Protein Alignment PCDH19 and Pcdh19

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001171809.1
• Gene: PCDH19 / 57526
• HGNCID: 14270
• Length: 1148
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: XP_006257284.1
• Gene: Pcdh19 / 317183
• RGDID: 1565392
• Length: 1145
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1148
• Identity: 1104/1148 - (96%)
• Similarity: 1126/1148 - (98%)
• Gaps: 3/1148 - (0%)

Human     1 MESLLLPVLLLLAILWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDAREAGFALDPRQASAFRVVS 65
            |||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.||||||||||
  Rat     1 MESLLLPVLLLLAVLWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDAREAGFAMDTRQASAFRVVS 65

Human    66 NSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEVMSSSMEICVIKVEIKDLNDNAPSFP 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 NSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEVMSSSMEICVIKVEIKDLNDNAPSFP 130

Human   131 AAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYELTPNELFGLEIKTRGDGSRFAELVVEKS 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 AAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYELTPNELFGLEIKTRGDGSRFAELVVEKS 195

Human   196 LDRETQSHYSFRITALDGGDPPRLGTVGLSIKVTDSNDNNPVFSESTYAVSVPENSPPNTPVIRL 260
            ||||||||||||||||||||||.:|||||:|||||||||||||.||||:||||||||||||||||
  Rat   196 LDRETQSHYSFRITALDGGDPPHMGTVGLTIKVTDSNDNNPVFGESTYSVSVPENSPPNTPVIRL 260

Human   261 NASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQIDPHSGLVTVTGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNS 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 NASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQIDPHSGLVTVTGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNS 325

Human   326 IPAHCKVTVSVLDTNDNPPVINLLSVNSELVEVSESAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLG 390
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 IPAHCKVTVSVLDTNDNPPIINLLSVNSELVEVSESAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLG 390

Human   391 NVPFRLQEYESFSTILVDGRLDREQHDQYNLTIQARDGGVPMLQSAKSFTVLITDENDNHPHFSK 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||
  Rat   391 NVPFRLQEYESFSTILVDGRLDREQHDQYNLTIQARDSGVPMLQSAKSFTVRITDENDNHPHFSK 455

Human   456 PYYQVIVQENNTPGAYLLSVSARDPDLGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALRS 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 PYYQVIVQENNTPGAYLLSVSARDPDLGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALRS 520

Human   521 FNHEQTKAFEFKVLAKDGGLPSLQSNATVRVIILDVNDNTPVITAPPLINGTAEVYIPRNSGIGY 585
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 FNHEQTKAFEFKVLAKDGGMPSLQSNATVRVIILDVNDNTPVITAPPLINGTAEVYIPRNSGIGY 585

Human   586 LVTVVKAEDYDEGENGRVTYDMTEGDRGFFEIDQVNGEVRTTRTFGESSKSSYELIVVAHDHGKT 650
            |||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:||:||||||||||||||
  Rat   586 LVTVVKADDYDEGENGRVTYDMTEGDRGFFEIDQVNGEVRTTRTFNENSKASYELIVVAHDHGKT 650

Human   651 SLSASALVLIYLSPALDAQESMGSVNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIFVAIKCKRDNKEIRTYNC 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 SLSASALVLIYLSPALDAQESMGSVNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIFVAIKCKRDNKEIRTYNC 715

Human   716 SNCLTITCLLGCFIKGQNSKCLHCISVSPISEEQDKKTEEKVSLRGKRIAEYSYGHQKKSSKKKK 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 SNCLTITCLLGCFIKGQNSKCLHCISVSPISEEQDKKAEEKVSLRGKRIAEYSYGHQKKSSKKKK 780

Human   781 ISKNDIRLVPRDVEETDKMNVVSCSSLTSSLNYFDYHQQTLPLGCRRSESTFLNVENQNTRNTSA 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat   781 ISKNDIRLVPRDVEETDKMNVVSCSSLTSSLNYFDYHQQTLPLGCRRSESTFLNVENQNTRNTTA 845

Human   846 NHIYHHSFNSQGPQQPDLIINGVPLPETENYSFDSNYVNSRAHLIKSSSTFKDLEGNSLKDSGHE 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 NHIYHHSFNSQGPQQPDLIINGVPLPETENYSFDSNYVNSRAHLIKSSSTFKDLEGNSLKDSGHE 910

Human   911 ESDQTDSEHDVQRSLYCDTAVNDVLNTSVTSMGSQMPDHDQNEGFHCREECRILGHSDRCWMPRN 975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||:||||||||||||||||||||||
  Rat   911 ESDQTDSEHDVQRSLYCDTAVNDVLNTSVTSMGSHMPDHDQNDGFHCREECRILGHSDRCWMPRN 975

Human   976 PMPIRSKSPEHVRNIIALSIEATAADVEAYDDCGPTKRTFATFGKDVSDHPAEERPTLKGKRTVD 1040
            |||.|||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||..||||||||
  Rat   976 PMPTRSKSPEHMRNIIALSIEATAADVEAYDDCGPTKRTFATFGKDVSSHPAEERSILKGKRTVD 1040

Human  1041 VTICSPKVNSVIREAGNGCEAISPVTSPLHLKSSLPTKPSVSYTIALAPPARDLEQYVNNVNNGP 1105
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||:|||:||||||.||:   ::.|.|.
  Rat  1041 VTICSPKVNSAIREAGNGCEAISPVTSPLHLKSPLPTKPSMSYTVALAPPAHDLD---HHANTGA 1102

Human  1106 TRPSEAEPRGADSEKVMHEVSPILKEGRNKESPGVKRLKDIVL 1148
            :|||||||||||||||||||:|||||||:||||.|||||||:|
  Rat  1103 SRPSEAEPRGADSEKVMHEVNPILKEGRDKESPAVKRLKDIIL 1145

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
PCDH19	NP_001171809.1	Cadherin_2	27..106	CDD:462413	76/78 (97%)
		Cadherin_repeat	133..234	CDD:206637	97/100 (97%)
		Cadherin_repeat	242..342	CDD:206637	98/99 (99%)
		Cadherin_repeat	356..449	CDD:206637	90/92 (98%)
		Cadherin_repeat	458..559	CDD:206637	99/100 (99%)
		Cadherin_repeat	574..662	CDD:206637	83/87 (95%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	901..921		19/19 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1100..1148		39/47 (83%)
Pcdh19	XP_006257284.1	Cadherin_2	27..106	CDD:462413	76/78 (97%)
		Cadherin_repeat	133..234	CDD:206637	97/100 (97%)
		Cadherin_repeat	242..342	CDD:206637	98/99 (99%)
		Cadherin_repeat	356..449	CDD:206637	90/92 (98%)
		Cadherin_repeat	458..559	CDD:206637	99/100 (99%)
		Cadherin_repeat	574..662	CDD:206637	83/87 (95%)