Protein Alignment l(2)41Ab and Ccdc40

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001104357.1
• Gene: l(2)41Ab / 5740691
• FlyBaseID: FBgn0262123
• Length: 890
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001395320.1
• Gene: Ccdc40 / 207607
• MGIID: 2443893
• Length: 1263
• Species: Mus musculus
• Alignment Length: 927
• Identity: 242/927 - (26%)
• Similarity: 432/927 - (46%)
• Gaps: 138/927 - (14%)

  Fly    16 EPNPEASPEPEELALLPPNHPLLSKFQVCLKGHLIRTKREIENEIAEIKHHVKLREQRREEQGLT 80
            |.:.||..|..:|.:|.|:|||:.:||..|||:|.|...:::.::.|:....|....:|:|.|:.
Mouse   387 EGSDEAEEEGSQLIVLDPDHPLMIRFQEALKGYLNRQMDKLKLDVQELDVATKQTRSQRQELGVN 451

  Fly    81 LYDMQQKM-KFQEKQIMELSAVIEKHL-----KNRQDEEFN------TKTLKAENEEKIKLTKSQ 133
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Mouse   452 LYGVQQHLARLQ----MQLEKSHDRHSLVACERRRKEEELQCARSVYNKTCQTANEERKKLAALQ 512

  Fly   134 KTLYHERMA-ELGDMQSLGSNIKKWACSVEDEVKNAKRIVSRDAQLQDQLSQEKRKSDILF---- 193
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Mouse   513 TEV--ESLALHLFYMQNIEQDVR-------DDIQVMKQVVRKTETEKMHAEVEKKKQDLFVDQLT 568

  Fly   194 ---YRLDIEIKKRENELLSICEEEATMKEVINILNMSIANANTDLEVLQNEHKRLTQAWNEVIIA 255
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Mouse   569 ERSHQLEENIALFEAQYLSQAEDTRVLKK-------AVTEAITEIDTIAVEKKRILQQWTTSLVG 626

  Fly   256 IQLRDKILFQVQDAARKHREAMKHNIAGIEAIKKQIGKEMELNKKLDSFKQRLADETSSLRR--- 317
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Mouse   627 MKHRNEAYKTVMDALRECQHQVKSTDSEIEVCKKSIMQEEEKNEKLARLLNRAETEATLVQKMTA 691

  Fly   318 ECQDESESLL----KMQAKLDDLPEFLN-------TTETDLQDALREGSHLFTEVR-KLDIAL-D 369
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Mouse   692 QCLSKQEALQTEFNTYQLALQDTEEMLNKGYVEHSAVLSELQ-ATRQAFHQEQELRQKMDMSMVD 755

  Fly   370 KYLTQKFRTEETILRLAQDHLITDKATAYRLKLLGKSQEKRRNVDLSLSKVQNQLSLSMLEVEKL 434
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Mouse   756 K---------------LQEQGTSSKMTKYFHQLLRKLQKENTNLVTHLSKIDGDIAQATLDITNT 805

  Fly   435 RCVVFNERAYNDSTKTKLKSAENKSSTLENGLKKIHIQIEIKMKLYEKINCKIEEMDHLFGDASG 499
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Mouse   806 NCKIDMHKKTLAEMDKEVKRFNDLITNSESEIARRTILIERKQSLINFFNKQLEQMVSELGGEEA 870

  Fly   500 NPTDLKIKQLEKSIHIGELQVREHQQFWIMLQNHFVNLSQKRNDQLNEIQVTRKQLSIIRQKSLK 564
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Mouse   871 GPLELEIKRLSKLTEEYNTGVAEAQMTWLRLQQELVQVTHEREEQLVSVDQLKKEVHIMEQKKLR 935

  Fly   565 SDQELEISHRKAKELQIFIKKF------TSKLELLNDKIYKKRIHHDVE------ETEFDHEQAE 617
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Mouse   936 I--ESKIAHEK-KEQKIVSRHMRDLDNDLSKLNMLLDK--NRCSSEELEQNNIATETEF------ 989

  Fly   618 QTQKLKIAELEILKLEGKIVELQNEIELHKDYVIDKHRETLSWETKYKMIEETIKWAKLERSVKG 682
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Mouse   990 -LRTLKDSERETIQMQEKLMELSEEKATLLNSFMEAEHQIMLWEKKIQLAKE------MRSSVDS 1047

  Fly   683 EIG-----LMKTEIHRMNIRYSQLKRAQESLVLDLEHCVMHREQIFVNASVKEHLQAK------- 735
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Mouse  1048 ETGQTEIRAMKAEIHRMKVRHGQLLKQQEKMIRDMELAVARRETIVVQAEGQSKIDKKVITKTEF 1112

  Fly   736 -FKQLKNTSQIQVRLDEVHNRTKLISNEITFLSEKQLIDDINKIERMIYMLRRIQSDLNDIIKED 799
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Mouse  1113 HYQQ----RELQKKVREMHKATDDCTNTISELEETQKFLS-SSLQEKQQLLSEMQA-TTDVLEEE 1171

  Fly   800 ANIQDRIEEGILAKHANLEQIIRKQMRAKAYKRLNTLKSQQVIL----RSELTV-QQLSQKQSEL 859
            .|      :....|..||.:|:..|.|.|..:.  .::.:.|.|    ||:|.. ::||.:.|:|
Mouse  1172 IN------QLTALKRQNLLEIVTLQTRGKHLQA--AIEGKYVFLHRNSRSQLMERKRLSVRLSQL 1228

  Fly   860 NYDLTEIAKALLLDYPK 876
            |..|:.:.:    |||:
Mouse  1229 NKVLSSVQE----DYPQ 1241

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
l(2)41Ab	NP_001104357.1	CCDC158	<54..>761	CDD:464943	194/767 (25%)
Ccdc40	NP_001395320.1	PHA03169	<5..>147	CDD:223003
		SMC_prok_B	467..1204	CDD:274008	199/800 (25%)
		BRE1	901..999	CDD:462547	32/109 (29%)