Protein Alignment VPS35 and vps35

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_060676.2
• Gene: VPS35 / 55737
• HGNCID: 13487
• Length: 796
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: XP_012816642.1
• Gene: vps35 / 549980
• XenbaseID: XB-GENE-941152
• Length: 796
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 796
• Identity: 756/796 - (94%)
• Similarity: 779/796 - (97%)
• Gaps: 0/796 - (0%)

Human     1 MPTTQQSPQDEQEKLLDEAIQAVKVQSFQMKRCLDKNKLMDALKHASNMLGELRTSMLSPKSYYE 65
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog     1 MPTTQQSPQDEQEKLLDEAVQAVKVQSFQMKRCLDKNKLMDALKHASNMLGELRTSMLSPKSYYE 65

Human    66 LYMAISDELHYLEVYLTDEFAKGRKVADLYELVQYAGNIIPRLYLLITVGVVYVKSFPQSRKDIL 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
 Frog    66 LYMAISDELHYLEVYLTDEFAKGRKVADLYELVQYAGNIIPRLYLLITVGVVYVKSFSQSRKDIL 130

Human   131 KDLVEMCRGVQHPLRGLFLRNYLLQCTRNILPDEGEPTDEETTGDISDSMDFVLLNFAEMNKLWV 195
            ||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.|:||.|||||||||||||||||||||||
 Frog   131 KDMVEMCRGVQHPLRGLFLRNYLLQCTRNILPDEGEQTNEEVTGDISDSMDFVLLNFAEMNKLWV 195

Human   196 RMQHQGHSRDREKRERERQELRILVGTNLVRLSQLEGVNVERYKQIVLTGILEQVVNCRDALAQE 260
            ||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
 Frog   196 RMQHQGHSRDKEKRERERQELRILVGTNLVRLSQLEGVNVERYKQIVLPGILEQVVNCRDALAQE 260

Human   261 YLMECIIQVFPDEFHLQTLNPFLRACAELHQNVNVKNIIIALIDRLALFAHREDGPGIPADIKLF 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   261 YLMECIIQVFPDEFHLQTLNPFLRACAELHQNVNVKNIIIALIDRLALFAHREDGPGIPADIKLF 325

Human   326 DIFSQQVATVIQSRQDMPSEDVVSLQVSLINLAMKCYPDRVDYVDKVLETTVEIFNKLNLEHIAT 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   326 DIFSQQVATVIQSRQDMPSEDVVSLQVSLINLAMKCYPDRVDYVDKVLETTVEIFNKLNLEHIAT 390

Human   391 SSAVSKELTRLLKIPVDTYNNILTVLKLKHFHPLFEYFDYESRKSMSCYVLSNVLDYNTEIVSQD 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:|||||.||:
 Frog   391 SSAVSKELTRLLKIPVDTYNNILTVLKLKHFHPLFEYFDYESRKSMSCYVLSNALEYNTEIGSQE 455

Human   456 QVDSIMNLVSTLIQDQPDQPVEDPDPEDFADEQSLVGRFIHLLRSEDPDQQYLILNTARKHFGAG 520
            |||:||||||||||||||||.|:||||||||||.|||||||||||:|||||||||||||||||||
 Frog   456 QVDAIMNLVSTLIQDQPDQPAEEPDPEDFADEQGLVGRFIHLLRSDDPDQQYLILNTARKHFGAG 520

Human   521 GNQRIRFTLPPLVFAAYQLAFRYKENSKVDDKWEKKCQKIFSFAHQTISALIKAELAELPLRLFL 585
            |||||||||||||||||:||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   521 GNQRIRFTLPPLVFAAYKLAFRYKENAKVDDKWEKKCQKIFSFAHQTISALIKAELAELPLRLFL 585

Human   586 QGALAAGEIGFENHETVAYEFMSQAFSLYEDEISDSKAQLAAITLIIGTFERMKCFSEENHEPLR 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||
 Frog   586 QGALAAGEIGFENHETVAYEFMSQAFSLYEDEISDSKAQLAAITLIIGTFEKMKCFSEENHEPLR 650

Human   651 TQCALAASKLLKKPDQGRAVSTCAHLFWSGRNTDKNGEELHGGKRVMECLKKALKIANQCMDPSL 715
            ||.|||||||||||||.||||..||||||||||||||||:|.|||||||||||||||||||||||
 Frog   651 TQSALAASKLLKKPDQCRAVSISAHLFWSGRNTDKNGEEIHSGKRVMECLKKALKIANQCMDPSL 715

Human   716 QVQLFIEILNRYIYFYEKENDAVTIQVLNQLIQKIREDLPNLESSEETEQINKHFHNTLEHLRLR 780
            |||||||||||||||||||||.||:|||||||||||||||||:::|||:||:.||.|||||||||
 Frog   716 QVQLFIEILNRYIYFYEKENDGVTVQVLNQLIQKIREDLPNLDATEETDQISTHFKNTLEHLRLR 780

Human   781 RESPESEGPIYEGLIL 796
            ::|||.:|||||||:|
 Frog   781 KDSPEGDGPIYEGLVL 796

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
VPS35	NP_060676.2	Vps35	15..752	CDD:427414	708/736 (96%)
		Interaction with SNX3. /evidence=ECO:0000269|PubMed:24344282	25..44		18/18 (100%)
		Interaction with SNX3. /evidence=ECO:0000269|PubMed:24344282	205..215		8/9 (89%)
		Interaction with SLC11A2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:24344282	438..796		326/357 (91%)
		Interaction with IGF2R cytoplasmic domain. /evidence=ECO:0000269|PubMed:15078903	500..693		183/192 (95%)
vps35	XP_012816642.1	Vps35	15..752	CDD:427414	708/736 (96%)