DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ABCG4 and Abcg4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_071452.2 Gene:ABCG4 / 64137 HGNCID:13884 Length:646 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001100286.2 Gene:Abcg4 / 300664 RGDID:1305840 Length:646 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:646 Identity:623/646 - (96%)
Similarity:633/646 - (97%) Gaps:0/646 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAEKALEAVGCGLGPGAVAMAVTLEDGAEPPVLTTHLKKVENHITEAQRFSHLPKRSAVDIEFVE 65
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAEKALEAVGCGLGPGAVAMAVALEDGAEPPVLTTHLKKVENHITEAQRFSHLPKRSAVDIEFVE 65

Human    66 LSYSVREGPCWRKRGYKTLLKCLSGKFCRRELIGIMGPSGAGKSTFMNILAGYRESGMKGQILVN 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 LSYSVREGPCWRKRGYKTLLKCLSGKFCRRELIGIMGPSGAGKSTFMNILAGYRESGMKGQILVN 130

Human   131 GRPRELRTFRKMSCYIMQDDMLLPHLTVLEAMMVSANLKLSEKQEVKKELVTEILTALGLMSCSH 195
            ||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 GRPRDLRTFRKMSCYIMQDDMLLPHLTVLEAMMVSANLKLSEKQEVKKELVTEILTALGLMSCSH 195

Human   196 TRTALLSGGQRKRLAIALELVNNPPVMFFDEPTSGLDSASCFQVVSLMKSLAQGGRTIICTIHQP 260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||:|||||||
  Rat   196 TRTALLSGGQRKRLAIALELVNNPPVMFFDEPTSGLDSASCFQVVSLMKSLAHGGRTVICTIHQP 260

Human   261 SAKLFEMFDKLYILSQGQCIFKGVVTNLIPYLKGLGLHCPTYHNPADFIIEVASGEYGDLNPMLF 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 SAKLFEMFDKLYILSQGQCIFKGVVTNLIPYLKGLGLHCPTYHNPADFIIEVASGEYGDLNPMLF 325

Human   326 RAVQNGLCAMAEKKSSPEKNEVPAPCPPCPPEVDPIESHTFATSTLTQFCILFKRTFLSILRDTV 390
            ||||||||.|||||||||||||||.||.||||:||||||||||||||||||||:|||||||||||
  Rat   326 RAVQNGLCTMAEKKSSPEKNEVPAHCPTCPPELDPIESHTFATSTLTQFCILFRRTFLSILRDTV 390

Human   391 LTHLRFMSHVVIGVLIGLLYLHIGDDASKVFNNTGCLFFSMLFLMFAALMPTVLTFPLEMAVFMR 455
            ||||||||||:||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 LTHLRFMSHVLIGVLIGLLYLHIGDDASKVFNNTGFLFFSMLFLMFAALMPTVLTFPLEMAVFMR 455

Human   456 EHLNYWYSLKAYYLAKTMADVPFQVVCPVVYCSIVYWMTGQPAETSRFLLFSALATATALVAQSL 520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.|||||||||
  Rat   456 EHLNYWYSLKAYYLAKTMADVPFQVVCPVVYCSIVYWMTGQPAETSRFLLFSALSIATALVAQSL 520

Human   521 GLLIGAASNSLQVATFVGPVTAIPVLLFSGFFVSFKTIPTYLQWSSYLSYVRYGFEGVILTIYGM 585
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||
  Rat   521 GLLIGAASTSLQVATFVGPVTAIPVLLFSGFFVSFKTIPTYLQWSSYLSYVRYGFEGLILTIYGM 585

Human   586 ERGDLTCLEERCPFREPQSILRALDVEDAKLYMDFLVLGIFFLALRLLAYLVLRYRVKSER 646
            |||.|||||:.||||:||.||..||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 ERGHLTCLEDHCPFRDPQIILHELDVEEAKLYMDFLVLGIFFLALRLLAYLVLRYRVKSER 646

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ABCG4NP_071452.2 3a01204 44..646 CDD:273361 579/601 (96%)
Abcg4NP_001100286.2 3a01204 44..646 CDD:273361 579/601 (96%)

Return to query results.
Submit another query.