Protein Alignment KDM5A and Kdm5a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001036068.1
• Gene: KDM5A / 5927
• HGNCID: 9886
• Length: 1690
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_666109.2
• Gene: Kdm5a / 214899
• MGIID: 2136980
• Length: 1690
• Species: Mus musculus
• Alignment Length: 1690
• Identity: 1634/1690 - (96%)
• Similarity: 1668/1690 - (98%)
• Gaps: 0/1690 - (0%)

Human     1 MAGVGPGGYAAEFVPPPECPVFEPSWEEFTDPLSFIGRIRPLAEKTGICKIRPPKDWQPPFACEV 65
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MASVGPGGYAAEFVPPPECPVFEPSWEEFTDPLSFIGRIRPFAEKTGICKIRPPKDWQPPFACEV 65

Human    66 KSFRFTPRVQRLNELEAMTRVRLDFLDQLAKFWELQGSTLKIPVVERKILDLYALSKIVASKGGF 130
            |:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 KTFRFTPRVQRLNELEAMTRVRLDFLDQLAKFWELQGSTLKIPVVERKILDLYALSKIVASKGGF 130

Human   131 EMVTKEKKWSKVGSRLGYLPGKGTGSLLKSHYERILYPYELFQSGVSLMGVQMPNLDLKEKVEPE 195
            |:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||.|
Mouse   131 EIVTKEKKWSKVGSRLGYLPGKGTGSLLKSHYERILYPYELFQSGVSLMGVQMPDLDLKEKVEAE 195

Human   196 VLSTDTQTSPEPGTRMNILPKRTRRVKTQSESGDVSRNTELKKLQIFGAGPKVVGLAMGTKDKED 260
            |||||.|.|||.||||||.||||||||:||:||:|:|||||||||||||||||||||:|.|||||
Mouse   196 VLSTDIQPSPERGTRMNIPPKRTRRVKSQSDSGEVNRNTELKKLQIFGAGPKVVGLAVGAKDKED 260

Human   261 EVTRRRKVTNRSDAFNMQMRQRKGTLSVNFVDLYVCMFCGRGNNEDKLLLCDGCDDSYHTFCLIP 325
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Mouse   261 EVTRRRKVTNRSDAFNMQMRQRKGTLSVNFVDLYVCMFCGRGNNEDKLLLCDGCDDSYHTFCLLP 325

Human   326 PLPDVPKGDWRCPKCVAEECSKPREAFGFEQAVREYTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVHMVPTELV 390
            ||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   326 PLPDVPKGDWRCPKCVAEECNKPREAFGFEQAVREYTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVHMVPTELV 390

Human   391 EKEFWRLVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGSGFPVKDGRRKILPEEEEYALSGWNLNNMPVLEQSV 455
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Mouse   391 EKEFWRLVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGSGFPKKDGQRKMLPEEEEYALSGWNLNNMPVLEQSV 455

Human   456 LAHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSHAAEQLEEVMRE 520
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Mouse   456 LAHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSHAAEQLEEVMRE 520

Human   521 LAPELFESQPDLLHQLVTIMNPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFVVTFPRAYHSGFNQGYNFAEAVN 585
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Mouse   521 LAPELFESQPDLLHQLVTIMNPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFVVTFPRAYHSGFNQGYNFAEAVN 585

Human   586 FCTADWLPIGRQCVNHYRRLRRHCVFSHEELIFKMAADPECLDVGLAAMVCKELTLMTEEETRLR 650
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Mouse   586 FCTADWLPIGRQCVNHYRRLRRHCVFSHEELIFKMAADPECLDVGLAAMVCKELTLMTEEETRLR 650

Human   651 ESVVQMGVLMSEEEVFELVPDDERQCSACRTTCFLSALTCSCNPERLVCLYHPTDLCPCPMQKKC 715
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||
Mouse   651 ESVVQMGVVMSEEEVFELVPDDERQCSACRTTCFLSALTCSCNPERLVCLYHPTDLCSCPMQNKC 715

Human   716 LRYRYPLEDLPSLLYGVKVRAQSYDTWVSRVTEALSANFNHKKDLIELRVMLEDAEDRKYPENDL 780
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Mouse   716 LRYRYPLEDLPSLLYGVKVRAQSYDTWVNRVTEALSASFNHKKDLIELRVMLEDAEDRKYPENDL 780

Human   781 FRKLRDAVKEAETCASVAQLLLSKKQKHRQSPDSGRTRTKLTVEELKAFVQQLFSLPCVISQARQ 845
            ||||||||||||||.||||||||||||||||.|||:|||||||||||||||||.||||||||.||
Mouse   781 FRKLRDAVKEAETCGSVAQLLLSKKQKHRQSSDSGKTRTKLTVEELKAFVQQLVSLPCVISQTRQ 845

Human   846 VKNLLDDVEEFHERAQEAMMDETPDSSKLQMLIDMGSSLYVELPELPRLKQELQQARWLDEVRLT 910
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Mouse   846 VKNLLDDVEEFHERAQEAMMDETPDSSKLQMLIDMGSSLYVELPELPRLKQELQQARWLDEVRLT 910

Human   911 LSDPQQVTLDVMKKLIDSGVGLAPHHAVEKAMAELQELLTVSERWEEKAKVCLQARPRHSVASLE 975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:||
Mouse   911 LSDPQQVTLDVMKKLIDSGVGLAPHHAVEKAMAELQELLTVSERWEEKAKVCLQARPRHSMANLE 975

Human   976 SIVNEAKNIPAFLPNVLSLKEALQKAREWTAKVEAIQSGSNYAYLEQLESLSAKGRPIPVRLEAL 1040
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||:||
Mouse   976 NIVNEAKNIPAFLPNVLSLKEALQKAREWTAKVEAIQSGNNYAYLEQLESLSAKGRPIPVRLDAL 1040

Human  1041 PQVESQVAAARAWRERTGRTFLKKNSSHTLLQVLSPRTDIGVYGSGKNRRKKVKELIEKEKEKDL 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
Mouse  1041 PQVESQVAAARAWRERTGRTFLKKNSSHTLLQVLSPRTDIGVYGSGKNRRKKVKEIIEKEKEKDL 1105

Human  1106 DLEPLSDLEEGLEETRDTAMVVAVFKEREQKEIEAMHSLRAANLAKMTMVDRIEEVKFCICRKTA 1170
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Mouse  1106 DLEPLSDLEEGLEESRDTAMVVAVFKEREQKEIEAMHSLRAANLAKMTIVERIEEVKFCICRKTA 1170

Human  1171 SGFMLQCELCKDWFHNSCVPLPKSSSQKKGSSWQAKEVKFLCPLCMRSRRPRLETILSLLVSLQK 1235
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Mouse  1171 SGFMLQCELCKDWFHNSCVPLPKSSSQKKGSSWQAKDVKFLCPLCMRSRRPRLETILSLLVSLQK 1235

Human  1236 LPVRLPEGEALQCLTERAMSWQDRARQALATDELSSALAKLSVLSQRMVEQAAREKTEKIISAEL 1300
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Mouse  1236 LPVRLPEGEALQCLTERAMSWQDKARQALATDELSSALAKLSVLSQRMVEQAAREKTEKIISAEL 1300

Human  1301 QKAAANPDLQGHLPSFQQSAFNRVVSSVSSSPRQTMDYDDEETDSDEDIRETYGYDMKDTASVKS 1365
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Mouse  1301 QKAAANPDLQGHLPSFQQSAFNRVVSSVSSSPHQTMDYDDEETDSDEDIRETYGYDMKDTASVKS 1365

Human  1366 SSSLEPNLFCDEEIPIKSEEVVTHMWTAPSFCAEHAYSSASKSCSQGSSTPRKQPRKSPLVPRSL 1430
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Mouse  1366 SSSLEPNLFCDEEIPIKSEEVVTHMWTAPSFCAEHAYSSASKSCSQGSSTPRKQPRKSPLVPRSL 1430

Human  1431 EPPVLELSPGAKAQLEELMMVGDLLEVSLDETQHIWRILQATHPPSEDRFLHIMEDDSMEEKPLK 1495
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Mouse  1431 EPPVLELSPGAKAQLEELMMVGDLLEVSLDETQHIWRILQATHPPSEDRFLHIMEDDSIEEKPLK 1495

Human  1496 VKGKDSSEKKRKRKLEKVEQLFGEGKQKSKELKKMDKPRKKKLKLGADKSKELNKLAKKLAKEEE 1560
            :|||||||||||||||||||||||||||:|||||:|||:||||||..||||||||||||||||||
Mouse  1496 MKGKDSSEKKRKRKLEKVEQLFGEGKQKTKELKKIDKPKKKKLKLNVDKSKELNKLAKKLAKEEE 1560

Human  1561 RKKKKEKAAAAKVELVKESTEKKREKKVLDIPSKYDWSGAEESDDENAVCAAQNCQRPCKDKVDW 1625
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Mouse  1561 RKKKKEKAAAAKVELVKESTEKKRERKVLDIPSKYDWSGAEESDDENAVCAAQNCQRPCKDKVDW 1625

Human  1626 VQCDGGCDEWFHQVCVGVSPEMAENEDYICINCAKKQGPVSPGPAPPPSFIMSYKLPMEDLKETS 1690
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Mouse  1626 VQCDGGCDEWFHQVCVGVSAEMAENEDYICINCAKKQGPDSPGQAPPPPFLMSYKLPMEDLKETS 1690

Human  1691  1690
            Mouse  1691  1690

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
KDM5A	NP_001036068.1	JmjN	18..59	CDD:128818	39/40 (98%)
		ARID_KDM5A	84..175	CDD:350637	89/90 (99%)
		PHD1_KDM5A	295..343	CDD:277075	46/47 (98%)
		GSGFP motif. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q3UXZ9	419..423		3/3 (100%)
		JmjC	470..586	CDD:396791	115/115 (100%)
		zf-C5HC2	676..728	CDD:460750	49/51 (96%)
		PLU-1	741..1072	CDD:462475	318/330 (96%)
		PHD2_KDM5A	1163..1215	CDD:277079	50/51 (98%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1327..1348		19/20 (95%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1407..1433		25/25 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1490..1509		17/18 (94%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1516..1543		22/26 (85%)
		PHD3_KDM5A	1608..1659	CDD:277156	49/50 (98%)
		Interaction with LMO2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:9129143	1623..1690		61/66 (92%)
Kdm5a	NP_666109.2	JmjN	18..59	CDD:128818	39/40 (98%)
		ARID_KDM5A	84..175	CDD:350637	89/90 (99%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	203..229		20/25 (80%)
		PHD1_KDM5A	295..343	CDD:277075	46/47 (98%)
		GSGFP motif. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20064375	419..423		3/3 (100%)
		JmjC	470..586	CDD:396791	115/115 (100%)
		zf-C5HC2	676..728	CDD:460750	49/51 (96%)
		PLU-1	741..1072	CDD:462475	318/330 (96%)
		PHD2_KDM5A	1163..1215	CDD:277079	50/51 (98%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1327..1346		17/18 (94%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1407..1435		27/27 (100%)
		PHD3_KDM5A	1608..1659	CDD:277156	49/50 (98%)
		Interaction with LMO2. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P29375	1622..1690		62/67 (93%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1662..1690		23/27 (85%)