DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment THADA and thada

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_071348.3 Gene:THADA / 63892 HGNCID:19217 Length:1953 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_002932440.2 Gene:thada / 100485214 XenbaseID:XB-GENE-981605 Length:1920 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1957 Identity:1067/1957 - (54%)
Similarity:1373/1957 - (70%) Gaps:80/1957 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGVKKKKEMQVAALTICHQDLETLKSFADVEGKNLASLLLHCVQLTDGVSQIHYIKQIVPLL--- 62
            |.:|||||::|..|......::.||.|.|.:.:|:.:|||.||||.|||.|||.||||||:|   
 Frog     1 MVLKKKKELKVDVLVFDGPSIQRLKDFVDEKEQNVPALLLQCVQLQDGVQQIHCIKQIVPILGSL 65

Human    63 -EKADKNGMCDPTIQSCLDILAGIYLSLSLKNPLKKVLASSLNSLPDFFLPEAMHRFTSRLQEEL 126
             |.:...||    :.:|||:|:.:|.||:.||||||||||||||:||.:.|:|:..||..|.|::
 Frog    66 PEDSTNAGM----VCACLDVLSEMYFSLNSKNPLKKVLASSLNSVPDQYKPDAVSAFTRCLAEDI 126

Human   127 NTTDLYSYRKVTDNISSCMENFNLGRASVNNLLKNVLHFLQKSLIEILEENRKCAGNHIIQTQLM 191
            .|.|...||||.|:::||||||:||.:.|.:|....|.||::.|.....:|::..||.:.||||:
 Frog   127 ATEDPEQYRKVVDDLASCMENFSLGSSCVTSLFLEALQFLERVLRMFQSQNKRILGNGLAQTQLI 191

Human   192 NDLLVGIRVSMMLVQKVQD-FQGNLWKTSDSPIWQNMCGLLSIFTKVLSDDDLLQTVQSTSGLAI 255
            :|||..:::||:||||||| .|..|...|.:|:|:.:|.||..|..::.|:||||.||.|||:|:
 Frog   192 HDLLTAVKLSMILVQKVQDPIQTALQSCSAAPLWRTLCDLLGRFADLVMDEDLLQNVQCTSGMAV 256

Human   256 ILFIKTMFHPSEKIPHLISSVLLRSVDCTSVPEWFMSSCRSLCCGDISQSAVLFLCQGTLAMLDW 320
            :|::|||.|.|.|:|.|:|:|:|.:||....|:||:|.||..|. |:..:|::||.||.||||:|
 Frog   257 VLYLKTMLHDSSKLPKLVSNVILCTVDPVDTPDWFLSCCRRFCM-DLPDTALIFLGQGALAMLEW 320

Human   321 QNGSMGRSGEALLLDTAHVLFTLSSQIKEPTLEMFLSRILASWTNSAIQVLESSSPSLTDSLNGN 385
            ::||||...|.||||...||...||::||.:..|.|||:||.||.||:::|...|..|.|.|||.
 Frog   321 KDGSMGEGSEKLLLDLLDVLLFQSSRLKESSAAMLLSRVLALWTGSALELLTICSTGLKDKLNGR 385

Human   386 SSIVGRLLEYVYTHWEHPLDALRHQTKIMFKNLLQMHRLTVEGADFVPDPFFVELTESLLRLEWH 450
            ||.:.::|||||.||||||||:|||||::||||||:||.:|..:|  .|||..|||.|||.||||
 Frog   386 SSAMQKILEYVYVHWEHPLDAVRHQTKLIFKNLLQIHRKSVALSD--EDPFLSELTHSLLHLEWH 448

Human   451 IKGKYTCLGCLVECIGVEHILAIDKTIPSQILEVMGDQSLVPYASDLLETMFRNHKSHLKSQTAE 515
            .||||..|||||||:|.|.|||:|.|||||||.||||||..||||:|||.||.|||:.|.|::..
 Frog   449 SKGKYASLGCLVECVGTEQILAVDGTIPSQILNVMGDQSFAPYASNLLEAMFINHKNQLTSRSGG 513

Human   516 SSWIDQWHETWVSPLLFILCEGNLDQKSYVIDYYLPKLLSYSPESLQYMVKILQTSIDAKTGQEQ 580
            ..|.::||:.||.|||..|||.|::|.:|:|||||||||..:||||.:|:::||.|  |.|    
 Frog   514 QCWTERWHDIWVKPLLLRLCEENINQTTYIIDYYLPKLLKCNPESLSFMIEVLQAS--AST---- 572

Human   581 SFPSLGSCNSRGALGALMACLRIARAHGHLQSATD-TWENLVSDARIKQGLIHQHCQVRIDTLGL 644
               :|||.:|||:|||:|||||.|||||||:...: .|...||...|:|||:|:|.|||:|.|||
 Frog   573 ---NLGSGSSRGSLGAIMACLRTARAHGHLRFTENYVWSGKVSTTLIQQGLVHKHDQVRVDALGL 634

Human   645 LCESNRSTEIVSMEEMQWIQFFITYNLNSQSPGVRQQICSLLKKLFCRIQESSQVLYKLEQSKSK 709
            ||||:.|||:||::||:.:.|.:.||||.|||.:|||:|.:||||||||.||||||||.||:|..
 Frog   635 LCESHWSTEVVSLDEMKLVLFCLQYNLNCQSPSIRQQLCYMLKKLFCRIHESSQVLYKQEQTKKL 699

Human   710 REPENELTKQHPSVSLQQYKNFMSSICNSLFEALFPGSSYSTRFSALTILGSIAEVFHVPEGRIY 774
            ...::.......|::||||:.||:|:.|||||:||.|||:.||||||||||:|||:|.|.||...
 Frog   700 NIAKDVRNVGDSSLALQQYQEFMASVTNSLFESLFAGSSHPTRFSALTILGAIAEIFPVEEGSCQ 764

Human   775 TVYQLSHDIDVGRFQTLMECFTSTFEDVKILAFDLLMKLSKTAVHFQDSGKLQGLFQAALELSTS 839
            :|:.|...:.....|.|:||.::|||:||:|||.||.||:...:..:||.:|..|.|||::||||
 Frog   765 SVFHLGPAVQAQHVQALLECLSNTFEEVKVLAFVLLRKLTPCVLVSKDSARLHLLLQAAMDLSTS 829

Human   840 TKPYDCVTASYLLNFLIWQDALPSSLSAYLTQQ---VAC--DNGDRPAAVVERNTLMVIKCLMEN 899
            ||.:||||||||||||:.|:|||.:|.|....|   |.|  .|.:| ...||||....::.||..
 Frog   830 TKHFDCVTASYLLNFLMCQEALPVALDALDQNQPGPVVCWSRNTER-VNFVERNAFSAVRYLMNK 893

Human   900 LEEEVSQAENSLLQAAAAFPMYGRVHCITGALQKLSLNSLQLVSEWRPVVEKLLLMSYRLSTVVS 964
            |..|:.|||.|||||||:||:|||||||.|.||:|.|..|.:|:|||.::.:|||||||||.:||
 Frog   894 LGVEIVQAEMSLLQAAASFPLYGRVHCIIGLLQQLPLKELSMVAEWRDLIGELLLMSYRLSAIVS 958

Human   965 PVIQSSSPEGLIPMDTDSESASRLQMILNEIQPRDTNDYFNQAKILKEHDSFDMKDLNASVVNID 1029
            ||:.|||||||:|||||:|:|::|.||::|||||||||||:|.:.|:       |||::..:..|
 Frog   959 PVVHSSSPEGLMPMDTDTEAAAQLHMIMSEIQPRDTNDYFSQPRTLQ-------KDLHSQPLPED 1016

Human  1030 TS------TEIKGKEVKTCDVTAQMVLVCCWRSMKEVALLLGMLCQLLPMQPVPESSDGLLTVEQ 1088
            |:      ||:||.|..:|.|||||||||||||||||:||||||||.||:...|:|..||:||||
 Frog  1017 TAPANSLCTEMKGSEGSSCSVTAQMVLVCCWRSMKEVSLLLGMLCQNLPLMTEPDSPRGLITVEQ 1081

Human  1089 VKEIGDYFKQHLLQSRHRGAFELAYTGFVKLTEVLNRCPNVSLQKLPEQWLWSVLEEIKCSDPSS 1153
            |||:|:|||.|||||||||||||||.||.||||:|..|...||::||.|||.|||||||.|||||
 Frog  1082 VKEMGEYFKHHLLQSRHRGAFELAYVGFAKLTEMLIGCKEESLRRLPGQWLCSVLEEIKSSDPSS 1146

Human  1154 KLCATRRSAGIPFYIQALLASEPKKGRMDLLKITMKELISLAGPTDDI---QSTVPQVHALNILR 1215
            ||||||||||||||||||||||||..:...||:|||:|||||.|..|.   :||:||||||||||
 Frog  1147 KLCATRRSAGIPFYIQALLASEPKNSKAGFLKMTMKQLISLAMPESDASGDKSTIPQVHALNILR 1211

Human  1216 ALFRDTRLGENIIPYVADGAKAAILGFTSPVWAVRNSSTLLFSALITRIFGVKRAKDEHSKTNRM 1280
            |||||||||||:|||||:|.:|||||||||:||||||||||||.||||||||||.|||.||.|||
 Frog  1212 ALFRDTRLGENVIPYVAEGTQAAILGFTSPIWAVRNSSTLLFSTLITRIFGVKRGKDERSKKNRM 1276

Human  1281 TGREFFSRFPELYPFLLKQLETVANTVDSDMGEPNRHPSMFLLLLVLERLYASPMDGTSSALSMG 1345
            ||||||||||.||||||:|||.||:||||..||...|||:|||||:|.:||.||||||.|||||.
 Frog  1277 TGREFFSRFPALYPFLLEQLEVVADTVDSPTGESKLHPSLFLLLLILSKLYPSPMDGTYSALSMA 1341

Human  1346 PFVPFIMRCGHSPVYHSREMAARALVPFVMIDHIPNTIRTLLSTLPSCTDQCFRQNHIHGTLLQV 1410
            ||:|||:||||||||.||||||.|||||||.:.:|.|...||::||...|...|||.:|||||||
 Frog  1342 PFIPFIIRCGHSPVYRSREMAAHALVPFVMTNEVPQTALNLLNSLPHSADPRIRQNRVHGTLLQV 1406

Human  1411 FHLLQAYSDSKHGTNSD-FQHELTDITVCTKAKLWLAKRQNPCLVTRAVYIDILFLLTCCLNRSA 1474
            |:|||::.::||..||: .|.|:.||..|.||:|||||.|||||||||.:|.||.::.       
 Frog  1407 FYLLQSFFEAKHSANSERIQREMGDIMACMKARLWLAKSQNPCLVTRASFISILEMII------- 1464

Human  1475 KDNQPVL---ESLGFWEEVRGIISG--SELITGFPWAFKVPGLPQYLQSLTRLAIAAVWAAAAKS 1534
             :||.:|   |...|:.::..||..  ||::   |.|..:|||.||.||:.|| :.:|....||.
 Frog  1465 -NNQEILRNKEFSSFYSDICTIIECDLSEVV---PHASAIPGLVQYAQSMARL-VLSVLTLNAKL 1524

Human  1535 GERETNV--PISFSQLLE----SAFPEVRSLTLEALLEKFLAAASGLGEKGVPPLLCNMGEKFLL 1593
            |..:|:.  .:..|||||    |.|||||.|.||:     |:..|....:.....|.:..||.|.
 Frog  1525 GGPDTDAGSTVCPSQLLETLLRSDFPEVRLLVLES-----LSKWSDTCAEETRNYLTSKAEKTLF 1584

Human  1594 -LAMKENHPECFCKILKILHCMDPGEWLPQTEHCVHLTPKEFLIWTMDIAS--NERSEIQSVALR 1655
             :...|.:|||.|::|.:.:.:...|.|.:.:| :...||:.|:..:.:||  :...||||.|||
 Frog  1585 EMISVERNPECLCQVLTLYYKIGAEELLLKMKH-LQTEPKDLLVRVLKLASTASHSVEIQSSALR 1648

Human  1656 LASKVISHHMQTCVENRELIAAELKQWVQLVILSCEDHLPTESRLAVVEVLTSTTPLFLTNPHPI 1720
            |:|:::|   ....:.:|.:.:|||.|..||...|||.|.||.:||..|:|..|.|.|:||...:
 Frog  1649 LSSELLS---ALVAKAQEDVGSELKHWAALVGQFCEDELQTEVKLAAAEMLIKTAPCFVTNQVLV 1710

Human  1721 LELQDTLALWKCVLTLLQSEEQAVRDAATETVTTAMSQENTCQSTEFAFCQVDASIALALALAVL 1785
            |.|.|||:||..:..|||||:.:|||||.:.:....::|:....|.|.:|.|:..:||.|||..|
 Frog  1711 LGLADTLSLWMGIFQLLQSEDISVRDAAADIIRVYHARESHKSETVFPYCTVNPPMALDLALQAL 1775

Human  1786 CDLLQQWDQLAPGLPILLGWLLGESDDLVACVESMHQVEEDYLFEKAEVNFWAETLIFVKYLCKH 1850
            |.|||||||:..|:||||.||||:.||.::.:|:|..||||:||||.|.|||||.|:||:.|.||
 Frog  1776 CGLLQQWDQVPAGIPILLQWLLGDDDDDLSDLETMRLVEEDFLFEKGEANFWAEKLMFVRLLSKH 1840

Human  1851 LFCLLSKSGWRPPSPEMLCHLQRMVSEQCHLLSQFFRELPPAAEFVKTVEFTRLRIQEERTLACL 1915
            |..|::.:....|..|.|..|....:::...:.:|.:.|||..||:||.|::||.|::|||..|:
 Frog  1841 LKDLITSAPSSLPPKENLSELSSAATKRSETIQRFLQALPPTPEFLKTTEYSRLLIEKERTSRCI 1905

Human  1916 RLLAFLE 1922
            :|||||:
 Frog  1906 QLLAFLQ 1912

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
THADANP_071348.3 COG5543 394..>1484 CDD:227830 692/1108 (62%)
DUF2428 947..1248 CDD:463054 212/309 (69%)
thadaXP_002932440.2 DUF2428 942..1244 CDD:463054 212/308 (69%)

Return to query results.
Submit another query.