DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Apl and Arts

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_730182.1 Gene:Apl / 59216 FlyBaseID:FBgn0042178 Length:1080 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001261957.1 Gene:Arts / 59215 FlyBaseID:FBgn0042177 Length:1080 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1080 Identity:1056/1080 - (97%)
Similarity:1070/1080 - (99%) Gaps:0/1080 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MEAAILDIINGILTIDTERIRESTAKMLKAYENPDSLLVLTQIVMSDRPVQERQVAAVLLKRRVK 65
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly     1 MEAAILDIINGILAIDTERIRESTAKMLKAYENPDSLLVLTQIVMSDRPVQERQVAAVLLKRRVK 65

  Fly    66 KLRHWQLVPAEHQAAIKSNMLQVLIAVKEKTVKGTVAFIIGSLVRHEEGEQNSWREEILKFIYER 130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:|||||||||||||||
  Fly    66 KLRHWQLVPAEHQAAIKSNMLQVLIAVKEKTVKGTVAFIIGSLVRHEEDKQNSWREEILKFIYER 130

  Fly   131 CSSPDPIESERGSSIFSSLMDAAPDQFSDHTDTMFPLLAGILVTAEANGNMATPTVHNMLTGSCF 195
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||:||||||||||||||||||||||||||.|:|.
  Fly   131 CSSPDPIESERGSSIFSSLMDAAPDQFSNHTDTIFPLLAGILVTAEANGNMATPTVHNMLAGTCV 195

  Fly   196 LLPFVSGHSNAEQIVVKAVPLILKALAAFVEKGYSIEFMGAFDIIDSMAEHVPHLLTGNVKLLLE 260
            ||||:||||:||||:||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||:||||||||||||||
  Fly   196 LLPFISGHSDAEQIMVKAVPLILKALAAFAEKGNSNEFMGAFDIIDSMAEYVPHLLTGNVKLLLE 260

  Fly   261 FCLMIARNKQFDASIRVQVLTFVGSLVRLKKKIIMKQKLLQPTLSVLFEVICQDDLEEGDDDYFS 325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||
  Fly   261 FCLMIARNKQFDASIRVQVLTFVGSLVRLKKKIIMKQKLLQPTLSVLFEVICQDDLKEGDDDYFS 325

  Fly   326 SESLSSPSNAAAQTLDLMALHMVPDKFIPPLLDLLEPALQSPEPVLRRSSFICMGVIAEGCSEAI 390
            ||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   326 SESLNSPSNAAAQTLDLMALHMVPDKFIPPLLDLLEPALQSPEPVLRRSSFICMGVIAEGCSEAI 390

  Fly   391 GKKYLEVMLNIIKAGVLDSVMFVRTAAFFALGQFSEFLQPTICKFAPQILPVLFDYLNQLVLELK 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   391 GKKYLEVMLNIIKAGVLDSVMFVRTAAFFALGQFSEFLQPTICKFAPQILPVLFDYLNQLVLELK 455

  Fly   456 VGEPDSKHMDRMFYALETFCENLDEDIVPYLPTLMDRLFGVMEPQNSNQMREMALSAIAAVSAAA 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   456 VGEPDSKHMDRMFYALETFCENLDEDIVPYLPTLMDRLFGVMEPQNSNQMREMALSAIAAVSAAA 520

  Fly   521 KENLMPYFPRIMTVLQGCLVKDCPKEMYSQRIQAIDTLAALCRELGKDNIIPLADDTMNFCLMML 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
  Fly   521 KENLMPYFPRIMTVLQGCLVKDCPKEMYSQRIQAIDTLAALCRELGKDNIIPLADETMNFCLMML 585

  Fly   586 EDGPDDPEYRRSIYNLMSSLSSVVNESMASVFPKFIDRIMESVIFSEDMVPNVSDNADDDLALVD 650
            ||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||:|||||||
  Fly   586 EDGPDDPEFRRSIYNLMSSLSSVVNESMASVFPKFIDRIMESVISSEDMVPNVSDNAEDDLALVD 650

  Fly   651 APDIEIDLEHTDDEDDQDAYPVENDYIVEKEEAILSLKEFATHTGAAFAPYLQSAFENVYKMIDH 715
            ||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   651 APDIEIDLEHTDDEDDQDAYLGENDYIVEKEEAILSLKEFATHTGAAFAPYLQSAFENVYKMIDH 715

  Fly   716 PQGDVRMACIDSICSFITALHKLDDAAGLKRACEIAIPKFAHIMRTDDQVAVVLRMLDVLYDVFK 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   716 PQGDVRMACIDSICSFITALHKLDDAAGLKRACEIAIPKFAHIMRTDDQVAVVLRMLDVLYDVFK 780

  Fly   781 YVPAINSQEHAELIFGCIRDIFTNKMACQFNEESGGGDDECSEESENDEMLFENAANLFPMFGLT 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   781 YVPAINSQEHAELIFGCIRDIFTNKMACQFNEESGGGDDECSEESENDEMLFENAANLFPMFGLT 845

  Fly   846 LQPELFSLYFGRLYHFYIQRLAKVKERDLPEQRAYIYGALADCCKALKGCCATYFDALRPIFIAG 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   846 LQPELFSLYFGRLYHFYIQRLAKVKERDLPEQRAYIYGALADCCKALKGCCATYFDALRPIFIAG 910

  Fly   911 SRDSDAKARQNSYFALGEIVFHSEEKSFESYPTILQALSEAIVRESVPAAMDNICGAVARLIVTN 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   911 SRDSDAKARQNSYFALGEIVFHSEEKSFESYPTILQALSEAIVRESVPAAMDNICGAVARLIVTN 975

  Fly   976 PDSVPLGQVLPVWLNHLPLKDDTVENDVIQKAFRVLYLKARPSIEAHLEQILAITIEASYKRQMP 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
  Fly   976 PDSVPLGQVLPVWLNHLPLKDDTVENDVIQKAFRVLYLKARPSIEAHLEQILAITIEASYKKQMP 1040

  Fly  1041 DVETTESAVALIKEIRANYPELFSKVSNMNPEVFNYVQAL 1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly  1041 DVETTESAVALIKEIRANYPELFSKVSNMNPEVFNYVQAL 1080

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AplNP_730182.1 IBN_N 29..90 CDD:197981 60/60 (100%)
KAP95 <304..703 CDD:227540 390/398 (98%)
HEAT repeat 356..384 CDD:293787 27/27 (100%)
HEAT repeat 397..427 CDD:293787 29/29 (100%)
HEAT repeat 438..473 CDD:293787 34/34 (100%)
ArtsNP_001261957.1 IBN_N 29..90 CDD:197981 60/60 (100%)
KAP95 <304..703 CDD:227540 390/398 (98%)
HEAT repeat 356..384 CDD:293787 27/27 (100%)
HEAT repeat 397..427 CDD:293787 29/29 (100%)
HEAT repeat 438..473 CDD:293787 34/34 (100%)

Return to query results.
Submit another query.