Protein Alignment NPLOC4 and Nploc4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001424915.1
• Gene: NPLOC4 / 55666
• HGNCID: 18261
• Length: 617
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_542144.1
• Gene: Nploc4 / 140639
• RGDID: 620794
• Length: 608
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 564
• Identity: 547/564 - (96%)
• Similarity: 554/564 - (98%)
• Gaps: 0/564 - (0%)

Human     1 MAESIIIRVQSPDGVKRITATKRETAATFLKKVAKEFGFQNNGFSVYINRNKTGEITASSNKSLN 65
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:
  Rat     1 MAESIIIRVQSPDGVKRITATKRETAATFLKKVAKEFGFQNNGFSVYINRNKTGEITASSSKSLH 65

Human    66 LLKIKHGDLLFLFPSSLAGPSSEMETSVPPGFKVFGAPNVVEDEIDQYLSKQDGKIYRSRDPQLC 130
            |||||||||||||||||||||||||||...|.|.||||:||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 LLKIKHGDLLFLFPSSLAGPSSEMETSTSVGLKAFGAPHVVEDEIDQYLSKQDGKIYRSRDPQLC 130

Human   131 RHGPLGKCVHCVPLEPFDEDYLNHLEPPVKHMSFHAYIRKLTGGADKGKFVALENISCKIKSGCE 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 RHGPLGKCVHCVPLEPFDEDYLNHLEPPVKHMSFHAYIRKLTGGADKGKFVALENISCKIKSGCE 195

Human   196 GHLPWPNGICTKCQPSAITLNRQKYRHVDNIMFENHTVADRFLDFWRKTGNQHFGYLYGRYTEHK 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 GHLPWPNGICTKCQPSAITLNRQKYRHVDNIMFENHTVADRFLDFWRKTGNQHFGYLYGRYTEHK 260

Human   261 DIPLGIRAEVAAIYEPPQIGTQNSLELLEDPKAEVVDEIAAKLGLRKVGWIFTDLVSEDTRKGTV 325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 DIPLGIRAEVAAIYEPPQIGTQNSLELLEDPKAEVVDEIASKLGLRKVGWIFTDLVSEDTRKGTV 325

Human   326 RYSRNKDTYFLSSEECITAGDFQNKHPNMCRLSPDGHFGSKFVTAVATGGPDNQVHFEGYQVSNQ 390
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 RYSRNKDTYFLSSEECITAGDFQNKHPNICRLSPDGHFGSKFVTAVATGGPDNQVHFEGYQVSNQ 390

Human   391 CMALVRDECLLPCKDAPELGYAKESSSEQYVPDVFYKDVDKFGNEITQLARPLPVEYLIIDITTT 455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 CMALVRDECLLPCKDAPELGYAKESSSEQYVPDVFYKDIDKFGNEITQLARPLPVEYLIIDITTT 455

Human   456 FPKDPVYTFSISQNPFPIENRDVLGETQDFHSLATYLSQNTSSVFLDTISDFHLLLFLVTNEVMP 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 FPKDPVYTFSISQNPFPIENRDVLGETQDFHSLATYLSQNTSSVFLDTISDFHLLLFLVTNEVMP 520

Human   521 LQDSISLLLEAVRTRNEELAQTWKRSEQWATIEQLCSEYPHPLP 564
            ||||||||||||||||||||||||:||||||||||||.....||
  Rat   521 LQDSISLLLEAVRTRNEELAQTWKKSEQWATIEQLCSTVGVQLP 564

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
NPLOC4	NP_001424915.1	None
Nploc4	NP_542144.1	UN_NPL4	1..80	CDD:431926	76/78 (97%)
		zf-NPL4	105..245	CDD:461523	139/139 (100%)
		NPL4	249..555	CDD:461524	301/305 (99%)
		ZnF_RBZ	584..606	CDD:197784
		RanBP2-type Zn finger	584..603	CDD:275376