DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment STIM2 and Stim2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001162589.1 Gene:STIM2 / 57620 HGNCID:19205 Length:754 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038947488.1 Gene:Stim2 / 117087 RGDID:1304641 Length:817 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:754 Identity:707/754 - (93%)
Similarity:727/754 - (96%) Gaps:3/754 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MLVLGLLVAGAADGCELVPRHLRGRRATGSAATAASSPAAAAGDSPALMTDPCMSLSPPCFTEED 65
            ||:.||||||.||||:|||||||||||:|||..|||..|||||:..||:||||||||||||||||
  Rat    67 MLLFGLLVAGVADGCDLVPRHLRGRRASGSAGAAASPSAAAAGERQALLTDPCMSLSPPCFTEED 131

Human    66 RFSLEALQTIHKQMDDDKDGGIEVEESDEFIREDMKYKDATNKHSHLHREDKHITIEDLWKRWKT 130
            ||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:|||
  Rat   132 RFSLEALQTIHKQMDDDKDGGIEVDESDEFIREDMKYKDATNKHSHLHREDKHITVEDLWKQWKT 196

Human   131 SEVHNWTLEDTLQWLIEFVELPQYEKNFRDNNVKGTTLPRIAVHEPSFMISQLKISDRSHRQKLQ 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
  Rat   197 SEVHNWTLEDTLQWLIEFVELPQYEKNFRDNNVKGTTLPRIAVHETSFMISQLKISDRSHRQKLQ 261

Human   196 LKALDVVLFGPLTRPPHNWMKDFILTVSIVIGVGGCWFAYTQNKTSKEHVAKMMKDLESLQTAEQ 260
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   262 LKALDVVLFGPLTRPPHNWMKDFILTISIVIGVGGCWFAYTQNKTSKEHVAKMMKDLESLQTAEQ 326

Human   261 SLMDLQERLEKAQEENRNVAVEKQNLERKMMDEINYAKEEACRLRELREGAECELSRRQYAEQEL 325
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   327 SLMDLQERLEKAQEENRTVAVEKQNLERKMMDEINYAKEEACRLRELREGAECELSRRQYAEQEL 391

Human   326 EQVRMALKKAEKEFELRSSWSVPDALQKWLQLTHEVEVQYYNIKRQNAEMQLAIAKDEVAASYLI 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
  Rat   392 EQVRMALKKAEKEFELRSSWSVPDALQKWLQLTHEVEVQYYNIKRQNAEMQLAIAKDEVAASYLM 456

Human   391 QAEKIKKKRSTVFGTLHVAHSSSLDEVDHKILEAKKALSELTTCLRERLFRWQQIEKICGFQIAH 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   457 QAEKIKKKRSTVFGTLHVAHSSSLDEVDHKILEAKKALSELTTCLRERLFRWQQIEKICGFQIAH 521

Human   456 NSGLPSLTSSLYSDHSWVVMPRVSIPPYPIAGGVDDLDEDTPPIVSQFPGTMAKPPGSLARSSSL 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||.|||||||||
  Rat   522 NSGLPSLTSSLYSDHSWVVMPRVSIPPYPIAGGVDDLDEDTPPIVSQFPGTVAKPAGSLARSSSL 586

Human   521 CRSRRSIVPSSPQPQRAQLAPHAPHPSHPRHPHHPQHTPHSLPSPDPDILSVSSCPALYRNEEEE 585
            |||||||||||||.|||||..|||..:|||||||||   ||||||||||||||||||||||||||
  Rat   587 CRSRRSIVPSSPQSQRAQLPAHAPLAAHPRHPHHPQ---HSLPSPDPDILSVSSCPALYRNEEEE 648

Human   586 EAIYFSAEKQWEVPDTASECDSLNSSIGRKQSPPLSLEIYQTLSPRKISRDEVSLEDSSRGDSPV 650
            |||||:||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||:||||||||||||
  Rat   649 EAIYFTAEKQWEVPDTASECDSLNSSIGRKQSPPSSLEIYQTLSSRKISRDELSLEDSSRGDSPV 713

Human   651 TVDVSWGSPDCVGLTETKSMIFSPASKVYNGILEKSCSMNQLSSGIPVPKPRHTSCSSAGNDSKP 715
            |.|||.|||:||||||||||||||||:||||||||||||:|||||||||.|||||||.||:||||
  Rat   714 TADVSRGSPECVGLTETKSMIFSPASRVYNGILEKSCSMHQLSSGIPVPNPRHTSCSLAGSDSKP 778

Human   716 VQEAPSVARISSIPHDLCHNGEKSKKPSKIKSLFKKKSK 754
            ||||.||:|:.||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   779 VQEASSVSRVGSIPHDLCHNGEKSKKPSKIKSLFKKKSK 817

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
STIM2NP_001162589.1 SAM_STIM2 132..205 CDD:188973 71/72 (99%)
PRK00409 <250..430 CDD:234750 177/179 (99%)
SOAR 346..453 CDD:465164 105/106 (99%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 491..570 67/78 (86%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 693..754 53/60 (88%)
Stim2XP_038947488.1 SAM_STIM2 198..271 CDD:188973 71/72 (99%)
PRK00409 <316..496 CDD:234750 177/179 (99%)
SOAR 412..519 CDD:465164 105/106 (99%)

Return to query results.
Submit another query.