DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment VPS13C and vps13c

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_065872.1 Gene:VPS13C / 54832 HGNCID:23594 Length:3753 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_031754979.1 Gene:vps13c / 100495847 XenbaseID:XB-GENE-6043823 Length:3768 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:3796 Identity:2410/3796 - (63%)
Similarity:3012/3796 - (79%) Gaps:81/3796 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     2 VLESVVADLLNRFLGDYVENLNKSQLKLGIWGGNVALDNLQIKENALSELDVPFKVKAGQIDKLT 66
            :||||||||||||||||||||::||||||||||||||:||:|||||||||:||||||||||||||
 Frog     1 MLESVVADLLNRFLGDYVENLDRSQLKLGIWGGNVALENLRIKENALSELNVPFKVKAGQIDKLT 65

Human    67 LKIPWKNLYGEAVVATLEGLYLLVVPGASIKYDAVKEEKSLQDVKQKELSRIEEALQKAAEKGTH 131
            ||||||||||:|||||||||:|||||||||||||.|||||:|:.||:||.||||||||||:||..
 Frog    66 LKIPWKNLYGDAVVATLEGLFLLVVPGASIKYDAQKEEKSIQETKQRELLRIEEALQKAADKGVL 130

Human   132 SGEFIYGLENFVYKDIKPGRKRKKHKKHFKKPFKGLDRSKDKPKEAKKDTFVEKLATQVIKNVQV 196
            .|| .|.|:|||||::|||.|||| .||||..||.||...|.||:||||||:|||.||||||:|:
 Frog   131 PGE-CYNLQNFVYKNVKPGSKRKK-LKHFKNRFKVLDSKTDIPKDAKKDTFMEKLLTQVIKNLQI 193

Human   197 KITDIHIKYEDDVTDPKRPLSFGVTLGELSLLTANEHWTPCILNEADKIIYKLIRLDSLSAYWNV 261
            |||||||:||||:||.|.|:|.||||.||||.|.||.|.|||||||.||||||:||||.|.||||
 Frog   194 KITDIHIRYEDDITDAKVPVSLGVTLSELSLQTCNESWKPCILNEATKIIYKLVRLDSFSTYWNV 258

Human   262 NCSMSYQRSREQILDQLKNEILTSGNIPPNYQYIFQPISASAKLYMNPYAESELKTPKLDCNIEI 326
            ...:.|::.||.||..||..||:....|.:|||||:|::||||||:||.||.||||||:|..:|:
 Frog   259 KSKLYYRKPREDILTALKEGILSEARKPKDYQYIFKPVNASAKLYINPLAEMELKTPKIDWIMEV 323

Human   327 QNIAIELTKPQYLSMIDLLESVDYMVRNAPYRKYKPYLPLHTNGRRWWKYAIDSVLEVHIRRYTQ 391
            ||:|||:|||||||.:||||||||||||||||||:|.|.|..:.::||.|||:|:|||||:|.|.
 Frog   324 QNVAIEVTKPQYLSFMDLLESVDYMVRNAPYRKYRPQLSLQEDTKQWWLYAINSILEVHIKRRTH 388

Human   392 MWSWSNIKKHRQLLKSYKIAYKNKLTQSKVSEEIQKEIQDLEKTLDVFNIILARQQAQVEVIRSG 456
            ||||:||.||||.||.||.|||.||||:|:.||..|::|..||.||||||:|||||||.|:||||
 Frog   389 MWSWNNIAKHRQNLKMYKNAYKTKLTQAKLPEETVKQLQACEKLLDVFNIVLARQQAQAEIIRSG 453

Human   457 QKL-RKKSADTGEKR-GGWFSGLWGKKESKKKD--EESLIPETIDDLMTPEEKDKLFTAIGYSES 517
            ||| .|||:..|||: ||||...|.|||:.|||  :|....|.|||.||||||.|||||||||:|
 Frog   454 QKLMAKKSSAGGEKKGGGWFGSFWSKKEATKKDDVDEIFASEKIDDFMTPEEKAKLFTAIGYSDS 518

Human   518 THNLTLPKQYVAHIMTLKLVSTSVTIRENKNIPEILKIQIIGLGTQVSQRPGAQALKVEAKLEHW 582
            :|||.|||.|||||:..||:.||:||||:.:.||.|:||||.|.|:|.|||||||:|:|||||||
 Frog   519 SHNLALPKAYVAHILNFKLLRTSITIREDIHTPETLQIQIIDLSTKVFQRPGAQAVKIEAKLEHW 583

Human   583 YITGLRQQDIVPSLVASIGDTTSSLLKIKFETNPEDSPADQTLIVQSQPVEVIYDAKTVNAVVEF 647
            |:|||.||:||||||.|||:..||||:|.|||||:...|||.||::|||||:||||.|:||:.||
 Frog   584 YVTGLSQQNIVPSLVTSIGNRESSLLRIVFETNPQHIKADQVLILESQPVEIIYDAVTINALAEF 648

Human   648 FQSNKGLDLEQITSATLMKLEEIKERTATGLTHIIETRKVLDLRINLKPSYLVVPQTGFHHEKSD 712
            ||:.||:||||:|||||||||||||:|||||:|||||||.||:||||:|||.|:|::||:|||||
 Frog   649 FQTQKGMDLEQLTSATLMKLEEIKEKTATGLSHIIETRKRLDVRINLQPSYFVIPKSGFYHEKSD 713

Human   713 LLILDFGTFQLNSKDQGLQKTTNSSLEEIMDKAYDKFDVEIKNVQLLFARAEETWKKCRFQHPST 777
            |:|:|.|:.|:.|.||. ::|||.|||::|:||||||||.|||||:||....|.|||.|.:..|:
 Frog   714 LVIVDLGSLQIISVDQA-EETTNLSLEDLMEKAYDKFDVRIKNVQILFGTKGEDWKKAREKGSSS 777

Human   778 MHILQPMDIHVELAKAMVEKDIRMARFKVSGGLPLMHVRISDQKMKDVLYLMNSIPLPQKSSA-Q 841
            :|||||:||.::|.|||||:|.||.|||:.|.|||:|::|||:|::.|..|:||||||||:|. .
 Frog   778 LHILQPLDIELKLEKAMVERDSRMPRFKILGELPLLHIKISDKKIQGVFQLVNSIPLPQKTSTPT 842

Human   842 SPERQVSSIPIISGGTKGLL----GTSLLLDTVESESDDEYFDAEDGEPQTCKSMK-GSELKKAA 901
            :..:::.:|.|:....:.||    ..||.|:..:|:|::|:||.:|..|...|:.: ..::...|
 Frog   843 NANKKIPAIAILPRRFEKLLKKEIEQSLFLEDDQSDSNEEFFDVDDNFPAIVKTKQIHKQISVNA 907

Human   902 EVPN------EELINLLLKFEIKEVILEFTKQQ-KEEDTILVFNVTQLGTEATMRTFDLTVVSYL 959
            |:.|      |||.:|.||||:|||.:|||||| |.::|||||||.|||||:.::|:.||.||||
 Frog   908 EMSNTEVTNVEELTDLNLKFEVKEVKIEFTKQQEKLQETILVFNVLQLGTESCIKTYSLTSVSYL 972

Human   960 KKISLDYHEIEGSKRKPLHLISSSDKPGLDLLKVEYIKADKNGPSFQTAFGKTEQTVKVAFSSLN 1024
            |||||||::.:|.:::||||||||||...:||||||:|||..||.|||.|..||||:||.||:::
 Frog   973 KKISLDYYDTKGFRKQPLHLISSSDKNASELLKVEYVKADTKGPQFQTTFDNTEQTLKVFFSAMD 1037

Human  1025 LLLQTQALVASINYLTTIIPSDDQSISVAKEVQISTEKQQKNSTLPKAIVSSRDSDIIDFRLFAK 1089
            |||.::||:::|::||..||:..:::...|:       |.|.|.:.||...|::.||..|:|||.
 Frog  1038 LLLHSEALLSTISFLTESIPNLPENVRAPKQ-------QDKESLVKKAAKISKEKDIFAFKLFAN 1095

Human  1090 LNAFCVIVCNEKNNIAEIKIQGLDSSLSLQSRKQSLFARLENIIVTDVDPKTVHKKAVSIMGNEV 1154
            |:||.|.|.:|||:||||||||:.....:||.:..:||||::|||.||:|:|:||||||||..||
 Frog  1096 LDAFNVNVWDEKNHIAEIKIQGMACHFFIQSNQTEVFARLKDIIVNDVNPQTIHKKAVSIMEEEV 1160

Human  1155 FRFNLDLYPDATEGDLYTDMSKVDGVLSLNVGCIQIVYLHKFLMSLLNFLNNFQTAKESLSAATA 1219
            |.|.|.|||:||:||.|.|:|||||.|.|.|||||||:||||||:||.||||||.|||.:|.|||
 Frog  1161 FSFRLMLYPEATQGDAYKDVSKVDGKLDLRVGCIQIVFLHKFLMTLLKFLNNFQAAKERVSMATA 1225

Human  1220 QAAERAATSVKDLAQRSFRVSINIDLKAPVIVIPQSSISTNAVVVDLGLIRVHNQFSLVSDEDYL 1284
            |||:||||||||||:||||:.:::.||||:||:||||:|.||:|.||||::::|:|:|||.||..
 Frog  1226 QAAQRAATSVKDLAERSFRLLMDVHLKAPLIVVPQSSVSCNAIVADLGLLKINNRFTLVSSEDQQ 1290

Human  1285 NPPVIDRMDVQLTKLTLYRTVIQPGIYHPDIQLLHPINLEFLVNRNLAASWYHKVPVVEIKGHLD 1349
            .||.:|.|.:.||:..|.||::|.|.:.||:::|||||:...:||||||:||||:||:|:||||:
 Frog  1291 LPPFVDHMTINLTEFKLSRTMLQDGSFQPDVEILHPININLSINRNLAATWYHKIPVLEVKGHLN 1355

Human  1350 SMNVSLNQEDLNLLFRILTENLCEGTEDLDKVKPRVQETGEIKEP--LEIS-----ISQDVHDSK 1407
            :|||.|:|||:::|..:|.|||.|..|: ||....:.|..|..|.  |||:     |.:|..|.|
 Frog  1356 TMNVGLSQEDVSVLLNVLVENLGEAREE-DKGIEHIHELKEATEQSLLEITKSTQKILEDSRDDK 1419

Human  1408 NTLTTGVEEIRSVDIINMLLNFEIKEVVVTLMKKSEKKGRPLHELNVLQLGMEAKVKTYDMTAKA 1472
            :      |:..::|::   |:|||:||||.|:::|...|.|||..:|.|:|.||:|.:..|||..
 Frog  1420 D------EKSLALDLV---LHFEIQEVVVRLLRQSSGGGLPLHVFHVSQVGAEARVGSQLMTASV 1475

Human  1473 YLKKISMQCFDFTDSKGEPLHIINSSNVTDEPLLKMLLTKADSDGPEFKTIHDSTKQRLKVSFAS 1537
            |||||||.|.||....|.||.:||||:..:.|||||...|||.:||.||||||:|:|...:|.:|
 Frog  1476 YLKKISMACNDFMGPSGGPLLLINSSDDDNAPLLKMEYVKADQNGPNFKTIHDNTEQSFNISVSS 1540

Human  1538 LDLVLHLEALLSFMDFLSSAAPF------SEPSSSE-KESELKPLVGESRSIAVKAVSSNISQKD 1595
            ||.:||.:||||.|:|||||.|.      :.|..|: |||.||       ||..:..|.|.:.:|
 Frog  1541 LDFILHTQALLSLMNFLSSAVPSHNILEENRPKESKAKESRLK-------SIIARPESYNFNTED 1598

Human  1596 VFDLKITAELNAFNVFVCDQKCNIADIKIHGMDASISVKPKQTDVFARLKDIIVMNVDLQSIHKK 1660
            .|.||::|:|||.|:||||:.||||||:|.|||||::|:.|||:|.|||:|.::.:||.::||||
 Frog  1599 SFSLKVSAKLNALNIFVCDEICNIADIRIQGMDASVAVQTKQTEVCARLEDFVIFDVDSKTIHKK 1663

Human  1661 AVSILGDEVFRFQLTLYPDATEGEAYADMSKVDGKLSFKVGCIQIVYVHKFFMSLLNFLNNFQTA 1725
            ||.|:|||||.|::::||:||||.:|:|||.||||:..:||||.|:|:|:|.|||||||:.||.|
 Frog  1664 AVFIMGDEVFNFKMSMYPEATEGISYSDMSAVDGKICLRVGCIHIIYLHRFLMSLLNFLDKFQAA 1728

Human  1726 KEALSTATVQAAERAASSMKDLAQKSFRLLMDINLKAPVIIIPQSSVSPNAVIADLGLIRVENKF 1790
            ||||||||.||||:||||||:.|||||||.|||:||||||||||||||.||::||||.||::|||
 Frog  1729 KEALSTATSQAAEKAASSMKEFAQKSFRLSMDIDLKAPVIIIPQSSVSANAIVADLGFIRIQNKF 1793

Human  1791 SLVPMEHYSLPPVIDKMNIELTQLKLSRTILQASLPQNDIEILKPVNMLLSIQRNLAAAWYVQIP 1855
            ||||:....||||:|:|||:||:|:||||:|.:...:.::|||:|||:|:|:|||||::||.:||
 Frog  1794 SLVPVVDCPLPPVVDQMNIQLTELQLSRTVLMSGSDKPELEILQPVNLLVSVQRNLASSWYSEIP 1858

Human  1856 GMEIKGKLKPMQVALSEDDLTVLMKILLENLGEASSQPSPTQSVQETVRVRK-VDVSSV--PDHL 1917
            .:::.|.||.||:|||::||::||.:|.|||.|..|.|...::.:...:|:| |:..|.  .|.:
 Frog  1859 ALQLVGDLKHMQIALSQEDLSILMSVLFENLAEKPSLPRVVETTKSIEQVKKEVECQSYQQKDTM 1923

Human  1918 KEQEDWTDSKLSMNQIVSLQFDFHFESLSIILYNNDINQESGVAFHNDSFQLGELRLHLMASSGK 1982
            | .||..:..::....|:|.:.|.||||||:||.:|.::|:.:..||:|.:||||||||:.|||.
 Frog  1924 K-TEDSVEQDVAEALSVTLNYKFKFESLSIVLYQSDCSKETALWLHNESLRLGELRLHLLTSSGN 1987

Human  1983 MFKDGSMNVSVKLKTCTLDDLREGIERATSRMIDRKNDQDNNSSMIDISYKQDKNGSQIDAVLDK 2047
            |:.||||:.||.|||||||||||||.:|||||||:| |.....:|:||:|||......|..:|:|
 Frog  1988 MYSDGSMDASVYLKTCTLDDLREGITKATSRMIDQK-DGVCERNMVDITYKQGAQDCLITTILEK 2051

Human  2048 LYVCASVEFLMTVADFFIKAVPQSPENVAKETQILPRQTATGKVKIEKDDSVRPN---MTLKAMI 2109
            ||||||:|||||||||||:|:||||.......:.:.|.|.| |.:.|..:|..|:   :.:|.:|
 Frog  2052 LYVCASMEFLMTVADFFIQAMPQSPSGEKSMQKHVRRSTQT-KPRAESGESHPPSQKKVNVKVLI 2115

Human  2110 TDPEVVFVASLTKADAPALTASFQCNLSLSTSKLEQMMEASVRDLKVLACPFLREKRGKNITTVL 2174
            .|||:||||:|.|||||||:.|||.|.:|.:....|.:.|.|::.||||||||||.||.|||||:
 Frog  2116 MDPEIVFVANLMKADAPALSVSFQGNFTLDSLSGSQKVAAIVKEFKVLACPFLRELRGSNITTVM 2180

Human  2175 QPCSLFMEKCTWASGKQNINIMVKEFIIKISPIILNTVLTIMAALSPKTKEDGSKDTSKEMENLW 2239
            |||||.:|....|:|.:|:.:.::|.|||:||||||||.||:.||.||.||:...:...|:.|:|
 Frog  2181 QPCSLQIEGTIDAAGAKNLILSLEEVIIKVSPIILNTVQTIIDALKPKPKEEEVNENLTELVNIW 2245

Human  2240 GIKSINDYNTWFLGVDTATEITESFKGIEHSLIEENCGVVVESIQVTLECGLGHRTVPLLLAESK 2304
            .::||:..:.||||||.|.||||:|:..||...:|:..:.|:|:|:|||||||||||||||.||.
 Frog  2246 DVRSIDSCSNWFLGVDMAQEITETFQSSEHKEKQESFELEVKSVQITLECGLGHRTVPLLLMEST 2310

Human  2305 FSGNIKNWTSLMAAVADVTLQVHYYNEIHAVWEPLIERVE-GKRQWNLRLDVKKNPVQDKSLLPG 2368
            ||..:|||||.:...||.||:||||||.:||||||||||. |.|:|:|:.::|.|||.||||.||
 Frog  2311 FSTKVKNWTSFINITADTTLEVHYYNENYAVWEPLIERVNCGSRRWSLKFEMKNNPVMDKSLFPG 2375

Human  2369 DDF--IPEPQMAIHISSGNTMNITISKSCLNVFNNLAKGFSEGTASTFDYSLKDRAPFTVKNAVG 2431
            |||  ||||:.||:|.|.:||||||||..|.||.||||.||||||||:||..|||||.|:|||:|
 Frog  2376 DDFILIPEPRSAINIYSKDTMNITISKCTLTVFGNLAKAFSEGTASTYDYDSKDRAPLTIKNALG 2440

Human  2432 VPIKVKPNCNLRVMGFPE-KSDIFDVDAGQNLELEYASMVPSSQGNLSILSRQESSFFTLTIVPH 2495
            :||.|:...|:| ...|. .|...|||.||:||||:.::....:|..|.|.||:||..|:.||||
 Frog  2441 IPIIVQHGSNMR-RNIPSPHSQTHDVDEGQSLELEFCAVELLKRGQHSALHRQDSSLLTVGIVPH 2504

Human  2496 GYTEVANIPVARPGRRLYNVRNPNASHSDSVLVQIDATEGNKVITLRSPLQIKNHFSIAFIIYKF 2560
            ||||:|||||.:..|||||||||...:..||||||||||||||||:||||||||||||.|.:|||
 Frog  2505 GYTEMANIPVTKTARRLYNVRNPQQENFVSVLVQIDATEGNKVITIRSPLQIKNHFSIPFTVYKF 2569

Human  2561 VKNVKLLERIGIARPEEEFHVPLDSYRCQLFIQPAGILEHQYKESTTYISWKEELHRSREVRCML 2625
            |.:.||||.||:||.:|||||||||||||||::|||.||.|:||||:||:|||.:|||.||||.|
 Frog  2570 VASAKLLEPIGVARQDEEFHVPLDSYRCQLFLRPAGALEEQFKESTSYITWKEMVHRSSEVRCTL 2634

Human  2626 QCPSVEVSFLPLIVNTVALPDELSYICTHGE-DWDVAYIIHLYPSLTLRNLLPYSLRYLL----E 2685
            |||:.|:|||||:||..|:|||:::|..:|| :||.||||||||:||:|||:|||:|:||    |
 Frog  2635 QCPASEISFLPLMVNCSAVPDEINFISRNGEKEWDPAYIIHLYPTLTVRNLVPYSIRFLLEVNAE 2699

Human  2686 GTAETHELAEGSTADVLHSRISGEIMELVLVKYQGKNWNGHFRIRDTLPEFFPVCFSSDSTEVTT 2750
            |.||||||||||:.|||.||||||||||.|:||||:|||||.|:.:.|.|||||.|::||:|:.|
 Frog  2700 GAAETHELAEGSSLDVLQSRISGEIMELFLIKYQGRNWNGHIRVHENLSEFFPVLFTADSSELLT 2764

Human  2751 VDLSVHVRRIGSRMVLSVFSPYWLINKTTRVLQYRSEDIHVKHPADFRDIILFSFKKKNIFTKNK 2815
            ||||||||.||:||||||:||||:||||:|:|||::||||||||:|:||:|||||||||||:|||
 Frog  2765 VDLSVHVRHIGNRMVLSVYSPYWIINKTSRILQYKAEDIHVKHPSDYRDVILFSFKKKNIFSKNK 2829

Human  2816 VQLKISTSAWSSSFSLDTVGSYGCVKCPANNMEYLVGVSIKMSSFNLSRIVTLTPFCTIANKSSL 2880
            :||.||||:||:.||||||||||||||||..|||||||:|||||||||||||||||.|:.|||.|
 Frog  2830 IQLCISTSSWSTGFSLDTVGSYGCVKCPAVKMEYLVGVNIKMSSFNLSRIVTLTPFYTLVNKSKL 2894

Human  2881 ELEVGEIASDGSMPTNKWNYIASSECLPFWPESLSGKLCVRVVGCEGSSKPFFYNRQDNGTLLSL 2945
            |:||||:|:|.|....||||::||||:|||||::||||||||:||||.|||||:|:|||||||||
 Frog  2895 EIEVGEMATDVSPTDIKWNYVSSSECIPFWPENISGKLCVRVIGCEGISKPFFFNKQDNGTLLSL 2959

Human  2946 EDLNGGILVDVNTAEHSTVITFSDYHEGSAPALIMNHTPWDILTYKQSGSPEEMVLLPRQARLFA 3010
            |.:|.||:|||:.|:||||||||||::|:|||||:||.|...|||.|||:..|..|.|.:|||||
 Frog  2960 ESMNTGIIVDVSIADHSTVITFSDYYKGAAPALIINHMPHAKLTYNQSGTEIEKELGPGEARLFA 3024

Human  3011 WADPTGTRKLTWTYAANVGEHDLLKDGCGQFPYDANIQIHWVSFLDGRQRVLLFTDDVALVSKAL 3075
            |.|||||:||.|..|:...|.|||||..|||.|:.|:||||||||||||||||||:|||:|:||.
 Frog  3025 WEDPTGTKKLNWKCASTTREVDLLKDESGQFAYNQNVQIHWVSFLDGRQRVLLFTEDVAVVTKAR 3089

Human  3076 QAEEMEQADYEITLSLHSLGLSLVNNESKQEVSYIGITSSGVVWEVKPKQKWKPFSQKQIILLEQ 3140
            |||||||:|.|:|:||||||||||||:|:.|:|||||.||||:||:|.|.||:||:||||..||.
 Frog  3090 QAEEMEQSDQEVTVSLHSLGLSLVNNDSRHEISYIGIISSGVIWEMKRKHKWQPFNQKQIFQLEG 3154

Human  3141 SYQKHQISRDHGWIKLDNNFEVNFDKDPMEMRLPIRSPIKRDFLSGIQIEFKQSSHQRSLRARLY 3205
            :|:|:..:.:.||:.::.||.|.|.|.||||||||:..|:|:|:|||.:|||||.|||||||:||
 Frog  3155 AYEKYLTNEEQGWVSVEENFVVCFSKVPMEMRLPIKCSIRRNFMSGIYMEFKQSPHQRSLRAQLY 3219

Human  3206 WLQVDNQLPGAMFPVVFHPVAPPKSIALDSEPKPFIDVSVITRFNEYSKVLQFKYFMVLIQEMAL 3270
            ||||||.|||:|||||||||.||||:|||||||||||||:||||||:|||:||||||||.|.|||
 Frog  3220 WLQVDNHLPGSMFPVVFHPVIPPKSVALDSEPKPFIDVSIITRFNEFSKVMQFKYFMVLTQCMAL 3284

Human  3271 KIDQGFLGAIIALFTPTTDPEAERRRTKLIQQDIDALNAELMETSMTDMSILSFFEHFHISPVKL 3335
            |:|||||.|:|.||||.|||.||::||:|||:|:|:||.||||:|:||:|..||||||||||:||
 Frog  3285 KLDQGFLAAVIGLFTPETDPNAEKQRTQLIQKDLDSLNTELMESSLTDISFPSFFEHFHISPLKL 3349

Human  3336 HLSLSLGSGGEESDKEKQEMFAVHSVNLLLKSIGATLTDVDDLIFKLAYYEIRYQFYKRDQLIWS 3400
            |||||||:|||:|:||::|:.|:.||||||||||||||||||||||||.:|::|||||::||...
 Frog  3350 HLSLSLGAGGEQSNKEEKEIIAIASVNLLLKSIGATLTDVDDLIFKLACFELKYQFYKQNQLRNL 3414

Human  3401 VVRHYSEQFLKQMYVLVLGLDVLGNPFGLIRGLSEGVEALFYEPFQGAVQGPEEFAEGLVIGVRS 3465
            |||||:||||||:||||||||||||||||||||:|||||.||||||||||||||||||||||::|
 Frog  3415 VVRHYTEQFLKQVYVLVLGLDVLGNPFGLIRGLTEGVEAFFYEPFQGAVQGPEEFAEGLVIGMKS 3479

Human  3466 LFGHTVGGAAGVVSRITGSVGKGLAAITMDKEYQQKRREELSRQPRDFGDSLARGGKGFLRGVVG 3530
            |.|||||||||:||||||:|||||||||||||||||||:|:.|||:|||:|||:|||||||||||
 Frog  3480 LLGHTVGGAAGMVSRITGTVGKGLAAITMDKEYQQKRRQEMGRQPKDFGESLAKGGKGFLRGVVG 3544

Human  3531 GVTGIITKPVEGAKKEGAAGFFKGIGKGLVGAVARPTGGIVDMASSTFQGIQRAAESTEEVSSLR 3595
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||.||
 Frog  3545 GVTGIITKPVEGAKKEGAAGFFKGIGKGLVGVVARPTGGIVDMASSTFQGIQRVAESTEEVSPLR 3609

Human  3596 PPRLIHEDGIIRPYDRQESEGSDLLEN-HIKKLEGETYRYHCAIPGSKKTILMVTNRRVLCIKEV 3659
            ||||||||||||||:..|::|..|.:| ::|||:||.|||.|.:. ::|..|||||||::|:|||
 Frog  3610 PPRLIHEDGIIRPYNESEAQGFKLFQNLNVKKLDGEMYRYSCCLQ-NRKANLMVTNRRLICMKEV 3673

Human  3660 EILGLMCVDWQCPFEDFVFPPSVSENVLKISVKEQGL--FHKKDSANQGCVRKVYLKDTATAERA 3722
            ||||...:||...||:||.||.|..|.|.:.||.|.|  |.||::|::..::.|.|::..|||..
 Frog  3674 EILGHRMIDWTYTFEEFVHPPIVDGNTLTLFVKNQALLGFQKKENADEESLKVVPLQNECTAEAV 3738

Human  3723 CNAIEDAQSTRQQQKLMKQSSVRLLR 3748
            ..||::|.|.|:|..|::..|.|.::
 Frog  3739 LKAIDEACSRRRQHALVRTKSERFIK 3764

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
VPS13CNP_065872.1 MRS6 3..>1366 CDD:227376 877/1379 (64%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 150..176 15/25 (60%)
FFAT. /evidence=ECO:0000305 877..883 3/5 (60%)
MRS6 1046..>2612 CDD:227376 894/1589 (56%)
Required for late endosome/lysosome localization. /evidence=ECO:0000269|PubMed:30093493 2415..3309 628/899 (70%)
SHR-BD 2766..>2942 CDD:461974 136/175 (78%)
MRS6 <3184..3662 CDD:227376 383/478 (80%)
Required for lipid droplet localization. /evidence=ECO:0000269|PubMed:30093493 3310..3753 320/442 (72%)
VPS13_C 3323..3500 CDD:465310 148/176 (84%)
vps13cXP_031754979.1 MRS6 1..>1372 CDD:227376 877/1380 (64%)
VPS13 179..411 CDD:465309 157/231 (68%)
MRS6 <1247..>2635 CDD:227376 788/1408 (56%)
SHR-BD 2780..3030 CDD:461974 185/249 (74%)
MRS6 <3198..3676 CDD:227376 383/478 (80%)
VPS13_C 3336..3514 CDD:465310 148/177 (84%)

Return to query results.
Submit another query.