DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PTK7 and Ptk7

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001257327.1 Gene:PTK7 / 5754 HGNCID:9618 Length:1078 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001382670.1 Gene:Ptk7 / 301242 RGDID:1310472 Length:1062 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1043 Identity:972/1043 - (93%)
Similarity:1001/1043 - (95%) Gaps:0/1043 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    35 GTQTAIVFIKQPSSQDALQGRRALLRCEVEAPGPVHVYWLLDGAPVQDTERRFAQGSSLSFAAVD 99
            |..:||||||:|||||||||||||||||||||.||||||||:|.|||||||||||||||||||||
  Rat    19 GAHSAIVFIKEPSSQDALQGRRALLRCEVEAPDPVHVYWLLNGVPVQDTERRFAQGSSLSFAAVD 83

Human   100 RLQDSGTFQCVARDDVTGEEARSANASFNIKWIEAGPVVLKHPASEAEIQPQTQVTLRCHIDGHP 164
            ||||||.|||||||::|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
  Rat    84 RLQDSGAFQCVARDNITGEEARSANASFNIKWIEAGPVVLKHPASAAEIQPQTQVTLRCHIDGHP 148

Human   165 RPTYQWFRDGTPLSDGQSNHTVSSKERNLTLRPAGPEHSGLYSCCAHSAFGQACSSQNFTLSIAD 229
            |||||||||||||||.||.|||||||||||||||.||||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat   149 RPTYQWFRDGTPLSDDQSTHTVSSKERNLTLRPASPEHSGLYSCCAHNAFGQACSSQNFTLSIAD 213

Human   230 ESFARVVLAPQDVVVARYEEAMFHCQFSAQPPPSLQWLFEDETPITNRSRPPHLRRATVFANGSL 294
            ||||||:||||||||||.|||||||||||||||||||:|||||||||||||||||:|.|||||||
  Rat   214 ESFARVLLAPQDVVVARNEEAMFHCQFSAQPPPSLQWVFEDETPITNRSRPPHLRKAMVFANGSL 278

Human   295 LLTQVRPRNAGIYRCIGQGQRGPPIILEATLHLAEIEDMPLFEPRVFTAGSEERVTCLPPKGLPE 359
            |||||||||||:|||||||||||||:|||||||||||||...|||||.||.||||.|..|:|||.
  Rat   279 LLTQVRPRNAGVYRCIGQGQRGPPIVLEATLHLAEIEDMLPLEPRVFIAGGEERVACPAPQGLPT 343

Human   360 PSVWWEHAGVRLPTHGRVYQKGHELVLANIAESDAGVYTCHAANLAGQRRQDVNITVATVPSWLK 424
            |||||||||||||.||||:|||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||:||:
  Rat   344 PSVWWEHAGVRLPAHGRVHQKGLELVFATIAESDAGVYTCHAANLAGQRRQDVNITVATVPTWLR 408

Human   425 KPQDSQLEEGKPGYLDCLTQATPKPTVVWYRNQMLISEDSRFEVFKNGTLRINSVEVYDGTWYRC 489
            |||||||||||||||.|||||||||||:||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||
  Rat   409 KPQDSQLEEGKPGYLHCLTQATPKPTVIWYRNQMLISEDSRFEVSKNGTLRINSVEVYDGTVYRC 473

Human   490 MSSTPAGSIEAQARVQVLEKLKFTPPPQPQQCMEFDKEATVPCSATGREKPTIKWERADGSSLPE 554
            :|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||.|||||||||
  Rat   474 VSSTPAGSIEAQARVQVLEKLKFTPPPQPQQCMEFDKEATVPCSATGREKPTVKWVRADGSSLPE 538

Human   555 WVTDNAGTLHFARVTRDDAGNYTCIASNGPQGQIRAHVQLTVAVFITFKVEPERTTVYQGHTALL 619
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   539 WVTDNAGTLHFARVTRDDAGNYTCIASNEPQGQIRAHVQLTVAVFITFKVEPERTTVYQGHTALL 603

Human   620 QCEAQGDPKPLIQWKGKDRILDPTKLGPRMHIFQNGSLVIHDVAPEDSGRYTCIAGNSCNIKHTE 684
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||:|||
  Rat   604 RCEAQGDPKPLIQWKGKDRILDPTKLGPRMHIFQNGSLVIHDVAPEDSGSYTCIAGNSCNIRHTE 668

Human   685 APLYVVDKPVPEESEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVAYIIAVLGLMFYCKKRCKAKRLQKQPEG 749
            |||.|||||:.|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   669 APLLVVDKPLMEDSEGPGSPPPYKMIQTIGLSVGAAVAYIIAVLGLMFYCKKRCKAKRLQKQPEG 733

Human   750 EEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLGSGPAATNKRHSTSDKMHFPRSSLQPITTLGKSE 814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||:||||||||||||
  Rat   734 EEPEMECLNGGPLQNGQPSAEIQEEVALTSLGSGPTATNKRHSTGDKMHFPRASLQPITTLGKSE 798

Human   815 FGEVFLAKAQGLEEGVAETLVLVKSLQSKDEQQQLDFRRELEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPH 879
            ||||||||||||:||..||||||||||:||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
  Rat   799 FGEVFLAKAQGLDEGATETLVLVKSLQNKDEQQQLDFRREFEMFGKLNHANVVRLLGLCREAEPH 863

Human   880 YMVLEYVDLGDLKQFLRISKSKDEKLKSQPLSTKQKVALCTQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNC 944
            ||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat   864 YMVLEYVDLGDLKQFLRISKNKDEKLKSQPLSTKQKVALCSQVALGMEHLSNNRFVHKDLAARNC 928

Human   945 LVSAQRQVKVSALGLSKDVYNSEYYHFRQAWVPLRWMSPEAILEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFT 1009
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||
  Rat   929 LVSAQRQVKVSALGLSKDVYNSEYYHFRQAWVPLRWMSPEAVLEGDFSTKSDVWAFGVLMWEVFT 993

Human  1010 HGEMPHGGQADDEVLADLQAGKARLPQPEGCPSKLYRLMQRCWALSPKDRPSFSEIASALGDSTV 1074
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||.|||...
  Rat   994 HGEMPHGGQGDDEVLADLQAGKARLPQPEGCPSKLYRLMQRCWALNPKDRPSFSEIASTLGDGPA 1058

Human  1075 DSK 1077
            |||
  Rat  1059 DSK 1061

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PTK7NP_001257327.1 IG_like 46..120 CDD:214653 67/73 (92%)
IGc2 53..113 CDD:197706 55/59 (93%)
Ig2_PTK7 154..230 CDD:143237 71/75 (95%)
IG_like 239..>309 CDD:214653 64/69 (93%)
Ig 250..310 CDD:143165 55/59 (93%)
IG 348..416 CDD:214652 57/67 (85%)
IGc2 348..406 CDD:197706 47/57 (82%)
I-set 420..506 CDD:254352 78/85 (92%)
Ig 422..506 CDD:299845 77/83 (93%)
I-set 511..596 CDD:254352 81/84 (96%)
IGc2 528..582 CDD:197706 51/53 (96%)
IG_like 606..689 CDD:214653 79/82 (96%)
IGc2 613..677 CDD:197706 61/63 (97%)
PTK_CCK4 798..1071 CDD:133178 260/272 (96%)
STYKc 809..1069 CDD:214568 249/259 (96%)
Ptk7NP_001382670.1 None


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83683327
Domainoid 1 1.000 474 1.000 Domainoid score I8118
eggNOG 1 0.900 - - E1_KOG4475
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG47887
OrthoDB 1 1.010 - - D18713at9347
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0007317
OrthoInspector 1 1.000 - - oto137553
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_109217
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X6206
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1212.160

Return to query results.
Submit another query.