DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ZGRF1 and Zgrf1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_060862.3 Gene:ZGRF1 / 55345 HGNCID:25654 Length:2104 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017446825.1 Gene:Zgrf1 / 310880 RGDID:1305834 Length:2031 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2127 Identity:1346/2127 - (63%)
Similarity:1588/2127 - (74%) Gaps:120/2127 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MESQEFIVLYTHQKMKKSKVWQDGILKITHLGNKAILYDDKGACLESLFLKCLEVKPGDDLESDR 65
            ||.|||||||||||||||||||||:||.|.||:|||||||||.|||||||||||||||||||:||
  Rat     1 MECQEFIVLYTHQKMKKSKVWQDGVLKTTQLGSKAILYDDKGTCLESLFLKCLEVKPGDDLETDR 65

Human    66 YLITVEEVKVAGAIGIVKQNVNKEAPELNSRTFISSGRSLGCQPSGLKRKFTGFQGPRQVPKKMV 130
            |||||||.|.||: ..|:.:..:||.|...||.:||.|||||||||||||.||||.|.::|||:.
  Rat    66 YLITVEEAKAAGS-RAVEPDGPREALESGPRTLVSSSRSLGCQPSGLKRKATGFQRPYKMPKKVA 129

Human   131 IMESGESAAS---HEAKKTGPTIFSPFCSMPPLFPTVGKKDVNNILADPENIVTYKNRERNAMDF 192
            :.|:...|||   ..:...||.....|.:..|||.|||.|||....||.|:.||::|.||:.|..
  Rat   130 VTENSGPAASLGDGNSGLPGPRFLPTFSNTLPLFSTVGHKDVTTTSADNESPVTFRNTERSDMSL 194

Human   193 SSVFSPSFQINPEVLCEENYFCSPVNSGNKLSDSLLTNEPVKRDSLASHYSGVSQNIRSKAQILA 257
            ||: |.||.||.:.|.:|:..|.||:|..|.|||||.:||::|:.|.|...||||.|||||||||
  Rat   195 SSL-SSSFTINTDTLGKEDKLCFPVSSETKYSDSLLASEPMRRNGLDSFCPGVSQTIRSKAQILA 258

Human   258 LLKSESSSSCEELNSEMTEHFPQKQPQGSLKIATKPKYLIQQEECAEMKSTENLYYQHQSENTMR 322
            |||| ||::.::|..|.|.|.|:.||.|.|||.:|||     |:|||.:||.||:.:.||||..|
  Rat   259 LLKS-SSTTRKDLPDESTGHVPKIQPHGCLKITSKPK-----EDCAETQSTGNLHCEQQSENPTR 317

Human   323 NKSRWAMYLSSQ-SSPIHSSTVDGNDTERKPKAQEDDVNSNLKDLSLQKIIQFVETYAEERKKYN 386
            :.||||.||.|| |||  .|..|.|||:.||:||||....||.:|.:|:..:..||..|:.:.|:
  Rat   318 STSRWARYLPSQRSSP--CSARDENDTQDKPEAQEDVNIFNLSELLVQQKSELFETCIEKGELYS 380

Human   387 VDQSVGNNDPSWNQEVKLEIPSFNESSSLQVTCSSAENDGILSESDIQEDNKIPFNQNDKGCIKG 451
            .|:.: ::..||:.|..| .|||.::||:.|:|||.|:..:|||||.|..:|:|||||:|.||:|
  Rat   381 EDKPI-DDCQSWSPEESL-APSFCKNSSVWVSCSSKESVDLLSESDTQYSSKVPFNQNEKVCIQG 443

Human   452 SVLIKENAQEVNTCGTLEKEYEQSESSLPELKHLQIE----SSNNSRISDDITDMISESKMDNES 512
            | |..:..|..: ..|||.|| :..|.|.|::|.|||    .|.:|||||||.||:|:|..:.|:
  Rat   444 S-LSTQGIQGAD-ADTLEPEY-RPLSPLSEIEHKQIEVESSLSTSSRISDDIVDMVSKSSAEREN 505

Human   513 LNSIHESLSNVTQPFLEVTFNLNNFETSDTEEESQESNKISQDSESWVKDILVNDGNSCFQKRSE 577
            |:::.::    .||||||:|||:|||.|||:|.|||.:::|||||.|.|::::.| :||.||.|.
  Rat   506 LDTVQKA----AQPFLEVSFNLSNFEASDTDEMSQEDSRLSQDSERWEKEVVLID-DSCVQKSSG 565

Human   578 NTNCEEIEGEHLPFLTSVSDKPTVTFPVKETLPSQFCDKTYVGFDMGICKTENTGKEIEE--YSD 640
            :..|.||.|:|||.|:|...||........||.|:|||:|.|||:.|..:..||||.:|.  |.|
  Rat   566 DIGCREIAGKHLPLLSSADGKPKEALTATVTLLSEFCDRTCVGFNSGPHEDANTGKALEGQCYGD 630

Human   641 TLSNFE-SFKWTDAVYGDNKEDANKPIQEVRINYDFALPPNKSKGINMNLHIPHIQNQIA----E 700
            |.|:.: |..|::.|.||:||||::.||...|||....|.||.:|||.:||||::.|.||    |
  Rat   631 TGSSLDSSLGWSEEVPGDSKEDASESIQGNAINYGSVSPSNKLEGINTSLHIPYLLNTIANPTPE 695

Human   701 NSNLFSEDAQPQPFILGSDLDKNDEHVLPSTSSSDNSVQLLNTNQNHYECIALDKSNTHISNSLF 765
            ||:|.||...|.  :|.|.:|:|||.||...||||.|.|||:|.|:|.|...||:.||.:|:|||
  Rat   696 NSDLISEGTPPS--VLQSHIDRNDEWVLSPISSSDISGQLLSTTQDHSEHHELDEFNTQVSSSLF 758

Human   766 YPLGKKHLISKDTEAHISEPEDLGKIRSPPPDHVEVETAREGKQYW-NPRNSSELSGLVNTISIL 829
            ||:|.||.|.:|:|..|||.::||:|||...:|.:|||.:..:|.| ..:|||||..::|.||.|
  Rat   759 YPVGIKHPIYRDSEEDISESKELGRIRSLSCNHFKVETTQRNEQSWATYKNSSELLEVINNISFL 823

Human   830 KSLCEHSTALDSLEILKKKNTVFQQGTQQTYEPDSPPEVRKPFITVVSP---KSPHLHKDSQQIL 891
            ||..||.|||::|.::|:|: ||....|.:..||..|:.|:...||||.   ..||.|:.|||  
  Rat   824 KSRPEHGTALENLAVVKEKH-VFPHEVQHSRGPDVSPKARRSPATVVSHALLDCPHEHRASQQ-- 885

Human   892 KEDEVELSEPLQSVQFSSSGSKEETAFQAVIPKQIERKTCDPKPVEFQGHQVKGSATSGVMVRGH 956
                                                       ||||||||||||||||||||||
  Rat   886 -------------------------------------------PVEFQGHQVKGSATSGVMVRGH 907

Human   957 SSQLGCSQFPDSTEYENFMTE----TPELPSTCMQIDFLQVTSPEENISTLSPVSTFSLNSRDED 1017
            |.||||||||||.||::|:|:    ||||||||:|.|||||.|||: ||..||..|||.|:|.||
  Rat   908 SLQLGCSQFPDSIEYDSFLTDPCVWTPELPSTCVQSDFLQVISPEK-ISAFSPAPTFSFNTRSED 971

Human  1018 FMVEFSETSLKARTLPDDLHFLNLEGMKKSRSLENENLQRLSLLSRTQVPLITLPRTDGPPDLDS 1082
            ..:||||.|||.||.|         |:|.....:|:|.||...||...||.:|||..|||..|||
  Rat   972 SELEFSEESLKTRTFP---------GLKNIGFQDNKNFQRFPFLSGASVPFVTLPPDDGPAVLDS 1027

Human  1083 HSYMINSNTYESSGSPMLNLCEKSAVLSFSIEPEDQNETFFSEESREVNPGDV-SLNNISTQSKW 1146
            .|:||:.:|.|.|||..|||||:|. |||.:..|||:..          |.|| .|...||||||
  Rat  1028 CSFMIDDDTREPSGSSRLNLCEESG-LSFDLGLEDQDGI----------PRDVLLLPKSSTQSKW 1081

Human  1147 LKYQNTSQCNVATPNRVDKRITDGFFAEAVSGMHFRDTSERQSDAVNESSLDSVHLQMIKGMLYQ 1211
            |||||.|.||.|..||:...:|:...||||||:||..|||      :|||:|.||||||||||||
  Rat  1082 LKYQNPSHCNSAALNRIASEVTEDLSAEAVSGLHFSHTSE------SESSVDPVHLQMIKGMLYQ 1140

Human  1212 QRQDFSSQDSVSRKKVLSLNLKQTSKTEEIKNVLGGSTCYNYSVKDLQEISGSELCFPSGQKIKS 1276
            |:|||:|||.|||:|.|||||.|||:|.|::..||.|...|..|:|.|||:.|:||||:||||.|
  Rat  1141 QQQDFTSQDLVSRQKALSLNLNQTSRTGELRTALGSSASSNCRVRDGQEINNSDLCFPNGQKILS 1205

Human  1277 AYLPQRQIHIPAVFQSPAHYKQTFTSCLIEHLNILLFGLAQNLQKALSKVDISFYTSLKGEKLKN 1341
            |||||||:||||||||||||:|.|||.:|||||||||||||.|.|||||||||||||.|||.:|:
  Rat  1206 AYLPQRQVHIPAVFQSPAHYRQIFTSSIIEHLNILLFGLAQRLYKALSKVDISFYTSSKGEMMKS 1270

Human  1342 AENNVPSCHHSQPAKLVMVKKEGPNKGRLFYTCDGPKADRCKFFKWLEDVTPGYSTQEGARPGMV 1406
            .:||.|||||:|||||||||||||||||||||||.||.::||||||||||||...:|..::|.|:
  Rat  1271 GKNNSPSCHHNQPAKLVMVKKEGPNKGRLFYTCDKPKGNQCKFFKWLEDVTPEQLSQNESQPNMI 1335

Human  1407 LSDIKSIGLYLRSQKIPLYEECQLLVRKGFDFQRKQYGKLKKFTTVNPEFYNEPKTKLYLKLSRK 1471
            .:||||||.|||||||.:|||||||:|||||||:||:|||||..|||||||:|.|:|||||||||
  Rat  1336 FNDIKSIGSYLRSQKIAVYEECQLLLRKGFDFQKKQHGKLKKLATVNPEFYSETKSKLYLKLSRK 1400

Human  1472 ERSSAYSKNDLWVVSKTLDFELDTFIACSAFFGPSSINEIEILPLKGYFPSNWPTNMVVHALLVC 1536
            |.||.|||.||||:||||||||||||||||||||||:||:|:||||||||||||||:.|||||||
  Rat  1401 ESSSVYSKGDLWVISKTLDFELDTFIACSAFFGPSSVNEVELLPLKGYFPSNWPTNITVHALLVC 1465

Human  1537 NASTELTTLKNIQDYFNPATLPLTQYLLTTSSPTIVSNKRVSKRKFIPPAFTNVSTKFELLSLGA 1601
            |.|||||.|:|||||||||||||..|||..|....||:|.||||||||||.|::.||||||.|||
  Rat  1466 NVSTELTMLQNIQDYFNPATLPLMPYLLAMSQSATVSSKNVSKRKFIPPAITSIKTKFELLHLGA 1530

Human  1602 TLKLASELIQVHKLNKDQATALIQIAQMMASHESIEEVKELQTHTFPITIIHGVFGAGKSYLLAV 1666
            ||:||.|||.||:||.|||:||:||||||||..|.|:..|..:|:.|||:|||||||||||||||
  Rat  1531 TLQLARELINVHRLNNDQASALMQIAQMMASRGSDEDALEPFSHSLPITVIHGVFGAGKSYLLAV 1595

Human  1667 VILFFVQLFEKSEAPTIGNARPWKLLISSSTNVAVDRVLLGLLSLGFENFIRVGSVRKIAKPILP 1731
            ||||.|:||||.::..:|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||:||
  Rat  1596 VILFLVELFEKCDSEAVGRARPWKLLISSSTNVAVDRVLLGLLSLGFEKFIRVGSVRKIAKPVLP 1660

Human  1732 YSLHAGSENESEQLKELHALMKEDLTPTERVYVRKSIEQHKLGTNRTLLKQVRVVGVTCAACPFP 1796
            |||||.|:|||||||||||||:|:|||.||||||||||||||||||.||||.||||:||||||||
  Rat  1661 YSLHASSDNESEQLKELHALMREELTPIERVYVRKSIEQHKLGTNRVLLKQARVVGITCAACPFP 1725

Human  1797 CMNDLKFPVVVLDECSQITEPASLLPIARFECEKLILVGDPKQLPPTIQGSDAAHENGLEQTLFD 1861
            |||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
  Rat  1726 CMNDLKFPVVVLDECSQMTEPASLLPIARFECEKLILVGDPKQLPPTIQGSDAAHGNGLEQTLFD 1790

Human  1862 RLCLMGHKPILLRTQYRCHPAISAIANDLFYKGALMNGVTEIERSPLLEWLPTLCFYNVKGLEQI 1926
            ||||||||||.|||||||||.||||||||||:|.|:||::|.||||:||||||||||||.|.||:
  Rat  1791 RLCLMGHKPIQLRTQYRCHPVISAIANDLFYEGNLVNGISERERSPVLEWLPTLCFYNVTGTEQV 1855

Human  1927 ERDNSFHNVAEATFTLKLIQSLIASGIAGSMIGVITLYKSQMYKLCHLLSAVDFHHPDIKTVQVS 1991
            ||:|||.|||||.||||||:||||||:.||||||||||||||||:|.||||||..|||:|.|:||
  Rat  1856 ERENSFVNVAEAAFTLKLIRSLIASGLEGSMIGVITLYKSQMYKICSLLSAVDVDHPDVKAVEVS 1920

Human  1992 TVDAFQGAEKEIIILSCVRTRQVGFIDSEKRMNVALTRGKRHLLIVGNLACLRKNQLWGRVIQHC 2056
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:|:|:|||||||||||||||
  Rat  1921 TVDAFQGAEKEIIILSCVRTRQVGFIDSEKRMNVALTRGRRHLLIIGSLSCLRKNQLWGRVIQHC 1985

Human  2057 EGREDGLQHANQYEPQLNHLLKDYFEKQVEEKQKKKSEKEKSKDKSH 2103
            :|||||||||:|.||||:.|||:|.|||.|||| ||:||||.|||||
  Rat  1986 KGREDGLQHASQCEPQLDRLLKEYLEKQAEEKQ-KKTEKEKLKDKSH 2031

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ZGRF1NP_060862.3 DUF2439 4..74 CDD:463065 63/69 (91%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 335..359 14/23 (61%)
zf-GRF 1347..1391 CDD:462017 38/43 (88%)
DNA2 <1686..2057 CDD:440729 329/370 (89%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2085..2104 15/19 (79%)
Zgrf1XP_017446825.1 DUF2439 3..75 CDD:463065 63/71 (89%)
zf-GRF 1276..1320 CDD:462017 38/43 (88%)
DNA2 <1608..1986 CDD:440729 330/377 (88%)

Return to query results.
Submit another query.