DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NUP107 and Nup107

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_065134.1 Gene:NUP107 / 57122 HGNCID:29914 Length:925 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_598771.1 Gene:Nup107 / 103468 MGIID:2143854 Length:926 Species:Mus musculus


Alignment Length:925 Identity:845/925 - (91%)
Similarity:885/925 - (95%) Gaps:1/925 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MDRSGFGEISSPVIREAEVTRTARKQSAQKRVLLQASQDENFGNTTPRNQVIPRTPSSFRQPF-T 64
            |||||||.:||||||:|||||||||.||.||||:||:|::|||..|||:|:|||||||||||| |
Mouse     1 MDRSGFGGMSSPVIRDAEVTRTARKHSAHKRVLIQANQEDNFGTATPRSQIIPRTPSSFRQPFVT 65

Human    65 PTSRSLLRQPDISCILGTGGKSPRLTQSSGFFGNLSMVTNLDDSNWAAAFSSQRSGLFTNTEPHS 129
            |:||||||.||||.||||.|:|||.|||||:.||||||||||||||||||||||.||:||||.||
Mouse    66 PSSRSLLRHPDISYILGTEGRSPRHTQSSGYLGNLSMVTNLDDSNWAAAFSSQRLGLYTNTEHHS 130

Human   130 ITEDVTISAVMLREDDPGEAASMSMFSDFLQSFLKHSSSTVFDLVEEYENICGSQVNILSKIVSR 194
            :||||.:|.|||||||||||||||||||||.|||||||:||||||||||||||||||||||||||
Mouse   131 MTEDVNLSTVMLREDDPGEAASMSMFSDFLHSFLKHSSTTVFDLVEEYENICGSQVNILSKIVSR 195

Human   195 ATPGLQKFSKTASMLWLLQQEMVTWRLLASLYRDRIQSALEEESVFAVTAVNASEKTVVEALFQR 259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||::||:..:|||||.|||.||||
Mouse   196 ATPGLQKFSKTASMLWLLQQEMVTWRLLASLYRDRIQSSLEEENMFAIAGINASEKMVVETLFQR 260

Human   260 DSLVRQSQLVVDWLESIAKDEIGEFSDNIEFYAKSVYWENTLHTLKQRQLTSYVGSVRPLVTELD 324
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||.|::||.||||||||
Mouse   261 DSLVRQSQLVVDWLESIAKDEIGEFSDNIEFYAKSVYWENTLHSLKQRQLLSHMGSTRPLVTELD 325

Human   325 PDAPIRQKMPLDDLDREDEVRLLKYLFTLIRAGMTEEAQRLCKRCGQAWRAATLEGWKLYHDPNV 389
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   326 PDAPIRQKLPLDDLDREDEVRLLKYLFTLIRAGMTEEAQRLCKRCGQAWRAATLEGWKLYHDPNV 390

Human   390 NGGTELEPVEGNPYRRIWKISCWRMAEDELFNRYERAIYAALSGNLKQLLPVCDTWEDTVWAYFR 454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   391 NGGTELEPVEGNPYRRIWKISCWRMAEDELFNKYERAIYAALSGNLKQLLPVCDTWEDTVWAYFR 455

Human   455 VMVDSLVEQEIQTSVATLDETEELPREYLGANWTLEKVFEELQATDKKRVLEENQEHYHIVQKFL 519
            |||||||||||:|||.|.|::|||||||:.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   456 VMVDSLVEQEIRTSVMTQDDSEELPREYMEANWTLEKVFEELQATDKKRVLEENQEHYHIVQKFL 520

Human   520 ILGDIDGLMDEFSKWLSKSRNNLPGHLLRFMTHLILFFRTLGLQTKEEVSIEVLKTYIQLLIREK 584
            ||||:||||||||||||||.::|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||
Mouse   521 ILGDVDGLMDEFSKWLSKSGSSLPGHLLRFMTHLILFLRTLGLQTKEEVSIEVLKTYIQLLISEK 585

Human   585 HTNLIAFYTCHLPQDLAVAQYALFLESVTEFEQRHHCLELAKEADLDVATITKTVVENIRKKDNG 649
            ||:|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Mouse   586 HTSLIAFYTCHLPQDLAVAQYALFLEGVTEFEQRHQCLELAKEADLDVATITKTVVENICKKDNG 650

Human   650 EFSHHDLAPALDTGTTEEDRLKIDVIDWLVFDPAQRAEALKQGNAIMRKFLASKKHEAAKEVFVK 714
            |||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||.||||||||||||
Mouse   651 EFSHHDLAPSLDTGTTEEDRLKIDVIDWLVFDPAQRAEALRQGNAIMRKFLALKKHEAAKEVFVK 715

Human   715 IPQDSIAEIYNQCEEQGMESPLPAEDDNAIREHLCIRAYLEAHETFNEWFKHMNSVPQKPALIPQ 779
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|:.|
Mouse   716 IPQDSIAEIYNQWEEQGMESPLPAEDDNAIREHLCIRAYLEAHETFNEWFKHMNSAPQKPTLLSQ 780

Human   780 PTFTEKVAHEHKEKKYEMDFGIWKGHLDALTADVKEKMYNVLLFVDGGWMVDVREDAKEDHERTH 844
            .|||||||:||:|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||::|.||||
Mouse   781 ATFTEKVAYEHREKKYEMDHNIWKGHLDALTADVKEKMYNVLLFVDGGWMVDVREDAEDDPERTH 845

Human   845 QMVLLRKLCLPMLCFLLHTILHSTGQYQECLQLADMVSSERHKLYLVFSKEELRKLLQKLRESSL 909
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   846 QMVLLRKLCLPMLCFLLHTILHSTGQYQECLQLADMVSSERHKLYLVFSKEELRKLLQKLRESSL 910

Human   910 MLLDQGLDPLGYEIQ 924
            |||||||||||||||
Mouse   911 MLLDQGLDPLGYEIQ 925

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NUP107NP_065134.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 20..66 35/46 (76%)
Nup84_Nup100 209..908 CDD:461184 649/698 (93%)
Nup107NP_598771.1 Nup84_Nup100 210..909 CDD:461184 649/698 (93%)

Return to query results.
Submit another query.