DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CGN and Cgn

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_065821.1 Gene:CGN / 57530 HGNCID:17429 Length:1203 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006232989.1 Gene:Cgn / 310655 RGDID:1311992 Length:1197 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1198 Identity:1029/1198 - (85%)
Similarity:1090/1198 - (90%) Gaps:3/1198 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     7 MAEPRGPVDHGVQIRFITEPVSGAEMGTLRRGGRRPAKDARASTYGVAVRVQGIAGQPFVVLNSG 71
            ||:|||||||||||||||||...||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     2 MADPRGPVDHGVQIRFITEPEGAAEMGTLRRSGRRPAKDARASTYGVAVRVQGIAGQPFVVLNSG 66

Human    72 EKGGDSFGVQIKGANDQGASGALSSDLELPENPYSQVKGFPAPSQSSTSDEEPGAYWNGKLLRSH 136
            |||.|||||||||.|::|:.||||||.||||||||||||:||.||.|||||||..:.|||||||.
  Rat    67 EKGADSFGVQIKGGNNRGSPGALSSDSELPENPYSQVKGYPATSQGSTSDEEPRDHLNGKLLRSQ 131

Human   137 SQASLAGPGPVDPSNRSNSMLELAPKVASPGSTIDTAPLSSVDSLINKFDSQLGGQARGRTGRRT 201
            |||||.|...:.|||||.|:|||||:.....:||||||||||||||||||.|.|.|.||||||||
  Rat   132 SQASLTGLALMSPSNRSTSLLELAPQKTPSVNTIDTAPLSSVDSLINKFDGQKGSQVRGRTGRRT 196

Human   202 RMLPPE-QRKRSKSLDSRLPRDTFEERERQSTNHWTSSTKYDNHVGTSKQPAQSQNLSPLSGFSR 265
            :.||.| |||||:||||||.|||.|:||.||||||...||||||:.:||...|.|  ||.|.|||
  Rat   197 KTLPQEQQRKRSQSLDSRLSRDTREDRELQSTNHWARGTKYDNHMDSSKTLPQKQ--SPFSSFSR 259

Human   266 SRQTQDWVLQSFEEPRRSAQDPTMLQFKSTPDLLRDQQEAAPPGSVDHMKATIYGILREGSSESE 330
            ||||||||||||||.|...|||.|:||||||||||||:|||||||.|||||||||||||||::||
  Rat   260 SRQTQDWVLQSFEESREKVQDPAMVQFKSTPDLLRDQREAAPPGSADHMKATIYGILREGSADSE 324

Human   331 TSVRRKVSLVLEKMQPLVMVSSGSTKAVAGQGELTRKVEELQRKLDEEVKKRQKLEPSQVGLERQ 395
            .|||||||||||:||||.|||..||||:.||.|||||:||||:|||||||||||||||::|||||
  Rat   325 ASVRRKVSLVLEQMQPLGMVSPASTKALVGQAELTRKMEELQKKLDEEVKKRQKLEPSRIGLERQ 389

Human   396 LEEKTEECSRLQELLERRKGEAQQSNKELQNMKRLLDQGEDLRHGLETQVMELQNKLKHVQGPEP 460
            ||||.|||.|||||||:||||.|||.|||||||.||.|.|.|||||||||.|||.||||.|..:|
  Rat   390 LEEKAEECHRLQELLEKRKGEVQQSAKELQNMKLLLGQEEGLRHGLETQVKELQLKLKHSQNLDP 454

Human   461 AKEVLLKDLLETRELLEEVLEGKQRVEEQLRLRERELTALKGALKEEVASRDQEVEHVRQQYQRD 525
            .||.||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
  Rat   455 GKESLLKDLLETRELLEELLEGKQRVEEQLRLRERELTALKGALKEEVASHDQEVEHVRLQYQRD 519

Human   526 TEQLRRSMQDATQDHAVLEAERQKMSALVRGLQRELEETSEETGHWQSMFQKNKEDLRATKQELL 590
            ||||||||||||||||.:||||||||:|||.||:|||||||||||||:|||||||:|||.|||||
  Rat   520 TEQLRRSMQDATQDHAAVEAERQKMSSLVRELQKELEETSEETGHWQNMFQKNKEELRAAKQELL 584

Human   591 QLRMEKEEMEEELGEKIEVLQRELEQARASAGDTRQVEVLKKELLRTQEELKELQAERQSQEVAG 655
            ||||||||:|||||||:|:|||:|||||||..||:|||.|||||.|||.||||||||||||||||
  Rat   585 QLRMEKEEIEEELGEKMEILQRDLEQARASTRDTQQVEELKKELQRTQGELKELQAERQSQEVAG 649

Human   656 RHRDRELEKQLAVLRVEADRGRELEEQNLQLQKTLQQLRQDCEEASKAKMVAEAEATVLGQRRAA 720
            |||::.|||||:|||.||||.|:||||||||||||||||||||||||||:.:|.||.|||||:|.
  Rat   650 RHRNQVLEKQLSVLRAEADRSRDLEEQNLQLQKTLQQLRQDCEEASKAKVASETEAMVLGQRQAT 714

Human   721 VETTLRETQEENDEFRRRILGLEQQLKETRGLVDGGEAVEARLRDKLQRLEAEKQQLEEALNASQ 785
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||:||||||||||||:.|||.||||||||||.:|
  Rat   715 VETTLRETQEENDEFRRRILGLEQQLKEARGLVEGGEAVEARLRDKVHRLEVEKQQLEEALNVAQ 779

Human   786 EEEGSLAAAKRALEARLEEAQRGLARLGQEQQTLNRALEEEGKQREVLRRGKAELEEQKRLLDRT 850
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||.||:.|||||||||||:||
  Rat   780 EEEGSLAAAKRALEIRLEEAQRGLARLGQEQQALNRALEEEGKQREALRKSKAELEEQKRLLNRT 844

Human   851 VDRLNKELEKIGEDSKQALQQLQAQLEDYKEKARREVADAQRQAKDWASEAEKTSGGLSRLQDEI 915
            |||||||||:||:|||.||||||:|:||||||||:||||||||||||||||||.||||||||||:
  Rat   845 VDRLNKELEQIGDDSKLALQQLQSQMEDYKEKARKEVADAQRQAKDWASEAEKNSGGLSRLQDEL 909

Human   916 QRLRQALQASQAERDTARLDKELLAQRLQGLEQEAENKKRSQDDRARQLKGLEEKVSRLETELDE 980
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||.|||||||||.||||
  Rat   910 QRLRQALQTSQAERDTARLDKELLAQRLQGLEQEAENKKRSQDDKARQLKSLEEKVSRLEAELDE 974

Human   981 EKNTVELLTDRVNRGRDQVDQLRTELMQERSARQDLECDKISLERQNKDLKTRLASSEGFQKPSA 1045
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
  Rat   975 EKNTVELLTDRVNRGRDQVDQLRTELMQERSARQDLECDKISLERQNKDLKTRLASSEGLQKPSA 1039

Human  1046 SLSQLESQNQLLQERLQAEEREKTVLQSTNRKLERKVKELSIQIEDERQHVNDQKDQLSLRVKAL 1110
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:|||||||||||||:||||||
  Rat  1040 SFSQLESQNQLLQERLQAEEREKTVLQSTNRKLERRVKELSIQIDDERQHVNDQKDQLTLRVKAL 1104

Human  1111 KRQVDEAEEEIERLDGLRKKAQREVEEQHEVNEQLQARIKSLEKDSWRKASRSAAESALKNEGLS 1175
            |||||||||||||||.||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
  Rat  1105 KRQVDEAEEEIERLDSLRKKAQRELEEQHEVNEQLQARIKSLEKDSWRKASRSAAESALKQEGLS 1169

Human  1176 SDEEFDSVYDPSSIASLLTESNLQTSSC 1203
            ||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1170 SDEEFDSVYDPSSIASLLTESNLQTSSC 1197

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CGNNP_065821.1 SMC_N 368..1152 CDD:330553 695/783 (89%)
CgnXP_006232989.1 Myosin_tail_1 362..1146 CDD:279860 695/783 (89%)
RILP-like <1017..1118 CDD:304877 95/100 (95%)
Tho2 1084..>1165 CDD:288156 76/80 (95%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 1229 1.000 Domainoid score I953
eggNOG 1 0.900 - - E1_292HY
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H41394
Inparanoid 1 1.050 1952 1.000 Inparanoid score I1547
NCBI 1 1.000 - -
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D110948at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0012556
OrthoInspector 1 1.000 - - oto132798
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_113088
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR46349
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X6329
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1616.330

Return to query results.
Submit another query.