DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CHD7 and Chd7

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011515855.1 Gene:CHD7 / 55636 HGNCID:20626 Length:3027 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001264078.1 Gene:Chd7 / 320790 MGIID:2444748 Length:2986 Species:Mus musculus


Alignment Length:3028 Identity:2843/3028 - (93%)
Similarity:2907/3028 - (96%) Gaps:43/3028 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MADPGMMSLFGEDGNIFSEGLEGLGECGYPENPVNPMGQQMPIDQGFASLQPSLHHPSTNQNQTK 65
            ||||||||||||||::|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||
Mouse     1 MADPGMMSLFGEDGSLFSEGLEGLGECGYPENPVNPMGQQMPIDQGFPSLQPSLHHPSPNQNQTK 65

Human    66 LTHFDHYNQYEQQKMHLMDQPNRMMSNTPGNGLASPHSQYHTPPVPQVPHGGSGGGQMGVYPGMQ 130
            |||||||:||| |||||||||||||.:.||||||||||||||||||||||||.||||||||||:|
Mouse    66 LTHFDHYSQYE-QKMHLMDQPNRMMGSAPGNGLASPHSQYHTPPVPQVPHGGGGGGQMGVYPGIQ 129

Human   131 NERHGQSFVDSSSMWGPRAVQVPDQIRAPYQQQQPQPQPPQPAPSGPPAQGHPQHMQQMGSYMAR 195
            ||||||||||..||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||:||
Mouse   130 NERHGQSFVDGGSMWGPRAVQVPDQIRAPYQQQQ-----PQPAPSGPPAQGHPQHMQQMGSYLAR 189

Human   196 GDFSMQQHGQPQQRMSQFSQGQEGLNQGNPFIATSGPGHLSHVPQQSPSMAPSLRHSV-QQFHHH 259
            |||||||||||||||.|||||||||:||:|||||||||||||:|||||||||||||.| ||||||
Mouse   190 GDFSMQQHGQPQQRMGQFSQGQEGLSQGSPFIATSGPGHLSHMPQQSPSMAPSLRHPVQQQFHHH 254

Human   260 PSTALHGESVAHSPRFSPNPPQQGAVRPQTLNFSSRSQTVPSPTINNSGQYSRYPYSNLNQGLVN 324
            |: |||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||:||||||||||||||||||||
Mouse   255 PA-ALHGESVAHSPRFSPNPPQQGAVRPQTLNFSSRNQTVPSPTVNNSGQYSRYPYSNLNQGLVN 318

Human   325 NTGMNQNLGLTNNTPMNQSVPRYPNAVGFPSNSGQGLMHQQPIHPSGSLNQMNTQTMHPSQPQGT 389
            :|||||||||||:||||||||||||||||||||||||:||||||.||||||||||||||||||||
Mouse   319 STGMNQNLGLTNSTPMNQSVPRYPNAVGFPSNSGQGLVHQQPIHSSGSLNQMNTQTMHPSQPQGT 383

Human   390 YASPPPMSPMKAMSNPAGTPPPQVRPGSAGIPMEVGSYPNMPHPQPSHQPPGAMGIGQRNMGPRN 454
            ||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   384 YASPPPMSPMKAMSNPAGTPPPQVRPGSAGMPMEVGSYPNMPHPQPSHQPPGAMGIGQRNMGPRN 448

Human   455 MQQSRPFIGMSSAPRELTGHMRPNGCPGVGLGDPQAIQERLIPGQQHPGQQPSFQQLPTCPPLQP 519
            |||.|.|:|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   449 MQQPRSFMGMSSAPRELTGHMRPNGCPGVGLADPQAIQERLIPGQQHPGQQPSFQQLPTCPPLQP 513

Human   520 HPGLHHQSSPPHPHHQPWAQLHPSPQNTPQKVPVHQHSPSEPFLEKPVPDMTQVSGPNAQLVKSD 584
            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||
Mouse   514 HPGL-HQSSPPHPHHQPWAQLHPSPQNTPQKVPVHQHSPSEPFLEKPVPDMTQVSAQNAQLVKSD 577

Human   585 DYLPSIEQQPQQKKKKKKNNHIVAEDPSKGFGKDDFPGGVDNQELNRNSLDGSQEEKKKKKRSKA 649
            ||||||||||||||||||||||.|.|.|||||||||||||:||||.|||||.||||||||||.|.
Mouse   578 DYLPSIEQQPQQKKKKKKNNHIAAGDSSKGFGKDDFPGGVENQELRRNSLDVSQEEKKKKKRPKV 642

Human   650 KKDPKEPKEPKEKKEPKEPKTPKAPKIPKEPKEKKAKTATPKPKSSKKSSNKKPDSEASALKKKV 714
            ||||||.||||||   ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Mouse   643 KKDPKESKEPKEK---KEPKTPKAPKIPKEPKEKKAKTVTPKPKSSKKSSNKKPDSEASALKKKV 704

Human   715 NKGKTEGSENSDLDKTPPPSPPPEEDEDPGVQKRRSSRQVKRKRYTEDLEFKISDEEADDADAAG 779
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   705 NKGKTEGSENSDLDKTPPPSPAPEEDEDPGVQKRRSSRQVKRKRYTEDLEFKISDEEADDADAAG 769

Human   780 RDSPSNTSQSEQQESVDAEGPVVEKIMSSRSVKKQKESGEEVEIEEFYVKYKNFSYLHCQWASIE 844
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||:|||||||||||||||||||:|
Mouse   770 RDSPSNTSQSEQQESVDAEGPVVEKIMSSRLVKKQKESGEEVEVEEFYVKYKNFSYLHCQWASVE 834

Human   845 DLEKDKRIQQKIKRFKAKQGQNKFLSEIEDELFNPDYVEVDRIMDFARSTDDRGEPVTHYLVKWC 909
            ||||||||||||||||:||||:||||||||:||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Mouse   835 DLEKDKRIQQKIKRFKSKQGQSKFLSEIEDDLFNPDYVEVDRIMDFARSTDDRGEPVIHYLVKWC 899

Human   910 SLPYEDSTWERRQDIDQAKIEEFEKLMSREPETERVERPPADDWKKSESSREYKNNNKLREYQLE 974
            ||||||||||.:|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   900 SLPYEDSTWELKQDIDQTKIEEFEKLMSREPETERVERPPADDWKKSESSREYKNNNKLREYQLE 964

Human   975 GVNWLLFNWYNMRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEIYLKGIHGPFLVIAPLSTIPNWEREFRTWT 1039
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   965 GVNWLLFNWYNMRNCILADEMGLGKTIQSITFLYEIYLKGIHGPFLVIAPLSTIPNWEREFRTWT 1029

Human  1040 ELNVVVYHGSQASRRTIQLYEMYFKDPQGRVIKGSYKFHAIITTFEMILTDCPELRNIPWRCVVI 1104
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1030 ELNVVVYHGSQASRRTIQLYEMYFKDPQGRVIKGSYKFHAIITTFEMILTDCPELRNIPWRCVVI 1094

Human  1105 DEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSRFPSETTFMQEFGDL 1169
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1095 DEAHRLKNRNCKLLEGLKMMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSRFPSETTFMQEFGDL 1159

Human  1170 KTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGG 1234
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1160 KTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGG 1224

Human  1235 QANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFKETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLL 1299
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1225 QANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFKETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLL 1289

Human  1300 PKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYPYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLL 1364
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1290 PKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYPYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLL 1354

Human  1365 CTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKAS 1429
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1355 CTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKAS 1419

Human  1430 LKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRR 1494
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1420 LKLGLDKAVLQSMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRR 1484

Human  1495 THTITIESEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVR 1559
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1485 THTITIESEGKGSTFAKASFVASGNRTDISLDDPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVR 1549

Human  1560 KQTRLYSAVKEDELMEFSDLESDSEEKPCAKPRRPQDKSQGYARSECFRVEKNLLVYGWGRWTDI 1624
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1550 KQTRLYSAVKEDELMEFSDLESDSEEKPCAKPRRPQDKSQGYARSECFRVEKNLLVYGWGRWTDI 1614

Human  1625 LSHGRYKRQLTEQDVETICRTILVYCLNHYKGDENIKSFIWDLITPTADGQTRALVNHSGLSAPV 1689
            ||||||||||||||||||||.|||||||||:||||||||||||||||||||||||:|||||||||
Mouse  1615 LSHGRYKRQLTEQDVETICRAILVYCLNHYRGDENIKSFIWDLITPTADGQTRALLNHSGLSAPV 1679

Human  1690 PRGRKGKKVKAQSTQPVVQDADWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNNSGNNATDQLYVLASCDL 1754
            ||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||.                 
Mouse  1680 PRGRKGKKVKAQSTQPVVHDAHWLASCNPDALFQEDSYKKHLKHHCNK----------------- 1727

Human  1755 EQVIQPLEDSLSWVLLRVRMLYYLRQEVIGDQADKILEGADSSEADVWIPEPFHAEVPADWWDKE 1819
                         ||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||.||||:|
Mouse  1728 -------------VLLRVRMLYYLRQEVIGDQAEKILEGADSSEADVWIPEPFHAEVPTDWWDRE 1779

Human  1820 ADKSLLIGVFKHGYEKYNSMRADPALCFLERVGMPDAKAIAAEQRGTDMLADGGDGGEFDREDED 1884
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1780 ADKSLLIGVFKHGYEKYNSMRADPALCFLERVGMPDAKAIAAEQRGTDMLADGGDGGEFDREDED 1844

Human  1885 PEYKPTRTPFKDEIDEFANSPSEDKEESMEIHATGKHSESNAELGQLYWPNTSTLTTRLRRLITA 1949
            |||||||.|||||||||||||:||||||||:|::|||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1845 PEYKPTRAPFKDEIDEFANSPAEDKEESMEVHSSGKHSESNAELGQLYWPNTSTLTTRLRRLITA 1909

Human  1950 YQRSYKRQQMRQEALMKTDRRRRRPREEVRALEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVSTFGVI 2014
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1910 YQRSYKRQQMRQEALMKTDRRRRRPREEVRALEAEREAIISEKRQKWTRREEADFYRVVSTFGVI 1974

Human  2015 FDPVKQQFDWNQFRAFARLDKKSDESLEKYFSCFVAMCRRVCRMPVKPDDEPPDLSSIIEPITEE 2079
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||:||||||:|:|||||||
Mouse  1975 FDPVKQQFDWNQFRAFARLDKKSDESLGKYFSCFVAMCRRVCRMPAKPEDEPPDLASLIEPITEE 2039

Human  2080 RASRTLYRIELLRKIREQVLHHPQLGERLKLCQPSLDLPEWWECGRHDRDLLVGAAKHGVSRTDY 2144
            |||||||||||||||||||||||||.:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2040 RASRTLYRIELLRKIREQVLHHPQLSDRLKLCQPSLDLPEWWECGRHDRDLLVGAAKHGVSRTDY 2104

Human  2145 HILNDPELSFLDAHKNFAQNRGAGNTSSLNPLAVGFVQTPPVISSAHIQDERVLEQAEGKVEEPE 2209
            |||||||||||||||:|||||||.....||.||:||.||||||||||:.:|:.:||||||.||.|
Mouse  2105 HILNDPELSFLDAHKSFAQNRGASTVPPLNTLAMGFGQTPPVISSAHVHEEKAMEQAEGKAEECE 2169

Human  2210 NPAAKEKCEGKEEEEETDGSGKESKQECEAEASSVKNELKGVEVGADTGSKSISEKGSEEDEEEK 2274
            :..|||:.:|||||||. |..|:.|||||.||||||.||||||..||.||||:||||||||||||
Mouse  2170 HSPAKERSDGKEEEEEA-GGAKDGKQECEVEASSVKGELKGVEGSADPGSKSVSEKGSEEDEEEK 2233

Human  2275 LEDDDKSEESSQPEAGAVSRGKNFDEESNASMSTARDETRDGFYMEDGDPSVAQLLHERTFAFSF 2339
            ||||||||||||||||||||||.||||||||:|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Mouse  2234 LEDDDKSEESSQPEAGAVSRGKTFDEESNASLSTARDETRDGFYMEDGDASVAQLLHERTFAFSF 2298

Human  2340 WPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQMFDFQGLIPGYTPTTVDSPLQKRSFAELSMVGQASI 2404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||.|:.||||||||||||||||.||||
Mouse  2299 WPKDRVMINRLDNICEAVLKGKWPVNRRQMFDFQGLVPGYPPSAVDSPLQKRSFAELSMVSQASI 2363

Human  2405 SGSEDITTSPQLSKEDALNLSVPRQRRRRRRKIEIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENGQE 2469
            |.||||||||||||:|||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2364 SASEDITTSPQLSKDDALNLSVPRQRRRRRRKVEIEAERAAKRRNLMEMVAQLRESQVVSENGQE 2428

Human  2470 KVVDLSKASREATSSTSNFSSLSSKFILPNVSTPVSDAFKTQMELLQAGLSRTPTRHLLNGSLVD 2534
            ||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||:||||||||||||||||:|||||||
Mouse  2429 KVVDLSKASREATSSTSNFSSLTSKFILPNVSTPVSDAFKSQMELLQAGLSRTPTRHMLNGSLVD 2493

Human  2535 GEPPMKRRRGRRKNVEGLDLLFMSHKRTSLSAEDAEVTKAFEEDIETPPTRNIPSPGQLDPDTRI 2599
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Mouse  2494 GEPPMKRRRGRRKNVEGLDLLFMSHKRTPLSAEDAEVTKAFEEDIETPPIRNIPSPGQLDPDTRI 2558

Human  2600 PVINLEDGTRLVGEDAPKNKDLVEWLKLHPTYTVDMPSYVPKNADVLFSSFQKPKQKRHRCRNPN 2664
            |||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Mouse  2559 PVINLEDGTRLVGEDAPKNKDLVDWLKLHPTYTVDMPSYVPKNTDVLFSSFQKPKQKRHRCRNPN 2623

Human  2665 KLDINTLTGEERVPVVNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESM 2729
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2624 KLDINTLTGEERVPVVNKRNGKKMGGAMAPPMKDLPRWLEENPEFAVAPDWTDIVKQSGFVPESM 2688

Human  2730 FDRLLTGPVVRGEGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVASTSGINPLLVNSLFAGMDLTSLQNLQNL 2794
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2689 FDRLLTGPVVRGEGASRRGRRPKSEIARAAAAAAAVASTSGINPLLVNSLFAGMDLTSLQNLQNL 2753

Human  2795 QSLQLAGLMGFPPGLATAATAGGDAKNPAAVLPLMLPGMAGLPNVFGLGGLLNNPLSAATGNTTT 2859
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2754 QSLQLAGLMGFPPGLATAATAGGDAKSPAAVLPLMLPGMAGLPNVFGLGGLLNNPLSAATGNTTT 2818

Human  2860 ASSQGEPEDSTSKGEEKGNENEDENKDSEKSTDAVSAADSANGSVGAATAPAGLPSNPLAFNPFL 2924
            |||||||||.|||.|||||:|||||:|||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||
Mouse  2819 ASSQGEPEDGTSKAEEKGNDNEDENRDSEKSTDTVSAADSANGSVGAATAPAALPSNPLAFNPFL 2883

Human  2925 LSTMAPGLFYPSMFLPPGLGGLTLPGFPALAGLQNAVGSSEEKAADKAEGGPFKDGETLEGSDAE 2989
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||.||||||||||||
Mouse  2884 LSTMAPGLFYPSMFLPPGLGGLTLPGFPALAGLQNAVGTSEEKAADKAEGGPCKDGETLEGSDAE 2948

Human  2990 ESLDKTAESSLLEDEIAQGEELDSLDGGDEIENNENDE 3027
            |:||||.|||:||||:|||||||||:|||||||..|||
Mouse  2949 ENLDKTVESSILEDEVAQGEELDSLEGGDEIENTGNDE 2986

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CHD7XP_011515855.1 Atrophin-1 197..>578 CDD:460830 359/381 (94%)
CD1_tandem_CHD5-9_like 796..861 CDD:349315 61/64 (95%)
CD2_tandem_CHD5-9_like 879..936 CDD:349310 52/56 (93%)
PLN03142 967..>1566 CDD:215601 598/598 (100%)
BRK 2593..2634 CDD:462196 39/40 (98%)
BRK 2672..2716 CDD:197800 43/43 (100%)
Chd7NP_001264078.1 Glutenin_hmw <23..553 CDD:367362 500/537 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 93..146 48/52 (92%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 159..180 20/25 (80%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 194..246 47/51 (92%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 261..307 43/45 (96%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 372..412 39/39 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 461..792 316/334 (95%)
CD1_tandem_CHD5-9_like 786..850 CDD:349315 60/63 (95%)
CD2_tandem_CHD5-9_like 869..926 CDD:349310 52/56 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 928..949 20/20 (100%)
PLN03142 957..>1556 CDD:215601 598/598 (100%)
DEAH box 1095..1098 2/2 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1566..1590 23/23 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1826..1851 24/24 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2151..2274 95/123 (77%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2366..2393 25/26 (96%)
BRK 2552..2593 CDD:462196 39/40 (98%)
BRK 2631..2675 CDD:197800 43/43 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2812..2861 43/48 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2924..2986 53/61 (87%)

Return to query results.
Submit another query.