DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MYH7B and myo-1

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_047296292.1 Gene:MYH7B / 57644 HGNCID:15906 Length:2033 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_492053.1 Gene:myo-1 / 172471 WormBaseID:WBGene00002348 Length:1938 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1985 Identity:832/1985 - (41%)
Similarity:1273/1985 - (64%) Gaps:88/1985 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    54 RYLRQGYQEMTKVHTIPWDGKKRVWVPDEQDAYVEAEVKSEATGGRVTVETKDQKVLMVREAELQ 118
            :||::..::.....:.|:|.||.||:||.::.|:|..:|.........:.|...|.:.:::..:|
 Worm    12 QYLKRSREQQLADQSRPYDSKKNVWIPDAEEGYIEGVIKGPGPKADTVIVTAGGKDVTLKKDIVQ 76

Human   119 PMNPPRFDLLEDMAMMTHLNEASVLHNLRQRYARWMIYTYSGLFCVTINPYKWLPVYTASVVAAY 183
            .:|||:|:..|||:.:|.||:||||.|||.|||..:||||||||||.|||||.||:||.||...:
 Worm    77 EVNPPKFEKTEDMSNLTFLNDASVLWNLRSRYAAMLIYTYSGLFCVVINPYKRLPIYTDSVARMF 141

Human   184 KGKRRSDSPPHIYAVADNAYNDMLRSKGRLDSSPTADPDLGPGRPLPRQPV------HADHQFLA 242
            .||||::.|||::||:|.||..||:.  ..:.|.....:.|.|:....:.|      ....|..|
 Worm   142 MGKRRTEMPPHLFAVSDQAYRYMLQD--HENQSMLITGESGAGKTENTKKVICYFATVGASQKAA 204

Human   243 TKTGG---TLEDQIIEANPAMEAFGNAKTLRNDNSSRFGKFIRIHFGPSGKLASADIDSYLLEKS 304
            .|.|.   ||||||::.||.:||||||||:||:|||||||||||||...|.|||.||:.||||||
 Worm   205 LKEGEKEVTLEDQIVQTNPVLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFIRIHFNKHGTLASCDIEHYLLEKS 269

Human   305 RVIFQLPGERSYHVYYQILSGRKPELQDMLLLSMNPYDYHFCSQGVITVDNMNDGEELIATDHAM 369
            |||.|.||||.||::|||.|..||:|:|.|||:....:|.|.:|..:.:|.::|.||...||.|.
 Worm   270 RVIRQAPGERCYHIFYQIYSDFKPQLRDELLLNHPISNYWFVAQAELLIDGIDDTEEFQLTDEAF 334

Human   370 DILGFSVDEKCACYKIVGALLHFGNMKFKQKQREEQAEADGTESADKAAYLMGVSSGDLLKGLLH 434
            |:|.||..||..||:::.|.:|.|||||||:.||||||.||.:.|::|..:.|:.....||.|:.
 Worm   335 DVLKFSPTEKMDCYRLMSAHMHMGNMKFKQRPREEQAEPDGQDEAERACNMYGIDVDQFLKALVS 399

Human   435 PRVRVGNEYVTKGQSVEQVVFAVGALAKATYDRLFRWLVSRINQTLDTK-LPRQFFIGVLDIAGF 498
            |||:||.|:|:|||:|:||.:|:||:||..|.|:|.|||.:.|.|||.| :.|.:||||||||||
 Worm   400 PRVKVGTEWVSKGQNVDQVHWAIGAMAKGLYARVFHWLVKKCNLTLDQKGIDRDYFIGVLDIAGF 464

Human   499 EIFEFNSFEQLCINFTNEKLQQFFNQHMFVLEQEEYKREGIDWVFIDFGLDLQPCIDLIEKVRRL 563
            |||:|||||||.|||.|||||||||.||||||||||.||||.|.|||||||||.||:||||    
 Worm   465 EIFDFNSFEQLWINFVNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYAREGIQWTFIDFGLDLQACIELIEK---- 525

Human   564 RLSDVGGPHSYSFCSQPLGILSILEEECMFPKASDASFRAKLYDNHAGKSPNFQQPRPDKKRKYQ 628
                            ||||:|:|:|||:.|||:|.:...||.|.|.||.|||::|:|.|.::.:
 Worm   526 ----------------PLGIISMLDEECIVPKATDMTLAQKLTDQHLGKHPNFEKPKPPKGKQGE 574

Human   629 AHFEVVHYAGVVPYSIVGWLEKNKDPLNETVVPIFQKS-QNRLLATLYENYAGSCSTE-----PP 687
            |||.:.||||.|.|:::.||||||||||:|||.:.:.| :|.||..::::|    :|:     ..
 Worm   575 AHFAMRHYAGTVRYNVLNWLEKNKDPLNDTVVSVMKASKKNDLLVEIWQDY----TTQEEAAAAA 635

Human   688 KSGVKEKRKKAASFQTVSQLHKENLNKLMTNLRATQPHFVRCIVPNENKTPGVMDAFLVLHQLRC 752
            |:|...|..|:.||.|||.:::|:||||||.|..|.|||:|||:|||.|..|::||.|||:||.|
 Worm   636 KAGGGRKGGKSGSFMTVSMMYRESLNKLMTMLHKTHPHFIRCIIPNEKKQSGMIDAALVLNQLTC 700

Human   753 NGVLEGIRICRQGFPNRLLYTDFRQRYRIL--NPSAIPDDTFMDSRKATEKLLGSLDLDHTQYQF 815
            |||||||||||:|||||..:.||.|||.||  ..:...||....:....:.|:....|:..|::.
 Worm   701 NGVLEGIRICRKGFPNRTQHPDFVQRYAILAAKEAKSSDDMKTCAGAILQALINQKQLNDEQFRI 765

Human   816 GHTKVGALWDQGWPWLWRSHWAGFMRMVGGYPGCLPLRPQVFFKAGLLGVLEELRDQRLAKVLTL 880
            ||||                                    ||||||::..:|:|||.:|.:::|.
 Worm   766 GHTK------------------------------------VFFKAGVVAHIEDLRDDKLNQIITG 794

Human   881 LQARSRGRLMRLEYQRLLGGR----DALFTIQWNIRAFNAVKNWSWMKLFFKMKPLLRSAQAEEE 941
            .|:..|......:    .|.|    ::...:|.|||::..::.|.|..||.|::|.|:..:..||
 Worm   795 FQSAIRWYTATAD----AGARRKQLNSYIILQRNIRSWCVLRTWDWFLLFGKLRPQLKCGKMAEE 855

Human   942 LAALRAELRGLRGALAAAEAKRQELEETHVSITQEKNDLALQLQAEQDNLADAEERCHLLIKSKV 1006
            :..:..|.:.|......||:.|:..||.:..::.|::.|...|:..|...|..||:...|..::.
 Worm   856 MIKMAEEQKVLEAEAKKAESARKSQEEAYAKLSAERSKLLEALELTQGGSAAIEEKLTRLNSARQ 920

Human  1007 QLEGKVKELSERLEDEEEVNADLAARRRKLEDECTELKKDIDDLELTLAKAEKEKQATENKVKNL 1071
            ::|..:.:.::||.:.||.||||..:|||.:.|...|||.|:.::..|||:.:||.|.||::.:|
 Worm   921 EVEKSLNDANDRLSEHEEKNADLEKQRRKAQQEVENLKKSIEAVDGNLAKSLEEKAAKENQIHSL 985

Human  1072 TEEMAALDESVARLTKEKKALQEAHQQALGDLQAEEDRVSALTKAKLRLEQQVEDLECSLEQEKK 1136
            .:||.:.||::.::.||||.|:|.::|.:.||||||.:.:...:.:.:|||.::::|.::|:||:
 Worm   986 QDEMNSQDETIGKINKEKKLLEENNRQLVDDLQAEEAKQAQANRLRGKLEQTLDEMEEAVEREKR 1050

Human  1137 LRMDTERAKRKLEGDLKLTQESVADAAQDKQQLEEKLKKKDSELSQLSLRVEDEQLLGAQMQKKI 1201
            :|.:||::|||:||:||..||::.:.:..|.:.:..||||::::..|.:|:||||.|..::.::.
 Worm  1051 IRAETEKSKRKVEGELKGAQETIDELSAIKLETDASLKKKEADIHALGVRIEDEQALANRLTRQS 1115

Human  1202 KELQARAEELEEELEAERAARARVEKQRAEAARELEELSERLEEAGGASAGQREGCRKREAELGR 1266
            ||...|..|:|:|||.||.:|::.::.|||..|||:||:|||:|.......|::..:|:::|:.:
 Worm  1116 KENAQRIIEIEDELEHERQSRSKADRARAELQRELDELNERLDEQNKQLEIQQDNNKKKDSEIIK 1180

Human  1267 LRRELEEAALRHEATVAALRRKQAEGAAELGEQVDSLQRVRQKLEKEKSELRMEVDDLAANVETL 1331
            .||:|:|..:.:|..:|.:|||..:..:.|...:|:||:.:.|:||||..|:.|:||:.|.|:..
 Worm  1181 FRRDLDEKNMANEDQMAMIRRKNNDQISALTNTLDALQKSKAKIEKEKGVLQKELDDINAQVDQE 1245

Human  1332 TRAKASAEKLCRTYEDQLSEAKIKVEELQRQLADASTQRGRLQTESGELSRLLEEKECLISQLSR 1396
            |:::...|:|.:.||.|::|.:.||:|..||:.:.::.:|||..::.:|:|.:||.|..::.::|
 Worm  1246 TKSRVEQERLAKQYEIQVAELQQKVDEQSRQIGEYTSTKGRLSNDNSDLARQVEELEIHLATINR 1310

Human  1397 GKALAAQSLEELRRQLEEESKAKSALAHAVQALRHDCDLLREQHEEEAEAQAELQRLLSKANAEV 1461
            .|...:..|.|.::..|:|...:.....|.:.|.|:.|...|..||:...:.::||.||:.|:|:
 Worm  1311 AKTAFSSQLVEAKKAAEDELHERQEFHAACKNLEHELDQCHELLEEQINGKDDIQRQLSRINSEI 1375

Human  1462 AQWRSKYEADAIQRTEELEEAKKKLALRLQEAEEGVEAANAKCSSLEKAKLRLQTESEDVTLELE 1526
            :||:::||.:.:..:|||||.|:|...|:.:.:|.:.||..|..||||||.:|..|:||...:::
 Worm  1376 SQWKARYEGEGLVGSEELEELKRKQMNRVMDLQEALSAAQNKVISLEKAKGKLLAETEDARSDVD 1440

Human  1527 RATSAAAALDKKQRHLERALEERRRQEEEMQRELEAAQRESRGLGTELFRLRHGHEEALEALETL 1591
            |..:..|:|:||||..::.:::.:|:.:::|:|::|..|:||...||:|:||...:...|.:|||
 Worm  1441 RHLTVIASLEKKQRAFDKIVDDWKRKVDDIQKEIDATTRDSRNTSTEVFKLRSSMDNLSEQIETL 1505

Human  1592 KRENKNLQEEISDLTDQVSLSGKSIQELEKTKKALEGEKSEIQAALEEAEGALELEETKTLRIQL 1656
            :||||...:||.|:.:|::..|::.||:.|:.:.||.||.|:|.||:|||.|||.||:|.||:|:
 Worm  1506 RRENKIFSQEIRDINEQITQGGRTYQEVHKSVRRLEQEKDELQHALDEAEAALEAEESKVLRLQI 1570

Human  1657 ELSQVKAEVDRKLAEKDEECANLRRNHQRAVESLQASLDAETRARNEALRLKKKMEGDLNDLELQ 1721
            |:.|:::|:::::.||:||..|.|:|||||:||:||||:.|.:::.|..|.|||:|.|:|.||:.
 Worm  1571 EVQQIRSEIEKRIQEKEEEFENTRKNHQRALESIQASLETEAKSKAELARAKKKLETDINQLEIA 1635

Human  1722 LGHATRQATEAQAATRLMQAQLKEEQAGRDEEQRLAAELHEQAQALERRASLLAAELEELRAALE 1786
            |.||.:...:||...:.:..|:||.|...|:|||...|:.|...|.|:|.::..:|.|:|...:|
 Worm  1636 LDHANKANVDAQKNLKKLFDQVKELQGQVDDEQRRREEIRENYLAAEKRLAIALSESEDLAHRIE 1700

Human  1787 QGERSRRLAEQELLEATERLNLLHSQNTGLLNQKKKLEADLAQLSGEVEEAAQERREAEEKAKKA 1851
            ..::.::..|.|..|.......|...|..|...|:|:|.::.....|::|...|.:.:||:|:||
 Worm  1701 ASDKHKKQLEIEQAELKSSNTELIGNNAALSAMKRKVENEVQIARNELDEYLNELKASEERARKA 1765

Human  1852 ITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKTLEQTVRELQARLEEAEQAALRGGKKQVQKLEAKVRELE 1916
            ..||..:|||:::||:.:.|::|.:|:||...:||||::::||:|.::.|.|.:.|:|.:||.||
 Worm  1766 AADADRLAEEVRQEQEHAVHVDRQRKSLELNAKELQAKIDDAERAMIQFGAKALAKVEDRVRSLE 1830

Human  1917 AELDAEQKKHAEALKGVRKHERRVKELAYQAEEDRKNLARMQDLVDKLQSKVKSYKRQFEEAEQQ 1981
            |||.:||::|.|::||..|.|||.:||.:|.|||:|...|:|:.|:|||.|::..|||.||||:.
 Worm  1831 AELHSEQRRHQESIKGYTKQERRARELQFQVEEDKKAFDRLQENVEKLQQKIRVQKRQIEEAEEV 1895

Human  1982 ANTNLAKYRKAQHELDDAEERADMAETQANKLRAR 2016
            |..||:|:|:.|..|::|||||::||....::|.:
 Worm  1896 ATQNLSKFRQIQLALENAEERAEVAENSLVRMRGQ 1930

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MYH7BXP_047296292.1 Myosin_N 72..117 CDD:460670 12/44 (27%)
Motor_domain 140..820 CDD:473979 371/697 (53%)
Myosin_tail_1 939..2016 CDD:460256 407/1076 (38%)
myo-1NP_492053.1 Myosin_N 30..73 CDD:460670 12/42 (29%)
MYSc_class_II 98..773 CDD:276951 374/736 (51%)
Myosin_tail_1 854..1919 CDD:460256 404/1064 (38%)

Return to query results.
Submit another query.