DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TRPC7 and Trpc7

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_065122.1 Gene:TRPC7 / 57113 HGNCID:20754 Length:862 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017455952.1 Gene:Trpc7 / 282822 RGDID:628820 Length:904 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:862 Identity:794/862 - (92%)
Similarity:802/862 - (93%) Gaps:55/862 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MLRNSTFKNMQRRHTTLREKGRRQAIRGPAYMFNEKGTSLTPEEERFLDSAEYGNIPVVRKMLEE 65
            ||.::||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    98 MLGSNTFKNMQRRHTTLREKGRRQAIRGPAYMFNEKGTSLTPEEERFLDSAEYGNIPVVRKMLEE 162

Human    66 SKTLNFNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARVGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPA 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
  Rat   163 SKTLNFNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARVGDALLLAISKGYVRIVEAILSHPA 227

Human   131 FAQGQRLTLSPLEQELRDDDFYAYDEDGTRFSHDITPIILAAHCQEYEIVHILLLKGARIERPHD 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   228 FAQGQRLTLSPLEQELRDDDFYAYDEDGTRFSHDITPIILAAHCQEYEIVHILLLKGARIERPHD 292

Human   196 YFCKCNECTEKQRKDSFSHSRSRMNAYKGLASAAYLSLSSEDPVLTALELSNELARLANIETEFK 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   293 YFCKCNECTEKQRKDSFSHSRSRMNAYKGLASAAYLSLSSEDPVLTALELSNELARLANIETEFK 357

Human   261 NDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDTEEVEAILNGDVNFQVWSDHHRPSLSRIKLAIKYEVKKFVAH 325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||     
  Rat   358 NDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDTEEVEAILNGDVNLQVWSDHHRPSLSRIKLAIKYEVK----- 417

Human   326 PNCQQQLLTMWYENLSGLRQQSIAVKFLAVFGVSIGLPFLAIAYWIAPCSKLGRTLRSPFMKFVA 390
                                                              |||||||||||||||
  Rat   418 --------------------------------------------------KLGRTLRSPFMKFVA 432

Human   391 HAVSFTIFLGLLVVNASDRFEGVKTLPNETFTDYPKQIFRVKTTQFSWTEMLIMKWVLGMIWSEC 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   433 HAVSFTIFLGLLVVNASDRFEGVKTLPNETFTDYPKQIFRVKTTQFSWTEMLIMKWVLGMIWSEC 497

Human   456 KEIWEEGPREYVLHLWNLLDFGMLSIFVASFTARFMAFLKATEAQLYVDQHVQDDTLHNVSLPPE 520
            |||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||:||||||||:|||.||||||||||
  Rat   498 KEIWEEGPREYVLHLWNLLDFGMLSVFVASFTARFMAFLKASEAQLYVDQYVQDVTLHNVSLPPE 562

Human   521 VAYFTYARDKWWPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVI 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   563 VAYFTYARDKWWPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVI 627

Human   586 FIMVFVAFMIGMFNLYSYYRGAKYNPAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVISVVLKYDHKFIENIGY 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   628 FIMVFVAFMIGMFNLYSYYRGAKYNPAFTTVEESFKTLFWSIFGLSEVISVVLKYDHKFIENIGY 692

Human   651 VLYGVYNVTMVVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFARAKLWLSYFDEGRTLPAPFNLVPSP 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   693 VLYGVYNVTMVVVLLNMLIAMINNSYQEIEEDADVEWKFARAKLWLSYFDEGRTLPAPFNLVPSP 757

Human   716 KSFYYLIMRIKMCLIKLCKSKAKSCENDLEMGMLNSKFKKTRYQAGMRNSENLTANNTLSKPTRY 780
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||:|||||||||||||||||:|.||||||
  Rat   758 KSFYYLIMRIKMCLIKLCKSKAKRCENDLEMGMLNSKFRKTRYQAGMRNSENLTANSTFSKPTRY 822

Human   781 QKIMKRLIKRYVLKAQVDRENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQATGELADLIQQLSEKF 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   823 QKIMKRLIKRYVLKAQVDRENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQATGELADLIQQLSEKF 887

Human   846 GKNLNKDHLRVNKGKDI 862
            |||||||||||||||||
  Rat   888 GKNLNKDHLRVNKGKDI 904

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TRPC7NP_065122.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..21 16/19 (84%)
trp 27..822 CDD:273311 729/794 (92%)
ANK 1 42..71 28/28 (100%)
ANK repeat 77..108 CDD:293786 30/30 (100%)
ANK 2 77..106 28/28 (100%)
ANK 3 108..134 24/25 (96%)
ANK repeat 109..155 CDD:293786 44/45 (98%)
ANK repeat 157..192 CDD:293786 34/34 (100%)
ANK 4 163..192 28/28 (100%)
Trpc7XP_017455952.1 trp 124..864 CDD:273311 729/794 (92%)
ANK repeat 174..205 CDD:293786 30/30 (100%)
ANK repeat 206..252 CDD:293786 44/45 (98%)
ANK repeat 254..289 CDD:293786 34/34 (100%)

Return to query results.
Submit another query.