DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment RHOT1 and Rhot1

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_047292309.1 Gene:RHOT1 / 55288 HGNCID:21168 Length:722 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001427054.1 Gene:Rhot1 / 303351 RGDID:1307023 Length:752 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:747 Identity:661/747 - (88%)
Similarity:679/747 - (90%) Gaps:53/747 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    29 VSPVARTDLAQKRH-----SARVGKTSLIMSLVSEEFPEEVPPRAEEITIPADVTPERVPTHIVD 88
            |.|:..:|:.:...     ..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     6 VRPLRASDMKKDVRILLVGEPRVGKTSLIMSLVSEEFPEEVPPRAEEITIPADVTPERVPTHIVD 70

Human    89 YSEAEQSDEQLHQEISQANVICIVYAVNNKHSIDKVTSRWIPLINERTDKDSRLPLILVGNKSDL 153
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    71 YSEAEQSDEQLHQEISQANVICIVYAVNNKHSIDKVTSRWIPLINERTDKDSRLPLILVGNKSDL 135

Human   154 VEYSSMETILPIMNQYTEIETCVECSAKNLKNISELFYYAQKAVLHPTGPLYCPEEKEMKPACIK 218
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   136 VEYSSMETILPIMNQYTEIETCVECSAKNLKNISELFYYAQKAVLHPTGPLYCPEEKEMKPACIK 200

Human   219 ALTRIFKISDQDNDGTLNDAELNFFQRICFNTPLAPQALEDVKNVVRKHISDGVADSGLTLKGFL 283
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||:|||
  Rat   201 ALTRIFKISDQDNDGTLNDAELNFFQRICFNTPLAPQALEDVKNVVRKHLSDGVADSGLTLRGFL 265

Human   284 FLHTLFIQRGRHETTWTVLRRFGYDDDLDLTPEYLFPLLKIPPDCTTELNHHAYLFLQSTFDKHD 348
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   266 FLHTLFIQRGRHETTWTVLRRFGYDDDLDLTPEYLFPLLKIPPDCTTELNHHAYLFLQSTFDKHD 330

Human   349 LDRDCALSPDELKDLFKVFPYIPWGPDVNNTVCTNERGWITYQGFLSQWTLTTYLDVQRCLEYLG 413
            ||||||||||||||||:|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   331 LDRDCALSPDELKDLFQVFPYIPWGPDVNNTVCTNESGWITYQGFLSQWTLTTYLDVQRCLEYLG 395

Human   414 YLGYSILTEQESQASAVTVTRDKKIDLQKKQTQRNVFRCNVIGVKNCGKSGVLQALLGRNLMRQK 478
            ||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||.|||:||||:||||||||||
  Rat   396 YLGYSILTEQESQASAITVTRDKKIDLQKKQTQRNVFRCNVIGVKGCGKTGVLQSLLGRNLMRQK 460

Human   479 KIREDHKSYYAINTVYVYGQEKYLLLHDISESEFLTEAEIICDVVCLVYDVSNPKSFEYCARIFK 543
            |||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||:|||||||||||||
  Rat   461 KIRDDHKSYYAINTVYVYGQEKYLLLHDISESEFLTEAEIVCDVVCLVYDVTNPKSFEYCARIFK 525

Human   544 QHFMDSRIPCLIVAAKSDLHEVKQEYSISPTDFCRKHKMPPPQAFTCNTADAPSKDIFVKLTTMA 608
            |||||||||||||||||||||||||:|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   526 QHFMDSRIPCLIVAAKSDLHEVKQEHSVSPTDFCRKHKMPPPQAFTCNTADAPSKDIFVKLTTMA 590

Human   609 MYPEDHYRDRLSRDMGHTDRIENLRKIWVFLKTAFHARLRCMCTCNRCTFCICQNFLNSDLLQSV 673
            ||||||||..||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
  Rat   591 MYPEDHYRGSLSRDMGSTDRIENLRKIWVFLKTAFHARLRCMCTCNRCTFCICQNLLNSDLLQSV 655

Human   674 KNKIFTAVL------------------------------------------------NRHVTQAD 690
            |||:|||||                                                ||||||||
  Rat   656 KNKVFTAVLNRLKARVAEWGAMLLADDEGSITHQVHAVRSVEDSIFMESSRGQIFLDNRHVTQAD 720

Human   691 LKSSTFWLRASFGATVFAVLGFAMYKALLKQR 722
            |||||||||||||||||||:|||||:||||||
  Rat   721 LKSSTFWLRASFGATVFAVVGFAMYRALLKQR 752

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
RHOT1XP_047292309.1 Miro1 46..200 CDD:206680 153/153 (100%)
EF_assoc_2 250..334 CDD:462444 81/83 (98%)
EF_assoc_1 372..441 CDD:462443 66/68 (97%)
Miro2 446..611 CDD:206679 156/164 (95%)
Rhot1NP_001427054.1 None

Return to query results.
Submit another query.