..1211 CDD:212928 49/52 (94%)
RhoGEF 1238..1421 CDD:238091 180/182 (99%)
PH_13 1440..1582 CDD:465218 140/141 (99%)
C2_Intersectin 1582..1716 CDD:176021 133/133 (100%)
Itsn1XP_038944174.1 EH 14..106 CDD:197477 88/91 (97%)
Atrophin-1 <85..>194 CDD:460830 101/108 (94%)
EH 217..309 CDD:197477 91/91 (100%)
Smc <362..>655 CDD:440809 274/292 (94%)
MAP7 605..714 CDD:461709 87/109 (80%)
SH3 741..800 CDD:473055 58/58 (100%)
INTAP 800..914 CDD:435467 106/113 (94%)
SH3_Intersectin1_2 914..965 CDD:212922 49/50 (98%)
SH3 1003..1054 CDD:473055 44/50 (88%)
SH3_Intersectin1_4 1071..1135 CDD:212926 63/63 (100%)
SH3_Intersectin1_5 1155..1208 CDD:212928 49/52 (94%)
RhoGEF 1235..1418 CDD:238091 180/182 (99%)
PH_13 1437..1579 CDD:465218 140/141 (99%)
C2_Intersectin 1579..1713 CDD:176021 133/133 (100%)

Return to query results.
Submit another query.