DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SLC12A5 and Slc12a5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001128243.1 Gene:SLC12A5 / 57468 HGNCID:13818 Length:1139 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001380604.1 Gene:Slc12a5 / 171373 RGDID:620811 Length:1139 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1139 Identity:1119/1139 - (98%)
Similarity:1126/1139 - (98%) Gaps:0/1139 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSRRFTVTSLPPAGPARSPDPESRRHSVADPRHLPGEDVKGDGNPKESSPFINSTDTEKGKEYDG 65
            |||||||||||||..|.|.|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||:||||
  Rat     1 MSRRFTVTSLPPAASAASADPESRRHSVADPRRLPREDVKGDGNPKESSPFINSTDTEKGREYDG 65

Human    66 KNMALFEEEMDTSPMVSSLLSGLANYTNLPQGSREHEEAENNEGGKKKPVQAPRMGTFMGVYLPC 130
            :||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 RNMALFEEEMDTSPMVSSLLSGLANYTNLPQGSKEHEEAENNEGGKKKPVQAPRMGTFMGVYLPC 130

Human   131 LQNIFGVILFLRLTWVVGIAGIMESFCMVFICCSCTMLTAISMSAIATNGVVPAGGSYYMISRSL 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 LQNIFGVILFLRLTWVVGIAGIMESFCMVFICCSCTMLTAISMSAIATNGVVPAGGSYYMISRSL 195

Human   196 GPEFGGAVGLCFYLGTTFAGAMYILGTIEILLAYLFPAMAIFKAEDASGEAAAMLNNMRVYGTCV 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 GPEFGGAVGLCFYLGTTFAGAMYILGTIEILLAYLFPAMAIFKAEDASGEAAAMLNNMRVYGTCV 260

Human   261 LTCMATVVFVGVKYVNKFALVFLGCVILSILAIYAGVIKSAFDPPNFPICLLGNRTLSRHGFDVC 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 LTCMATVVFVGVKYVNKFALVFLGCVILSILAIYAGVIKSAFDPPNFPICLLGNRTLSRHGFDVC 325

Human   326 AKLAWEGNETVTTRLWGLFCSSRFLNATCDEYFTRNNVTEIQGIPGAASGLIKENLWSSYLTKGV 390
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 AKLAWEGNETVTTRLWGLFCSSRLLNATCDEYFTRNNVTEIQGIPGAASGLIKENLWSSYLTKGV 390

Human   391 IVERSGMTSVGLADGTPIDMDHPYVFSDMTSYFTLLVGIYFPSVTGIMAGSNRSGDLRDAQKSIP 455
            ||||.||.|||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 IVERRGMPSVGLADGTPVDMDHPYVFSDMTSYFTLLVGIYFPSVTGIMAGSNRSGDLRDAQKSIP 455

Human   456 TGTILAIATTSAVYISSVVLFGACIEGVVLRDKFGEAVNGNLVVGTLAWPSPWVIVIGSFFSTCG 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 TGTILAIATTSAVYISSVVLFGACIEGVVLRDKFGEAVNGNLVVGTLAWPSPWVIVIGSFFSTCG 520

Human   521 AGLQSLTGAPRLLQAISRDGIVPFLQVFGHGKANGEPTWALLLTACICEIGILIASLDEVAPILS 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 AGLQSLTGAPRLLQAISRDGIVPFLQVFGHGKANGEPTWALLLTACICEIGILIASLDEVAPILS 585

Human   586 MFFLMCYMFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFRYYHWTLSFLGMSLCLALMFICSWYYALVAMLIAGL 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 MFFLMCYMFVNLACAVQTLLRTPNWRPRFRYYHWTLSFLGMSLCLALMFICSWYYALVAMLIAGL 650

Human   651 IYKYIEYRGAEKEWGDGIRGLSLSAARYALLRLEEGPPHTKNWRPQLLVLVRVDQDQNVVHPQLL 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 IYKYIEYRGAEKEWGDGIRGLSLSAARYALLRLEEGPPHTKNWRPQLLVLVRVDQDQNVVHPQLL 715

Human   716 SLTSQLKAGKGLTIVGSVLEGTFLENHPQAQRAEESIRRLMEAEKVKGFCQVVISSNLRDGVSHL 780
            ||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 SLTSQLKAGKGLTIVGSVLEGTFLDNHPQAQRAEESIRRLMEAEKVKGFCQVVISSNLRDGVSHL 780

Human   781 IQSGGLGGLQHNTVLVGWPRNWRQKEDHQTWRNFIELVRETTAGHLALLVTKNVSMFPGNPERFS 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 IQSGGLGGLQHNTVLVGWPRNWRQKEDHQTWRNFIELVRETTAGHLALLVTKNVSMFPGNPERFS 845

Human   846 EGSIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLRHHKVWRKCKMRIFTVAQMDDNSIQMKKDLTTFLYHLRITAE 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 EGSIDVWWIVHDGGMLMLLPFLLRHHKVWRKCKMRIFTVAQMDDNSIQMKKDLTTFLYHLRITAE 910

Human   911 VEVVEMHESDISAYTYEKTLVMEQRSQILKQMHLTKNEREREIQSITDESRGSIRRKNPANTRLR 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 VEVVEMHESDISAYTYEKTLVMEQRSQILKQMHLTKNEREREIQSITDESRGSIRRKNPANTRLR 975

Human   976 LNVPEETAGDSEEKPEEEVQLIHDQSAPSCPSSSPSPGEEPEGEGETDPEKVHLTWTKDKSVAEK 1040
            ||||||||.|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:|
  Rat   976 LNVPEETACDNEEKPEEEVQLIHDQSAPSCPSSSPSPGEEPEGEGETDPEKVHLTWTKDKSAAQK 1040

Human  1041 NKGPSPVSSEGIKDFFSMKPEWENLNQSNVRRMHTAVRLNEVIVKKSRDAKLVLLNMPGPPRNRN 1105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
  Rat  1041 NKGPSPVSSEGIKDFFSMKPEWENLNQSNVRRMHTAVRLNEVIVNKSRDAKLVLLNMPGPPRNRN 1105

Human  1106 GDENYMEFLEVLTEHLDRVMLVRGGGREVITIYS 1139
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||
  Rat  1106 GDENYMEFLEVLTEQLDRVMLVRGGGREVITIYS 1139

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SLC12A5NP_001128243.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..63 54/61 (89%)
2a30 44..1139 CDD:273347 1080/1094 (99%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 92..116 22/23 (96%)
Scissor helix. /evidence=ECO:0000269|PubMed:33199848, ECO:0000269|PubMed:33310850, ECO:0007744|PDB:6M23, ECO:0007744|PDB:7D8Z 667..681 13/13 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 942..1052 105/109 (96%)
Slc12a5NP_001380604.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..62 54/60 (90%)
2a30 44..1139 CDD:273347 1080/1094 (99%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 95..116 19/20 (95%)
Scissor helix. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q9H2X9 667..681 13/13 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 943..1025 79/81 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1033..1052 16/18 (89%)

Return to query results.
Submit another query.