DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment futsch and Map1a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001096864.1 Gene:futsch / 5740544 FlyBaseID:FBgn0259108 Length:5495 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006234888.1 Gene:Map1a / 25152 RGDID:3042 Length:3014 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3673 Identity:823/3673 - (22%)
Similarity:1348/3673 - (36%) Gaps:1073/3673 - (29%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    71 DAGASSL--PPSEIGGRAPLDTACSDADGGAPSSLAGGIVGPPSPLTGCYLLIVLGEPHSEEHKD 133
            :.|..||  ||::    .|.:..|   :.||      .:......|....||||:|:..:|....
  Rat    20 ELGLQSLGAPPTQ----NPAELLC---EAGA------AVAAARWDLRKYSLLIVIGDIGTESQLR 71

  Fly   134 NILQHLLKGFLSWDVSDCHVDLEEELNT-ITQHAPEGEEARHGERLIQYASENLVTEVLIHPQYN 197
            .:..||.:|.|||::.....||.::|.. ||:|.........|:|.:.:.||.|.|.:|::|..:
  Rat    72 AVRAHLEQGILSWNIDLSSFDLNQQLRLFITRHLAHFSSEVKGQRTLCHQSEILETIILVNPSAD 136

  Fly   198 TLIQCMRNLLSSFTRHRHIIHAGYTFSGNGSWILQDGTFSVADFSEAFQEHDVQRV-------IR 255
            ::...:.:||||.:.|:.:|.:|.|....|..|||.||:|..:|::...:.::.::       |:
  Rat   137 SISSEVHHLLSSPSAHKLLILSGQTLEPEGDLILQSGTYSYQNFAQVLHKPEIAQLLSNRDPEIQ 201

  Fly   256 AYADTITMNIHCADAGLWHTLPEKAFARQCRIRINPVDVLDTSSECINGFIDYLAPMVMPTSLRE 320
            |:     :.:.|...|.|..|...:......:|:||..||.| .:.:..|.:|::..|...|..:
  Rat   202 AF-----LTVSCLGEGDWSHLGLSSSQETLHLRLNPEPVLPT-MDGVAEFSEYVSETVDVPSPFD 260

  Fly   321 LLETSDVVGNIRFTHPTLYVFPGGQGDAALFGINGFNMLVDGGFNRKACFWDFARHLDRLDAVLM 385
            |||.....|.::.:.|..|:||||:||:|||.:||||:|||||.:||:|||...|||||:|:||:
  Rat   261 LLEPPTSGGFLKLSKPCCYIFPGGRGDSALFAVNGFNILVDGGSDRKSCFWKLVRHLDRIDSVLL 325

  Fly   386 TRLNNSNVQGLGAVVSRK---------RDAHVY---------PQIGHFFGNVPDRKGLPSPDGDK 432
            |.:...|:.|:..::.||         :.:..|         |::|..|.||||:..||......
  Rat   326 THIGADNLPGINGLLQRKVAELEEEQSQGSSSYSDWVKNLISPELGVVFFNVPDKLRLPDASRKA 390

  Fly   433 DRDPLLIDLFERGHGIVSDLKALDLKPQCCYR----NQEPVNLYHKVGHGTLDMYVISPARDSKE 493
            .|.      .|.....:..|..|.::.:..||    ..||:.|:||:|.|.|||||::|.:||||
  Rat   391 KRS------IEEACLTLQHLNRLGIQAEPLYRVVSNTIEPLTLFHKMGVGRLDMYVLNPVKDSKE 449

  Fly   494 VKEFLQKWHAGDQRL---FAARDSRDFNFPLQNLVSICALLVWQPANPDDTITRILFPGSTPDFK 555
            ::..:||| ||:.:.   ....:.::....:..|.||.||:||.||||.:.|.|:||||:.|..|
  Rat   450 MQFLMQKW-AGNSKAKTGIVLANGKEAEISVPYLTSITALVVWLPANPTEKIVRVLFPGNAPQNK 513

  Fly   556 IQEGLEKLKHLEFMKHSTCTAKSIA----PA------IQTVTSTRKSLKSAIEATPAPPSASYKT 610
            |.||||||:||:|:::...|.|.:|    ||      |:....:::|||:      ||.:|..|.
  Rat   514 ILEGLEKLRHLDFLRYPVATQKDLAAGAVPANLKPSKIKHRADSKESLKA------APKTAVSKL 572

  Fly   611 TKFSPVASAALAVQHPQQQDNKAKEAAAAAAAAAAAAASAATIARAKADSMDTDAEPEHEADPEP 675
            .|...|.                 |..|..|.:..|...|.|..:||                  
  Rat   573 AKREEVL-----------------EEGAKEARSELAKELAKTEKKAK------------------ 602

  Fly   676 ADTGDEAAPTEQEPEAETEPEPEHEPEAEQDKDVGEEKKVEVLIMKPQQATPAVIAASGKDGVDA 740
                   .|:|:.||   :|........|..:.:..||:   .::|.:         :||..:..
  Rat   603 -------EPSEKPPE---KPSKSERVRGESSEALKAEKR---RLIKDK---------AGKKHLKE 645

  Fly   741 ASADATPTGKLSKASAKGKADKPRAEVKPVVRSRIDTKPPKSMDRKLAKRDEKKSSPTTTPAARA 805
                     |:||  .:.|.||.:.|:|. .|..:..:..:..::|.||:|||:           
  Rat   646 ---------KISK--LEEKKDKEKKEIKK-ERKELKKEEGRKEEKKDAKKDEKR----------- 687

  Fly   806 PVAQNAKPKV--LSRPATKSSPSSTPAKSAKEANNRKVLESKQQAARVQATSTVSRRVTSTASER 868
               ::.||:|  ||:|..|   ..||       ..||.|...:...||                 
  Rat   688 ---KDTKPEVKKLSKPDLK---PFTP-------EVRKTLYKAKAPGRV----------------- 722

  Fly   869 RVQQQAEAKTAATGATQATQRKPISRRPRGVSPSKRAPAPGSPVKQAKPKAADLKKTRLDKGGTT 933
                :.:...||.|      .|.:|..|| ..|:::..||.:.|...:..|              
  Rat   723 ----KVDKGRAARG------EKELSSEPR-TPPAQKGAAPPAAVSGHRELA-------------- 762

  Fly   934 DSSLVSTPSADEATAAKKLQDLTASQELDAEKQRELDDLKEEQEVVREIEAVFSRDEMKRQQHQQ 998
                :|:|           :|||          ::.::||.|:                    :.
  Rat   763 ----LSSP-----------EDLT----------QDFEELKREE--------------------RG 782

  Fly   999 IKAELRE-------MPAEGTGDGE-------NEPDEEEEYLIIEKEEVEQYTE---DSIVEQESS 1046
            :.||.|:       :||:.|..|.       .:|...    ::|.|.||:..|   ||..::.|:
  Rat   783 LLAEQRDTGLGEKPLPADATEQGHPSAAIQVTQPSGP----VLEGEHVEREKEVVPDSPGDKGST 843

  Fly  1047 MTKEEEIQKHQRDSQESEKKRKKSAEEEIEAAIAKVEAAERKARL--EGASARQDESELDVEPEQ 1109
                    ....||....:|.|::.||.          .:|:|.|  |..:|| :|||.:|:.:.
  Rat   844 --------NRGPDSGAEVEKEKETWEER----------KQREAELGPENTAAR-EESEAEVKEDV 889

  Fly  1110 SKIKAEVQDIIAT---AKDIAKSRTEEQLAKPAEEEL-SSPTPEEKLSKKTSDTKDDQIGAPVDV 1170
            .: |||::::..|   .::..:::.|....|..:|.| :||...|.|..:               
  Rat   890 IE-KAELEEMEETHPSDEEGEETKAESFYQKHTQEALKASPKSREALGGR--------------- 938

  Fly  1171 LPVNLQESLPEEKFSATIES-----GATTAPTLPEDERIPLDQIKEDLVIEEKYVKEETKEAEAI 1230
             .:..|...||::.::.:.|     |||...:..:||.||.....|..:.:|: :.:|..|..| 
  Rat   939 -DLGFQGKAPEKETASFLSSLATPAGATEHVSYIQDETIPGYSETEQTISDEE-IHDEPDERPA- 1000

  Fly  1231 VVATVQTLPEAAPLAIDTILASATKDAPKDANAEALGELPDSGERVLPMKMTFEAQQNLLRDVIK 1295
                    |...|        ::|.|.   :..|..|              .|||.|        
  Rat  1001 --------PPRFP--------TSTYDL---SGPEGPG--------------PFEASQ-------- 1024

  Fly  1296 TPDEVADLPVHEEADLGLYEKDSQDAGAKSISHKEESAKEEKETDDEKENKVGEIELGDEPNKVD 1360
                        .||..:....|:..||.                        |.||...||.| 
  Rat  1025 ------------AADSAVPASSSKTYGAP------------------------ETELTYPPNMV- 1052

  Fly  1361 ISHVLLKESVQEVAEKVVVIETTVEKKQEEIVEATTVITQENQEDLMEQVKDKEEHEQKIES--G 1423
                     ...:||             ||.|.:.|.||:.:                |:.|  .
  Rat  1053 ---------AAPLAE-------------EEHVSSATSITECD----------------KLSSFAT 1079

  Fly  1424 IITEKEAKKSASTPEEKET--SDITSD--DELPAQLADPT----------TVPPKSAKDREDTGS 1474
            .:.|.::..|.:.|:.:||  |.:..|  ..:|:...:.|          |:.|.|:.: ||.| 
  Rat  1080 SVAEDQSVASLTAPQTEETGKSSLLLDTVTSIPSSRTEATQGLDYVPSAGTISPTSSLE-EDKG- 1142

  Fly  1475 IESPPTIEEAIEVEVQAKQEAQKPVPAPEEAI-KTEKSPLASKETSRP---------------ES 1523
            .:|||..:.::..|.:.|.|......:.|:|: |.||..:.|::.|..               |.
  Rat  1143 FKSPPCEDFSVTGESEKKGETVGRGLSGEKAVGKEEKYVVTSEKLSGQYAAVFGAPGHTLPPGEP 1207

  Fly  1524 ATGSVKE----DTEQTKSKKSPVPSRPESEAKDKKSPFASGEASRPESVAESVKDEAGKAESRRE 1584
            |.|.|:|    ..:.|....||.||.|.|.|   .:||..          ..|:|::...:.:.:
  Rat  1208 ALGEVEERCLSPDDSTVKMASPPPSGPPSAA---HTPFHQ----------SPVEDKSEPRDFQED 1259

  Fly  1585 SIAKTHKDESSLDKAKEQESRRESLAESIKPESGIDEKSALASKEASRPESVTDKSKEPSRRESI 1649
            |..:|        |.....|:.:|..:::||               ...|..:::.|.|..|...
  Rat  1260 SWGET--------KHSPGVSKEDSEEQTVKP---------------GPEEGTSEEGKGPPTRSPQ 1301

  Fly  1650 AE----SLKAESTKDEKSAPPSK------EASRPGSVVES------VKDETEKSKEPSRRESIA- 1697
            |:    |:....|.......|.:      |....||::.:      |:..||::.||.:.|.:. 
  Rat  1302 AQDTPVSIAGGQTGCTIQLLPEQDKAIVFETGEAGSILGAGTLPGEVRTSTEEATEPQKDEVLRF 1366

  Fly  1698 --ESAKPPIEFREVSRPESVIDGIKDESAKPESRRDSPLASKEASRPESVLESVKDEPIKSTEKS 1760
              :|..|     |.:...||:..:..::.|.|:...||.:.||....:.:...|..|..:|.   
  Rat  1367 TDQSLSP-----EDAESLSVLSVVSPDTTKQEATPRSPCSLKEQQPHKDLWPMVSPEDTQSL--- 1423

  Fly  1761 RRESVAESFKADSTKDEKS-PLTSKDISRPES------------------AVENVMDAVGSAERS 1806
                   ||..:|...|.| .::||.:| |||                  .::...|:...|..|
  Rat  1424 -------SFSEESPSKETSLDISSKQLS-PESLGTLQFGELNLGKEERGPVMKAEDDSCHLAPVS 1480

  Fly  1807 QPE----SVTASRD------------------VSRPESVAE----------SEKDDTDKPESVVE 1839
            .||    :|:.|.|                  |.|..|..|          |:...|..|||:..
  Rat  1481 IPEPHRATVSPSTDETPAGTLPGGSFSHSALSVDRKHSPGEITGPGGHFMTSDSSLTKSPESLSS 1545

  Fly  1840 SVIPASD--VVEIEKGAADKEKGVFVSLEIGKPDSPSEVISRPGPVVESVKPESRRESSTEIVLP 1902
               ||.:  .||.|..|..|||         :|:..||...:.|.::    ||.......:::: 
  Rat  1546 ---PAMEDLAVEWEGKAPGKEK---------EPELKSETRQQKGQIL----PEKVAVVEQDLII- 1593

  Fly  1903 CHAEDS--KEPSRPESKVECLKDESEVLKGS--TRRESVAESDKSSQPFKETSRPESAVGSMKDE 1963
             |.:|.  .|.::|..:    :|::...||.  ..:::.||.||..:|              |::
  Rat  1594 -HQKDGALDEENKPGRQ----QDKTPEQKGRDLDEKDTAAELDKGPEP--------------KEK 1639

  Fly  1964 SMSKEPSRRE----SVKDGAAQSRET-------SRPASVAESAKDGADDLKELSRPESTTQSKEA 2017
            .:.:|...:.    :.||.|::.|:|       :.|...|:..:|..:..|.|...:.|.:.|:.
  Rat  1640 DLDREDQGQRAGPPAEKDKASEQRDTDLQQTQATEPRDRAQERRDSEEKDKSLELRDRTPEEKDR 1704

  Fly  2018 GSIKDEKSPLASEEASRP-------ASVAESVKDEAEKSKEESRRESVAE-KSPLPSKEA---SR 2071
            ..::::::|    |.|.|       |...:...|:.:|.:....:|.|.| |.....||.   .:
  Rat  1705 ILVQEDRAP----EHSIPEPTQTDRAPDRKGTDDKEQKEEASEEKEQVLEQKDWALGKEGETLDQ 1765

  Fly  2072 PASVAESIKDEAEKSKEESRRESVAEKSPLPSKEA---SRPASVAESIKDEAEKSKEESRRESVA 2133
            .|..||...:..::.|.:.::.|..|.....|||.   .:.|..|:|::.:...:.|::|...: 
  Rat  1766 EARTAEQKDETLKEDKTQGQKSSFVEDKTTTSKETVLDQKSAEKADSVEQQDGAALEKTRALGL- 1829

  Fly  2134 EKSPLPSKEASRPASVAESIKDEAEKSKEES--RRESV-AEKSPLPSKEASRPASVAESIKDEAE 2195
            |:||....:|..........:|..:..:|.|  |.|.| .:|.|:|:.|...|.......:|...
  Rat  1830 EESPAEGSKAREQEKKYWKEQDVVQGWRETSPTRGEPVGGQKEPVPAWEGKSPEQEVRYWRDRDI 1894

  Fly  2196 KSKEES--RRESVAEKSPLPSK---EASRPASVAE---SIKDEAEKSKEESRRESVAE------- 2245
            ..::::  |..|...|...|.:   :.:||....|   :..||....:|.:..:....       
  Rat  1895 TLQQDAYWRELSCDRKVWFPHELDGQGARPRYCEERESTFLDEGPDEQEITPLQHTPRSPWTSDF 1959

  Fly  2246 ---KSPLPSKEASRPASVAES---IKDEAEKSKEESRRESVA------------------EKSPL 2286
               :.|||.|.......:|||   :..|.|.....|..|.::                  ::||:
  Rat  1960 KDFQEPLPQKGLEVERWLAESPVGLPPEEEDKLTRSPFEIISPPASPPEMTGQRVPSAPGQESPV 2024

  Fly  2287 PSKEASRPASVAESIKDEAEKSKEETRRESVAEKSP-LPSKEASRPASVAESIKDEAEKSKEESR 2350
            |..|::.|            ...|.|....:||..| :|......||.:                
  Rat  2025 PDTESTAP------------MRNEPTTPSWLAEIPPWVPKDRPLPPAPL---------------- 2061

  Fly  2351 RESAAEKSPLPSKEASRPA----------SVAESVKDEA-------------DKSKEESRRESMA 2392
              |.|...|.|:.|...|.          ||..:|::.|             |..|.|..||  .
  Rat  2062 --SPAPAPPTPAPEPHTPVPFSWGLAEYDSVVAAVQEGAAELEGGPYSPLGKDYRKAEGERE--G 2122

  Fly  2393 ESGKAQSIKGDQSPLKEVSRPESVAESVKDDPVKSKEPSRRE-------------------SVAG 2438
            |.|.........||    ..||: .||:.....:..||.:||                   .:.|
  Rat  2123 EGGAGAPDSSSFSP----KVPEA-GESLATRDTEQTEPEQREPTPYPDERSFQYADIYEQMMLTG 2182

  Fly  2439 SVTADSARDDQSPLESKGASRPESVVDSVKDEAEKQESRRESKTES------------------- 2484
            ...|...|  :.||.:.|...|..   |.|:||....:..|.:|.|                   
  Rat  2183 LGPACPTR--EPPLGASGDWPPHL---STKEEAAGCNTSAEKETSSPASPQNLQSDTPAFSYASL 2242

  Fly  2485 ---VIPPKAKDDKSPKEVLQPVSMTETIREDADQPMKP-SQAESRRESIAESIKASSPRDEKSPL 2545
               .:||:.:.|..|.  ::|     :|...|..|..| |.::.....:..|..:.|| |.::| 
  Rat  2243 AGPAVPPRQEPDPGPN--VEP-----SITPPAVPPRAPISLSKDLSPPLNGSTVSCSP-DRRTP- 2298

  Fly  2546 ASKEASR----PGSVAESIKYDLDKPQIIKDDKSTEHSRRESLEDKSAVTSEKSVSRPLSVASDH 2606
            :.||..|    .|:                :|...|...||..|.:   |...|...|:.:.   
  Rat  2299 SPKETGRGHWDDGT----------------NDSDLEKGAREQPEKE---TRSPSPHHPMPMG--- 2341

  Fly  2607 EAAVAIEDDAKSSISPKDKSRPGFVAETVSSPIEEATMEFSKIEVVEKSSLALSLQGGSGGKLQT 2671
            .:::..|.:|.||:|  ..|..|.|..::..|  .:...||.::....             :|.:
  Rat  2342 HSSLWPETEAYSSLS--SDSHLGSVRPSLDFP--ASAFGFSSLQPAPP-------------QLPS 2389

  Fly  2672 DSSPVDVAEGDFS----HAVASVSTVTPTLTKPAELAQIGAAKTVSSPLDEALRTPSAP-----E 2727
            .:.|.....|..:    .|:|.|.. |||.|:..|..::..|.::.|.|.: |.:||:|     .
  Rat  2390 PAEPRSAPCGSLAFSGDRALALVPG-TPTRTRHDEYLEVTKAPSLDSSLPQ-LPSPSSPGGPLLS 2452

  Fly  2728 HISRADSPAECASEEIASQDKSPQVLKESSR-PAWVAESKDDAAQLKSSVE-------DLR---- 2780
            ::.|..|||  .||..:|:..:|.:...:.| |..:..::..|..|.|..|       ||.    
  Rat  2453 NLPRPASPA--LSEGSSSEATTPVISSVAERFPPGLEAAEQSAEGLGSGKESAAHSLWDLTPLSP 2515

  Fly  2781 SPVASTEISRPASAGETASSPIEEAPKDFAEFEQAEKAVLPLTIELKGNLPTLSSPVDVAHGDFP 2845
            :|.||.::: ||.|...|.:|....|.|..:      ..||...|..|.|....||.....||. 
  Rat  2516 APSASLDLA-PAPAPAPAPAPAPGLPGDLGD------GTLPCRPECTGELTKKPSPFLSPSGDH- 2572

  Fly  2846 QTSTPTSSPTVASVQPAELSKVDIEKTASSPIDEAPKSLIGCPAEER---PESPAESAK-----D 2902
                ..:.|...|:.|...    :..||.....|||.      |.||   ||....|::     .
  Rat  2573 ----EANGPGETSLNPPGF----VTATAEKEEAEAPH------AWERGSWPEGAERSSRPDTLLS 2623

  Fly  2903 AAESVEKSKDASRPP----SVVE------STKADSTKGDISPS------PESVLEGPKDDVEKSK 2951
            :.:.:...|.:..||    |.||      :|......|::|||      |.|.     ||.:.|.
  Rat  2624 SEQPLRPGKSSGGPPCSLSSEVEAGPQGCATDPRPHCGELSPSFLNPPLPPST-----DDSDLST 2683

  Fly  2952 ESSRPPSVSASITG-DSTKDVSRPASVVE--SVKDEHDKAESRRESIAKVESVIDEAGKSDSKSS 3013
            |.:|       :.| ...:.|.||.:...  .:.||.....:                 |||.||
  Rat  2684 EEAR-------LAGKGGRRRVGRPGATGGPCPMADETPPTSA-----------------SDSGSS 2724

  Fly  3014 SQDS----QKDEKSTLASKEASRRESVVESSKDDAEKSESRPESVIASGEPVPRESKSPLDSKDT 3074
            ..||    :.:|..::.:      |:.::|.:|.......:...|..:..|.|.....|....| 
  Rat  2725 QSDSDVPPETEECPSITA------EAALDSDEDGDFLPVDKAGGVSGTHHPRPGHDPPPTPLPD- 2782

  Fly  3075 SRPGSMVESVTAEDEK--SEQQSRRESVAESVKADTKKDGKSQEASRPSSVDELLKDDDEKQESR 3137
            .||......|...|.:  |.:..|.|.:.|..:...:..|:::.||                .:|
  Rat  2783 PRPSPPRPDVCMADPEGLSSESGRVERLREKGRPGRRAPGRAKPAS----------------PAR 2831

  Fly  3138 RQSITGSHKAMSTMGDESPMDKADKSKEPSRPESVAESIKHENTKDEESPLGSRRDSVAESIKSD 3202
            |..|.|  |...|.| :.|:|:.  |:...||.|....:.....||..||:..   .:...:|:.
  Rat  2832 RLDIRG--KRSPTPG-KGPVDRT--SRTVPRPRSTPSQVTSAEEKDGHSPMSK---GLVNGLKAG 2888

  Fly  3203 IT----KGEKSPLPSKEVSR-PESVVGSIKDEKAESRRESVAESVKPESSKDATSAPPSKEHSRP 3262
            .|    ||...|....:::. |....|...|:....|   |..|....|..|..:..||:     
  Rat  2889 STALGSKGGSGPPVYVDLAYIPNHCSGKTADQDFFRR---VRASYYVVSGNDPANGEPSR----- 2945

  Fly  3263 ESVLGSLKDEGDKTTSRRVSVADSIKDEKSLLVSQEASRPESEAESLKDAAAPSQET-------- 3319
                               :|.|::.:.|:           ...|:|:....|:.:|        
  Rat  2946 -------------------AVLDALLEGKA-----------QWGENLQVTLIPTHDTEVTREWYQ 2980

  Fly  3320 ---SRPESVTESVKDGKSPVASKEASRPASVAE 3349
               .:.:.:...|....|.|..::.|.||...|
  Rat  2981 QTHEQQQQLNVLVLASSSTVVMQDESFPACKIE 3013

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
futschNP_001096864.1 PTZ00121 <580..1228 CDD:173412 140/687 (20%)
PTZ00121 <1464..2163 CDD:173412 173/819 (21%)
PTZ00121 <1890..2644 CDD:173412 181/894 (20%)
LGT <2780..2945 CDD:469786 46/192 (24%)
PTZ00121 <2878..3754 CDD:173412 106/521 (20%)
PTZ00121 <3352..4195 CDD:173412
Map1aXP_006234888.1 ComEC 284..>387 CDD:441904 43/102 (42%)
PTZ00121 <539..998 CDD:173412 138/685 (20%)
PTZ00121 <1608..>1845 CDD:173412 53/259 (20%)
PHA03307 1981..>2350 CDD:223039 86/441 (20%)
PHA03247 <2224..2683 CDD:223021 120/537 (22%)
PHA03247 <2534..2862 CDD:223021 90/405 (22%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Return to query results.
Submit another query.