DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PHIP and phip

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_060404.4 Gene:PHIP / 55023 HGNCID:15673 Length:1821 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_002936252.2 Gene:phip / 100158567 XenbaseID:XB-GENE-988009 Length:1835 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1854 Identity:1416/1854 - (76%)
Similarity:1590/1854 - (85%) Gaps:69/1854 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     9 SELRSELYFLIARFLEDGPCQQAAQVLIREVAEKELLPRRTDWTGKEHPRTYQNLVKYYRHLAPD 73
            :||:|||||||||||||||||||||||||||.||||||:|.|||||||.||||||||||||||||
 Frog    10 TELKSELYFLIARFLEDGPCQQAAQVLIREVEEKELLPKRVDWTGKEHARTYQNLVKYYRHLAPD 74

Human    74 HLLQICHRLGPLLEQEIPQSVPGVQTLLGAGRQSLLRTNKSCKHVVWKGSALAALHCGRPPESPV 138
            ||||||.|:|||||:|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:
 Frog    75 HLLQICQRIGPLLEKEVPQSVPGVQTLLGAGRQSLLRTNKSCKHVVWKGSALAALHCGRPPEPPI 139

Human   139 NYGSPPSIADTLFSRKLNGKYRLERLVPTAVYQHMKMHKRILGHLSSVYCVTFDRTGRRIFTGSD 203
            |||||||||:|.|:|||||.|:.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   140 NYGSPPSIANTFFARKLNGNYQFENLVPTAVYQHMKMHKRILGHLSSVYCVTFDRTGRRIFTGSD 204

Human   204 DCLVKIWATDDGRLLATLRGHAAEISDMAVNYENTMIAAGSCDKMIRVWCLRTCAPLAVLQGHSA 268
            |||||||:|||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||:||||||||||:||||||
 Frog   205 DCLVKIWSTDDGRLLATLRGHAAEISDMAVNFENTMIAAGSCDKMIRIWCLRTCAPLAILQGHSA 269

Human   269 SITSLQFSPLCSGSKRYLSSTGADGTICFWLWDAGTLKINPRPAKFTERPRPGVQMICSSFSAGG 333
            |||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||.|:||||||||||||||||:||
 Frog   270 SITSLQFSPLCNGSKRYLSSTGADGTICFWLWDAGTLKINPRPTKYTERPRPGVQMICSSFSSGG 334

Human   334 MFLATGSTDHIIRVYFFGSGQPEKISELEFHTDKVDSIQFSNTSNRFVSGSRDGTARIWQFKRRE 398
            ||||||||||:||||:|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
 Frog   335 MFLATGSTDHVIRVYYFGSGQPEKISELEFHTDKVDSIQFSNTGNRFVSGSRDGTARIWQFKRRE 399

Human   399 WKSILLDMATRPAGQNLQGIEDKITKMKVTMVAWDRHDNTVITAVNNMTLKVWNSYTGQLIHVLM 463
            ||||||||.|||.|  :||:||||||:||||||||||||.|||||||||||||||..|||:|:||
 Frog   400 WKSILLDMTTRPTG--VQGVEDKITKLKVTMVAWDRHDNFVITAVNNMTLKVWNSSNGQLVHILM 462

Human   464 GHEDEVFVLEPHPFDPRVLFSAGHDGNVIVWDLARGVKIRSYFNMIEGQGHGAVFDCKCSPDGQH 528
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   463 GHEDEVFVLESHPFDPRVLFSAGHDGNVIVWDLARGVKIRSYFNMIEGQGHGAVFDCKCSPDGQH 527

Human   529 FACTDSHGHLLIFGFGSSSKYDKIADQMFFHSDYRPLIRDANNFVLDEQTQQAPHLMPPPFLVDV 593
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
 Frog   528 FACTDSHGHLLIFGFGSSSKYDKIADQMFFHSDYRPLIRDANNYVLDEQTQQAPHLMPPPFLVDV 592

Human   594 DGNPHPSRYQRLVPGRENCREEQLIPQMGVTSSGLNQVLSQQANQEISPLDSMIQRLQQEQDLRR 658
            ||||||:|||||||||||||:||||||||:||||:|||||||::.|:|||||:|||||.|||.|.
 Frog   593 DGNPHPTRYQRLVPGRENCRDEQLIPQMGLTSSGMNQVLSQQSDNEVSPLDSLIQRLQLEQDQRM 657

Human   659 SGEAVISNTSRLSRGSISSTSEVHSPPNVGLRRSGQIEGVRQMHSNAPRSEIATERDLVAWSRRV 723
            :.:....::||:.|.|:||:||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   658 NADTSGGSSSRMGRASVSSSSEVHSPPNIGLRRSGQIEGVRQMHSNAPRSEIATERDLVAWSRRV 722

Human   724 VVPELSAGVASRQEEWRTAKGEEEIKTYRSEEKRKHLT--VPKENKIPTVSKNHAHEHFLDLGES 786
            ||||||.||.|:|||||||||||||:.|::|:|:|.:|  ..:|:|: :.||||:.|..||:.:.
 Frog   723 VVPELSTGVLSKQEEWRTAKGEEEIRMYKAEDKKKTITNHAVRESKV-SYSKNHSLELLLDIEDP 786

Human   787 KKQQTNQHNYRTRSALEETPRPSEEIENGSSSSD----EGEVVAVSGGTSEEEER-AWHSDGSSS 846
            |:|.:|.:|||||:|.||...|:|::||  ||||    |.|.||.||.||||:|: .|:||||||
 Frog   787 KRQSSNSYNYRTRAAPEEQAVPTEDVEN--SSSDEAYVESEAVAASGATSEEDEKQEWNSDGSSS 849

Human   847 DYSSDYSDWTADAGINLQPPKKVPKNKTKKAESSSDEEEESEKQKQKQIKKEKKKVNEEKDGPIS 911
            ||||||||||||||||||||||:.|::||||||||::||.|:|.||||.|||:||..|:|||..|
 Frog   850 DYSSDYSDWTADAGINLQPPKKILKHRTKKAESSSEDEENSDKFKQKQNKKERKKGMEDKDGSSS 914

Human   912 PKKKKPKERKQKRLAVGELTENGLTLEEWLPSTWITDTIPRRCPFVPQMGDEVYYFRQGHEAYVE 976
            ||||||||||||||.:|||||.||:|||||||.|||||:||||||||||||||||||||||||||
 Frog   915 PKKKKPKERKQKRLPIGELTEQGLSLEEWLPSAWITDTVPRRCPFVPQMGDEVYYFRQGHEAYVE 979

Human   977 MARKNKIYSINPKKQPWHKMELREQELMKIVGIKYEVGLPTLCCLKLAFLDPDTGKLTGGSFTMK 1041
            ||:|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||:||||
 Frog   980 MAKKNKIYRINPKKQPWHKMELREQELMKIVGIKYEVGLPTLCCLKLAFLDSDTGKLTGGAFTMK 1044

Human  1042 YHDMPDVIDFLVLRQQFDDAKYRRWNIGDRFRSVIDDAWWFGTIESQEPLQLEYPDSLFQCYNVC 1106
            ||||||||||||||||||:|:.|:|:||||||||||||||||||||||||..:||||||||||||
 Frog  1045 YHDMPDVIDFLVLRQQFDEARRRQWSIGDRFRSVIDDAWWFGTIESQEPLHQDYPDSLFQCYNVC 1109

Human  1107 WDNGDTEKMSPWDMELIPNNAVFPEELGTSVPLTDGECRSLIYKPLDGEWGTNPRDEECERIVAG 1171
            ||||||||||||||||||:||||||||||||||.:.|.|||:|:.||||||...|||||:||.|.
 Frog  1110 WDNGDTEKMSPWDMELIPDNAVFPEELGTSVPLIEEEVRSLLYRSLDGEWGCRSRDEECDRITAA 1174

Human  1172 INQLMTLDIASAFVAPVDLQAYPMYCTVVAYPTDLSTIKQRLENRFYRRVSSLMWEVRYIEHNTR 1236
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
 Frog  1175 INQLMTLDIASAFVAPVDLQAYPMYSTVVAYPTDLSTIKQRLENRFYRRLSSLMWEVRYIEHNTR 1239

Human  1237 TFNEPGSPIVKSAKFVTDLLLHFIKDQTCYNIIPLYNSMKKKVLSDS-EDEEKDADVPGTSTRKR 1300
            |||||||||.:|||.|.|:||||:|||.||:||||||::|||:|||| |:|||||||||||||||
 Frog  1240 TFNEPGSPIERSAKLVIDVLLHFVKDQCCYDIIPLYNNLKKKLLSDSEEEEEKDADVPGTSTRKR 1304

Human  1301 KDHQPRRRLRNRAQSYDIQAWKKQCEELLNLIFQCEDSEPFRQPVDLLEYPDYRDIIDTPMDFAT 1365
            |::||||:||:||.|||:.:||||||||||||||||||||||||||||||.|||:||||||||.|
 Frog  1305 KEYQPRRKLRSRAPSYDLHSWKKQCEELLNLIFQCEDSEPFRQPVDLLEYSDYREIIDTPMDFGT 1369

Human  1366 VRETLEAGNYESPMELCKDVRLIFSNSKAYTPSKRSRIYSMSLRLSAFFEEHISSVLSDYKSALR 1430
            |||||||||||:|:||.|||||||||||||||||||:||||||||||||||.:|::|:||:||||
 Frog  1370 VRETLEAGNYETPLELSKDVRLIFSNSKAYTPSKRSKIYSMSLRLSAFFEERMSNILADYRSALR 1434

Human  1431 FHKRNTITKRRKKRNRSSSVSSSAASSPERKKRILKPQLKSESST-SAFSTPTRSIPPRHNAAQI 1494
            ||.|||.||.|:|||||||.|||.|||||||:|.:|.|..||::| |..|...|::..:...:.:
 Frog  1435 FHNRNTKTKSRRKRNRSSSSSSSPASSPERKRRYVKQQPNSENTTMSPASVHQRTVAHKVTNSLV 1499

Human  1495 NGK-TESSSVVRTRSNRVVVDPVVTEQPSTSSAAKTFITKANASAIPGKT-ILENSVKHSKALNT 1557
            ||| ||.|::.||||.:..|:|.|.|:|:||...|....|:|.|.:.||: ::||:.|..|:.||
 Frog  1500 NGKATEPSTLARTRSYKRQVEPAVPEKPTTSGTPKQLTAKSNHSTVAGKSAMIENAAKLLKSQNT 1564

Human  1558 LSSPGQSSFSHGTRNNSAKENMEKEKPVKRKMKSSVLPKASTLSKSSAVIEQGDCKNNALVPGTI 1622
              ||.|:| :|..:||..||.:||:||:||:||:           ||.:..:.|.|.......:|
 Frog  1565 --SPNQAS-NHLIKNNVPKEKLEKDKPLKRRMKA-----------SSNMALRADRKEILHQASSI 1615

Human  1623 QVNGHGGQPSK-LVKRGPGRKPKVEVNTNSG-------EIIHKKRGRKPKKLQYAKPEDLEQNNV 1679
            |||||..:|.| :||..|||||||.:|.::.       :::.||||||||   |.:.|.|:..:.
 Frog  1616 QVNGHSSEPLKPIVKGRPGRKPKVILNNSNNYETITVVQVVPKKRGRKPK---YPRNEALQSVSQ 1677

Human  1680 HP---------IRDEVLPSSTCNFLSETNNVKEDLLQKKNRGGRKPKRKMKTQKLDADLLVPA-- 1733
            .|         |:::. .||:||..:......|:.:.||.| ||||  |:||:......::||  
 Frog  1678 KPPNSVVETGKIKEQP-ASSSCNSHAAPCEKTENEVPKKRR-GRKP--KVKTEPTSLVAVIPAPS 1738

Human  1734 --------SVKVLRRSNRKKIDDPIDEEEEF---EELKGSEPHMRTRNQGRRTAFYNEDDSEEEQ 1787
                    :||:..||..||.|.  .|.|..   |::..:|..|||||||||||||||:||||||
 Frog  1739 AHELKREETVKIQTRSKCKKSDQ--SEGESLTVSEDINNTEIQMRTRNQGRRTAFYNEEDSEEEQ 1801

Human  1788 RQLLFEDTSLTFGTSSRGRVRKLTEKAKANLIGW 1821
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1802 RQLLFEDTSLTFGTSSRGRVRKLTEKAKANLIGW 1835

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PHIPNP_060404.4 WD40 118..497 CDD:441893 345/378 (91%)
WD 1 181..222 39/40 (98%)
WD40 repeat 186..223 CDD:293791 35/36 (97%)
WD 2 224..262 35/37 (95%)
WD40 repeat 229..265 CDD:293791 32/35 (91%)
WD 3 265..310 43/44 (98%)
WD40 repeat 270..315 CDD:293791 42/44 (95%)
WD 4 319..360 37/40 (93%)
WD40 repeat 323..362 CDD:293791 35/38 (92%)
WD 5 363..402 37/38 (97%)
WD40 repeat 368..416 CDD:293791 42/47 (89%)
WD 6 422..461 33/38 (87%)
WD 7 464..504 38/39 (97%)
WD40 repeat 469..494 CDD:293791 23/24 (96%)
WD 8 512..551 38/38 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 658..689 14/30 (47%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 751..927 114/182 (63%)
Mediates interaction with IRS1. /evidence=ECO:0000250 924..1129 185/204 (91%)
Bromo_WDR9_I_like 1148..1263 CDD:99958 97/114 (85%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1280..1310 25/30 (83%)
Bromo_WDR9_II 1316..1434 CDD:99928 101/117 (86%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1435..1507 38/73 (52%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1555..1597 19/41 (46%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1623..1646 15/23 (65%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1751..1784 20/35 (57%)
phipXP_002936252.2 WD40 <182..496 CDD:441893 291/315 (92%)
WD40 repeat 187..224 CDD:293791 35/36 (97%)
WD40 repeat 230..266 CDD:293791 32/35 (91%)
WD40 repeat 271..311 CDD:293791 38/39 (97%)
WD40 repeat 324..363 CDD:293791 35/38 (92%)
WD40 repeat 369..416 CDD:293791 42/48 (88%)
WD40 repeat 468..493 CDD:293791 23/24 (96%)
Bromo_WDR9_I_like 1151..1266 CDD:99958 97/114 (85%)
Bromodomain 1320..1438 CDD:445827 101/117 (86%)
DUF612 <1481..1772 CDD:282585 110/313 (35%)

Return to query results.
Submit another query.