DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment KCNT1 and kcnt1b

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011517180.1 Gene:KCNT1 / 57582 HGNCID:18865 Length:1283 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_073807699.1 Gene:kcnt1b / 563670 ZFINID:ZDB-GENE-141210-6 Length:1252 Species:Danio rerio


Alignment Length:1245 Identity:970/1245 - (77%)
Similarity:1058/1245 - (84%) Gaps:67/1245 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    81 QRRPCAGDGALLDTAGFKMSDLDSEVLPLPPRYRFRDLLLGDPSFQNDDRVQVEFYVNENTFKER 145
            ||...:..|.:||.:..|::|:||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Zfish    33 QRNNSSNTGVILDISTLKLADVDSEVPPLPPRYRFRDLLLGDQSFQNDDRVQVEFYVNENTFKER 97

Human   146 LKLFFIKNQRSSLRIRLFNFSLKLLTCLLYIVRVLLDDPALGIGCWG----------CPK--QNY 198
            |||||||||||||||||||.|||||||||||:||.||||...:.|..          |.|  .||
Zfish    98 LKLFFIKNQRSSLRIRLFNLSLKLLTCLLYIIRVSLDDPTNQVTCARKHCANITDALCSKACANY 162

Human   199 SFNDSS--SEINWAPILWVERKMTLWAIQVIVAIISFLETMLLIYLSYKGNIWEQIFRVSFVLEM 261
            :.|.::  ::|||..|.||.|::.:|||||.||:||||:.|||:|||||||||||||::||::||
Zfish   163 TANLTADPTQINWELIFWVNRRVPVWAIQVTVALISFLQAMLLVYLSYKGNIWEQIFQISFIIEM 227

Human   262 INTLPFIITIFWPPLRNLFIPVFLNCWLAKHALENMINDFHRAILRTQSAMFNQVLILFCTLLCL 326
            |||:|||||||||||||:|:||||||||||.||||||||.||||.||.||||||||||.||||||
Zfish   228 INTVPFIITIFWPPLRNIFVPVFLNCWLAKSALENMINDLHRAIQRTHSAMFNQVLILICTLLCL 292

Human   327 VFTGGCRTCGIQHLERAGENLSLLTSFYFCIVTFSTVGYGDVTPKIWPSQLLVVIMICVALVVLP 391
            ||||   .||||||||||:||:|..:.|||||||||||||||||:||||||||||||||||||||
Zfish   293 VFTG---ACGIQHLERAGKNLTLFDALYFCIVTFSTVGYGDVTPRIWPSQLLVVIMICVALVVLP 354

Human   392 LQFEELVYLWMERQKSGGNYSRHRAQTEKHVVLCVSSLKIDLLMDFLNEFYAHPRLQDYYVVILC 456
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   355 LQFEELAYLWMERQKSGGNYSRHRAQTEKHVVLCVTSLKIDLLMDFLNEFYAHPRLQDYYVVILC 419

Human   457 PTEMDVQVRRVLQIPLWSQRVIYLQGSALKDQDLMRAKMDNGEACFILSSRNEVDRTAADHQTIL 521
            |||||:||||:|||||||||||||||||||||||||||||:.|||||||||||||||||||||||
Zfish   420 PTEMDIQVRRILQIPLWSQRVIYLQGSALKDQDLMRAKMDDAEACFILSSRNEVDRTAADHQTIL 484

Human   522 RAWAVKDFAPNCPLYVQILKPENKFHVKFADHVVCEEECKYAMLALNCICPATSTLITLLVHTSR 586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||:|||||||:||||||||
Zfish   485 RAWAVKDFAPNCPLYVQILKPENKFHVKFADHVVCEEEFKYAMLALNCVCPATSTLVTLLVHTSR 549

Human   587 GQEGQESPEQWQRMYGRCSGNEVYHIRMGDSKFFREYEGKSFTYAAFHAHKKYGVCLIGLKREDN 651
            |||||.|||||||.|||||||||||||:.|||||.||:|||||||:|||||||||||||.|||||
Zfish   550 GQEGQTSPEQWQRTYGRCSGNEVYHIRLMDSKFFGEYDGKSFTYASFHAHKKYGVCLIGTKREDN 614

Human   652 KSILLNPGPRHILAASDTCFYINITKEENSAFIFKQEEKRKKRAFSGQGLHEGPARLPVHSIIAS 716
            ||||||||||||::|:|||:|||||||||||||||||||..| ..|..|:::.|:||||.|||||
Zfish   615 KSILLNPGPRHIMSATDTCYYINITKEENSAFIFKQEEKHSK-GLSAAGVYDAPSRLPVQSIIAS 678

Human   717 M-------GTVAMDLQGTEHRPTQSGGGGGGSKLALPTENGSGSRRPSIAPVLELADSSALLPCD 774
            |       ||||:|||..: .|..|      :|||||||||:||||||||||||:|||||:||||
Zfish   679 MVDQSTSYGTVAIDLQNPD-PPADS------NKLALPTENGAGSRRPSIAPVLEIADSSAILPCD 736

Human   775 LLSDQSEDEVTPSDDEGLSVVEYVKGYPPNSPYIGSSPTLCHLLPVKAPFCCLRLDKGCKHNSYE 839
            ||:|.||||...||::|...::.|||||||||||||||||||||..|||||||||||||:|||:|
Zfish   737 LLNDPSEDETNQSDEDGAPAIDCVKGYPPNSPYIGSSPTLCHLLQQKAPFCCLRLDKGCRHNSFE 801

Human   840 DAKAYGFKNKLIIVSAETAGNGLYNFIVPLRAYYRSRKELNPIVLLLDNKPDHHFLEAICCFPMV 904
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||:||||||||||||
Zfish   802 DAKAYGFKNKLIIVSAETAGNGLYNFIVPLRAYYRPRKELNPIVLLLDNPPDNHFLEAICCFPMV 866

Human   905 YYMEGSVDNLDSLLQCGIIYADNLVVVDKESTMSAEEDYMADAKTIVNVQTMFRLFPSLSITTEL 969
            |||.|::||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Zfish   867 YYMAGTIDNLDNLLQCGIIYADNLVVVDKESTMSAEEDYMADAKTIVNVQTMFRLFPSLSIITEL 931

Human   970 THPSNMRFMQFRAKDSYSLALSKLEKRERENGSNLAFMFRLPFAAGRVFSISMLDTLLYQSFVKD 1034
            |||||||||||||||.||||||||||.||:.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   932 THPSNMRFMQFRAKDCYSLALSKLEKIERDKGSNLAFMFRLPFAAGRVFSISMLDTLLYQSFVKD 996

Human  1035 YMITITRLLLGLDTTPGSGYLCAMKITEGDLWIRTYGRLFQKLCSSSAEIPIGIYRTESHVFSTS 1099
            |||.|.|||||||||||||||||||:||.|||||||||||||||||||||||||||||||:||:|
Zfish   997 YMILIARLLLGLDTTPGSGYLCAMKVTEEDLWIRTYGRLFQKLCSSSAEIPIGIYRTESHMFSSS 1061

Human  1100 EPHDLRAQSQISVNVEDCEDTREVKGPWGSRAGTGGSSQGRHTGGGDPAEHPLLRRKSLQWARRL 1164
            |..::..|    |:||||||.|:.:..|..:      :..|::.|.|.:||||||:||:||||||
Zfish  1062 EFKEICKQ----VSVEDCEDQRDHRESWKEK------TAHRNSTGSDQSEHPLLRKKSMQWARRL 1116

Human  1165 SRKAPKQAGRAAAAEWISQQRLSLYRRSERQELSELVKNRMKHLGLPTTGY-------------- 1215
            |||..|...|   ||.|:||||:|||||||||||||||||||||||||.||              
Zfish  1117 SRKNTKPPSR---AERINQQRLNLYRRSERQELSELVKNRMKHLGLPTVGYEDVANLTASDVMNR 1178

Human  1216 -------DEMNDHQNTLSYVLINPPPDTRLEPSDIVYLIRSDPLAHVASSSQSRKSSCSHKLSSC 1273
                   |||||:|||||||||||||||.||.:||||:|||||||||..:.....:....: ...
Zfish  1179 VNLGYLQDEMNDNQNTLSYVLINPPPDTILELNDIVYIIRSDPLAHVPENLPGAPAGAKIR-QDY 1242

Human  1274 NPETRDETQL 1283
            .|||||||.|
Zfish  1243 RPETRDETHL 1252

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
KCNT1XP_011517180.1 Ion_trans 207..390 CDD:459842 146/182 (80%)
Ion_trans_2 322..398 CDD:462301 64/75 (85%)
BK_channel_a 552..646 CDD:460947 83/93 (89%)
kcnt1bXP_073807699.1 None

Return to query results.
Submit another query.