DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment RBL2 and Rbl2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_005602.3 Gene:RBL2 / 5934 HGNCID:9894 Length:1139 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006255261.1 Gene:Rbl2 / 81758 RGDID:3541 Length:1136 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1142 Identity:1027/1142 - (89%)
Similarity:1081/1142 - (94%) Gaps:9/1142 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MPSGGDQSPPPPPPPPAAAASDEEEEDDGEAEDAAPPAESPTPQIQQRFDELCSRLNMDEAARAE 65
            |.|||:||   .|||||||||.||||:||:..|.|.||.||:.||||||:|||||||||||||||
  Rat     1 MASGGNQS---SPPPPAAAASSEEEEEDGDTADRAQPAGSPSHQIQQRFEELCSRLNMDEAARAE 62

Human    66 AWDSYRSMSESYTLEGNDLHWLACALYVACRKSVPTVSKGTVEGNYVSLTRILKCSEQSLIEFFN 130
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||:|||||||||||
  Rat    63 AWSSYRSMSESYTLEGNDLHWLACALYVACRKSVPTVSKGTAEGNYVSLTRILRCSEQSLIEFFN 127

Human   131 KMKKWEDMANLPPHFRERTERLERNFTVSAVIFKKYEPIFQDIFKYPQEEQPRQQRGRKQRRQPC 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   128 KMKKWEDMANLPPHFRERTERLERNFTVSAVIFKKYEPIFQDIFKYPQEEQPRQQRGRKQRRQPC 192

Human   196 TVSEIFHFCWVLFIYAKGNFPMISDDLVNSYHLLLCALDLVYGNALQCSNRKELVNPNFKGLSED 260
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
  Rat   193 TTSEIFHFCWVLFIYAKGNFPMISDDLVNSYHLLLCALDLVYGNALQCSNRKELVNPNFKGVSED 257

Human   261 FHAKDSKPSSDPPCIIEKLCSLHDGLVLEAKGIKEHFWKPYIRKLYEKKLLKGKEENLTGFLEPG 325
            .|.:||.|||||||:|||||||||||||||||||:||||||||||:|||||:|||||||||||||
  Rat   258 GHPRDSHPSSDPPCVIEKLCSLHDGLVLEAKGIKQHFWKPYIRKLFEKKLLRGKEENLTGFLEPG 322

Human   326 NFGESFKAINKAYEEYVLSVGNLDERIFLGEDAEEEIGTLSRCLNAGSGTETAERVQMKNILQQH 390
            ||.|||||:|||||||||:.|:||||||||||||||:||||||::|.||||:|||.||::|||||
  Rat   323 NFAESFKAVNKAYEEYVLATGSLDERIFLGEDAEEEVGTLSRCVSAASGTESAERTQMRDILQQH 387

Human   391 FDKSKALRISTPLTGVRYIKENSPCVTPVSTATHSLSRLHTMLTGLRNAPSEKLEQILRTCSRDP 455
            .||||.||:..|||||||::||||||||||||||||:||||||.|||||||||||||||:|||||
  Rat   388 LDKSKTLRVCNPLTGVRYVQENSPCVTPVSTATHSLNRLHTMLAGLRNAPSEKLEQILRSCSRDP 452

Human   456 TQAIANRLKEMFEIYSQHFQPDEDFSNCAKEIASKHFRFAEMLYYKVLESVIEQEQKRLGDMDLS 520
            |:|||:||:||:|||||||||||:.||||||:|:|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   453 TRAIADRLREMYEIYSQHFQPDENVSNCAKEMANKHFRFAEMLYYKVLESVIEQEQKRLGDMDLS 517

Human   521 GILEQDAFHRSLLACCLEVVTFSYKPPGNFPFITEIFDVPLYHFYKVIEVFIRAEDGLCREVVKH 585
            |:|||||||:||||||||||.||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||
  Rat   518 GVLEQDAFHKSLLACCLEVVAFSYKPPGNFPFIAEIFDVPHYHFYKVIEVFIRAEDGLCREVVKH 582

Human   586 LNQIEEQILDHLAWKPESPLWEKIRDNENRVPTCEEVMPPQNLERADEICIAGSPLTPRRVTEVR 650
            |||||||||||||||.:||||::||||||||||||||.||.||||.|||.|||||||||||.|||
  Rat   583 LNQIEEQILDHLAWKTKSPLWDRIRDNENRVPTCEEVTPPHNLERTDEIYIAGSPLTPRRVGEVR 647

Human   651 ADTGGLGRSITSPTTLYDRYSSPPASTTRRRLFVENDSPSDGGTPGRMPPQPLVNAVPVQNVSGE 715
            .|.||||||:|||||||||||||..|||||||| |:||||:|.|.||:|||||||||||||||||
  Rat   648 TDAGGLGRSVTSPTTLYDRYSSPTVSTTRRRLF-ESDSPSEGSTAGRIPPQPLVNAVPVQNVSGE 711

Human   716 TVSVTPVPGQTLVTMATATVTANNGQTVTIPVQGIANENGGITFFPVQVNVGGQAQAVTGSIQPL 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   712 TVSVTPVPGQTLVTMATATVTANNGQTVTIPVQGIANENGGITFFPVQVNVGGQAQAVTGSIQPL 776

Human   781 SAQALAGSLSSQQVTGTTLQVPGQVAIQQISPGGQQQKQGQSVTSSSNRPRKTSSLSLFFRKVYH 845
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||.:||||.||||||||||||||||:
  Rat   777 SAQALAGSLSSQQVTGTTLQVPGPVAIQQISPGGQQQNQGQPLTSSSIRPRKTSSLSLFFRKVYY 841

Human   846 LAAVRLRDLCAKLDISDELRKKIWTCFEFSIIQCPELMMDRHLDQLLMCAIYVMAKVTKEDKSFQ 910
            ||.|||||||.||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   842 LAGVRLRDLCTKLDISDELRKKIWTCFEFSIVQCPELMMDRHLDQLLMCAIYVMAKVTKEDKSFQ 906

Human   911 NIMRCYRTQPQARSQVYRSVLIKGKRKRRNSGSSDSRSHQNSPTELNKDRTSRDSSPVMRSSSTL 975
            ||||||||||||||||||||||||  |||||||.::|||||||||||.||.||||||||||:|||
  Rat   907 NIMRCYRTQPQARSQVYRSVLIKG--KRRNSGSCENRSHQNSPTELNTDRASRDSSPVMRSNSTL 969

Human   976 PVPQPSSAPPTPTRLTGANSDMEEEERGDLIQFYNNIYIKQIKTFAMKYSQAN---MDAPPLSPY 1037
            |||||||||||||||||||||:||||||||||||||||.|||:||||||||||   ||.||||||
  Rat   970 PVPQPSSAPPTPTRLTGANSDIEEEERGDLIQFYNNIYRKQIQTFAMKYSQANSQQMDTPPLSPY 1034

Human  1038 PFVRTGSPRRIQLSQNHPVYISPHKNETMLSPREKIFYYFSNSPSKRLREINSMIRTGETPTKKR 1102
            ||||||||||:||||:||:||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1035 PFVRTGSPRRVQLSQSHPIYISPHKNEAMLSPREKIFYYFSNSPSKRLREINSMIRTGETPTKKR 1099

Human  1103 GILLEDGSESPAKRICPENHSALLRRLQDVANDRGSH 1139
            ||||:||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1100 GILLDDGSESPAKRICPENHSALLRRLQDVANDRGSH 1136

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
RBL2NP_005602.3 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..45 27/43 (63%)
CYCLIN_SF 44..134 CDD:410207 85/89 (96%)
DUF3452 104..239 CDD:463402 131/134 (98%)
Pocket, binds E1A 417..1024 550/606 (91%)
Domain A 417..616 178/198 (90%)
RB_A 417..609 CDD:460364 172/191 (90%)
Spacer 617..827 189/209 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 654..678 20/23 (87%)
SP1-4_N 670..>810 CDD:425404 130/139 (94%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 810..831 16/20 (80%)
Domain B 828..1024 179/195 (92%)
CYCLIN_RBL2 835..1024 CDD:410309 173/188 (92%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 933..999 56/65 (86%)
Rbl2XP_006255261.1 CYCLIN_SF 41..131 CDD:410207 85/89 (96%)
DUF3452 101..236 CDD:463402 131/134 (98%)
RB_A 414..606 CDD:460364 172/191 (90%)
SP1-4_N <696..>834 CDD:425404 132/137 (96%)
CYCLIN_RBL2 831..1018 CDD:410309 173/188 (92%)

Return to query results.
Submit another query.