DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PTPN3 and Ptpn3

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011517190.1 Gene:PTPN3 / 5774 HGNCID:9655 Length:934 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006538160.1 Gene:Ptpn3 / 545622 MGIID:105307 Length:935 Species:Mus musculus


Alignment Length:935 Identity:854/935 - (91%)
Similarity:895/935 - (95%) Gaps:1/935 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVEQEGLSCGHPPE-NCYSAIVMTSRLRALGGRINNIRTSELPKEKTRSEVICSIHFLDGVVQTF 64
            ||||||:....||| |.|||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||:||||
Mouse     1 MVEQEGIPPRGPPEDNRYSAAVMTSRLRALGGRINNTRTSELPKEKTRSEVICSIRFLDGLVQTF 65

Human    65 KVTKQDTGQVLLDMVHNHLGVTEKEYFGLQHDDDSVDSPRWLEASKAIRKQLKGGFPCTLHFRVR 129
            ||.|||.||.||||.:.||||||||||||||.||.|||||||||||.:|||||||||||||||||
Mouse    66 KVNKQDLGQSLLDMAYGHLGVTEKEYFGLQHGDDPVDSPRWLEASKPLRKQLKGGFPCTLHFRVR 130

Human   130 FFIPDPNTLQQEQTRHLYFLQLKMDICEGRLTCPLNSAVVLASYAVQSHFGDYNSSIHHPGYLSD 194
            :||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||:||||||||||:|
Mouse   131 YFIPDPNTLQQEQTRHLYFLQLKMDVCEGRLTCPLNSAVVLASYAVQSHFGDFNSSIHHPGYLAD 195

Human   195 SHFIPDQNEDFLTKVESLHEQHSGLKQSEAESCYINIARTLDFYGVELHSGRDLHNLDLMIGIAS 259
            |.||||||:|||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Mouse   196 SQFIPDQNDDFLSKVESLHEQHSGLKQSEAESCYINIARTLDFYGVELHGGRDLHNLDLMIGIAS 260

Human   260 AGVAVYRKYICTSFYPWVNILKISFKRKKFFIHQRQKQAESREHIVAFNMLNYRSCKNLWKSCVE 324
            ||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 AGIAVYRKYICTSFYPWVNILKISFKRKKFFIHQRQKQAESREHIVAFNMLNYRSCKNLWKSCVE 325

Human   325 HHTFFQAKKLLPQEKNVLSQYWTMGSRNTKKSVNNQYCKKVIGGMVWNPAMRRSLSVEHLETKSL 389
            ||:||||||||||||||||||||:||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Mouse   326 HHSFFQAKKLLPQEKNVLSQYWTLGSRNPKKSVNNQYCKKVIGGMVWNPVMRRSLSVERLETKSL 390

Human   390 PSRSPPITPNWRSPRLRHEIRKPRHSSADNLANEMTYITETEDVFYTYKGSLAPQDSDSEVSQNR 454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:|:|||||||||.
Mouse   391 PSRSPPITPNWRSPRLRHEIRKPRHSSADNLANEMTYITETEDVFYTYKGPLSPKDSDSEVSQNH 455

Human   455 SPHQESLSENNPAQSYLTQKSSSSVSPSSNAPGSCSPDGVDQQLLDDFHRVTKGGSTEDASQYYC 519
            |||:|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||:.|:|:|:|||||..||||||||
Mouse   456 SPHRESLSENNPAQSCLTQKSSSSVSPSSNAPGSCSPDGVDQRFLEDYHKVTKGGFVEDASQYYC 520

Human   520 DKNDNGDSYLVLIRITPDEDGKFGFNLKGGVDQKMPLVVSRINPESPADTCIPKLNEGDQIVLIN 584
            ||:|:||.|||||||||||:|:|||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||
Mouse   521 DKSDDGDGYLVLIRITPDEEGRFGFNLKGGVDQKMPLVVSRINPESPADTCMPKLNEGDQIVLIN 585

Human   585 GRDISEHTHDQVVMFIKASRESHSRELALVIRRRAVRSFADFKSEDELNQLFPEAIFPMCPEGGD 649
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:||||.|:.:|||||:||||||:||.||||||
Mouse   586 GRDISEHTHDQVVMFIKASRESHSRELALVIRRKAVRSLAEIRSEDELSQLFPEAMFPACPEGGD 650

Human   650 TLEGSMAQLKKGLESGTVLIQFEQLYRKKPGLAITFAKLPQNLDKNRYKDVLPYDTTRVLLQGNE 714
            :|||||..|||||||||||||||||||||||||::||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   651 SLEGSMELLKKGLESGTVLIQFEQLYRKKPGLAVSFAKLPQNLDKNRYKDVLPYDTTRVLLQGNE 715

Human   715 DYINASYVNMEIPAANLVNKYIATQGPLPHTCAQFWQVVWDQKLSLIVMLTTLTERGRTKCHQYW 779
            |||||||||||:|||||||||||||||||:||||||||||||||||:||||||||||||||||||
Mouse   716 DYINASYVNMEMPAANLVNKYIATQGPLPNTCAQFWQVVWDQKLSLVVMLTTLTERGRTKCHQYW 780

Human   780 PDPPDVMNHGGFHIQCQSEDCTIAYVSREMLVTNTQTGEEHTVTHLQYVAWPDHGVPDDSSDFLE 844
            |||||:|:||.||||||:|||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   781 PDPPDIMDHGIFHIQCQTEDCTIAYVSREMLVTNTETGEEHTVTHLQYVAWPDHGVPDDSSDFLE 845

Human   845 FVNYVRSLRVDSEPVLVHCSAGIGRTGVLVTMETAMCLTERNLPIYPLDIVRKMRDQRAMMVQTS 909
            ||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||:||||||||||||||||||||
Mouse   846 FVKYVRSLRVDGEPALVHCSAGIGRTGVLVTMETAMCLIERNLPVYPLDIVRKMRDQRAMMVQTS 910

Human   910 SQYKFVCEAILRVYEEGLVQMLDPS 934
            ||||||||||||||||||||.||||
Mouse   911 SQYKFVCEAILRVYEEGLVQRLDPS 935

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PTPN3XP_011517190.1 B41 52..243 CDD:214604 171/190 (90%)
FERM_C_PTPN4_PTPN3_like 237..330 CDD:270010 89/92 (97%)
PDZ_PTPN3-4-like 527..616 CDD:467190 84/88 (95%)
PTPc-N3 652..925 CDD:350448 255/272 (94%)
Ptpn3XP_006538160.1 B41 53..244 CDD:214604 171/190 (90%)
FERM_C_PTPN4_PTPN3_like 238..331 CDD:270010 89/92 (97%)
PDZ_PTPN3-4-like 528..617 CDD:467190 84/88 (95%)
PTPc-N3 653..926 CDD:350448 255/272 (94%)

Return to query results.
Submit another query.