Protein Alignment l(2)41Ab and ccdc42.2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001104357.1
• Gene: l(2)41Ab / 5740691
• FlyBaseID: FBgn0262123
• Length: 890
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_031750354.1
• Gene: ccdc42.2 / 108648942
• XenbaseID: XB-GENE-29091331
• Length: 1012
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 924
• Identity: 225/924 - (24%)
• Similarity: 426/924 - (46%)
• Gaps: 105/924 - (11%)

  Fly     8 DCDFPISFEPNPEASPEPE-------ELALLPPNHPLLSKFQVCLKGHLIRTKREIENEIAEIKH 65
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 Frog   116 DSDDPVGEEETAEEEEEKKEYDDKESELVVLDPDHPLMGRFQTALKTYLTKQIKSLDLELREMTE 180

  Fly    66 HVKLREQRREEQGLTLYDMQQKM-KFQEKQIMELSAVIEKH----LKNRQ-DEEFNT------KT 118
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 Frog   181 SMKNNKKEREDLGMFLYGVQQELARLQ----MGLEKQHDKHSHVSVQRRQKEDELETIRNLYKKT 241

  Fly   119 LKAENEEKIKLTKSQKTLYHERMA-ELGDMQSLGSNIKKWACSVEDEVKNAKRIVSRDAQLQDQL 182
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 Frog   242 HQITDTERKKVSSMQTEV--ENLALRLFYMENMNRDVR-------SDINVMKRAVQKAEMERLQA 297

  Fly   183 SQEKRKSDILFYRLDIEIKKRENELLSICEEEATMKEVINILNMSIANANTDLEVLQNEHKRLTQ 247
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 Frog   298 EVEKKKQDIFVDRLTCEVDRLREQIALYEAQVSAQREDTKAARETVAEACMEIEAIAVEKKQLIQ 362

  Fly   248 AWNEVIIAIQLRDKILFQVQDAARKHREAMKHNIAGIEAIKKQIGKEMELNKKLDSFKQRLADET 312
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 Frog   363 QWNSSLIGMTRRDEAYAAIQEAFSLAQQELLSIDAEIEGCKKTITKEEERNEQLNFMLNRAESDA 427

  Fly   313 SSLRRECQDESESLLKMQA---KLDDLPEFLNTTETDLQDALREGSHLFTEVRKLDIALDKYLTQ 374
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 Frog   428 AMSKKQV---AQSLTKQEALRLEFSTYARTLQETEQAINRVAVERSGYVNEITAMQKKIEKESQV 489

  Fly   375 KFRTEETILRLAQDHLITDKATAYRLKLLGKSQEKRRNVDLSLSKVQNQLSLSMLEV----EKLR 435
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 Frog   490 KVNLEAQILAKLQEKMTSDKAAKYSSLLAAKLQKQTLELEINCSKVENETAQISLEINHSLSRMK 554

  Fly   436 CVVFNERAYNDSTKTKLKSAENKSSTLENGLKKIHIQIEIKMKLYEKINCKIEEMDHLFGDASGN 500
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 Frog   555 AL---QKTLVDLDK-NIEDTNDLISQSQNEITKRTLAIERKQATINLFSKQIEATIAQTGGKEVG 615

  Fly   501 PTDLKIKQLEKSIHIGELQVREHQQFWIMLQNHFVNLSQKRNDQLNEIQVTRKQLSIIRQKSLKS 565
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 Frog   616 PLEIQITALTKQIDECNSEIMSLQQYWLRLQTEMVNLTKQREEQDASVEMLRRELTILQQKKIRT 680

  Fly   566 DQELEISHRKAKELQIFIKKFTSKLELLNDKIYKK-------RIHHDVEETEFDHEQAEQTQKLK 623
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 Frog   681 ENEIEQEKNEQKDIEHHMRNLKNDMVRLNMLLSKNSSTKEQLQQNNQLMESEF-------MRSLR 738

  Fly   624 IAELEILKLEGKIVELQNEIE--LHKDYVIDKHRETLSWETKYKMIEETIKWAKLERSVKGEIG- 685
            .||.|.::::..:..||.|.|  ||.  :::...:.:.||.|.::.:|      :..:|..|||
 Frog   739 EAERESIEMQENLRNLQEEKERILHS--LVETEHQIMLWEKKIQLAKE------MRNAVDSEIGQ 795

  Fly   686 ----LMKTEIHRMNIRYSQLKRAQESLVLDLEHCVMHREQIF---VNASVKEHLQAKFKQLKNTS 743
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 Frog   796 GDIQAMKAEIHRMQIRHSQLMKQQEKMICDMEAVVSRRETIARRGQGQSEKNKKQLTVSDFRRKL 860

  Fly   744 Q-IQVRLDEVHNRTKLISNEITFLSEKQLIDDINKIERMIYMLRRIQSDLNDIIKEDANIQDRIE 807
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 Frog   861 QDLRKKIKEIQKNTEECTDTIADLEDTQ--------ESLTAAIAEKQHNISTMKQDFSSTAAEIE 917

  Fly   808 EGILAKHANLEQIIRKQMRAK--------AYKRL----NTLKSQQVILRSEL-----TVQQLSQK 855
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 Frog   918 QLQEKKRQNLLQIVSYQTRLKHLQAVKDGKYKPLCSTWQALEAEQHKQESRIHTISTIIHQIQQE 982

  Fly   856 QSELNYDLTEIAKA 869
            ..:...||..|:.|
 Frog   983 YPQFQSDLHSISLA 996

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
l(2)41Ab	NP_001104357.1	CCDC158	<54..>761	CDD:464943	180/744 (24%)
ccdc42.2	XP_031750354.1	SMC_prok_B	<164..870	CDD:274008	179/740 (24%)
		BRE1	645..743	CDD:462547	24/104 (23%)