DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment UBQLN4 and Ubqln4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_064516.2 Gene:UBQLN4 / 56893 HGNCID:1237 Length:601 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001101158.1 Gene:Ubqln4 / 310633 RGDID:1308273 Length:595 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:601 Identity:551/601 - (91%)
Similarity:568/601 - (94%) Gaps:6/601 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAEPSGAETRPPIRVTVKTPKDKEEIVICDRASVKEFKEEISRRFKAQQDQLVLIFAGKILKDGD 65
            |||||||||||.||||||||||||||:|||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAEPSGAETRPQIRVTVKTPKDKEEILICDQASVKEFKEEISRRFKAQQDQLVLIFAGKILKDGD 65

Human    66 TLNQHGIKDGLTVHLVIKTPQKAQDPAAATASSPSTPDPASAPSTTPASPATPAQPSTSGSASSD 130
            ||||||||||||||||||||||||||...|||||||||.||||||||||||.|.||.:||:.:||
  Rat    66 TLNQHGIKDGLTVHLVIKTPQKAQDPVTTTASSPSTPDSASAPSTTPASPAAPVQPCSSGNTTSD 130

Human   131 AGSGSRRSSGGGPSPGAGEGSPSATASILSGFGGILGLGSLGLGSANFMELQQQMQRQLMSNPEM 195
            |      ||||||||.|.||..:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 A------SSGGGPSPVAAEGPSNATASILSGFGGILGLGSLGLGSANFMELQQQMQRQLMSNPEM 189

Human   196 LSQIMENPLVQDMMSNPDLMRHMIMANPQMQQLMERNPEISHMLNNPELMRQTMELARNPAMMQE 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   190 LSQIMENPLVQDMMSNPDLMRHMIMANPQMQQLMERNPEISHMLNNPELMRQTMELARNPAMMQE 254

Human   261 MMRNQDRALSNLESIPGGYNALRRMYTDIQEPMFSAAREQFGNNPFSSLAGNSDSSSSQPLRTEN 325
            ||||||||||||||:|||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||:||||||||||
  Rat   255 MMRNQDRALSNLESVPGGYNALRRMYTDIQEPMFTAAREQFGNNPFSSLAGNSDNSSSQPLRTEN 319

Human   326 REPLPNPWSPSPPTSQAPGSGGEGTGGSGTSQVHPTVSNPFGINAASLGSGMFNSPEMQALLQQI 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   320 REPLPNPWSPSPPTSQAPGSGGEGTGGSGTSQVHPTVSNPFGINAASLGSGMFNSPEMQALLQQI 384

Human   391 SENPQLMQNVISAPYMRSMMQTLAQNPDFAAQMMVNVPLFAGNPQLQEQLRLQLPVFLQQMQNPE 455
            |||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   385 SENPQLMQNVISAPYMRTMMQTLAQNPDFAAQMMVNVPLFAGNPQLQEQLRLQLPVFLQQMQNPE 449

Human   456 SLSILTNPRAMQALLQIQQGLQTLQTEAPGLVPSLGSFGISRTPAPSAGSNAGSTPEAPTSSPAT 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||..|.||||:||..||||:||.|
  Rat   450 SLSILTNPRAMQALLQIQQGLQTLQTEAPGLVPSLGSFGTPRTSVPLAGSNSGSAAEAPTASPGT 514

Human   521 PATSSPTGASSAQQQLMQQMIQLLAGSGNSQVQTPEVRFQQQLEQLNSMGFINREANLQALIATG 585
            |||:.|:..|:.||||||||||||:|||||||..|||||||||||||||||:|||||||||||||
  Rat   515 PATTPPSAGSNTQQQLMQQMIQLLSGSGNSQVPVPEVRFQQQLEQLNSMGFVNREANLQALIATG 579

Human   586 GDINAAIERLLGSQLS 601
            ||||||||||||||||
  Rat   580 GDINAAIERLLGSQLS 595

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
UBQLN4NP_064516.2 Ubl_PLICs 11..83 CDD:340506 68/71 (96%)
rad23 13..>291 CDD:273167 252/277 (91%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 87..155 45/67 (67%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 301..366 63/64 (98%)
STI1 393..>424 CDD:128966 29/30 (97%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 490..533 26/42 (62%)
UBA_PLICs 558..597 CDD:270582 37/38 (97%)
Ubqln4NP_001101158.1 Ubl_PLICs 11..83 CDD:340506 68/71 (96%)
PRK10856 <84..>151 CDD:236776 50/72 (69%)
STI1 186..234 CDD:450205 47/47 (100%)
STI1 216..260 CDD:450205 43/43 (100%)
STI1 <371..407 CDD:450205 34/35 (97%)
UBA_PLICs 552..591 CDD:270582 37/38 (97%)

Return to query results.
Submit another query.