DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment THADA and Thada

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001077422.1 Gene:THADA / 63892 HGNCID:19217 Length:1953 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_898842.2 Gene:Thada / 240174 MGIID:3039623 Length:1938 Species:Mus musculus


Alignment Length:1955 Identity:1532/1955 - (78%)
Similarity:1704/1955 - (87%) Gaps:19/1955 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGVKKKKEMQVAALTICHQDLETLKSFADVEGKNLASLLLHCVQLTDGVSQIHYIKQIVPLLEKA 65
            ||||||:||||||||:||||:|||:||||:|||||||||||||||||||||||.||||||||||.
Mouse     1 MGVKKKREMQVAALTVCHQDMETLRSFADMEGKNLASLLLHCVQLTDGVSQIHSIKQIVPLLEKV 65

Human    66 DKNGMCDPTIQSCLDILAGIYLSLSLKNPLKKVLASSLNSLPDFFLPEAMHRFTSRLQEELNTTD 130
            ||||:|||.||||||||||||.||:||||||||||||||.||:.||.:|.|.||..|||||:|.|
Mouse    66 DKNGVCDPAIQSCLDILAGIYFSLTLKNPLKKVLASSLNGLPEVFLTQATHSFTFHLQEELDTAD 130

Human   131 LYSYRKVTDNISSCMENFNLGRASVNNLLKNVLHFLQKSLIEILEENRKCAGNHIIQTQLMNDLL 195
            |||||||.|||||||||||||||||.||||:||||||||||||||||||.|||.|:|||||:|||
Mouse   131 LYSYRKVMDNISSCMENFNLGRASVVNLLKDVLHFLQKSLIEILEENRKFAGNRIVQTQLMSDLL 195

Human   196 VGIRVSMMLVQKVQDFQGNLWKTSDSPIWQNMCGLLSIFTKVLSDDDLLQTVQSTSGLAIILFIK 260
            ||:||:|.||||||..||:||..|.|||||:||||||||||.|:||||||||:||||||:|||||
Mouse   196 VGVRVAMTLVQKVQGPQGSLWNDSSSPIWQSMCGLLSIFTKFLNDDDLLQTVESTSGLAVILFIK 260

Human   261 TMFHPSEKIPHLISSVLLRSVDCTSVPEWFMSSCRSLCCGDISQSAVLFLCQGTLAMLDWQNGSM 325
            |||.||||:|.||||:||||.:|||:|||.|:|||||||.|:..|.:||||||||||||||:|||
Mouse   261 TMFRPSEKLPGLISSLLLRSAECTSIPEWLMNSCRSLCCTDVPASTLLFLCQGTLAMLDWQDGSM 325

Human   326 GRSGEALLLDTAHVLFTLSSQIKEPTLEMFLSRILASWTNSAIQVLESSSPSLTDSLNGNSSIVG 390
            |.||||||||..||||||||||||.||:|||||||||||:||||:|||.|..|...|||:|.:..
Mouse   326 GPSGEALLLDIVHVLFTLSSQIKESTLDMFLSRILASWTSSAIQILESGSSGLKGHLNGDSCVPR 390

Human   391 RLLEYVYTHWEHPLDALRHQTKIMFKNLLQMHRLTVEGADFVPDPFFVELTESLLRLEWHIKGKY 455
            ||||||||||||||||||||||:||:|||||||||:||||...|||.:|||:|||:|||||||||
Mouse   391 RLLEYVYTHWEHPLDALRHQTKVMFRNLLQMHRLTMEGADLATDPFCLELTKSLLQLEWHIKGKY 455

Human   456 TCLGCLVECIGVEHILAIDKTIPSQILEVMGDQSLVPYASDLLETMFRNHKSHLKSQTAESSWID 520
            .|||||||.:|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||..::|:|
Mouse   456 ACLGCLVETLGIEHILAIDKTIPSQILEVMGDQSLVPYASDLLETMFKNHKSHLKSQTVTNTWMD 520

Human   521 QWHETWVSPLLFILCEGNLDQKSYVIDYYLPKLLSYSPESLQYMVKILQTSIDAKTGQEQSFPSL 585
            :||||||.|:|.:||.|||||:|||||||||::|:||||||.|||.|||.|.|..|         
Mouse   521 KWHETWVFPVLSVLCGGNLDQRSYVIDYYLPRILNYSPESLHYMVHILQASTDTGT--------- 576

Human   586 GSCNSRGALGALMACLRIARAHGHLQSATDTWENLVSDARIKQGLIHQHCQVRIDTLGLLCESNR 650
            ||||.||||||||||||.|||||||||||..|||||..||:||||||||||||||||||||||||
Mouse   577 GSCNHRGALGALMACLRTARAHGHLQSATQAWENLVCSARVKQGLIHQHCQVRIDTLGLLCESNR 641

Human   651 STEIVSMEEMQWIQFFITYNLNSQSPGVRQQICSLLKKLFCRIQESSQVLYKLEQSKSKREPENE 715
            |||:||.|||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..:.||.
Mouse   642 STEVVSTEEMQWVQFFITYNLNSQSPGVRQQICSLLKKLFCRIQESSQVLYKLEQRKSTPDSENG 706

Human   716 LTKQHPSVSLQQYKNFMSSICNSLFEALFPGSSYSTRFSALTILGSIAEVFHVPEGRIYTVYQLS 780
            ..::.|||:||||||||||:||.|||||||||||||||||||||||:||||..|||.|.||||||
Mouse   707 SIREQPSVTLQQYKNFMSSVCNILFEALFPGSSYSTRFSALTILGSVAEVFPDPEGNIQTVYQLS 771

Human   781 HDIDVGRFQTLMECFTSTFEDVKILAFDLLMKLSK-TAVHFQDSGKLQGLFQAALELSTSTKPYD 844
            ||||.||:|.||||||||||:||.||||||||||. ||..||||.|||.||||||||||||||||
Mouse   772 HDIDAGRYQILMECFTSTFEEVKTLAFDLLMKLSSVTAGQFQDSEKLQDLFQAALELSTSTKPYD 836

Human   845 CVTASYLLNFLIWQDALPSSLSAYLTQQVACDNGDRPAAVVERNTLMVIKCLMENLEEEVSQAEN 909
            |||||||||.||.|||||:.|||...||:....|: .:||:|||||:||||||||||:|:|||||
Mouse   837 CVTASYLLNLLIRQDALPAVLSASSPQQLTRGAGE-TSAVLERNTLVVIKCLMENLEDEISQAEN 900

Human   910 SLLQAAAAFPMYGRVHCITGALQKLSLNSLQLVSEWRPVVEKLLLMSYRLSTVVSPVIQSSSPEG 974
            ||||||::|||||||||||.|.|:|.||.|:|.|||||::.:|||:||||||||:||||||||||
Mouse   901 SLLQAASSFPMYGRVHCITRAFQRLPLNDLRLASEWRPLLGRLLLLSYRLSTVVAPVIQSSSPEG 965

Human   975 LIPMDTDSESASRLQMILNEIQPRDTNDYFNQAKILKEHDSFDMKDLNASVVNIDTSTEIKGKEV 1039
            |||:||||.||||||:|||||||||||||||..|||||.||||::||:.||.|||:|.|:||||.
Mouse   966 LIPVDTDSASASRLQLILNEIQPRDTNDYFNHTKILKECDSFDLEDLSTSVSNIDSSAEVKGKEE 1030

Human  1040 KTCDVTAQMVLVCCWRSMKEVALLLGMLCQLLPMQPVPESSDGLLTVEQVKEIGDYFKQHLLQSR 1104
            |.|||||||||.||||||||||||||.||||||:||.||||:..|||:|||||||||||||||||
Mouse  1031 KACDVTAQMVLACCWRSMKEVALLLGTLCQLLPVQPGPESSNVFLTVQQVKEIGDYFKQHLLQSR 1095

Human  1105 HRGAFELAYTGFVKLTEVLNRCPNVSLQKLPEQWLWSVLEEIKCSDPSSKLCATRRSAGIPFYIQ 1169
            |||||||||||||||||:||||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||
Mouse  1096 HRGAFELAYTGFVKLTEILNRCSNVSLQKLPEQWLRSVLEEIKGSDPSSKLCATRRSAGIPFYIQ 1160

Human  1170 ALLASEPKKGRMDLLKITMKELISLAGPTDDIQSTVPQVHALNILRALFRDTRLGENIIPYVADG 1234
            |||||||||.|||||||||:||||||...||.:..||||||||||||||||||||||||||||.|
Mouse  1161 ALLASEPKKSRMDLLKITMRELISLALSADDSKGRVPQVHALNILRALFRDTRLGENIIPYVAGG 1225

Human  1235 AKAAILGFTSPVWAVRNSSTLLFSALITRIFGVKRAKDEHSKTNRMTGREFFSRFPELYPFLLKQ 1299
            ||||||||||||||||||||||||:||||:|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||
Mouse  1226 AKAAILGFTSPVWAVRNSSTLLFSSLITRVFGVKRGKDEVSKTNRMTGREFFSRFPELYPFLLKQ 1290

Human  1300 LETVANTVDSDMGEPNRHPSMFLLLLVLERLYASPMDGTSSALSMGPFVPFIMRCGHSPVYHSRE 1364
            |||||:||||::|||:|||.||||||||||||.|||||||||||:.||||||:|||.||:|.|||
Mouse  1291 LETVASTVDSELGEPDRHPGMFLLLLVLERLYPSPMDGTSSALSLAPFVPFIIRCGRSPIYRSRE 1355

Human  1365 MAARALVPFVMIDHIPNTIRTLLSTLPSCTDQCFRQNHIHGTLLQVFHLLQAY-SDSKHGTNSDF 1428
            |||||||||:|||.||:|:..||::||:.|||||||||||||||||||||||| :|.:|.||:||
Mouse  1356 MAARALVPFIMIDQIPSTLCALLNSLPNSTDQCFRQNHIHGTLLQVFHLLQAYITDCRHRTNADF 1420

Human  1429 QHELTDITVCTKAKLWLAKRQNPCLVTRAVYIDILFLLTCCLNRSAKDNQPVLESLGFWEEVRGI 1493
            ..||:|:|.|||||||||.||||||||||||||||||||.||:|..:..|..||||||||:||.|
Mouse  1421 LQELSDVTACTKAKLWLAMRQNPCLVTRAVYIDILFLLTNCLDRPEEGKQTALESLGFWEDVRRI 1485

Human  1494 ISGSELITGFPWAFKVPGLPQYLQSLTRLAIAAVWAAAAKSGERETNVPISFSQLLESAFPEVRS 1558
            |..||||.||||.||||||||||||||:|||..|||:.|::..:.|.||:|||:||:|:|||||.
Mouse  1486 ILESELIKGFPWTFKVPGLPQYLQSLTKLAIPEVWASLAEAKGQATAVPLSFSRLLKSSFPEVRL 1550

Human  1559 LTLEALLEKFLAAASGLGEKGVPPLLCNMGEKFLLLAMKENHPECFCKILKILHCMDPGEWLPQT 1623
            |.|:.|||:  |.:|...:|...||||:|||:.|||||||:||.|||::||||:.::|.||||||
Mouse  1551 LALDTLLER--ARSSEQEQKEPLPLLCSMGEELLLLAMKEDHPGCFCRVLKILYHLNPSEWLPQT 1613

Human  1624 EHCVHLTPKEFLIWTMDIASNERSEIQSVALRLASKVISHHMQTCVENRELIAAELKQWVQLVIL 1688
            |...||:|||||:|:||||||:|||||.|||:||||:|::.:|:|.:|::.:|.||:||||||:.
Mouse  1614 ECYAHLSPKEFLMWSMDIASNDRSEIQGVALKLASKIIAYRVQSCEKNKDSLAPELRQWVQLVVW 1678

Human  1689 SCEDHLPTESRLAVVEVLTSTTPLFLTNPHPILELQDTLALWKCVLTLLQSEEQAVRDAATETVT 1753
            ||.|||||.|||||.||||||.|||||:|.||||||.||:||:|||||||||||.||:||||.||
Mouse  1679 SCGDHLPTASRLAVAEVLTSTAPLFLTSPQPILELQGTLSLWRCVLTLLQSEEQTVREAATEIVT 1743

Human  1754 TAMSQENTCQSTEFAFCQVDASIALALALAVLCDLLQQWDQLAPGLPILLGWLLGESDDLVACVE 1818
            |||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.|.|||...|:
Mouse  1744 TAMSQGNTCQSTEFAFCQVDASIALTLALAVLCDLLQQWDQLEPGLPILLGWLLEEGDDLEGHVQ 1808

Human  1819 SMHQVEEDYLFEKAEVNFWAETLIFVKYLCKHLFCLLSKSGWRPPSPEMLCHLQRMVSEQCHLLS 1883
            |.||.||:::|||:|||||||||.|||.||:.||.||.:|||:.|..:.||||||:.|||.||:|
Mouse  1809 SPHQGEEEHIFEKSEVNFWAETLTFVKSLCRQLFHLLCQSGWQSPHSQKLCHLQRIASEQSHLIS 1873

Human  1884 QFFRELPPAAEFVKTVEFTRLRIQEERTLACLRLLAFLEGKEGEDTLVLSVWDSYAESRQLTLPR 1948
            |.|||||.:|||:||||:||||||||||||.|||||.||||||     |...|...|.||:..||
Mouse  1874 QLFRELPLSAEFLKTVEYTRLRIQEERTLAVLRLLACLEGKEG-----LRAEDCPREWRQVMAPR 1933

Human  1949 TEAAC 1953
            |||||
Mouse  1934 TEAAC 1938

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
THADANP_001077422.1 DUF2428 952..1247 CDD:287339 254/294 (86%)
ThadaNP_898842.2 DUF2428 953..1239 CDD:370999 246/285 (86%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83972239
Domainoid 1 1.000 1505 1.000 Domainoid score I652
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5543
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H75175
Inparanoid 1 1.050 3029 1.000 Inparanoid score I601
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG40512
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0002253
OrthoInspector 1 1.000 - - oto117125
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_102243
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR14387
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 1 1.000 - - X2730
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1717.260

Return to query results.
Submit another query.