DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SLO2 and SLO2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001097259.2 Gene:SLO2 / 5740325 FlyBaseID:FBgn0261698 Length:1878 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_061504691.1 Gene:SLO2 / 5667033 VectorBaseID:AGAMI1_005477 Length:1656 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:1946 Identity:1267/1946 - (65%)
Similarity:1377/1946 - (70%) Gaps:391/1946 - (20%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    27 SVASPSL----NHRLQRNVNFNEDLN-DLAGYPPQQLPTAPAVR-RFSKSIFQRPRSMSVWSDIS 85
            ||:|.||    .|.|||     |:.| .......||......|| |....:|   |.:|..|.||
Mosquito     8 SVSSMSLFFFRLHNLQR-----EEANKKRKKQQQQQQQQQQRVRQRRGAKVF---RGVSCNSGIS 64

  Fly    86 RSSM---------------RLDE------RVRVEYYVNENTFKERLQLYFIKNQRSSLRIRIADL 129
            ..::               .|||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
Mosquito    65 HLTLGPSRLFEKTPMSPSDSLDEIALQIPRVRVEYYVNENTFKERLQLYFIKNQRSSLRIRIANL 129

  Fly   130 FLKLLSCVLYIIRVILDKNPTFITCYGCEVGNKTEFIISAKLTEEEFQENPIINWDAILWVNRPT 194
            |.|||:|:|||.||:.|.||||.|||||:|||||||:.||..|||.|||:||||||||||||||.
Mosquito   130 FFKLLTCILYIFRVVTDLNPTFATCYGCKVGNKTEFLWSATRTEEAFQEDPIINWDAILWVNRPN 194

  Fly   195 VLWVLQLLLAMVSLTQSLVLTYLGYKGNIWQQILSFHFILELVTTIPFALTIVHPPLRNLFIPIF 259
            .||.:||:||::|||::|::.||||||||||||||||||||||||||||:||:.||.||||||:|
Mosquito   195 ELWAVQLVLALISLTEALLMAYLGYKGNIWQQILSFHFILELVTTIPFAVTILWPPFRNLFIPVF 259

  Fly   260 LNCWLAKRSLENMFNDLHRAMQKSQSALSQQLTILSATLLCLVFTSVCGIQHFQRAGHRHLNLFQ 324
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito   260 LNCWLAKRSLENMFNDLHRAMQKSQSALSQQLTILSATLLCLVFTSVCGIQHFQRAGHRHLNLFQ 324

  Fly   325 STYYVVVTFSTVGYGDFVPDIWPSQLYMVIMICVALIVLPTQFEQLAFTWMERQKLGGSYSSHRA 389
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito   325 STYYVVVTFSTVGYGDFVPDIWPSQLFMVIMICVALIVLPTQFEQLAFTWMERQKLGGSYSSHRA 389

  Fly   390 QSEKHVVVCSTTLHADTIMDFLNEFYAHPLLQDFYVVLLSPMELDTTMRMILQVPIWAQRVIYIQ 454
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito   390 QSEKHVVVCSTTLHADTIMDFLNEFYAHPLLQDYYVVLLSPMELDTTMRMILQVPIWAQRVIYIQ 454

  Fly   455 GSCLKDGDLARARMNEAEACFILAARNYADKTAADEHTILRSWAVKDFAPNVPQYVQIFRPEHKL 519
            ||||||||||||||.|||||||||||:||||||||||.|||||||||||||:||||||||||:||
Mosquito   455 GSCLKDGDLARARMAEAEACFILAARSYADKTAADEHAILRSWAVKDFAPNIPQYVQIFRPENKL 519

  Fly   520 HVKFAEHVVCEDEFKYALLANNCTCPGASTLVTLLLHTSRGQEGQQSPEEWHRLYGKCSGNEIYH 584
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Mosquito   520 HVKFAEHVVCEDEFKYALLANNCTCPGASTLVTLLLHTSRGQEGQQSAEEWHRLYGKCSGNEIYH 584

  Fly   585 IVLGDSRFFGEYEGKSFTYASFHSHRKYGVALVGVRPAELPEFYEETILLNPGPRHIMKKDDTCY 649
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito   585 IVLGDSRFFGEYEGKSFTYASFHSHRKYGVALVGVRPAELPEFYEETILLNPGPRHIMKKDDTCY 649

  Fly   650 YMSITKEENSAFVVNQNQTSDPTAAAKEGSGTGGGGGASSSASHHHTAATANPTTTITTTVQATT 714
            ||||||||||||||||||...|....||                    .|||....         
Mosquito   650 YMSITKEENSAFVVNQNQNQSPDQPPKE--------------------VTANNNNN--------- 685

  Fly   715 TTISTTFTSSTLLSASTTTATINATSTAA---AAPP--PVPSVCVRVPHSPSYDSGGGTTGTTHL 774
                           :.....||..:..|   :.||  ||||||||||||||.:|....:     
Mosquito   686 ---------------NNNNHNINNNTNGAGGGSVPPMAPVPSVCVRVPHSPSLNSANSDS----- 730

  Fly   775 QPYPYPQSYPQPHPPMQTP--DSGEFASLFVPS----------ENP--------TAVIISDSRQN 819
                       |..|..|.  |..:|.:|.||:          .||        :|:.||||:.|
Mosquito   731 -----------PGSPRATSKMDGHDFTTLAVPTTYTESVTTGGSNPAPGTTALTSAITISDSKSN 784

  Fly   820 LKDTTVTQTAATI-TTTTLPPPPQTMGSPSMAGGSGGCGGGGLGLGSAHSMGTSLSITPATLTTT 883
            ||::..|..:.|. ||||......|:|.|::                                ::
Mosquito   785 LKESAATPFSTTAHTTTTTTTTQSTLGPPTI--------------------------------SS 817

  Fly   884 GNHLDVPFANNPNLLSPDVLNQRRGSRRPSILPVPDMFTSSSFSIAGND--DGEEGDESDDEIDD 946
            .|||::|..|||||||||:||||||||||||||||||||||||||:|.|  |||: :||||||||
Mosquito   818 ANHLEIPSGNNPNLLSPDILNQRRGSRRPSILPVPDMFTSSSFSISGEDGIDGED-NESDDEIDD 881

  Fly   947 EMPWRSPSEKIACLGGHFPQS--RTYSLIMSSSEDSYQRGCSFCSATASASAAAVAVAVAAAPAP 1009
            ::||||||||||  ||....|  :|.||::|||                                
Mosquito   882 DVPWRSPSEKIA--GGSADLSLLQTVSLVLSSS-------------------------------- 912

  Fly  1010 APAPAYPSDSAGESGTNADSAAMPSEEYLPQLRRRVMKKSYSCDSECRSVPGMGMGMAMGVGLGG 1074
                       |||                                                   
Mosquito   913 -----------GES--------------------------------------------------- 915

  Fly  1075 GTLARLAARRRQLQRCSSCSCSTATTTTTPAVAATTAMAAGSGATAFTSSSSVETRRPVRPVWVY 1139
                          :|.|.:..|..:|.||                              |.|..
Mosquito   916 --------------KCCSSTSDTKDSTHTP------------------------------PAWHT 936

  Fly  1140 DYSCIVKGFPPVSPFIGVSPTLCYLLKEKKPLCCLQLAQVCEHCSYRNAKEYQWQNKTIILAADY 1204
            |.|.|||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito   937 DCSRIVKGFPPVSPFIGVSPTLCFLLKEKKPLCCLQLAQVCEHCSYRNAKEYQWQNKTIILAADY 1001

  Fly  1205 ASNGIYNFIIPLRAHFRSKTSLNPIILLLERRPDVAFLDALSYFPLVYWMLGSIDCLDDLLRAGI 1269
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:||||||||||||||||||||||||
Mosquito  1002 ASNGIYNFIIPLRAHFRSKTSLNPIILLLERRPDIAFLDAISYFPLVYWMLGSIDCLDDLLRAGI 1066

  Fly  1270 TLAESVVVVNKELSNSAEEDSLSDCNTIVAVQNMFKFFPSIKSITELSQSSNMRFMQFRAHDKYA 1334
            ||||:|||||||||||||||:|:|||||||||.||||||||:|||||||||||||||||||||||
Mosquito  1067 TLAENVVVVNKELSNSAEEDTLADCNTIVAVQTMFKFFPSIRSITELSQSSNMRFMQFRAHDKYA 1131

  Fly  1335 LHLSKMEKREKERGSHISYMFRLPFAAGAVFSASMLDTLLYQAFVKDYVITFVRLLLGIDQAPGS 1399
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito  1132 LHLSKMEKREKERGSHISYMFRLPFAAGNVFSASMLDTLLYQAFVKDYVITFVRLLLGIDQAPGS 1196

  Fly  1400 GFLTSMRITKDDMWIRTYGRLYQKLCSTTCEIPIGIYRTQDTSNADTSHVSNSPV-ERWGPFSAF 1463
            ||||||:|:||||||||||||||||||||||||||||||||||:||.|||||||| |:|.||.:|
Mosquito  1197 GFLTSMKISKDDMWIRTYGRLYQKLCSTTCEIPIGIYRTQDTSSADASHVSNSPVAEKWRPFGSF 1261

  Fly  1464 S--RHCVRLRPS--------------YDEETGTPDSTKDSTEM------------LRGVTYRPPG 1500
            .  :||||||||              |:||..|..:|..||..            |||||||||.
Mosquito  1262 GTFKHCVRLRPSRGLCHASNATNLSKYEEEVVTTTATASSTSATGVPIKGVAEANLRGVTYRPPP 1326

  Fly  1501 SATGGASSFRPQPQRQRSVNCLGGCSERKGSSYSINLADEARDNHAQQIERAEIANLVRSRMESL 1565
            :..            ::|.:|||||:.|||||||||:||||||||.|||||||||||||||||||
Mosquito  1327 ATI------------RKSSSCLGGCTARKGSSYSINMADEARDNHVQQIERAEIANLVRSRMESL 1379

  Fly  1566 NLPTIDYDDVSEKRNHLSYVIINPSCDLKLEEGDLIYLVRPSPFSAQKTFERHNSRRKSNISFCS 1630
            |||:||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
Mosquito  1380 NLPSIDYDDVSEKRNHLSYVIINPSCDLKLEEGDIIYLVRPSPFSAQKTFERHNSRRKSNISFCS 1444

  Fly  1631 NINLGATCGPQMPQMNMNMANTAVGAGSRRGSGIAGLNPMQMQSVQTLAGYGSSSQRCSPPMQQI 1695
            ||||                 .|..||||||||| |||  .:...|.::||.:..   :||:...
Mosquito  1445 NINL-----------------AAAAAGSRRGSGI-GLN--TIGGPQPMSGYVTPR---APPLVTT 1486

  Fly  1696 KSNSLSLPDSPTVVGNQRGRSNSLRIDNDILLRRSSSLRQGLPSVGVSHGRRKSSLEEIGISHFT 1760
            |||||||||||..:|..||||||||||:|||||||:|||||||::|.: |||||||||||||||.
Mosquito  1487 KSNSLSLPDSPNAMGQMRGRSNSLRIDSDILLRRSNSLRQGLPNIGAA-GRRKSSLEEIGISHFA 1550

  Fly  1761 TLMQATNHSNPIKISLNGSIGMENQISLQVTPPEEPTPMLGVPCMLGGGGGGGINP-------SG 1818
            ||||||||||||||:||||||:|      |||||||.|::||||:     .|||||       ||
Mosquito  1551 TLMQATNHSNPIKIALNGSIGLE------VTPPEEPLPIIGVPCL-----SGGINPSTLGGPGSG 1604

  Fly  1819 AGSST-GGMLGGGSSLAINTADLGPGPSTSSGASGSLQAQDSLGQQSSQVSSPQHLQGTIV 1878
            .|.|| ||...|||||.::||    ..|.:|.::.::|.|:...||     .||||.||||
Mosquito  1605 LGGSTLGGSTLGGSSLGLSTA----VESNNSASTPNIQMQNESSQQ-----QPQHLHGTIV 1656

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SLO2NP_001097259.2 Ion_trans_2 <319..363 CDD:462301 42/43 (98%)
BK_channel_a 525..619 CDD:460947 92/93 (99%)
SLO2XP_061504691.1 None

Return to query results.
Submit another query.