DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment THADA and Thada

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_071348.3 Gene:THADA / 63892 HGNCID:19217 Length:1953 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001178698.1 Gene:Thada / 313865 RGDID:1560519 Length:1937 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1955 Identity:1547/1955 - (79%)
Similarity:1710/1955 - (87%) Gaps:20/1955 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGVKKKKEMQVAALTICHQDLETLKSFADVEGKNLASLLLHCVQLTDGVSQIHYIKQIVPLLEKA 65
            ||||||:|||.||||:||||||||:||||||||||||||||||||||||||||.:|||||||||.
  Rat     1 MGVKKKREMQFAALTVCHQDLETLRSFADVEGKNLASLLLHCVQLTDGVSQIHSVKQIVPLLEKV 65

Human    66 DKNGMCDPTIQSCLDILAGIYLSLSLKNPLKKVLASSLNSLPDFFLPEAMHRFTSRLQEELNTTD 130
            ||||:|||.||.||||||.||.||:||||||||||||||.||:.||.||.|.||..|||||:|.|
  Rat    66 DKNGVCDPIIQRCLDILASIYFSLTLKNPLKKVLASSLNGLPECFLNEAAHSFTFHLQEELDTAD 130

Human   131 LYSYRKVTDNISSCMENFNLGRASVNNLLKNVLHFLQKSLIEILEENRKCAGNHIIQTQLMNDLL 195
            |:|||||.|||||||||||||||||.|||:||||||||||||:.|||||.|||||:|||||||||
  Rat   131 LHSYRKVMDNISSCMENFNLGRASVVNLLQNVLHFLQKSLIEVQEENRKFAGNHIVQTQLMNDLL 195

Human   196 VGIRVSMMLVQKVQDFQGNLWKTSDSPIWQNMCGLLSIFTKVLSDDDLLQTVQSTSGLAIILFIK 260
            ||:||:|.||||||..|.|||..|.|||||:|||||||||:.|:|||||||:|||||||:|||||
  Rat   196 VGVRVAMTLVQKVQGPQSNLWNDSSSPIWQSMCGLLSIFTRFLNDDDLLQTIQSTSGLAVILFIK 260

Human   261 TMFHPSEKIPHLISSVLLRSVDCTSVPEWFMSSCRSLCCGDISQSAVLFLCQGTLAMLDWQNGSM 325
            |||.||||:|.||||:||:|.||||:|:|.|||||||||.|:..||:||||||||||||||:|||
  Rat   261 TMFRPSEKLPGLISSLLLQSADCTSIPDWLMSSCRSLCCADVPASALLFLCQGTLAMLDWQDGSM 325

Human   326 GRSGEALLLDTAHVLFTLSSQIKEPTLEMFLSRILASWTNSAIQVLESSSPSLTDSLNGNSSIVG 390
            |.|.|||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||:||||||||.|.|||:|||..
  Rat   326 GPSREALLLDTVHVLFTLSSQIKESTLEMFLSRILASWTNSAIQILESSSPSLKDHLNGDSSIPR 390

Human   391 RLLEYVYTHWEHPLDALRHQTKIMFKNLLQMHRLTVEGADFVPDPFFVELTESLLRLEWHIKGKY 455
            |||||||||||||||||||||||:|:|||||||||:||||.|.||||:|||:|||:|||||||||
  Rat   391 RLLEYVYTHWEHPLDALRHQTKIIFRNLLQMHRLTIEGADLVTDPFFLELTKSLLQLEWHIKGKY 455

Human   456 TCLGCLVECIGVEHILAIDKTIPSQILEVMGDQSLVPYASDLLETMFRNHKSHLKSQTAESSWID 520
            .|||.|||.:|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||..::|:|
  Rat   456 ACLGYLVESLGIEHILAIDKTIPSQILEVMGDQSLVPYASDLLETMFKNHKSHLKSQTVTNTWMD 520

Human   521 QWHETWVSPLLFILCEGNLDQKSYVIDYYLPKLLSYSPESLQYMVKILQTSIDAKTGQEQSFPSL 585
            :||||||.|:|.:||.|||||:|||||||||:||:||||||.|||:||||.||.:|         
  Rat   521 KWHETWVFPVLSVLCGGNLDQRSYVIDYYLPRLLNYSPESLHYMVQILQTPIDTET--------- 576

Human   586 GSCNSRGALGALMACLRIARAHGHLQSATDTWENLVSDARIKQGLIHQHCQVRIDTLGLLCESNR 650
            ||||.||||||||||||.|||||||||||..|||||..||:||||||||||||||||||||||:|
  Rat   577 GSCNHRGALGALMACLRTARAHGHLQSATHAWENLVCSARVKQGLIHQHCQVRIDTLGLLCESSR 641

Human   651 STEIVSMEEMQWIQFFITYNLNSQSPGVRQQICSLLKKLFCRIQESSQVLYKLEQSKSKREPENE 715
            |||:||.|||||:|||:|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..|..:.|..
  Rat   642 STEVVSREEMQWVQFFLTYNLNSQSPGVRQQICSLLTKLFCRIQESSQVLYKLEQRNSTPDSEKR 706

Human   716 LTKQHPSVSLQQYKNFMSSICNSLFEALFPGSSYSTRFSALTILGSIAEVFHVPEGRIYTVYQLS 780
            .|::.||||||||||||||:||.||||||||||||||||||||||||||||...:|.|.||||||
  Rat   707 STREQPSVSLQQYKNFMSSVCNILFEALFPGSSYSTRFSALTILGSIAEVFPASKGNIQTVYQLS 771

Human   781 HDIDVGRFQTLMECFTSTFEDVKILAFDLLMKLSK-TAVHFQDSGKLQGLFQAALELSTSTKPYD 844
            ||||.||||.||||||||||:||.|||||||.||. ||...|.|.|||.||||||||||||||||
  Rat   772 HDIDAGRFQILMECFTSTFEEVKTLAFDLLMNLSSVTAGQLQGSEKLQDLFQAALELSTSTKPYD 836

Human   845 CVTASYLLNFLIWQDALPSSLSAYLTQQVACDNGDRPAAVVERNTLMVIKCLMENLEEEVSQAEN 909
            |||||||||.||||||||:||||...||..|..|:: :||||||||:||||||||||:|:|||||
  Rat   837 CVTASYLLNLLIWQDALPASLSASSAQQPTCGAGEK-SAVVERNTLVVIKCLMENLEDEISQAEN 900

Human   910 SLLQAAAAFPMYGRVHCITGALQKLSLNSLQLVSEWRPVVEKLLLMSYRLSTVVSPVIQSSSPEG 974
            ||||||::|||||||||||.|.|||.|:.|:|||||:||:.||||:|||||||||||||||||||
  Rat   901 SLLQAASSFPMYGRVHCITRAFQKLPLHDLRLVSEWKPVLGKLLLLSYRLSTVVSPVIQSSSPEG 965

Human   975 LIPMDTDSESASRLQMILNEIQPRDTNDYFNQAKILKEHDSFDMKDLNASVVNIDTSTEIKGKEV 1039
            |||||||||||||||:||||||||||||||:|||||||.||||::||:.||.|||:|.||||||.
  Rat   966 LIPMDTDSESASRLQVILNEIQPRDTNDYFSQAKILKECDSFDLEDLSTSVSNIDSSAEIKGKEE 1030

Human  1040 KTCDVTAQMVLVCCWRSMKEVALLLGMLCQLLPMQPVPESSDGLLTVEQVKEIGDYFKQHLLQSR 1104
            |.|||||||||.||||||||||||||.||||||:||||||:.|||||:||||||:||||||||||
  Rat  1031 KACDVTAQMVLTCCWRSMKEVALLLGTLCQLLPLQPVPESAAGLLTVQQVKEIGEYFKQHLLQSR 1095

Human  1105 HRGAFELAYTGFVKLTEVLNRCPNVSLQKLPEQWLWSVLEEIKCSDPSSKLCATRRSAGIPFYIQ 1169
            |||||||||||||||||:||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
  Rat  1096 HRGAFELAYTGFVKLTEILNRCSNVSLQKLPEQWLWSVLEEIKSSDPSSKLCATRRSAGIPFYIQ 1160

Human  1170 ALLASEPKKGRMDLLKITMKELISLAGPTDDIQSTVPQVHALNILRALFRDTRLGENIIPYVADG 1234
            |||||||||||||||::||:||||||...||.:..||||||||||||||||||||||||||||.|
  Rat  1161 ALLASEPKKGRMDLLRVTMRELISLALSADDSKGRVPQVHALNILRALFRDTRLGENIIPYVAGG 1225

Human  1235 AKAAILGFTSPVWAVRNSSTLLFSALITRIFGVKRAKDEHSKTNRMTGREFFSRFPELYPFLLKQ 1299
            ||||||||||||||||||||||||:||||:|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||
  Rat  1226 AKAAILGFTSPVWAVRNSSTLLFSSLITRVFGVKRGKDELSKTNRMTGREFFSRFPELYPFLLKQ 1290

Human  1300 LETVANTVDSDMGEPNRHPSMFLLLLVLERLYASPMDGTSSALSMGPFVPFIMRCGHSPVYHSRE 1364
            |||||||||||:|:|:.||.||||||||||||.||||||:|.||:.||||||:|||.||.|.|||
  Rat  1291 LETVANTVDSDLGDPDGHPGMFLLLLVLERLYPSPMDGTASTLSLAPFVPFIIRCGRSPFYRSRE 1355

Human  1365 MAARALVPFVMIDHIPNTIRTLLSTLPSCTDQCFRQNHIHGTLLQVFHLLQAY-SDSKHGTNSDF 1428
            |||||||||:.||.||:|:..||.:|||.|||||||||||||||||||||||| :||||..|:||
  Rat  1356 MAARALVPFITIDQIPSTLHALLDSLPSSTDQCFRQNHIHGTLLQVFHLLQAYITDSKHRINADF 1420

Human  1429 QHELTDITVCTKAKLWLAKRQNPCLVTRAVYIDILFLLTCCLNRSAKDNQPVLESLGFWEEVRGI 1493
            ..||:|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||:|..:.....||||.|||:||.|
  Rat  1421 LQELSDITVCTKAKLWLAMRQNPCLVTRAVYIDILFLLTHCLDRPEEGKHTALESLDFWEDVRRI 1485

Human  1494 ISGSELITGFPWAFKVPGLPQYLQSLTRLAIAAVWAAAAKSGERETNVPISFSQLLESAFPEVRS 1558
            |.||||||||||.||||||||||||||:|||..|||:.|::..:.|.||:||||||:|:|||||.
  Rat  1486 ILGSELITGFPWTFKVPGLPQYLQSLTKLAIPEVWASLAEAEGQATAVPLSFSQLLKSSFPEVRL 1550

Human  1559 LTLEALLEKFLAAASGLGEKGVPPLLCNMGEKFLLLAMKENHPECFCKILKILHCMDPGEWLPQT 1623
            |.|:||||:  ||:|..|:||.||||.:|||:||||||||:||.|||::||||:.::|.||||||
  Rat  1551 LALDALLER--AASSEQGQKGPPPLLYSMGEEFLLLAMKEDHPGCFCRVLKILYHLNPSEWLPQT 1613

Human  1624 EHCVHLTPKEFLIWTMDIASNERSEIQSVALRLASKVISHHMQTCVENRELIAAELKQWVQLVIL 1688
            |..|||:|||||:||||||||:|||||.|:||||||:|::.:|:|.:|::.:|.||::||||::.
  Rat  1614 ECSVHLSPKEFLVWTMDIASNDRSEIQGVSLRLASKIIAYLVQSCEKNKDSVALELRRWVQLIVW 1678

Human  1689 SCEDHLPTESRLAVVEVLTSTTPLFLTNPHPILELQDTLALWKCVLTLLQSEEQAVRDAATETVT 1753
            ||.|||||.|||||.|||:.|.|||||:|.|||:|||||:||:|||||||||||.||:|||||||
  Rat  1679 SCGDHLPTASRLAVAEVLSGTAPLFLTSPQPILDLQDTLSLWRCVLTLLQSEEQPVREAATETVT 1743

Human  1754 TAMSQENTCQSTEFAFCQVDASIALALALAVLCDLLQQWDQLAPGLPILLGWLLGESDDLVACVE 1818
            |||||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||||.|..||...::
  Rat  1744 TAMSQGNTCQSTEFAFCQVDASIALTLAFAVLCDLLQQWDQLGPGLPILLGWLLEEGGDLKDLMQ 1808

Human  1819 SMHQVEEDYLFEKAEVNFWAETLIFVKYLCKHLFCLLSKSGWRPPSPEMLCHLQRMVSEQCHLLS 1883
            |.||.||:::|||:|||||||||.||||||..:|.||.:||.: .|...|.||||..|||..|:|
  Rat  1809 SPHQGEEEHIFEKSEVNFWAETLTFVKYLCNQVFHLLCQSGCQ-SSHSQLSHLQRTASEQHRLIS 1872

Human  1884 QFFRELPPAAEFVKTVEFTRLRIQEERTLACLRLLAFLEGKEGEDTLVLSVWDSYAESRQLTLPR 1948
            |.|||||.:|||:||||:||||||||||||.|||||.|||||     ||...|...|.||...||
  Rat  1873 QLFRELPLSAEFLKTVEYTRLRIQEERTLAVLRLLACLEGKE-----VLRAEDCPREWRQEMAPR 1932

Human  1949 TEAAC 1953
            |||||
  Rat  1933 TEAAC 1937

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
THADANP_071348.3 COG5543 394..>1484 CDD:227830 895/1091 (82%)
DUF2428 947..1248 CDD:463054 264/300 (88%)
ThadaNP_001178698.1 COG5543 394..>1408 CDD:227830 846/1023 (83%)
DUF2428 938..1239 CDD:463054 264/300 (88%)

Return to query results.
Submit another query.