DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ADGRB1 and Adgrb1

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_016869180.1 Gene:ADGRB1 / 575 HGNCID:943 Length:1663 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038935459.1 Gene:Adgrb1 / 362931 RGDID:1305608 Length:1615 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1663 Identity:1520/1663 - (91%)
Similarity:1554/1663 - (93%) Gaps:48/1663 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MRGQAAAPGPVWILAPLLLLLLLLGRRARAAAGADAGPGPEPCATLVQGKFFGYFSAAAVFPANA 65
            ||||||||||:|||||||||||||||.||||:|||.|||.|.|.|||||||||||||||||||||
  Rat     1 MRGQAAAPGPIWILAPLLLLLLLLGRWARAASGADIGPGTEQCTTLVQGKFFGYFSAAAVFPANA 65

Human    66 SRCSWTLRNPDPRRYTLYMKVAKAPVPCSGPGRVRTYQFDSFLESTRTYLGVESFDEVLRLCDPS 130
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 SRCSWTLRNPDPRRYTLYMKVAKAPAPCSGPGRVRTYQFDSFLESTRTYLGVESFDEVLRLCDPS 130

Human   131 APLAFLQASKQFLQMRRQQPPQHDGLRPRAGPPGPTDDFSVEYLVVGNRNPSRAACQMLCRWLDA 195
            |||||||||||||||:||||||...|    ||.|..||||||||||||||||.||||||||||||
  Rat   131 APLAFLQASKQFLQMQRQQPPQDGDL----GPQGSGDDFSVEYLVVGNRNPSHAACQMLCRWLDA 191

Human   196 CLAGSRSSHPCGIMQTPCACLGGEAGGPAAGPLAPRGDVCLRDAVAGGPENCLTSLTQDRGGHGA 260
            ||||||||||||||||||||||||||..|:.||.|||||||||.||||||||||||||||||||:
  Rat   192 CLAGSRSSHPCGIMQTPCACLGGEAGDTASSPLVPRGDVCLRDGVAGGPENCLTSLTQDRGGHGS 256

Human   261 TGGWKLWSLWGECTRDCGGGLQTRTRTCLPAPGVEGGGCEGVLEEGRQCNREACGPAGRTSSRSQ 325
            .|||||||||||||||||||||||||||.|..||||.||||||||||.|||:||||.||||||||
  Rat   257 AGGWKLWSLWGECTRDCGGGLQTRTRTCSPTLGVEGRGCEGVLEEGRLCNRKACGPTGRTSSRSQ 321

Human   326 SLRSTDARRREELGDELQQFGFPAPQTGDPAAEEWSPWSVCSSTCGEGWQTRTRFCVSSSYSTQC 390
            ||||||||||||.||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   322 SLRSTDARRREEFGDELQQFGFPSPQTGDPAAEEWSPWSVCSSTCGEGWQTRTRFCVSSSYSTQC 386

Human   391 SGPLREQRLCNNSAVCPVHGAWDEWSPWSLCSSTCGRGFRDRTRTCRPPQFGGNPCEGPEKQTKF 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   387 SGPLREQRLCNNSAVCPVHGAWDEWSPWSLCSSTCGRGFRDRTRTCRPPQFGGNPCEGPEKQTKF 451

Human   456 CNIALCPGRAVDGNWNEWSSWSACSASCSQGRQQRTRECNGPSYGGAECQGHWVETRDCFLQQCP 520
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   452 CNIALCPGRAVDGNWNEWSSWSTCSASCSQGRQQRTRECNGPSYGGAECQGHWVETRDCFLQQCP 516

Human   521 VDGKWQAWASWGSCSVTCGAGSQRRERVCSGPFFGGAACQGPQDEYRQCGTQRCPEPHEICDEDN 585
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
  Rat   517 VDGKWQAWASWGSCSVTCGGGSQRRERVCSGPFFGGAACQGPQDEYRQCGAQRCPEPHEICDEDN 581

Human   586 FGAVIWKETPAGEVAAVRCPRNATGLILRRCELDEEGIAYWEPPTYIRCVSIDYRNIQMMTREHL 650
            ||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat   582 FGAVVWKETPAGEVAAVRCPRNATGLILRRCELDEEGIAFWEPPTYIRCVSIDYRNIQMMTREHL 646

Human   651 AKAQRGLPGEGVSEVIQTLVEISQDGTSYSGDLLSTIDVLRNMTEIFRRAYYSPTPGDVQNFVQI 715
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   647 AKAQRGLPGEGVSEVIQTLLEISQDGTSYSGDLLSTIDVLRNMTEIFRRAYYSPTPGDVQNFVQI 711

Human   716 LSNLLAEENRDKWEEAQLAGPNAKELFRLVEDFVDVIGFRMKDLRDAYQVTDNLVLSIHKLPASG 780
            :|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   712 ISNLLAEENRDKWEEAQLMGPNAKELFRLVEDFVDVIGFRMKDLRDAYQVTDNLVLSIHKLPASG 776

Human   781 ATDISFPMKGWRATGDWAKVPEDRVTVSKSVFSTGLTEADEASVFVVGTVLYRNLGSFLALQRNT 845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||::|||||||||||||||||||||||
  Rat   777 ATDISFPMKGWRATGDWAKVPEDRVTVSKSVFSTGLAEADDSSVFVVGTVLYRNLGSFLALQRNT 841

Human   846 TVLNSKVISVTVKPPPRSLRTPLEIEFAHMYNGTTNQTCILWDETDVPSSSAPPQLGPWSWRGCR 910
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
  Rat   842 TVLNSKVISVTVKPPPRSLLTPLEIEFAHMYNGTTNQTCILWDETDGPSSSAPPQLGPWSWRGCR 906

Human   911 TVPLDALRTRCLCDRLSTFAILAQLSADANMEKATLPSVTLIVGCGVSSLTLLMLVIIYVSVWRY 975
            |||||||||||||||||||||||||||||.|:|.|:|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   907 TVPLDALRTRCLCDRLSTFAILAQLSADATMDKVTVPSVTLIVGCGVSSLTLLMLVIIYVSVWRY 971

Human   976 IRSERSVILINFCLSIISSNALILIGQTQTRNKVVCTLVAAFLHFFFLSSFCWVLTEAWQSYMAV 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   972 IRSERSVILINFCLSIISSNALILIGQTQTRNKVVCTLVAAFLHFFFLSSFCWVLTEAWQSYMAV 1036

Human  1041 TGHLRNRLIRKRFLCLGWGLPALVVAISVGFTKAKGYSTMNYCWLSLEGGLLYAFVGPAAAVVLV 1105
            ||.||:||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1037 TGRLRSRLVRKRFLCLGWGLPALVVAISVGFTKAKGYSTMNYCWLSLEGGLLYAFVGPAAAVVLV 1101

Human  1106 NMVIGILVFNKLVSKDGITDKKLKERAGQPSPHPLGRALKCAECGVLSAADATSDATSNAMASLW 1170
            |||||||||||||||||||||||||||||....||||||.||||||||||:||||||||||||||
  Rat  1102 NMVIGILVFNKLVSKDGITDKKLKERAGQLPVPPLGRALTCAECGVLSAAEATSDATSNAMASLW 1166

Human  1171 SSCVVLPLLALTWMSAVLAVTDRRSALFQILFAVFDSLEGFVIVMVHCILRREVQDAVKCRVVDR 1235
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1167 SSCVVLPLLALTWMSAVLAVTDRRSALFQILFAVFDSLEGFVIVMVHCILRREVQDAVKCRVVDR 1231

Human  1236 QEEGNGDSGGSFQNGHAQLMTDFEKDVDLACRSGPEAVTGSGFLSCGEANGPCSLWSFRYLKSTF 1300
            |||||||||||||||||||||||||||||||||| |.:|                          
  Rat  1232 QEEGNGDSGGSFQNGHAQLMTDFEKDVDLACRSG-ERLT-------------------------- 1269

Human  1301 SRDSPGRGAGTAPVLNKDIAACRTATITGTLKRPSLPEEEKLKLAHAKGPPTNFNSLPANVSKLH 1365
                         |||||||||||||||||.||||||||||:||  |||||..||||||||||||
  Rat  1270 -------------VLNKDIAACRTATITGTFKRPSLPEEEKMKL--AKGPPPTFNSLPANVSKLH 1319

Human  1366 LHGSPRYPGGPLPDFPNHSLTLKRDKAPKSSFVGDGDIFKKLDSELSRAQEKALDTSYVILPTAT 1430
            |||||||||||||||||||||||:||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1320 LHGSPRYPGGPLPDFPNHSLTLKKDKAPKSSFIGDGDIFKKLDSELSRAQEKALDTSYVILPTAT 1384

Human  1431 ATLRPKPKEEPKYSIHIDQMPQTRLIHLSTAPEASLPARSPPSRQPPSGGPPEAPPAQPPPPPPP 1495
            |||||||||||||||:|||||||||||||.||:||.|.||||:|:||.|.|||.||.| ||||||
  Rat  1385 ATLRPKPKEEPKYSINIDQMPQTRLIHLSMAPDASFPTRSPPAREPPGGAPPEVPPVQ-PPPPPP 1448

Human  1496 PPPPPQQPLPPPPNLEPAPPSLGDPGEPAAHPGPSTGPSTKNENVATLSVSSLERRKSRYAELDF 1560
            ||||||||:||||:||||||||||.|||:||||||:|..||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1449 PPPPPQQPIPPPPSLEPAPPSLGDTGEPSAHPGPSSGAGTKNENVATLSVSSLERRKSRYAELDF 1513

Human  1561 EKIMHTRKRHQDMFQDLNRKLQHAAEKDKEVLGPDSKQPEKQQTPNKRPWESLRKAHGTPTWVKK 1625
            |||||||||||||||||||||||||||:|||.|.|:| ||||||||||.||||||.||||.||||
  Rat  1514 EKIMHTRKRHQDMFQDLNRKLQHAAEKEKEVPGVDNK-PEKQQTPNKRAWESLRKPHGTPAWVKK 1577

Human  1626 ELEPLQPSPLELRSVEWERSGATIPLVGQDIIDLQTEV 1663
            |||||.||||||||||||::||||||||||||||||||
  Rat  1578 ELEPLPPSPLELRSVEWEKAGATIPLVGQDIIDLQTEV 1615

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ADGRB1XP_016869180.1 None
Adgrb1XP_038935459.1 AGRB_N 43..216 CDD:408958 162/176 (92%)
TSP1 260..310 CDD:214559 43/49 (88%)
TSP1 355..403 CDD:214559 47/47 (100%)
TSP1 408..458 CDD:214559 49/49 (100%)
TSP1 466..516 CDD:214559 48/49 (98%)
TSP1 521..571 CDD:214559 47/49 (96%)
HormR 573..639 CDD:214468 63/65 (97%)
GAIN 657..855 CDD:406802 191/197 (97%)
GPS 876..934 CDD:197639 56/57 (98%)
7tmB2_BAI_Adhesion_VII 941..1230 CDD:320379 278/288 (97%)
TM helix 1 943..967 CDD:320379 23/23 (100%)
TM helix 2 977..998 CDD:320379 20/20 (100%)
TM helix 3 1008..1030 CDD:320379 21/21 (100%)
TM helix 4 1048..1064 CDD:320379 15/15 (100%)
TM helix 5 1084..1107 CDD:320379 22/22 (100%)
TM helix 6 1165..1187 CDD:320379 21/21 (100%)
TM helix 7 1192..1217 CDD:320379 24/24 (100%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 758 1.000 Domainoid score I3015
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H1287
Inparanoid 1 1.050 3092 1.000 Inparanoid score I484
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG41304
OrthoDB 1 1.010 - - D11632at32523
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0010992
OrthoInspector 1 1.000 - - oto139833
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_105378
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR12011
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X8565
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1515.480

Return to query results.
Submit another query.