DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PTPN3 and Ptpn3

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011517190.1 Gene:PTPN3 / 5774 HGNCID:9655 Length:934 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_001059757.1 Gene:Ptpn3 / 362524 RGDID:1311363 Length:1018 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:925 Identity:844/925 - (91%)
Similarity:882/925 - (95%) Gaps:3/925 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    13 PE---NCYSAIVMTSRLRALGGRINNIRTSELPKEKTRSEVICSIHFLDGVVQTFKVTKQDTGQV 74
            ||   :.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||:||||||.|||.||.
  Rat    94 PESQAHSYSAAVMTSRLRALGGRINNIRTSELPKEKTRSEVTCSIRFLDGLVQTFKVNKQDLGQS 158

Human    75 LLDMVHNHLGVTEKEYFGLQHDDDSVDSPRWLEASKAIRKQLKGGFPCTLHFRVRFFIPDPNTLQ 139
            ||||.:.||||||||||||||.||.|||||||||||.:|||||||.||.||||||:|||||||||
  Rat   159 LLDMAYGHLGVTEKEYFGLQHGDDPVDSPRWLEASKPLRKQLKGGLPCILHFRVRYFIPDPNTLQ 223

Human   140 QEQTRHLYFLQLKMDICEGRLTCPLNSAVVLASYAVQSHFGDYNSSIHHPGYLSDSHFIPDQNED 204
            |||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||.||:||||||||||:||.||||||:|
  Rat   224 QEQTRHLYFLQLKMDVCEGRLTCPLNSAVVLASYAVQSHIGDFNSSIHHPGYLADSQFIPDQNDD 288

Human   205 FLTKVESLHEQHSGLKQSEAESCYINIARTLDFYGVELHSGRDLHNLDLMIGIASAGVAVYRKYI 269
            ||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||:|||||||
  Rat   289 FLSKVESLHEQHSGLKQSEAESCYINIARTLDFYGVELHGGRDLHNLDLMIGIASAGIAVYRKYI 353

Human   270 CTSFYPWVNILKISFKRKKFFIHQRQKQAESREHIVAFNMLNYRSCKNLWKSCVEHHTFFQAKKL 334
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||
  Rat   354 CTSFYPWVNILKISFKRKKFFIHQRQKQAESREHIVAFNMLNYRSCKNLWKSCVEHHSFFQAKKL 418

Human   335 LPQEKNVLSQYWTMGSRNTKKSVNNQYCKKVIGGMVWNPAMRRSLSVEHLETKSLPSRSPPITPN 399
            |||||||||||||:||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
  Rat   419 LPQEKNVLSQYWTLGSRNPKKSVNNQYCKKVIGGMVWNPVMRRSLSVERLETKSLPSRSPPITPN 483

Human   400 WRSPRLRHEIRKPRHSSADNLANEMTYITETEDVFYTYKGSLAPQDSDSEVSQNRSPHQESLSEN 464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:|||||||||.|||:.|||||
  Rat   484 WRSPRLRHEIRKPRHSSADNLANEMTYITETEDVFYTYKGSLSPKDSDSEVSQNHSPHRGSLSEN 548

Human   465 NPAQSYLTQKSSSSVSPSSNAPGSCSPDGVDQQLLDDFHRVTKGGSTEDASQYYCDKNDNGDSYL 529
            |||||.|||||||||||.||||||.||||||||.|:|:|:||||||.|:||||||||||:||.||
  Rat   549 NPAQSCLTQKSSSSVSPCSNAPGSFSPDGVDQQFLEDYHKVTKGGSIEEASQYYCDKNDDGDGYL 613

Human   530 VLIRITPDEDGKFGFNLKGGVDQKMPLVVSRINPESPADTCIPKLNEGDQIVLINGRDISEHTHD 594
            ||||||||::|:|||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||
  Rat   614 VLIRITPDKEGRFGFNLKGGVDQKMPLVVSRINPESPADTCMPKLNEGDQIVLINGRDISEHTHD 678

Human   595 QVVMFIKASRESHSRELALVIRRRAVRSFADFKSEDELNQLFPEAIFPMCPEGGDTLEGSMAQLK 659
            |||||||||||||||||||||||:||||.|:.:|||||:||||||:||.||||||:|||||..||
  Rat   679 QVVMFIKASRESHSRELALVIRRKAVRSLAEIRSEDELSQLFPEAMFPACPEGGDSLEGSMELLK 743

Human   660 KGLESGTVLIQFEQLYRKKPGLAITFAKLPQNLDKNRYKDVLPYDTTRVLLQGNEDYINASYVNM 724
            |||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   744 KGLESGTVLIQFEQLYRKKPGLAVTFAKLPQNLDKNRYKDVLPYDTTRVLLQGNEDYINASYVNM 808

Human   725 EIPAANLVNKYIATQGPLPHTCAQFWQVVWDQKLSLIVMLTTLTERGRTKCHQYWPDPPDVMNHG 789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||:|:||
  Rat   809 EIPAANLVNKYIATQGPLPHTCAQFWQVVWDQKLSLVVMLTTLTERGRTKCHQYWPDPPDIMDHG 873

Human   790 GFHIQCQSEDCTIAYVSREMLVTNTQTGEEHTVTHLQYVAWPDHGVPDDSSDFLEFVNYVRSLRV 854
            .||||||:|||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
  Rat   874 IFHIQCQAEDCTIAYVSREMLVTNTETGEEHTVTHLQYVAWPDHGVPDDSSDFLEFVKYVRSLRV 938

Human   855 DSEPVLVHCSAGIGRTGVLVTMETAMCLTERNLPIYPLDIVRKMRDQRAMMVQTSSQYKFVCEAI 919
            ..||.|||||||||||||||||||||||.|||||:||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   939 GGEPALVHCSAGIGRTGVLVTMETAMCLIERNLPVYPLDIVRKMRDQRAMMVQTSSQYKFVCEAI 1003

Human   920 LRVYEEGLVQMLDPS 934
            ||||||||||.||||
  Rat  1004 LRVYEEGLVQTLDPS 1018

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PTPN3XP_011517190.1 B41 52..243 CDD:214604 168/190 (88%)
FERM_C_PTPN4_PTPN3_like 237..330 CDD:270010 89/92 (97%)
PDZ_PTPN3-4-like 527..616 CDD:467190 83/88 (94%)
PTPc-N3 652..925 CDD:350448 257/272 (94%)
Ptpn3XP_001059757.1 B41 135..327 CDD:214604 168/191 (88%)
FERM_C_PTPN4_PTPN3_like 321..414 CDD:270010 89/92 (97%)
PDZ_PTPN3-4-like 611..700 CDD:467190 83/88 (94%)
PTPc-N3 736..1009 CDD:350448 257/272 (94%)

Return to query results.
Submit another query.