DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment INTS8 and Ints8

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_060334.2 Gene:INTS8 / 55656 HGNCID:26048 Length:995 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001414770.1 Gene:Ints8 / 297823 RGDID:1310592 Length:995 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:995 Identity:943/995 - (94%)
Similarity:978/995 - (98%) Gaps:0/995 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSAEAADREAATSSRPCTPPQTCWFEFLLEESLLEKHLRKPCPDPAPVQLIVQFLEQASKPSVNE 65
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MSAEAADREAATSSRPCTPPQTCWFEFLLEESLLEKHLRKACPDPAPVQLIVQFLEQASKPSVNE 65

Human    66 QNQVQPPPDNKRNRILKLLALKVAAHLKWDLDILEKSLSVPVLNMLLNELLCISKVPPGTKHVDM 130
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||:
  Rat    66 QNQVQPPPDNKRNRSLKLLALKVAAHLKWDLDILEKSLSVPVLNMLLNELLCVSKVPPGTKHVDV 130

Human   131 DLATLPPTTAMAVLLYNRWAIRTIVQSSFPVKQAKPGPPQLSVMNQMQQEKELTENILKVLKEQA 195
            |||.||||||||:||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||:|||
  Rat   131 DLAALPPTTAMAILLYNRWAIRTIVQSSFPVKQAKPGPPQLNVMNQMQQEKELTENILKVLREQA 195

Human   196 ADSILVLEAALKLNKDLYVHTMRTLDLLAMEPGMVNGETESSTAGLKVKTEEMQCQVCYDLGAAY 260
            |||||||||||||||||||||||||||||:|||.||||||:||||||::||||||||||||||||
  Rat   196 ADSILVLEAALKLNKDLYVHTMRTLDLLAVEPGTVNGETENSTAGLKIRTEEMQCQVCYDLGAAY 260

Human   261 FQQGSTNSAVYENAREKFFRTKELIAEIGSLSLHCTIDEKRLAGYCQACDVLVPSSDSTSQQLTP 325
            |||||||||.||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.|||:||
  Rat   261 FQQGSTNSAAYESAREKFFRTKELIAEIGSLSLHCTIDEKRLAGYCQACDVLVPSSDTNSQQVTP 325

Human   326 YSQVHICLRSGNYQEVIQIFIEDNLTLSLPVQFRQSVLRELFKKAQQGNEALDEICFKVCACNTV 390
            |||||||||||:||||:|||||||:|.:||||||||||||||:|||||||||||||||:|:||||
  Rat   326 YSQVHICLRSGSYQEVVQIFIEDNVTFTLPVQFRQSVLRELFQKAQQGNEALDEICFKICSCNTV 390

Human   391 RDILEGRTISVQFNQLFLRPNKEKIDFLLEVCSRSVNLEKASESLKGNMAAFLKNVCLGLEDLQY 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:::||||:||||||||||||||||||||||
  Rat   391 RDILEGRTISVQFNQLFLRPNKEKIDFLLEVCSRSIDIEKASDSLKGNMAAFLKNVCLGLEDLQY 455

Human   456 VFMISSHELFITLLKDEERKLLVDQMRKRSPRVNLCIKPVTSFYDIPASASVNIGQLEHQLILSV 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 VFMISSHELFITLLKDEERKLLVDQMRKRSPRVNLCIKPVTSFYDIPASASVNIGQLEHQLILSV 520

Human   521 DPWRIRQILIELHGMTSERQFWTVSNKWEVPSVYSGVILGIKDNLTRDLVYILMAKGLHCSTVKD 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 DPWRIRQILIELHGMTSERQFWTVSNKWEVPSVYSTVILGIKDNLTRDLVYILMAKGLHCSTVKD 585

Human   586 FSHAKQLFAACLELVTEFSPKLRQVMLNEMLLLDIHTHEAGTGQAGERPPSDLISRVRGYLEMRL 650
            |.|:||||.|.||||||||||||||||||:|||||.|||||.|.:||||||||||||||||||||
  Rat   586 FPHSKQLFTAGLELVTEFSPKLRQVMLNEILLLDILTHEAGVGHSGERPPSDLISRVRGYLEMRL 650

Human   651 PDIPLRQVIAEECVAFMLNWRENEYLTLQVPAFLLQSNPYVKLGQLLAATCKELPGPKESRRTAK 715
            ||||||||:|.|||||||||||||||||||||||.|:||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 PDIPLRQVVAAECVAFMLNWRENEYLTLQVPAFLFQNNPYVKLGQLLAATCKELPGPKESRRTAK 715

Human   716 DLWEVVVQICSVSSQHKRGNDGRVSLIKQRESTLGIMYRSELLSFIKKLREPLVLTIILSLFVKL 780
            |||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 DLWEVVVQICSVSNQHKRGNDGRVSLIKQRESTLGIMYRSELLSFIKKLREPLVLTIILSLFVKL 780

Human   781 HNVREDIVNDITAEHISIWPSSIPNLQSVDFEAVAITVKELVRYTLSINPNNHSWLIIQADIYFA 845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:|||.||:|||:|:|||||||||||
  Rat   781 HNVREDIVNDITAEHISIWPSSIPNLQSVDFEAVAITVREVVRYALSVNPNSHAWLIIQADIYFA 845

Human   846 TNQYSAALHYYLQAGAVCSDFFNKAVPPDVYTDQVIKRMIKCCSLLNCHTQVAILCQFLREIDYK 910
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 TNQHSAALHYYLQAGAVCSDFFNKAVPPDVYTDQVIKRMIKCCSLLNCHTQVAILCQFLREIDYK 910

Human   911 TAFKSLQEQNSHDAMDSYYDYIWDVTILEYLTYLHHKRGETDKRQIAIKAIGQTELNASNPEEVL 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   911 TAFKSLQEQNSHDAMDSYYDYIWDVTILEYLTYLHHKRGETDKRQIAIKAIGQTELNASNPEEVL 975

Human   976 QLAAQRRKKKFLQAMAKLYF 995
            ||||||||||||||||||||
  Rat   976 QLAAQRRKKKFLQAMAKLYF 995

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
INTS8NP_060334.2 WFEF motif. /evidence=ECO:0000269|PubMed:32966759 24..29 4/4 (100%)
TPR 1 250..288 35/37 (95%)
TPR 2 320..356 29/35 (83%)
TPR 3 570..603 28/32 (88%)
TPR 4 833..866 30/32 (94%)
Ints8NP_001414770.1 None

Return to query results.
Submit another query.