DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PTPN4 and Ptpn4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_002821.1 Gene:PTPN4 / 5775 HGNCID:9656 Length:926 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_064317.2 Gene:Ptpn4 / 19258 MGIID:1099792 Length:926 Species:Mus musculus


Alignment Length:926 Identity:877/926 - (94%)
Similarity:908/926 - (98%) Gaps:0/926 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MTSRFRLPAGRTYNVRASELARDRQHTEVVCNILLLDNTVQAFKVNKHDQGQVLLDVVFKHLDLT 65
            ||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||:||||||||
Mouse     1 MTARFRLPAGRTYNVRASELARDRQHTEVVCNILLLDNTVQAFRVNKHDQGQVLLDIVFKHLDLT 65

Human    66 EQDYFGLQLADDSTDNPRWLDPNKPIRKQLKRGSPYSLNFRVKFFVSDPNKLQEEYTRYQYFLQI 130
            |:||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 ERDYFGLQLADDSTDNPRWLDPNKPIRKQLKRGSPYNLNFRVKFFVSDPNKLQEEYTRYQYFLQI 130

Human   131 KQDILTGRLPCPSNTAALLASFAVQSELGDYDQSENLSGYLSDYSFIPNQPQDFEKEIAKLHQQH 195
            |||||||||.||.||||||||||||||||||:|||||:|||||||||||||||||||||||||||
Mouse   131 KQDILTGRLSCPCNTAALLASFAVQSELGDYNQSENLAGYLSDYSFIPNQPQDFEKEIAKLHQQH 195

Human   196 IGLSPAEAEFNYLNTARTLELYGVEFHYARDQSNNEIMIGVMSGGILIYKNRVRMNTFPWLKIVK 260
            :|||||||||||||.||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||.||||||
Mouse   196 VGLSPAEAEFNYLNAARTLELYGVEFHYARDQSNNEILIGVMSGGILIYKNRVRMNTFLWLKIVK 260

Human   261 ISFKCKQFFIQLRKELHESRETLLGFNMVNYRACKNLWKACVEHHTFFRLDRPLPPQKNFFAHYF 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 ISFKCKQFFIQLRKELHESRETLLGFNMVNYRACKTLWKACVEHHTFFRLDRPLPPQKNFFAHYF 325

Human   326 TLGSKFRYCGRTEVQSVQYGKEKANKDRVFARSPSKPLARKLMDWEVVSRNSISDDRLETQSLPS 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
Mouse   326 TLGSKFRYCGRTEVQSVQYGKEKANKDRVFARSPSKPLARKLMDWEVVSRNSLSDDRLETQSLPS 390

Human   391 RSPPGTPNHRNSTFTQEGTRLRPSSVGHLVDHMVHTSPSEVFVNQRSPSSTQANSIVLESSPSQE 455
            ||||||||||||:||||.||:|||||||||||:||.||||.||:|||||||||||||||||||||
Mouse   391 RSPPGTPNHRNSSFTQEATRVRPSSVGHLVDHVVHMSPSEDFVSQRSPSSTQANSIVLESSPSQE 455

Human   456 TPGDGKPPALPPKQSKKNSWNQIHYSHSQQDLESHINETFDIPSSPEKPTPNGGIPHDNLVLIRM 520
            ||.||:||||||||||||||||||:|:|||||.:|.||:||:||||||.||||||||||||||:|
Mouse   456 TPEDGQPPALPPKQSKKNSWNQIHFSNSQQDLVTHTNESFDVPSSPEKSTPNGGIPHDNLVLIKM 520

Human   521 KPDENGRFGFNVKGGYDQKMPVIVSRVAPGTPADLCVPRLNEGDQVVLINGRDIAEHTHDQVVLF 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   521 KPDENGRFGFNVKGGYDQKMPVIVSRVAPGTPADLCVPRLNEGDQVVLINGRDIAEHTHDQVVLF 585

Human   586 IKASCERHSGELMLLVRPNAVYDVVEEKLENEPDFQYIPEKAPLDSVHQDDHSLRESMIQLAEGL 650
            ||||||:|||||:|||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   586 IKASCEKHSGELVLLVRPNAVYDVVEEKLESEPDFQYIPEKAPLDSVHQDDHSLRESMIQLAEGL 650

Human   651 ITGTVLTQFDQLYRKKPGMTMSCAKLPQNISKNRYRDISPYDATRVILKGNEDYINANYINMEIP 715
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
Mouse   651 ITGTVLAQFDQLYRKKPGMTMSCAKLPQNISKNRYRDISPYDATRVLLKGNEDYINANYINMEIP 715

Human   716 SSSIINQYIACQGPLPHTCTDFWQMTWEQGSSMVVMLTTQVERGRVKCHQYWPEPTGSSSYGCYQ 780
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||:.||||||||
Mouse   716 SSSIINQYIACQGPLPHTCKDFWQMTWEQGSSMVVMLTTQVERGRVKCHQYWPEPSESSSYGCYQ 780

Human   781 VTCHSEEGNTAYIFRKMTLFNQEKNESRPLTQIQYIAWPDHGVPDDSSDFLDFVCHVRNKRAGKE 845
            |||||||||.||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||::|||||
Mouse   781 VTCHSEEGNPAYIFRKMTLFNQEKNESRQLTQIQYTAWPDHGVPDDSSDFLDFVCHVRDQRAGKE 845

Human   846 EPVVVHCSAGIGRTGVLITMETAMCLIECNQPVYPLDIVRTMRDQRAMMIQTPSQYRFVCEAILK 910
            ||::|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   846 EPIIVHCSAGIGRTGVLITMETAMCLIECNQPVYPLDIVRTMRDQRAMMIQTPSQYRFVCEAILK 910

Human   911 VYEEGFVKPLTTSTNK 926
            |||||||||||||:||
Mouse   911 VYEEGFVKPLTTSSNK 926

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PTPN4NP_002821.1 B41 30..222 CDD:214604 181/191 (95%)
FERM_C_PTPN4_PTPN3_like 216..310 CDD:270010 90/93 (97%)
FA 324..365 CDD:462582 40/40 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 380..412 29/31 (94%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 430..475 40/44 (91%)
PDZ_PTPN3-4-like 513..602 CDD:467190 85/88 (97%)
PTP_DSP_cys 641..914 CDD:475123 260/272 (96%)
Ptpn4NP_064317.2 B41 30..222 CDD:214604 181/191 (95%)
FERM_C_PTPN4_PTPN3_like 216..310 CDD:270010 90/93 (97%)
FA 324..365 CDD:462582 40/40 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 379..412 30/32 (94%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 429..474 40/44 (91%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 492..511 15/18 (83%)
PDZ_PTPN3-4-like 513..602 CDD:467190 85/88 (97%)
PTP_DSP_cys 641..914 CDD:475123 260/272 (96%)

Return to query results.
Submit another query.